MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 21186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_022439	CTCCA	2	10	857111	857120	20 %	20 %	0 %	60 %	545631473
16502	NC_022439	GAA	2	6	857178	857183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631473
16503	NC_022439	ATA	2	6	857293	857298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631473
16504	NC_022439	CTA	2	6	857313	857318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631473
16505	NC_022439	GA	3	6	857322	857327	50 %	0 %	50 %	0 %	545631473
16506	NC_022439	TCC	2	6	857417	857422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631473
16507	NC_022439	ACG	2	6	857438	857443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631473
16508	NC_022439	CCA	2	6	857444	857449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631473
16509	NC_022439	TCC	2	6	857461	857466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631473
16510	NC_022439	TAC	2	6	857485	857490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631473
16511	NC_022439	ATCC	2	8	857497	857504	25 %	25 %	0 %	50 %	545631473
16512	NC_022439	GAA	2	6	857540	857545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631473
16513	NC_022439	AGG	2	6	857557	857562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631473
16514	NC_022439	TTC	2	6	857699	857704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631474
16515	NC_022439	CAA	2	6	857707	857712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631474
16516	NC_022439	A	9	9	857728	857736	100 %	0 %	0 %	0 %	545631474
16517	NC_022439	CT	3	6	857738	857743	0 %	50 %	0 %	50 %	545631474
16518	NC_022439	TCT	2	6	857749	857754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631474
16519	NC_022439	ATT	2	6	857870	857875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631474
16520	NC_022439	TTG	2	6	858033	858038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631474
16521	NC_022439	GCT	2	6	858078	858083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631474
16522	NC_022439	GTTT	2	8	858106	858113	0 %	75 %	25 %	0 %	545631474
16523	NC_022439	CTG	2	6	858135	858140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631474
16524	NC_022439	ATG	2	6	858150	858155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631474
16525	NC_022439	CATACC	2	12	858218	858229	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545631474
16526	NC_022439	TAA	2	6	858268	858273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631474
16527	NC_022439	AACA	2	8	858342	858349	75 %	0 %	0 %	25 %	545631474
16528	NC_022439	AAT	2	6	858382	858387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631474
16529	NC_022439	AGG	2	6	858415	858420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631474
16530	NC_022439	AGA	3	9	858569	858577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631475
16531	NC_022439	ATTAC	2	10	858609	858618	40 %	40 %	0 %	20 %	545631475
16532	NC_022439	AAAG	2	8	858642	858649	75 %	0 %	25 %	0 %	545631475
16533	NC_022439	GCA	2	6	858684	858689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631475
16534	NC_022439	CGT	2	6	858693	858698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631475
16535	NC_022439	GCA	2	6	858714	858719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631475
16536	NC_022439	CAA	2	6	858727	858732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631475
16537	NC_022439	AAC	2	6	858768	858773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631475
16538	NC_022439	AAC	2	6	858806	858811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631475
16539	NC_022439	TAG	2	6	858821	858826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631475
16540	NC_022439	T	6	6	858873	858878	0 %	100 %	0 %	0 %	545631475
16541	NC_022439	TGC	2	6	858917	858922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631475
16542	NC_022439	AGC	2	6	858932	858937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631475
16543	NC_022439	TAC	2	6	858941	858946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631475
16544	NC_022439	AGC	2	6	858962	858967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631475
16545	NC_022439	A	6	6	858989	858994	100 %	0 %	0 %	0 %	545631475
16546	NC_022439	AAT	2	6	859023	859028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631475
16547	NC_022439	TAA	2	6	859069	859074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631475
16548	NC_022439	CCA	2	6	859109	859114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631475
16549	NC_022439	TA	3	6	859132	859137	50 %	50 %	0 %	0 %	545631475
16550	NC_022439	AAT	2	6	859144	859149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631475
16551	NC_022439	TA	3	6	859244	859249	50 %	50 %	0 %	0 %	545631475
16552	NC_022439	AAC	2	6	859351	859356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631476
16553	NC_022439	ATTA	2	8	859357	859364	50 %	50 %	0 %	0 %	545631476
16554	NC_022439	TTA	3	9	859362	859370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631476
16555	NC_022439	ACA	2	6	859374	859379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631476
16556	NC_022439	AAT	2	6	859409	859414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631476
16557	NC_022439	CCAT	2	8	859458	859465	25 %	25 %	0 %	50 %	545631476
16558	NC_022439	TCA	2	6	859482	859487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631476
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16560	NC_022439	AAT	2	6	859564	859569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631476
16561	NC_022439	GAA	2	6	859579	859584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631476
16562	NC_022439	T	8	8	859604	859611	0 %	100 %	0 %	0 %	545631476
16563	NC_022439	A	6	6	859690	859695	100 %	0 %	0 %	0 %	545631476
16564	NC_022439	CAG	2	6	859749	859754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631476
16565	NC_022439	TCG	2	6	859770	859775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631476
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16567	NC_022439	A	7	7	859856	859862	100 %	0 %	0 %	0 %	545631476
16568	NC_022439	ACG	2	6	859867	859872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631476
16569	NC_022439	GTA	3	9	859897	859905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631476
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16571	NC_022439	ATGC	2	8	860120	860127	25 %	25 %	25 %	25 %	545631476
16572	NC_022439	TCC	2	6	860203	860208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631476
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16574	NC_022439	A	6	6	860238	860243	100 %	0 %	0 %	0 %	545631476
16575	NC_022439	TAAG	2	8	860248	860255	50 %	25 %	25 %	0 %	545631476
16576	NC_022439	TGC	2	6	860321	860326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631476
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16579	NC_022439	TA	3	6	860395	860400	50 %	50 %	0 %	0 %	545631476
16580	NC_022439	TGT	2	6	860407	860412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631476
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16591	NC_022439	TAA	2	6	861181	861186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631477
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16599	NC_022439	CCCT	2	8	861580	861587	0 %	25 %	0 %	75 %	545631477
16600	NC_022439	ATCA	2	8	861604	861611	50 %	25 %	0 %	25 %	545631477
16601	NC_022439	GTT	2	6	861630	861635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631477
16602	NC_022439	T	8	8	861723	861730	0 %	100 %	0 %	0 %	545631477
16603	NC_022439	TCTTCA	2	12	861854	861865	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545631477
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16610	NC_022439	TAC	2	6	862389	862394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631477
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16613	NC_022439	CTT	2	6	862606	862611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631478
16614	NC_022439	TTAA	2	8	862659	862666	50 %	50 %	0 %	0 %	545631478
16615	NC_022439	ATA	2	6	862728	862733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631478
16616	NC_022439	TAT	2	6	862774	862779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631478
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16618	NC_022439	CT	3	6	862896	862901	0 %	50 %	0 %	50 %	545631478
16619	NC_022439	CAA	2	6	862939	862944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631478
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16987	NC_022439	AGA	2	6	883774	883779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631490
16988	NC_022439	AGC	2	6	883882	883887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631490
16989	NC_022439	TGC	2	6	883890	883895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631490
16990	NC_022439	TCC	2	6	883897	883902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631490
16991	NC_022439	GAC	2	6	884012	884017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631490
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16993	NC_022439	ACT	2	6	884056	884061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631490
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16999	NC_022439	T	7	7	884428	884434	0 %	100 %	0 %	0 %	545631491
17000	NC_022439	ATG	2	6	884449	884454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631491

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