MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168 = ATCC 700819 chromosome

Total Repeats: 3540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002163	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002163	A	7	7	1358	1364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002163	ATT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002163	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002163	TTA	3	9	1437	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002163	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002163	GAA	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002163	TA	3	6	6518	6523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002163	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002163	TAAT	2	8	6559	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002163	TAAT	2	8	6568	6575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002163	A	7	7	6586	6592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002163	ATT	2	6	6596	6601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002163	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002163	TCA	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002163	TTA	2	6	6647	6652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002163	T	6	6	6666	6671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002163	ATT	2	6	6691	6696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002163	T	6	6	8033	8038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002163	ATTT	3	12	8040	8051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002163	A	7	7	8077	8083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002163	AAG	2	6	16431	16436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002163	A	6	6	16709	16714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002163	T	6	6	17413	17418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002163	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002163	A	7	7	17443	17449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002163	TAA	2	6	17463	17468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002163	AAAT	2	8	17497	17504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002163	A	6	6	17539	17544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002163	TTA	2	6	17545	17550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002163	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002163	TTTA	2	8	19825	19832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002163	T	8	8	21103	21110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002163	AAAAT	2	10	23612	23621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002163	GTTAA	2	10	23639	23648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002163	A	6	6	23658	23663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002163	T	6	6	27304	27309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002163	ATT	2	6	27339	27344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002163	T	7	7	27343	27349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002163	A	6	6	27365	27370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002163	TGAT	2	8	27372	27379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002163	CAT	2	6	27395	27400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002163	TAA	2	6	28306	28311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002163	T	6	6	28342	28347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002163	AAGG	2	8	29716	29723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002163	T	6	6	34272	34277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002163	T	6	6	34288	34293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002163	T	6	6	34306	34311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002163	A	7	7	34360	34366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002163	TAA	2	6	37595	37600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002163	A	6	6	37605	37610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002163	A	6	6	37628	37633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002163	TTAT	2	8	37634	37641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002163	TGT	2	6	37643	37648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002163	T	6	6	38665	38670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002163	TATAT	2	10	38733	38742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002163	T	6	6	38749	38754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002163	CCA	2	6	38788	38793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_002163	TA	3	6	38800	38805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002163	TTTA	2	8	38839	38846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002163	T	6	6	38885	38890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002163	A	6	6	38892	38897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002163	TAG	2	6	38936	38941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002163	T	6	6	38988	38993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002163	T	6	6	39004	39009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002163	CTTTT	2	10	39020	39029	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_002163	T	6	6	39038	39043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002163	TTA	2	6	39080	39085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002163	TAA	2	6	39168	39173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002163	CTTTT	2	10	39190	39199	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_002163	GAA	2	6	39222	39227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002163	CTAT	2	8	39238	39245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_002163	T	6	6	39248	39253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002163	GGC	2	6	39288	39293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002163	ACA	2	6	39398	39403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002163	TA	3	6	39483	39488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002163	GGTAA	2	10	39502	39511	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002163	GAT	2	6	39550	39555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002163	GCA	2	6	39599	39604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_002163	GCA	2	6	39639	39644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_002163	CGC	2	6	39646	39651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_002163	GGA	2	6	39654	39659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002163	GAA	2	6	39695	39700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002163	CAG	2	6	39743	39748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_002163	TGG	2	6	39902	39907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002163	CTG	2	6	39960	39965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002163	GTT	2	6	40053	40058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002163	GAA	2	6	40197	40202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002163	TGC	2	6	40277	40282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_002163	GTC	2	6	40289	40294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_002163	TCGTG	2	10	40298	40307	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_002163	AGG	3	9	40397	40405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002163	GAC	2	6	40414	40419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_002163	TCA	2	6	40426	40431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_002163	AC	3	6	40452	40457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_002163	CCT	2	6	40756	40761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_002163	TAA	2	6	40777	40782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002163	AT	3	6	40803	40808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002163	TGA	2	6	40843	40848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002163	AGG	2	6	40906	40911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002163	CCA	2	6	40936	40941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_002163	TTA	2	6	40943	40948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002163	A	6	6	41028	41033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002163	AAG	2	6	41044	41049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002163	TA	3	6	41069	41074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002163	ATTT	2	8	41112	41119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002163	T	6	6	41117	41122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002163	ATTTAT	2	12	41179	41190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002163	AT	4	8	41204	41211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002163	CAAG	2	8	41268	41275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_002163	TAA	2	6	41279	41284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002163	TCTTT	2	10	41326	41335	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_002163	TAACT	2	10	41340	41349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_002163	AAG	2	6	41493	41498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002163	AAT	2	6	41544	41549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002163	A	7	7	41557	41563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002163	CTA	2	6	41570	41575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_002163	TGG	2	6	41584	41589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002163	AAG	2	6	41653	41658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002163	TA	3	6	41715	41720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002163	GCG	2	6	41791	41796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_002163	TAGC	2	8	41934	41941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002163	TGC	2	6	42247	42252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_002163	GGA	2	6	42310	42315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002163	TC	3	6	42396	42401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_002163	AT	3	6	42406	42411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002163	CAG	2	6	42520	42525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_002163	GGC	2	6	42529	42534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_002163	CGT	2	6	42548	42553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_002163	AAC	2	6	42563	42568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_002163	CTTA	2	8	42596	42603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_002163	AGG	2	6	42637	42642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002163	AGC	2	6	42653	42658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_002163	AAAG	2	8	42667	42674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002163	AGTA	2	8	42727	42734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002163	TAAT	2	8	42850	42857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002163	AGG	2	6	43055	43060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002163	GGAT	2	8	43120	43127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002163	AGA	2	6	43128	43133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002163	CCGTA	2	10	43185	43194	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_002163	GGTG	2	8	43205	43212	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002163	GAA	2	6	43236	43241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002163	CT	3	6	43242	43247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_002163	ACA	2	6	43336	43341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_002163	TCCC	2	8	43347	43354	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_002163	CGG	2	6	43485	43490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_002163	TCC	2	6	43618	43623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_002163	TAC	2	6	43659	43664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_002163	TTG	2	6	43746	43751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002163	TGG	2	6	43816	43821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002163	ATA	2	6	43851	43856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002163	TCGT	2	8	43895	43902	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_002163	GGT	2	6	43979	43984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_002163	TG	3	6	43987	43992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_002163	CGT	2	6	44174	44179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_002163	TGT	2	6	44276	44281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_002163	TCT	2	6	44366	44371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_002163	CT	3	6	44377	44382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_002163	AGA	2	6	44383	44388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_002163	CTA	2	6	44389	44394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_002163	GT	3	6	44409	44414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_002163	AAG	2	6	44501	44506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_002163	A	7	7	44632	44638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_002163	AGA	2	6	44653	44658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_002163	AAG	2	6	44789	44794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_002163	TGA	2	6	44811	44816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_002163	TAC	2	6	44817	44822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_002163	TAA	2	6	44890	44895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_002163	ATA	2	6	56451	56456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_002163	AAT	2	6	56459	56464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_002163	AT	3	6	56502	56507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_002163	TA	3	6	56516	56521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_002163	TTA	2	6	56530	56535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_002163	TAA	2	6	66485	66490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_002163	AAAAT	2	10	66514	66523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_002163	AAT	3	9	66521	66529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_002163	TAT	2	6	68175	68180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_002163	AT	3	6	68241	68246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_002163	AAAT	2	8	79786	79793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_002163	AT	3	6	81942	81947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_002163	TTTA	2	8	81955	81962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_002163	AAT	2	6	81984	81989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_002163	AAAAT	2	10	83204	83213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_002163	ATTTT	2	10	83214	83223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_002163	T	6	6	83310	83315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_002163	CTT	2	6	83330	83335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_002163	T	6	6	83340	83345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_002163	CAT	2	6	83399	83404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_002163	TCA	2	6	83449	83454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_002163	TCT	2	6	83461	83466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_002163	CTT	2	6	83471	83476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_002163	CAT	2	6	83492	83497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_002163	AGA	2	6	83511	83516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_002163	TCT	2	6	83517	83522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_002163	CTT	2	6	83915	83920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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335	NC_002163	TAAA	2	8	95883	95890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_002163	AAT	2	6	172818	172823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_002163	TAA	2	6	179269	179274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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