MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR15

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022607	CAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650831
2	NC_022607	GTAA	2	8	852	859	50 %	25 %	25 %	0 %	554650831
3	NC_022607	AAT	2	6	869	874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650831
4	NC_022607	TATTT	2	10	896	905	20 %	80 %	0 %	0 %	554650831
5	NC_022607	AGAA	2	8	913	920	75 %	0 %	25 %	0 %	554650831
6	NC_022607	GAT	2	6	1037	1042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650831
7	NC_022607	AGAACA	2	12	1103	1114	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554650831
8	NC_022607	A	6	6	1153	1158	100 %	0 %	0 %	0 %	554650832
9	NC_022607	A	10	10	1190	1199	100 %	0 %	0 %	0 %	554650832
10	NC_022607	T	6	6	1210	1215	0 %	100 %	0 %	0 %	554650832
11	NC_022607	T	6	6	1227	1232	0 %	100 %	0 %	0 %	554650832
12	NC_022607	GT	3	6	1269	1274	0 %	50 %	50 %	0 %	554650832
13	NC_022607	AAT	2	6	1276	1281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650832
14	NC_022607	TTCCAT	2	12	1309	1320	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	554650832
15	NC_022607	TC	3	6	1442	1447	0 %	50 %	0 %	50 %	554650832
16	NC_022607	CAT	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650832
17	NC_022607	GCA	2	6	1550	1555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650832
18	NC_022607	GGAT	2	8	1625	1632	25 %	25 %	50 %	0 %	554650832
19	NC_022607	TAA	2	6	1816	1821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650832
20	NC_022607	CT	3	6	1839	1844	0 %	50 %	0 %	50 %	554650832
21	NC_022607	GAA	2	6	1874	1879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650832
22	NC_022607	CAA	2	6	1911	1916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650832
23	NC_022607	A	6	6	1921	1926	100 %	0 %	0 %	0 %	554650832
24	NC_022607	AGA	2	6	1942	1947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650832
25	NC_022607	A	6	6	1978	1983	100 %	0 %	0 %	0 %	554650832
26	NC_022607	ATT	2	6	2315	2320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
27	NC_022607	CTA	2	6	2352	2357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
28	NC_022607	TA	3	6	2376	2381	50 %	50 %	0 %	0 %	554650833
29	NC_022607	TTG	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
30	NC_022607	TTC	2	6	2428	2433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
31	NC_022607	TAATCA	2	12	2480	2491	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554650833
32	NC_022607	ATC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
33	NC_022607	TAA	2	6	2533	2538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650833
34	NC_022607	CTT	2	6	2616	2621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
35	NC_022607	TCA	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
36	NC_022607	TTC	2	6	2734	2739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
37	NC_022607	GAA	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
38	NC_022607	CTT	2	6	2886	2891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
39	NC_022607	ATT	2	6	2902	2907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
40	NC_022607	CCATT	2	10	2912	2921	20 %	40 %	0 %	40 %	554650833
41	NC_022607	TA	3	6	3015	3020	50 %	50 %	0 %	0 %	554650833
42	NC_022607	GAA	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
43	NC_022607	TTC	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
44	NC_022607	ATC	2	6	3103	3108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
45	NC_022607	AGA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
46	NC_022607	TTC	2	6	3274	3279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
47	NC_022607	TCA	3	9	3296	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
48	NC_022607	AAG	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
49	NC_022607	TAT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
50	NC_022607	CTA	2	6	3492	3497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
51	NC_022607	GTT	2	6	3568	3573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
52	NC_022607	TCT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
53	NC_022607	TTG	2	6	3649	3654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
54	NC_022607	TAA	2	6	3704	3709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650833
55	NC_022607	TCA	2	6	3770	3775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
56	NC_022607	GTT	2	6	3793	3798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
57	NC_022607	AAG	2	6	3830	3835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
58	NC_022607	AAT	2	6	3884	3889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650833
59	NC_022607	GATT	2	8	3897	3904	25 %	50 %	25 %	0 %	554650833
60	NC_022607	AAAAT	2	10	3927	3936	80 %	20 %	0 %	0 %	554650833
61	NC_022607	AGT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650833
62	NC_022607	TGC	2	6	3952	3957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650833
63	NC_022607	TAT	2	6	4123	4128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
64	NC_022607	GTA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650833
65	NC_022607	ACA	2	6	4208	4213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650833
66	NC_022607	T	6	6	4232	4237	0 %	100 %	0 %	0 %	554650833
67	NC_022607	GTAAA	2	10	4244	4253	60 %	20 %	20 %	0 %	554650833
68	NC_022607	GATTG	2	10	4285	4294	20 %	40 %	40 %	0 %	554650833
69	NC_022607	ATAA	2	8	4295	4302	75 %	25 %	0 %	0 %	554650833
70	NC_022607	GAA	2	6	4315	4320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
71	NC_022607	A	6	6	4396	4401	100 %	0 %	0 %	0 %	554650833
72	NC_022607	ATC	2	6	5022	5027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650841
73	NC_022607	CTT	2	6	5101	5106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650841
74	NC_022607	CAA	2	6	5113	5118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650841
75	NC_022607	GCA	2	6	5133	5138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650841
76	NC_022607	TAT	2	6	5192	5197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650841
77	NC_022607	GTA	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650841
78	NC_022607	CTG	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650842
79	NC_022607	ACC	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554650843
80	NC_022607	AGC	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650843
81	NC_022607	AGC	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650843
82	NC_022607	ACC	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554650843
83	NC_022607	TCCA	2	8	5681	5688	25 %	25 %	0 %	50 %	554650843
84	NC_022607	A	6	6	5801	5806	100 %	0 %	0 %	0 %	554650843
85	NC_022607	TCAA	2	8	5808	5815	50 %	25 %	0 %	25 %	554650843
86	NC_022607	A	6	6	6694	6699	100 %	0 %	0 %	0 %	554650834
87	NC_022607	T	6	6	6741	6746	0 %	100 %	0 %	0 %	554650834
88	NC_022607	TTG	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650834
89	NC_022607	CCA	2	6	6832	6837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554650834
90	NC_022607	AT	3	6	6840	6845	50 %	50 %	0 %	0 %	554650834
91	NC_022607	GAT	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650834
92	NC_022607	AAT	2	6	6928	6933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650834
93	NC_022607	TAT	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650834
94	NC_022607	A	7	7	6961	6967	100 %	0 %	0 %	0 %	554650834
95	NC_022607	A	6	6	6971	6976	100 %	0 %	0 %	0 %	554650834
96	NC_022607	AGAA	2	8	7026	7033	75 %	0 %	25 %	0 %	554650834
97	NC_022607	AAAT	2	8	7051	7058	75 %	25 %	0 %	0 %	554650834
98	NC_022607	GAAA	2	8	7111	7118	75 %	0 %	25 %	0 %	554650835
99	NC_022607	AGCT	2	8	7123	7130	25 %	25 %	25 %	25 %	554650835
100	NC_022607	AGA	2	6	7162	7167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650835
101	NC_022607	A	6	6	7208	7213	100 %	0 %	0 %	0 %	554650835
102	NC_022607	GTT	2	6	7316	7321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650835
103	NC_022607	A	8	8	8229	8236	100 %	0 %	0 %	0 %	554650836
104	NC_022607	GAA	2	6	8249	8254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650836
105	NC_022607	CAA	2	6	8315	8320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650836
106	NC_022607	CAA	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650836
107	NC_022607	AACC	2	8	8487	8494	50 %	0 %	0 %	50 %	554650836
108	NC_022607	AAC	2	6	8511	8516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650836
109	NC_022607	AGGA	2	8	8532	8539	50 %	0 %	50 %	0 %	554650836
110	NC_022607	CTCAC	2	10	8651	8660	20 %	20 %	0 %	60 %	554650844
111	NC_022607	AGC	2	6	8676	8681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650844
112	NC_022607	GA	3	6	8682	8687	50 %	0 %	50 %	0 %	554650844
113	NC_022607	CA	3	6	8862	8867	50 %	0 %	0 %	50 %	554650844
114	NC_022607	TACCGA	2	12	8868	8879	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554650844
115	NC_022607	CA	3	6	8885	8890	50 %	0 %	0 %	50 %	554650844
116	NC_022607	TCC	2	6	8946	8951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	554650844
117	NC_022607	A	6	6	8991	8996	100 %	0 %	0 %	0 %	554650844
118	NC_022607	A	6	6	9101	9106	100 %	0 %	0 %	0 %	554650844
119	NC_022607	GA	3	6	9117	9122	50 %	0 %	50 %	0 %	554650844
120	NC_022607	CAT	2	6	9312	9317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650844
121	NC_022607	ACAA	2	8	9338	9345	75 %	0 %	0 %	25 %	554650844
122	NC_022607	AAC	2	6	9359	9364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650844
123	NC_022607	GCA	2	6	9371	9376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650844
124	NC_022607	ACA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650845
125	NC_022607	GCA	2	6	9718	9723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650845
126	NC_022607	CAA	2	6	9731	9736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650845
127	NC_022607	A	6	6	9740	9745	100 %	0 %	0 %	0 %	554650845
128	NC_022607	CGAA	2	8	9766	9773	50 %	0 %	25 %	25 %	554650845
129	NC_022607	TA	3	6	9811	9816	50 %	50 %	0 %	0 %	554650845
130	NC_022607	ATT	2	6	9856	9861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650846
131	NC_022607	GTG	2	6	9955	9960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554650846
132	NC_022607	CTT	2	6	10002	10007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650846
133	NC_022607	TGC	2	6	10026	10031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650846
134	NC_022607	TTA	2	6	10034	10039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650846
135	NC_022607	CAA	3	9	10097	10105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650846
136	NC_022607	AAACAA	2	12	10115	10126	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	554650846
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143	NC_022607	TGAT	2	8	10290	10297	25 %	50 %	25 %	0 %	554650846
144	NC_022607	ACAG	2	8	10313	10320	50 %	0 %	25 %	25 %	554650846
145	NC_022607	AGA	2	6	10321	10326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650846
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.