MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 21316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_022441	TTCT	2	8	853340	853347	0 %	75 %	0 %	25 %	545633321
16502	NC_022441	T	6	6	853453	853458	0 %	100 %	0 %	0 %	545633321
16503	NC_022441	TTC	2	6	853479	853484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633321
16504	NC_022441	ACA	2	6	853494	853499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633321
16505	NC_022441	TCT	2	6	853515	853520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633321
16506	NC_022441	AGC	2	6	853570	853575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633321
16507	NC_022441	TGA	2	6	853596	853601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633321
16508	NC_022441	TCC	2	6	853649	853654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633321
16509	NC_022441	GCA	2	6	853689	853694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633321
16510	NC_022441	TCA	2	6	853726	853731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633321
16511	NC_022441	CTT	2	6	853807	853812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633321
16512	NC_022441	A	6	6	853815	853820	100 %	0 %	0 %	0 %	545633321
16513	NC_022441	GAG	2	6	853868	853873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633321
16514	NC_022441	CGT	2	6	853962	853967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633321
16515	NC_022441	AGA	2	6	854051	854056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633321
16516	NC_022441	TCA	4	12	854094	854105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633321
16517	NC_022441	ATC	2	6	854112	854117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633321
16518	NC_022441	ATA	2	6	854118	854123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633321
16519	NC_022441	CT	3	6	854163	854168	0 %	50 %	0 %	50 %	545633321
16520	NC_022441	TCT	2	6	854460	854465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633322
16521	NC_022441	A	6	6	854490	854495	100 %	0 %	0 %	0 %	545633322
16522	NC_022441	CTT	2	6	854504	854509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633322
16523	NC_022441	AAG	2	6	854554	854559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633322
16524	NC_022441	CAGG	2	8	854592	854599	25 %	0 %	50 %	25 %	545633322
16525	NC_022441	CTT	2	6	854616	854621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633322
16526	NC_022441	A	7	7	854695	854701	100 %	0 %	0 %	0 %	545633322
16527	NC_022441	ATA	2	6	854731	854736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633322
16528	NC_022441	TAC	2	6	854775	854780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633322
16529	NC_022441	GAA	3	9	854829	854837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633322
16530	NC_022441	ATT	2	6	854852	854857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633322
16531	NC_022441	GGA	2	6	854916	854921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633322
16532	NC_022441	CTT	2	6	854967	854972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633322
16533	NC_022441	GAT	2	6	855120	855125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633322
16534	NC_022441	AGA	2	6	855239	855244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633322
16535	NC_022441	ATC	2	6	855403	855408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633322
16536	NC_022441	ATA	2	6	855643	855648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633322
16537	NC_022441	TGC	2	6	855653	855658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633322
16538	NC_022441	CTTT	2	8	855695	855702	0 %	75 %	0 %	25 %	545633322
16539	NC_022441	ATC	2	6	855721	855726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633322
16540	NC_022441	TTC	2	6	855767	855772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633323
16541	NC_022441	CAA	2	6	855784	855789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633323
16542	NC_022441	GA	3	6	855808	855813	50 %	0 %	50 %	0 %	545633323
16543	NC_022441	AGA	2	6	855872	855877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633323
16544	NC_022441	AAT	2	6	855962	855967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633323
16545	NC_022441	GA	3	6	855985	855990	50 %	0 %	50 %	0 %	545633323
16546	NC_022441	CTG	2	6	856012	856017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633323
16547	NC_022441	AGA	2	6	856052	856057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633323
16548	NC_022441	AAC	2	6	856133	856138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633323
16549	NC_022441	ATTGC	2	10	856164	856173	20 %	40 %	20 %	20 %	545633323
16550	NC_022441	CTTC	2	8	856195	856202	0 %	50 %	0 %	50 %	545633323
16551	NC_022441	TCT	2	6	856224	856229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633323
16552	NC_022441	ACG	2	6	856266	856271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633323
16553	NC_022441	TGC	2	6	856313	856318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633323
16554	NC_022441	AAT	2	6	856394	856399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633323
16555	NC_022441	CCGATA	2	12	856431	856442	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545633323
16556	NC_022441	CCA	2	6	856446	856451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545633323
16557	NC_022441	CTATAG	2	12	856645	856656	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545633323
16558	NC_022441	CAT	2	6	856786	856791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633323
16559	NC_022441	A	6	6	856928	856933	100 %	0 %	0 %	0 %	545633323
16560	NC_022441	A	6	6	856940	856945	100 %	0 %	0 %	0 %	545633323
16561	NC_022441	TCA	2	6	856947	856952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633323
16562	NC_022441	AAT	2	6	856957	856962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633323
16563	NC_022441	T	7	7	857141	857147	0 %	100 %	0 %	0 %	545633323
16564	NC_022441	CTA	2	6	857176	857181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633323
16565	NC_022441	AGT	2	6	857192	857197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633323
16566	NC_022441	TAAA	2	8	857200	857207	75 %	25 %	0 %	0 %	545633323
16567	NC_022441	AAT	2	6	857527	857532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633324
16568	NC_022441	TAC	2	6	857601	857606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633324
16569	NC_022441	TC	3	6	857610	857615	0 %	50 %	0 %	50 %	545633324
16570	NC_022441	TCT	3	9	857633	857641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633324
16571	NC_022441	CTCC	2	8	857645	857652	0 %	25 %	0 %	75 %	545633324
16572	NC_022441	ATC	2	6	857663	857668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633324
16573	NC_022441	CCA	2	6	857744	857749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545633324
16574	NC_022441	CA	3	6	857755	857760	50 %	0 %	0 %	50 %	545633324
16575	NC_022441	GA	3	6	857826	857831	50 %	0 %	50 %	0 %	545633324
16576	NC_022441	GATG	2	8	857853	857860	25 %	25 %	50 %	0 %	545633324
16577	NC_022441	ATG	2	6	857870	857875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633324
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16580	NC_022441	CTG	2	6	858018	858023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633324
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16593	NC_022441	TTG	2	6	858563	858568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633325
16594	NC_022441	GCA	2	6	858603	858608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633325
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16596	NC_022441	TAGC	2	8	858646	858653	25 %	25 %	25 %	25 %	545633325
16597	NC_022441	TTGCT	2	10	858713	858722	0 %	60 %	20 %	20 %	545633325
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16602	NC_022441	T	6	6	858905	858910	0 %	100 %	0 %	0 %	545633325
16603	NC_022441	CTCCA	2	10	858945	858954	20 %	20 %	0 %	60 %	545633325
16604	NC_022441	GAA	2	6	859012	859017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633325
16605	NC_022441	ATA	2	6	859127	859132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633325
16606	NC_022441	CTA	2	6	859147	859152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633325
16607	NC_022441	GA	3	6	859156	859161	50 %	0 %	50 %	0 %	545633325
16608	NC_022441	TTAGT	2	10	859225	859234	20 %	60 %	20 %	0 %	545633325
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16620	NC_022441	TCT	2	6	859583	859588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633326
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