MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 2987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003361	T	7	7	994927	994933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_003361	T	6	6	995863	995868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_003361	GAA	2	6	995892	995897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_003361	T	6	6	996158	996163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_003361	CTT	2	6	996175	996180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_003361	AGA	2	6	996824	996829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_003361	AAT	2	6	996855	996860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_003361	A	6	6	996861	996866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_003361	TTA	2	6	996867	996872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_003361	ATT	2	6	996918	996923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_003361	ATA	2	6	996932	996937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_003361	GGC	2	6	996952	996957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_003361	ACT	2	6	999902	999907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_003361	TGTTA	2	10	999980	999989	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_003361	TTCT	2	8	1000002	1000009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2516	NC_003361	TC	3	6	1000037	1000042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2517	NC_003361	TC	3	6	1012054	1012059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_003361	GTA	2	6	1012064	1012069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_003361	A	8	8	1012084	1012091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_003361	AAC	2	6	1012096	1012101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_003361	A	7	7	1012105	1012111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_003361	A	6	6	1012156	1012161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_003361	TAAAT	2	10	1012186	1012195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_003361	CAA	2	6	1012209	1012214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_003361	A	6	6	1012229	1012234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_003361	CTC	2	6	1012236	1012241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2530	NC_003361	TAAAA	2	10	1012326	1012335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_003361	A	8	8	1012332	1012339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_003361	TTTTC	2	10	1012357	1012366	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2533	NC_003361	A	7	7	1012370	1012376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_003361	TTG	2	6	1012377	1012382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_003361	AACA	2	8	1012393	1012400	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2536	NC_003361	ACA	2	6	1012439	1012444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_003361	T	6	6	1012840	1012845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_003361	T	6	6	1012893	1012898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_003361	CTC	2	6	1012901	1012906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2543	NC_003361	GGT	2	6	1014333	1014338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2545	NC_003361	T	6	6	1014748	1014753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2549	NC_003361	TCG	2	6	1016157	1016162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2551	NC_003361	TCCT	2	8	1016283	1016290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2552	NC_003361	T	6	6	1016330	1016335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_003361	T	6	6	1016359	1016364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_003361	A	6	6	1016385	1016390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_003361	CTAG	2	8	1016430	1016437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2556	NC_003361	TA	3	6	1016445	1016450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2559	NC_003361	TCT	2	6	1016562	1016567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2563	NC_003361	GATA	2	8	1017016	1017023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_003361	GTT	2	6	1017071	1017076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_003361	AAC	2	6	1017097	1017102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2569	NC_003361	AT	3	6	1017205	1017210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2593	NC_003361	CACT	2	8	1018533	1018540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2594	NC_003361	AG	3	6	1018568	1018573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2601	NC_003361	TGT	2	6	1018855	1018860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_003361	TAA	2	6	1018900	1018905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_003361	TCTT	2	8	1018915	1018922	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2604	NC_003361	CAA	2	6	1019049	1019054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2611	NC_003361	TAA	2	6	1019356	1019361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_003361	AT	3	6	1019412	1019417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_003361	TTCA	2	8	1019482	1019489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2614	NC_003361	TGC	2	6	1019592	1019597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2622	NC_003361	CAAC	2	8	1019764	1019771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2623	NC_003361	CTT	2	6	1019805	1019810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2625	NC_003361	AGA	2	6	1019842	1019847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_003361	ATCATA	2	12	1019934	1019945	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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2628	NC_003361	C	13	13	1019981	1019993	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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2630	NC_003361	AG	3	6	1020060	1020065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_003361	ATCG	2	8	1020086	1020093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2632	NC_003361	GAA	2	6	1020128	1020133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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