MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 21316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022441	ATG	2	6	23040	23045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632617
502	NC_022441	CCT	2	6	23084	23089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632617
503	NC_022441	TGGA	2	8	23166	23173	25 %	25 %	50 %	0 %	545632617
504	NC_022441	GCT	2	6	23180	23185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632617
505	NC_022441	CTTT	2	8	23201	23208	0 %	75 %	0 %	25 %	545632617
506	NC_022441	CA	3	6	23218	23223	50 %	0 %	0 %	50 %	545632617
507	NC_022441	TGT	2	6	23562	23567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632618
508	NC_022441	TTG	2	6	23574	23579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632618
509	NC_022441	AATCC	2	10	23679	23688	40 %	20 %	0 %	40 %	545632618
510	NC_022441	ATT	2	6	23730	23735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632618
511	NC_022441	ATC	2	6	23845	23850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632618
512	NC_022441	AG	3	6	23902	23907	50 %	0 %	50 %	0 %	545632618
513	NC_022441	CAC	2	6	23999	24004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545632618
514	NC_022441	CTT	2	6	24020	24025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632618
515	NC_022441	GTA	2	6	24054	24059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632618
516	NC_022441	GATA	2	8	24087	24094	50 %	25 %	25 %	0 %	545632618
517	NC_022441	TGC	2	6	24114	24119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632618
518	NC_022441	GTT	2	6	24123	24128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632618
519	NC_022441	AATT	2	8	24131	24138	50 %	50 %	0 %	0 %	545632618
520	NC_022441	TTAA	2	8	24142	24149	50 %	50 %	0 %	0 %	545632618
521	NC_022441	TGCT	2	8	24165	24172	0 %	50 %	25 %	25 %	545632618
522	NC_022441	TAAA	2	8	24199	24206	75 %	25 %	0 %	0 %	545632618
523	NC_022441	TGT	2	6	24325	24330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632618
524	NC_022441	GCT	2	6	24352	24357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632618
525	NC_022441	TTG	2	6	24366	24371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632618
526	NC_022441	CACCTA	2	12	24413	24424	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545632618
527	NC_022441	ATTT	2	8	24443	24450	25 %	75 %	0 %	0 %	545632618
528	NC_022441	T	7	7	24472	24478	0 %	100 %	0 %	0 %	545632618
529	NC_022441	ATA	2	6	24483	24488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632618
530	NC_022441	A	6	6	24544	24549	100 %	0 %	0 %	0 %	545632618
531	NC_022441	TGT	2	6	24550	24555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632618
532	NC_022441	T	6	6	24563	24568	0 %	100 %	0 %	0 %	545632618
533	NC_022441	TATG	2	8	24620	24627	25 %	50 %	25 %	0 %	545632618
534	NC_022441	AGT	2	6	24629	24634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632618
535	NC_022441	CCAA	2	8	24669	24676	50 %	0 %	0 %	50 %	545632618
536	NC_022441	TCC	2	6	24687	24692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632618
537	NC_022441	GTAT	2	8	24726	24733	25 %	50 %	25 %	0 %	545632618
538	NC_022441	AGA	2	6	24736	24741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632618
539	NC_022441	T	6	6	24743	24748	0 %	100 %	0 %	0 %	545632618
540	NC_022441	CATAAG	2	12	24767	24778	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545632618
541	NC_022441	AGC	2	6	24792	24797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632618
542	NC_022441	TCCA	2	8	24874	24881	25 %	25 %	0 %	50 %	545632618
543	NC_022441	GTT	2	6	24920	24925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632618
544	NC_022441	CTTTT	2	10	24935	24944	0 %	80 %	0 %	20 %	545632618
545	NC_022441	ATTAAG	2	12	24969	24980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545632618
546	NC_022441	TGC	2	6	25023	25028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632618
547	NC_022441	TTG	2	6	25063	25068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632618
548	NC_022441	TCC	2	6	25173	25178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632618
549	NC_022441	AAG	2	6	25181	25186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632618
550	NC_022441	CTT	2	6	25250	25255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632618
551	NC_022441	TGA	2	6	25322	25327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632618
552	NC_022441	AAG	2	6	25353	25358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632618
553	NC_022441	AGG	2	6	25397	25402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632618
554	NC_022441	GCT	2	6	25411	25416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632618
555	NC_022441	TCT	2	6	25435	25440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632618
556	NC_022441	GT	3	6	25442	25447	0 %	50 %	50 %	0 %	545632618
557	NC_022441	TCTG	2	8	25474	25481	0 %	50 %	25 %	25 %	545632618
558	NC_022441	CTG	2	6	25496	25501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632618
559	NC_022441	AAG	2	6	25589	25594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632618
560	NC_022441	AAG	2	6	25614	25619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632618
561	NC_022441	TGT	2	6	25626	25631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632618
562	NC_022441	CGC	2	6	25722	25727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545632618
563	NC_022441	T	6	6	25797	25802	0 %	100 %	0 %	0 %	545632618
564	NC_022441	AGA	2	6	25806	25811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632618
565	NC_022441	TAA	2	6	25850	25855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632618
566	NC_022441	TTC	2	6	25929	25934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632618
567	NC_022441	AGA	2	6	26040	26045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632618
568	NC_022441	AGA	2	6	26049	26054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632618
569	NC_022441	ATG	2	6	26263	26268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632619
570	NC_022441	TTC	2	6	26274	26279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632619
571	NC_022441	AGA	2	6	26296	26301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632619
572	NC_022441	TCTT	2	8	26313	26320	0 %	75 %	0 %	25 %	545632619
573	NC_022441	CAG	2	6	26335	26340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
574	NC_022441	CAG	2	6	26344	26349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
575	NC_022441	TTA	2	6	26350	26355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632619
576	NC_022441	ATT	2	6	26380	26385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632619
577	NC_022441	AG	3	6	26460	26465	50 %	0 %	50 %	0 %	545632619
578	NC_022441	GCAGA	2	10	26482	26491	40 %	0 %	40 %	20 %	545632619
579	NC_022441	TCT	3	9	26545	26553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632619
580	NC_022441	CAGGGA	2	12	26582	26593	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	545632619
581	NC_022441	TAT	2	6	26620	26625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632619
582	NC_022441	GAA	2	6	26649	26654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632619
583	NC_022441	TCA	2	6	26657	26662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632619
584	NC_022441	GGA	2	6	26721	26726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632619
585	NC_022441	TAA	2	6	26730	26735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632619
586	NC_022441	GAAT	2	8	26883	26890	50 %	25 %	25 %	0 %	545632619
587	NC_022441	TAC	2	6	26991	26996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632619
588	NC_022441	T	7	7	27011	27017	0 %	100 %	0 %	0 %	545632619
589	NC_022441	GA	3	6	27101	27106	50 %	0 %	50 %	0 %	545632619
590	NC_022441	CAG	3	9	27424	27432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
591	NC_022441	CAA	2	6	27542	27547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632619
592	NC_022441	GCA	3	9	27574	27582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
593	NC_022441	ACA	2	6	27676	27681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632619
594	NC_022441	ATAC	2	8	27689	27696	50 %	25 %	0 %	25 %	545632619
595	NC_022441	TAT	2	6	27749	27754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632619
596	NC_022441	TTC	2	6	27776	27781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632619
597	NC_022441	ACT	2	6	27817	27822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632619
598	NC_022441	AGC	2	6	27852	27857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
599	NC_022441	GAG	2	6	27889	27894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632619
600	NC_022441	CAG	2	6	27946	27951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
601	NC_022441	TTG	2	6	27953	27958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632619
602	NC_022441	CAAG	2	8	27961	27968	50 %	0 %	25 %	25 %	545632619
603	NC_022441	GC	3	6	27975	27980	0 %	0 %	50 %	50 %	545632619
604	NC_022441	CTTC	2	8	27988	27995	0 %	50 %	0 %	50 %	545632619
605	NC_022441	CTT	2	6	28044	28049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632619
606	NC_022441	TTC	2	6	28089	28094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632619
607	NC_022441	GAT	2	6	28107	28112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632619
608	NC_022441	CTG	2	6	28181	28186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632619
609	NC_022441	CTGGGT	2	12	28193	28204	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	545632619
610	NC_022441	GGA	2	6	28207	28212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632619
611	NC_022441	AG	3	6	28236	28241	50 %	0 %	50 %	0 %	545632619
612	NC_022441	AGC	2	6	28275	28280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
613	NC_022441	AGC	2	6	28290	28295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
614	NC_022441	AAC	2	6	28367	28372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632619
615	NC_022441	ACG	2	6	28375	28380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
616	NC_022441	GGT	2	6	28510	28515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632619
617	NC_022441	AGA	2	6	28548	28553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632619
618	NC_022441	CGA	2	6	28613	28618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
619	NC_022441	CAA	2	6	28630	28635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632619
620	NC_022441	GCA	2	6	28695	28700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
621	NC_022441	GTT	2	6	28711	28716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632619
622	NC_022441	AAG	2	6	28761	28766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632619
623	NC_022441	CA	3	6	28880	28885	50 %	0 %	0 %	50 %	545632620
624	NC_022441	CTT	2	6	28962	28967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632620
625	NC_022441	AAT	2	6	29092	29097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632621
626	NC_022441	ATC	2	6	29121	29126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632621
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628	NC_022441	ATA	2	6	29163	29168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632621
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751	NC_022441	AAAGA	2	10	35541	35550	80 %	0 %	20 %	0 %	545632629
752	NC_022441	AG	3	6	35571	35576	50 %	0 %	50 %	0 %	545632629
753	NC_022441	T	7	7	35730	35736	0 %	100 %	0 %	0 %	545632629
754	NC_022441	TAA	2	6	35758	35763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632629
755	NC_022441	CTTG	2	8	35857	35864	0 %	50 %	25 %	25 %	545632629
756	NC_022441	TTAA	2	8	35871	35878	50 %	50 %	0 %	0 %	545632629
757	NC_022441	GTTT	2	8	35905	35912	0 %	75 %	25 %	0 %	545632629
758	NC_022441	GAA	2	6	35937	35942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632629
759	NC_022441	TTC	2	6	35997	36002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632629
760	NC_022441	A	6	6	36005	36010	100 %	0 %	0 %	0 %	545632629
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763	NC_022441	GAA	2	6	36155	36160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632629
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773	NC_022441	ATG	2	6	36669	36674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632629
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801	NC_022441	TAA	2	6	38566	38571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632631
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874	NC_022441	A	6	6	42021	42026	100 %	0 %	0 %	0 %	545632635
875	NC_022441	TTC	2	6	42047	42052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632635
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880	NC_022441	ATG	2	6	42199	42204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632635
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882	NC_022441	AGAGC	2	10	42252	42261	40 %	0 %	40 %	20 %	545632635
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884	NC_022441	AGG	2	6	42529	42534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632636
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