MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni 4031 genome sequence

Total Repeats: 36899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022529	A	7	7	30	36	100 %	0 %	0 %	0 %	549691987
2	NC_022529	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	549691987
3	NC_022529	ACAA	2	8	153	160	75 %	0 %	0 %	25 %	549691987
4	NC_022529	A	7	7	169	175	100 %	0 %	0 %	0 %	549691987
5	NC_022529	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549691987
6	NC_022529	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549691987
7	NC_022529	A	7	7	492	498	100 %	0 %	0 %	0 %	549691987
8	NC_022529	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	549691987
9	NC_022529	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549691987
10	NC_022529	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549691987
11	NC_022529	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549691987
12	NC_022529	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549691987
13	NC_022529	A	7	7	828	834	100 %	0 %	0 %	0 %	549691987
14	NC_022529	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549691987
15	NC_022529	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549691987
16	NC_022529	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549691987
17	NC_022529	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549691987
18	NC_022529	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	549691987
19	NC_022529	A	7	7	1099	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	549691987
20	NC_022529	CTAG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	25 %	25 %	549691987
21	NC_022529	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549691987
22	NC_022529	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	549691987
23	NC_022529	A	7	7	1231	1237	100 %	0 %	0 %	0 %	549691987
24	NC_022529	ATG	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549691987
25	NC_022529	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549691987
26	NC_022529	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	549691988
27	NC_022529	A	8	8	1547	1554	100 %	0 %	0 %	0 %	549691988
28	NC_022529	T	8	8	1580	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	549691988
29	NC_022529	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549691988
30	NC_022529	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549691988
31	NC_022529	A	8	8	1653	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	549691988
32	NC_022529	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549691988
33	NC_022529	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549691988
34	NC_022529	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549691988
35	NC_022529	GTT	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549691988
36	NC_022529	T	6	6	1764	1769	0 %	100 %	0 %	0 %	549691988
37	NC_022529	A	6	6	1781	1786	100 %	0 %	0 %	0 %	549691988
38	NC_022529	A	6	6	1851	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	549691988
39	NC_022529	ACAA	2	8	1921	1928	75 %	0 %	0 %	25 %	549691988
40	NC_022529	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549691988
41	NC_022529	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549691988
42	NC_022529	A	6	6	2065	2070	100 %	0 %	0 %	0 %	549691988
43	NC_022529	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549691988
44	NC_022529	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	549691988
45	NC_022529	T	6	6	2114	2119	0 %	100 %	0 %	0 %	549691988
46	NC_022529	A	7	7	2269	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	549691988
47	NC_022529	A	6	6	2291	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	549691988
48	NC_022529	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549691988
49	NC_022529	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549691988
50	NC_022529	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549691988
51	NC_022529	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549691988
52	NC_022529	GTAT	2	8	2649	2656	25 %	50 %	25 %	0 %	549691989
53	NC_022529	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549691989
54	NC_022529	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549691989
55	NC_022529	GAAG	2	8	2771	2778	50 %	0 %	50 %	0 %	549691989
56	NC_022529	TAGT	2	8	2784	2791	25 %	50 %	25 %	0 %	549691989
57	NC_022529	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549691989
58	NC_022529	CT	3	6	2951	2956	0 %	50 %	0 %	50 %	549691989
59	NC_022529	A	6	6	2957	2962	100 %	0 %	0 %	0 %	549691989
60	NC_022529	GAAA	2	8	2978	2985	75 %	0 %	25 %	0 %	549691989
61	NC_022529	A	7	7	3056	3062	100 %	0 %	0 %	0 %	549691989
62	NC_022529	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549691989
63	NC_022529	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549691989
64	NC_022529	TAAA	2	8	3258	3265	75 %	25 %	0 %	0 %	549691989
65	NC_022529	A	6	6	3263	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	549691989
66	NC_022529	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549691989
67	NC_022529	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	549691989
68	NC_022529	CT	3	6	3365	3370	0 %	50 %	0 %	50 %	549691989
69	NC_022529	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549691989
70	NC_022529	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549691989
71	NC_022529	AC	3	6	3404	3409	50 %	0 %	0 %	50 %	549691989
72	NC_022529	TA	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	549691989
73	NC_022529	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549691989
74	NC_022529	TGT	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549691989
75	NC_022529	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549691989
76	NC_022529	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549691989
77	NC_022529	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549691989
78	NC_022529	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	549691989
79	NC_022529	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	549691989
80	NC_022529	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549691989
81	NC_022529	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549691989
82	NC_022529	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549691989
83	NC_022529	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549691989
84	NC_022529	ATGA	2	8	4115	4122	50 %	25 %	25 %	0 %	549691989
85	NC_022529	ATTT	2	8	4142	4149	25 %	75 %	0 %	0 %	549691989
86	NC_022529	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549691989
87	NC_022529	A	6	6	4175	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	549691989
88	NC_022529	ATTT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	549691989
89	NC_022529	GAAT	2	8	4272	4279	50 %	25 %	25 %	0 %	549691989
90	NC_022529	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549691989
91	NC_022529	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549691989
92	NC_022529	AATGAA	2	12	4478	4489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549691989
93	NC_022529	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549691989
94	NC_022529	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549691989
95	NC_022529	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549691989
96	NC_022529	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	549691989
97	NC_022529	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549691989
98	NC_022529	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549691989
99	NC_022529	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549691989
100	NC_022529	TTC	2	6	4910	4915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549691990
101	NC_022529	GTTTT	2	10	4921	4930	0 %	80 %	20 %	0 %	549691990
102	NC_022529	TTC	3	9	4952	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549691990
103	NC_022529	ATA	2	6	4980	4985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549691990
104	NC_022529	T	6	6	5006	5011	0 %	100 %	0 %	0 %	549691990
105	NC_022529	CATC	2	8	5055	5062	25 %	25 %	0 %	50 %	549691990
106	NC_022529	GCT	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549691990
107	NC_022529	TGCA	2	8	5091	5098	25 %	25 %	25 %	25 %	549691990
108	NC_022529	AATC	2	8	5169	5176	50 %	25 %	0 %	25 %	549691990
109	NC_022529	T	7	7	5246	5252	0 %	100 %	0 %	0 %	549691990
110	NC_022529	GCAT	2	8	5285	5292	25 %	25 %	25 %	25 %	549691991
111	NC_022529	AT	3	6	5298	5303	50 %	50 %	0 %	0 %	549691991
112	NC_022529	CCT	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549691991
113	NC_022529	ATA	2	6	5378	5383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549691991
114	NC_022529	TTG	2	6	5389	5394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549691991
115	NC_022529	T	6	6	5546	5551	0 %	100 %	0 %	0 %	549691991
116	NC_022529	T	6	6	5692	5697	0 %	100 %	0 %	0 %	549691991
117	NC_022529	ACC	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549691991
118	NC_022529	ACAA	2	8	5771	5778	75 %	0 %	0 %	25 %	549691991
119	NC_022529	CTC	2	6	5872	5877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549691991
120	NC_022529	TTC	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549691991
121	NC_022529	ATA	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549691991
122	NC_022529	CAT	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549691991
123	NC_022529	T	6	6	6117	6122	0 %	100 %	0 %	0 %	549691991
124	NC_022529	TCT	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549691991
125	NC_022529	T	6	6	6143	6148	0 %	100 %	0 %	0 %	549691991
126	NC_022529	TCTT	2	8	6197	6204	0 %	75 %	0 %	25 %	549691991
127	NC_022529	TGG	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549691991
128	NC_022529	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549691991
129	NC_022529	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549691991
130	NC_022529	GATA	2	8	6322	6329	50 %	25 %	25 %	0 %	549691991
131	NC_022529	T	6	6	6335	6340	0 %	100 %	0 %	0 %	549691991
132	NC_022529	A	6	6	6390	6395	100 %	0 %	0 %	0 %	549691991
133	NC_022529	T	6	6	6450	6455	0 %	100 %	0 %	0 %	549691991
134	NC_022529	TCT	2	6	6471	6476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549691991
135	NC_022529	TTGTT	2	10	6483	6492	0 %	80 %	20 %	0 %	549691991
136	NC_022529	TACT	2	8	6713	6720	25 %	50 %	0 %	25 %	549691992
137	NC_022529	GTT	2	6	6739	6744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549691992
138	NC_022529	TGA	2	6	6746	6751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549691992
139	NC_022529	TTTG	2	8	6758	6765	0 %	75 %	25 %	0 %	549691992
140	NC_022529	TTG	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549691992
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254	NC_022529	ATT	2	6	12058	12063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549691993
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265	NC_022529	A	6	6	12638	12643	100 %	0 %	0 %	0 %	549691994
266	NC_022529	T	6	6	12660	12665	0 %	100 %	0 %	0 %	549691994
267	NC_022529	A	7	7	12688	12694	100 %	0 %	0 %	0 %	549691994
268	NC_022529	A	6	6	12748	12753	100 %	0 %	0 %	0 %	549691994
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402	NC_022529	TCT	2	6	19022	19027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549692000
403	NC_022529	TCT	2	6	19031	19036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549692000
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409	NC_022529	A	6	6	19480	19485	100 %	0 %	0 %	0 %	549692001
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