MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 21316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022441	AAGG	2	8	623290	623297	50 %	0 %	50 %	0 %	545633133
12002	NC_022441	CAT	2	6	623303	623308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633133
12003	NC_022441	CCT	2	6	623458	623463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633133
12004	NC_022441	A	6	6	623623	623628	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
12005	NC_022441	GAA	2	6	623637	623642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
12006	NC_022441	GTG	2	6	623687	623692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545633133
12007	NC_022441	T	6	6	623854	623859	0 %	100 %	0 %	0 %	545633133
12008	NC_022441	ACTC	2	8	623894	623901	25 %	25 %	0 %	50 %	545633133
12009	NC_022441	AGA	2	6	623906	623911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
12010	NC_022441	A	6	6	623987	623992	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
12011	NC_022441	ATCTC	2	10	624015	624024	20 %	40 %	0 %	40 %	545633133
12012	NC_022441	CAT	2	6	624063	624068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633133
12013	NC_022441	TCT	2	6	624094	624099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
12014	NC_022441	ATA	2	6	624223	624228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633133
12015	NC_022441	TGA	2	6	624238	624243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633133
12016	NC_022441	GAA	2	6	624256	624261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
12017	NC_022441	GAG	2	6	624292	624297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633133
12018	NC_022441	TC	3	6	624376	624381	0 %	50 %	0 %	50 %	545633133
12019	NC_022441	CTG	2	6	624384	624389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633133
12020	NC_022441	GATAC	2	10	624462	624471	40 %	20 %	20 %	20 %	545633133
12021	NC_022441	ACA	2	6	624604	624609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633133
12022	NC_022441	TTC	2	6	624696	624701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
12023	NC_022441	CTT	2	6	624752	624757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
12024	NC_022441	GAT	2	6	624762	624767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633133
12025	NC_022441	GAAC	2	8	624783	624790	50 %	0 %	25 %	25 %	545633133
12026	NC_022441	TAG	2	6	624817	624822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633133
12027	NC_022441	TC	3	6	624832	624837	0 %	50 %	0 %	50 %	545633133
12028	NC_022441	AG	3	6	624855	624860	50 %	0 %	50 %	0 %	545633133
12029	NC_022441	ACA	2	6	624927	624932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633133
12030	NC_022441	AACTA	2	10	624943	624952	60 %	20 %	0 %	20 %	545633133
12031	NC_022441	TGT	2	6	625022	625027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633133
12032	NC_022441	GCCT	2	8	625096	625103	0 %	25 %	25 %	50 %	545633133
12033	NC_022441	CAA	2	6	625108	625113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633133
12034	NC_022441	CTA	3	9	625124	625132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633133
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12037	NC_022441	CA	3	6	625466	625471	50 %	0 %	0 %	50 %	545633133
12038	NC_022441	CTA	2	6	625643	625648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633133
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12040	NC_022441	TCT	2	6	625789	625794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
12041	NC_022441	A	6	6	625887	625892	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
12042	NC_022441	TGA	2	6	625895	625900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633133
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12044	NC_022441	TAT	2	6	626054	626059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633134
12045	NC_022441	CTG	2	6	626082	626087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633134
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12048	NC_022441	GAAG	2	8	626189	626196	50 %	0 %	50 %	0 %	545633134
12049	NC_022441	GAG	2	6	626204	626209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633134
12050	NC_022441	CTT	2	6	626281	626286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633134
12051	NC_022441	TGC	2	6	626302	626307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633134
12052	NC_022441	TCAAA	2	10	626343	626352	60 %	20 %	0 %	20 %	545633134
12053	NC_022441	TCA	2	6	626396	626401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633134
12054	NC_022441	T	6	6	626473	626478	0 %	100 %	0 %	0 %	545633134
12055	NC_022441	ATT	2	6	626485	626490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633134
12056	NC_022441	AAT	2	6	626500	626505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633134
12057	NC_022441	T	6	6	626524	626529	0 %	100 %	0 %	0 %	545633134
12058	NC_022441	A	6	6	626545	626550	100 %	0 %	0 %	0 %	545633134
12059	NC_022441	T	6	6	626553	626558	0 %	100 %	0 %	0 %	545633134
12060	NC_022441	A	6	6	626565	626570	100 %	0 %	0 %	0 %	545633134
12061	NC_022441	TTG	2	6	626602	626607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633134
12062	NC_022441	AAT	2	6	626608	626613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633134
12063	NC_022441	T	6	6	626645	626650	0 %	100 %	0 %	0 %	545633134
12064	NC_022441	TCT	2	6	626675	626680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633134
12065	NC_022441	AAG	2	6	626800	626805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633134
12066	NC_022441	TCT	2	6	626832	626837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633134
12067	NC_022441	CCT	2	6	626852	626857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633134
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12070	NC_022441	CCACTA	2	12	627104	627115	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545633134
12071	NC_022441	TAC	2	6	627150	627155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633134
12072	NC_022441	CT	3	6	627160	627165	0 %	50 %	0 %	50 %	545633134
12073	NC_022441	AGG	2	6	627172	627177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633134
12074	NC_022441	TAGGGA	2	12	627178	627189	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545633134
12075	NC_022441	GTT	2	6	627237	627242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633134
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12077	NC_022441	GGTG	2	8	627266	627273	0 %	25 %	75 %	0 %	545633134
12078	NC_022441	ACG	3	9	627277	627285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633134
12079	NC_022441	C	12	12	627307	627318	0 %	0 %	0 %	100 %	545633134
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12084	NC_022441	TCT	2	6	628792	628797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633135
12085	NC_022441	A	7	7	628866	628872	100 %	0 %	0 %	0 %	545633135
12086	NC_022441	GAG	2	6	628886	628891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633135
12087	NC_022441	CTT	2	6	628921	628926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633135
12088	NC_022441	CAT	2	6	628931	628936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633135
12089	NC_022441	CTG	2	6	628995	629000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633135
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12091	NC_022441	A	6	6	629045	629050	100 %	0 %	0 %	0 %	545633135
12092	NC_022441	TAT	2	6	629093	629098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633135
12093	NC_022441	GAAC	2	8	629143	629150	50 %	0 %	25 %	25 %	545633135
12094	NC_022441	AATA	2	8	629160	629167	75 %	25 %	0 %	0 %	545633135
12095	NC_022441	CGCATA	2	12	629232	629243	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545633135
12096	NC_022441	T	8	8	629287	629294	0 %	100 %	0 %	0 %	545633135
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12099	NC_022441	AATAA	2	10	629383	629392	80 %	20 %	0 %	0 %	545633135
12100	NC_022441	ACA	2	6	629542	629547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633135
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12102	NC_022441	ATG	2	6	629636	629641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633135
12103	NC_022441	TAC	2	6	629658	629663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633135
12104	NC_022441	CAAT	2	8	629683	629690	50 %	25 %	0 %	25 %	545633136
12105	NC_022441	AGG	2	6	629717	629722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633136
12106	NC_022441	ATA	2	6	629775	629780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633136
12107	NC_022441	ATT	2	6	629795	629800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633136
12108	NC_022441	AGA	2	6	629828	629833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633136
12109	NC_022441	A	6	6	629833	629838	100 %	0 %	0 %	0 %	545633136
12110	NC_022441	TTC	2	6	629853	629858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633136
12111	NC_022441	TAC	2	6	629867	629872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633136
12112	NC_022441	CCAAA	2	10	629918	629927	60 %	0 %	0 %	40 %	545633136
12113	NC_022441	CTT	2	6	629950	629955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633136
12114	NC_022441	CTC	2	6	630035	630040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633136
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12116	NC_022441	GAA	2	6	630160	630165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633136
12117	NC_022441	ACA	2	6	630229	630234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633136
12118	NC_022441	TCT	2	6	630316	630321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633136
12119	NC_022441	ACC	2	6	630325	630330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545633136
12120	NC_022441	A	6	6	630451	630456	100 %	0 %	0 %	0 %	545633137
12121	NC_022441	AGA	2	6	630469	630474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633137
12122	NC_022441	ACA	2	6	630479	630484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633137
12123	NC_022441	ATA	2	6	630494	630499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633137
12124	NC_022441	GAA	2	6	630510	630515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633137
12125	NC_022441	CTT	2	6	630547	630552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633137
12126	NC_022441	TCT	2	6	630590	630595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633137
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12132	NC_022441	CTT	2	6	630725	630730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633137
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12143	NC_022441	AAAATA	2	12	631192	631203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545633137
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12152	NC_022441	T	6	6	632133	632138	0 %	100 %	0 %	0 %	545633138
12153	NC_022441	CTT	2	6	632205	632210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633138
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12201	NC_022441	TCAA	2	8	635212	635219	50 %	25 %	0 %	25 %	545633142
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12210	NC_022441	TCT	2	6	635603	635608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633142
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12213	NC_022441	TTA	2	6	635720	635725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633142
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12222	NC_022441	AGC	2	6	635995	636000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633142
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12224	NC_022441	AGC	2	6	636010	636015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633142
12225	NC_022441	GCTCCA	2	12	636026	636037	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545633142
12226	NC_022441	GCTCCA	2	12	636041	636052	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545633142
12227	NC_022441	GCTCCA	2	12	636056	636067	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545633142
12228	NC_022441	GCTCCA	2	12	636071	636082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545633142
12229	NC_022441	GCTCCA	2	12	636086	636097	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545633142
12230	NC_022441	GCTCCA	2	12	636101	636112	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545633142
12231	NC_022441	GCTCCA	2	12	636116	636127	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545633142
12232	NC_022441	GCTCCA	2	12	636131	636142	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545633142
12233	NC_022441	GCTCCA	2	12	636146	636157	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545633142
12234	NC_022441	GCTCCA	2	12	636161	636172	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545633142
12235	NC_022441	GCTCCA	2	12	636176	636187	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545633142
12236	NC_022441	AAT	2	6	636203	636208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633142
12237	NC_022441	CTT	2	6	636222	636227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633142
12238	NC_022441	A	6	6	636228	636233	100 %	0 %	0 %	0 %	545633142
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12240	NC_022441	AG	3	6	636483	636488	50 %	0 %	50 %	0 %	545633143
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12401	NC_022441	TCAT	2	8	644175	644182	25 %	50 %	0 %	25 %	545633148
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12457	NC_022441	AAG	2	6	647252	647257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633151
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12463	NC_022441	TTTC	2	8	647497	647504	0 %	75 %	0 %	25 %	545633151
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12469	NC_022441	CGAT	2	8	647735	647742	25 %	25 %	25 %	25 %	545633151
12470	NC_022441	CTT	2	6	647920	647925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633152
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12472	NC_022441	TGC	2	6	647941	647946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633152
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12476	NC_022441	CT	4	8	648488	648495	0 %	50 %	0 %	50 %	545633152
12477	NC_022441	AAC	2	6	648536	648541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633152
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12480	NC_022441	AAAAT	2	10	648665	648674	80 %	20 %	0 %	0 %	545633152
12481	NC_022441	CCT	2	6	648688	648693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633152
12482	NC_022441	G	6	6	648695	648700	0 %	0 %	100 %	0 %	545633152
12483	NC_022441	CAA	2	6	648770	648775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633152
12484	NC_022441	CTC	2	6	648781	648786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633152
12485	NC_022441	CAA	2	6	648849	648854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633152
12486	NC_022441	GAT	2	6	648856	648861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633152
12487	NC_022441	CAAA	2	8	648912	648919	75 %	0 %	0 %	25 %	545633152
12488	NC_022441	CTTC	2	8	648943	648950	0 %	50 %	0 %	50 %	545633152
12489	NC_022441	AGA	2	6	648969	648974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633152
12490	NC_022441	GAA	2	6	648991	648996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633152
12491	NC_022441	AGA	2	6	649023	649028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633152
12492	NC_022441	AGA	2	6	649038	649043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633152
12493	NC_022441	AAGAA	2	10	649140	649149	80 %	0 %	20 %	0 %	545633152
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12497	NC_022441	CTT	2	6	649218	649223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633152
12498	NC_022441	TCCA	2	8	649409	649416	25 %	25 %	0 %	50 %	545633152
12499	NC_022441	TGC	2	6	649473	649478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633152
12500	NC_022441	T	7	7	649575	649581	0 %	100 %	0 %	0 %	545633153

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