MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 3082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002179	TC	3	6	1188395	1188400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_002179	CAT	2	6	1188408	1188413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_002179	T	7	7	1188435	1188441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_002179	GAA	2	6	1190371	1190376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_002179	AGA	2	6	1194135	1194140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_002179	TCAA	2	8	1194147	1194154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_002179	TTA	2	6	1194176	1194181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_002179	A	7	7	1194219	1194225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_002179	TGA	2	6	1195929	1195934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_002179	CT	3	6	1195938	1195943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_002179	ATGT	2	8	1197234	1197241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_002179	TAA	2	6	1197272	1197277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_002179	AAGA	2	8	1197334	1197341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_002179	T	6	6	1197398	1197403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_002179	TTA	2	6	1198986	1198991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_002179	CTC	2	6	1199040	1199045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_002179	TGT	2	6	1203176	1203181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_002179	ATT	2	6	1203260	1203265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_002179	CTT	2	6	1203283	1203288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_002179	ATT	2	6	1203403	1203408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_002179	GCT	2	6	1203449	1203454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_002179	TTA	2	6	1203503	1203508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_002179	AAAT	2	8	1203525	1203532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_002179	AT	3	6	1203536	1203541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_002179	ATTAA	2	10	1203574	1203583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_002179	TC	3	6	1203602	1203607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_002179	TAG	2	6	1203662	1203667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_002179	ATT	2	6	1203699	1203704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_002179	T	6	6	1211483	1211488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_002179	AG	3	6	1211625	1211630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_002179	CAT	2	6	1211653	1211658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_002179	TC	3	6	1211680	1211685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_002179	AACT	2	8	1211686	1211693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_002179	GAA	2	6	1211698	1211703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_002179	TC	3	6	1211714	1211719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_002179	A	6	6	1211796	1211801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_002179	GCT	2	6	1211812	1211817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_002179	AGG	2	6	1212917	1212922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_002179	G	6	6	1212921	1212926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_002179	T	6	6	1212953	1212958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_002179	TAA	2	6	1212963	1212968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_002179	TAC	2	6	1212996	1213001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_002179	TAA	2	6	1213027	1213032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_002179	TGA	2	6	1214959	1214964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_002179	GCA	2	6	1214965	1214970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_002179	T	6	6	1216734	1216739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_002179	TAA	2	6	1216747	1216752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_002179	AGA	3	9	1218557	1218565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_002179	CTT	2	6	1218587	1218592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_002179	T	7	7	1219858	1219864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_002179	T	7	7	1219898	1219904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_002179	T	6	6	1219922	1219927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_002179	CTTTC	2	10	1219958	1219967	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3054	NC_002179	TC	4	8	1219966	1219973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_002179	TCTTG	2	10	1220017	1220026	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3056	NC_002179	TAT	2	6	1220035	1220040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_002179	A	6	6	1220048	1220053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_002179	A	8	8	1220060	1220067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_002179	AGA	2	6	1220078	1220083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_002179	CTG	2	6	1220088	1220093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_002179	CTT	2	6	1221302	1221307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_002179	A	6	6	1222880	1222885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_002179	TAC	2	6	1222888	1222893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_002179	CTTTA	2	10	1222903	1222912	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3065	NC_002179	G	6	6	1222926	1222931	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_002179	GTGTT	2	10	1224844	1224853	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_002179	A	6	6	1224872	1224877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_002179	A	6	6	1224879	1224884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_002179	A	6	6	1224887	1224892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_002179	ATTC	2	8	1224934	1224941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3071	NC_002179	TTGT	2	8	1224985	1224992	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_002179	A	6	6	1227335	1227340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_002179	GA	4	8	1227367	1227374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_002179	TAA	2	6	1227538	1227543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_002179	CTC	2	6	1227613	1227618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_002179	TTA	2	6	1227677	1227682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_002179	TA	4	8	1227681	1227688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_002179	A	6	6	1227717	1227722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_002179	AAT	2	6	1227860	1227865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_002179	CGA	2	6	1229485	1229490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_002179	GC	3	6	1229494	1229499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_002179	ACG	2	6	1229519	1229524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.