MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 21316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_022441	TAT	2	6	282552	282557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632861
5503	NC_022441	AGA	2	6	282606	282611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632861
5504	NC_022441	CAA	2	6	283023	283028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632862
5505	NC_022441	AG	3	6	283034	283039	50 %	0 %	50 %	0 %	545632862
5506	NC_022441	G	6	6	283116	283121	0 %	0 %	100 %	0 %	545632862
5507	NC_022441	CGC	2	6	283141	283146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545632862
5508	NC_022441	GGA	2	6	283172	283177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632862
5509	NC_022441	TCT	2	6	283182	283187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632862
5510	NC_022441	TTCT	2	8	283222	283229	0 %	75 %	0 %	25 %	545632862
5511	NC_022441	AGAA	2	8	283239	283246	75 %	0 %	25 %	0 %	545632862
5512	NC_022441	TTA	2	6	283258	283263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632862
5513	NC_022441	AGA	2	6	283271	283276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632862
5514	NC_022441	AGG	2	6	283292	283297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632862
5515	NC_022441	AAG	2	6	283372	283377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632862
5516	NC_022441	ATC	2	6	283386	283391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632862
5517	NC_022441	GCT	2	6	283404	283409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632862
5518	NC_022441	TCC	2	6	283597	283602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632862
5519	NC_022441	GTGTT	2	10	283606	283615	0 %	60 %	40 %	0 %	545632862
5520	NC_022441	CGT	2	6	283656	283661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632862
5521	NC_022441	GCT	2	6	283662	283667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632862
5522	NC_022441	TGT	4	12	283686	283697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632862
5523	NC_022441	GGA	2	6	283701	283706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632862
5524	NC_022441	GAT	3	9	283707	283715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632862
5525	NC_022441	AGA	2	6	283790	283795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632862
5526	NC_022441	GACA	2	8	283817	283824	50 %	0 %	25 %	25 %	545632862
5527	NC_022441	CAG	2	6	283840	283845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632862
5528	NC_022441	AAG	2	6	283900	283905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632862
5529	NC_022441	GTG	2	6	283918	283923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632862
5530	NC_022441	ATG	2	6	283924	283929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632862
5531	NC_022441	AT	3	6	283935	283940	50 %	50 %	0 %	0 %	545632862
5532	NC_022441	AAG	2	6	283970	283975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632862
5533	NC_022441	TCC	3	9	283980	283988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632862
5534	NC_022441	ATAG	2	8	283998	284005	50 %	25 %	25 %	0 %	545632862
5535	NC_022441	TTC	2	6	284030	284035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632862
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5538	NC_022441	T	6	6	284074	284079	0 %	100 %	0 %	0 %	545632862
5539	NC_022441	CCT	2	6	284097	284102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632862
5540	NC_022441	TCC	2	6	284117	284122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632862
5541	NC_022441	CAG	2	6	284209	284214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632862
5542	NC_022441	TCC	2	6	284234	284239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632862
5543	NC_022441	TCC	2	6	284243	284248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632862
5544	NC_022441	GAA	2	6	284295	284300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632862
5545	NC_022441	TAA	2	6	284348	284353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632862
5546	NC_022441	AGG	3	9	284410	284418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632862
5547	NC_022441	TCC	2	6	284450	284455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632862
5548	NC_022441	TCC	2	6	284543	284548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632862
5549	NC_022441	CTG	2	6	284695	284700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632862
5550	NC_022441	AGCTAT	2	12	284750	284761	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632862
5551	NC_022441	GCG	2	6	284793	284798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545632862
5552	NC_022441	TGCT	2	8	284803	284810	0 %	50 %	25 %	25 %	545632862
5553	NC_022441	A	6	6	284821	284826	100 %	0 %	0 %	0 %	545632862
5554	NC_022441	TCA	2	6	284874	284879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632862
5555	NC_022441	TTA	2	6	284911	284916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632862
5556	NC_022441	TCT	2	6	284931	284936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632862
5557	NC_022441	AAG	2	6	285044	285049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632863
5558	NC_022441	TGT	2	6	285127	285132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632863
5559	NC_022441	TCC	2	6	285139	285144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632863
5560	NC_022441	GTG	2	6	285158	285163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632863
5561	NC_022441	TGCG	2	8	285239	285246	0 %	25 %	50 %	25 %	545632863
5562	NC_022441	GTAA	2	8	285414	285421	50 %	25 %	25 %	0 %	545632863
5563	NC_022441	GCA	2	6	285581	285586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632863
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5565	NC_022441	TTG	2	6	285687	285692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632863
5566	NC_022441	GCA	2	6	285890	285895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632863
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5570	NC_022441	GAAA	2	8	286065	286072	75 %	0 %	25 %	0 %	545632863
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5573	NC_022441	TCG	3	9	286175	286183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632863
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5575	NC_022441	AGT	2	6	286237	286242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632863
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5578	NC_022441	GTAATT	2	12	286334	286345	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545632863
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5589	NC_022441	TTA	2	6	286742	286747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632863
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5606	NC_022441	T	6	6	287327	287332	0 %	100 %	0 %	0 %	545632863
5607	NC_022441	GAA	2	6	287429	287434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632863
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5609	NC_022441	GTA	2	6	287486	287491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632863
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5612	NC_022441	CTTTT	2	10	287572	287581	0 %	80 %	0 %	20 %	545632863
5613	NC_022441	TTA	2	6	287597	287602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632863
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5621	NC_022441	AG	3	6	288081	288086	50 %	0 %	50 %	0 %	545632864
5622	NC_022441	AAGC	2	8	288096	288103	50 %	0 %	25 %	25 %	545632864
5623	NC_022441	CTT	2	6	288219	288224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632864
5624	NC_022441	GTAGC	2	10	288258	288267	20 %	20 %	40 %	20 %	545632864
5625	NC_022441	GTT	2	6	288275	288280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632864
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5627	NC_022441	GTATGC	2	12	288394	288405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545632864
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5647	NC_022441	GAA	2	6	289321	289326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632864
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5991	NC_022441	CAA	2	6	306531	306536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632871
5992	NC_022441	ACTCA	2	10	306556	306565	40 %	20 %	0 %	40 %	545632871
5993	NC_022441	TCT	2	6	306722	306727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632871
5994	NC_022441	GAGAA	2	10	306763	306772	60 %	0 %	40 %	0 %	545632871
5995	NC_022441	CTC	2	6	306775	306780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632871
5996	NC_022441	TTTA	2	8	306793	306800	25 %	75 %	0 %	0 %	545632871
5997	NC_022441	CCTT	2	8	306815	306822	0 %	50 %	0 %	50 %	545632871
5998	NC_022441	TCT	2	6	306896	306901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632871
5999	NC_022441	GTCT	2	8	306961	306968	0 %	50 %	25 %	25 %	545632871
6000	NC_022441	GTA	2	6	306989	306994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632871

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