MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 21186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022439	TGT	2	6	625139	625144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631284
12002	NC_022439	TCTT	2	8	625155	625162	0 %	75 %	0 %	25 %	545631284
12003	NC_022439	AG	3	6	625166	625171	50 %	0 %	50 %	0 %	545631284
12004	NC_022439	TA	3	6	625248	625253	50 %	50 %	0 %	0 %	545631284
12005	NC_022439	TCT	2	6	625344	625349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631284
12006	NC_022439	TCT	3	9	625436	625444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631284
12007	NC_022439	TGA	2	6	625454	625459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631284
12008	NC_022439	TACT	2	8	625473	625480	25 %	50 %	0 %	25 %	545631284
12009	NC_022439	ACTTT	2	10	625490	625499	20 %	60 %	0 %	20 %	545631284
12010	NC_022439	ACA	2	6	625544	625549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631284
12011	NC_022439	GAAGGG	2	12	625649	625660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631284
12012	NC_022439	AAT	2	6	625665	625670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631284
12013	NC_022439	C	19	19	625786	625804	0 %	0 %	0 %	100 %	545631284
12014	NC_022439	CGAGTA	2	12	625817	625828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545631284
12015	NC_022439	GAA	2	6	625841	625846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631284
12016	NC_022439	ATA	2	6	625870	625875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631284
12017	NC_022439	TAT	3	9	625893	625901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631284
12018	NC_022439	A	8	8	627283	627290	100 %	0 %	0 %	0 %	545631285
12019	NC_022439	GAG	2	6	627304	627309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631285
12020	NC_022439	TC	3	6	627341	627346	0 %	50 %	0 %	50 %	545631285
12021	NC_022439	CTG	2	6	627413	627418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631285
12022	NC_022439	ACA	2	6	627423	627428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631285
12023	NC_022439	A	6	6	627463	627468	100 %	0 %	0 %	0 %	545631285
12024	NC_022439	CTT	2	6	627472	627477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631285
12025	NC_022439	TAT	2	6	627511	627516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631285
12026	NC_022439	GAAC	2	8	627561	627568	50 %	0 %	25 %	25 %	545631285
12027	NC_022439	AATA	2	8	627578	627585	75 %	25 %	0 %	0 %	545631285
12028	NC_022439	CGCATA	2	12	627650	627661	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545631285
12029	NC_022439	T	8	8	627705	627712	0 %	100 %	0 %	0 %	545631285
12030	NC_022439	AGA	2	6	627713	627718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631285
12031	NC_022439	AGTAT	2	10	627723	627732	40 %	40 %	20 %	0 %	545631285
12032	NC_022439	AATAA	2	10	627801	627810	80 %	20 %	0 %	0 %	545631285
12033	NC_022439	ACA	2	6	627960	627965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631285
12034	NC_022439	ACT	2	6	627969	627974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631285
12035	NC_022439	ATG	2	6	628054	628059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631285
12036	NC_022439	TAC	2	6	628076	628081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631285
12037	NC_022439	CAAT	2	8	628101	628108	50 %	25 %	0 %	25 %	545631286
12038	NC_022439	AGG	2	6	628135	628140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631286
12039	NC_022439	ATA	2	6	628193	628198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631286
12040	NC_022439	ATT	2	6	628213	628218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631286
12041	NC_022439	AGA	2	6	628246	628251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631286
12042	NC_022439	A	6	6	628251	628256	100 %	0 %	0 %	0 %	545631286
12043	NC_022439	TTC	2	6	628271	628276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631286
12044	NC_022439	TAC	2	6	628285	628290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631286
12045	NC_022439	CCAAA	2	10	628336	628345	60 %	0 %	0 %	40 %	545631286
12046	NC_022439	CTT	2	6	628368	628373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631286
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12051	NC_022439	ACC	2	6	628743	628748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631286
12052	NC_022439	A	6	6	628869	628874	100 %	0 %	0 %	0 %	545631287
12053	NC_022439	AGA	2	6	628887	628892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631287
12054	NC_022439	ACA	2	6	628897	628902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631287
12055	NC_022439	ATA	2	6	628912	628917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631287
12056	NC_022439	GAA	2	6	628928	628933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631287
12057	NC_022439	CT	3	6	629005	629010	0 %	50 %	0 %	50 %	545631287
12058	NC_022439	ATAAG	2	10	629016	629025	60 %	20 %	20 %	0 %	545631287
12059	NC_022439	CTC	2	6	629061	629066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631287
12060	NC_022439	GAA	2	6	629078	629083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631287
12061	NC_022439	TAA	2	6	629087	629092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631287
12062	NC_022439	TTC	3	9	629130	629138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631287
12063	NC_022439	CTT	2	6	629143	629148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631287
12064	NC_022439	CAA	2	6	629155	629160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631287
12065	NC_022439	TTTA	2	8	629199	629206	25 %	75 %	0 %	0 %	545631287
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12068	NC_022439	TGC	2	6	629373	629378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631287
12069	NC_022439	A	9	9	629388	629396	100 %	0 %	0 %	0 %	545631287
12070	NC_022439	ATAA	2	8	629418	629425	75 %	25 %	0 %	0 %	545631287
12071	NC_022439	TAA	3	9	629460	629468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631287
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12075	NC_022439	AAAATA	2	12	629610	629621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545631287
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12081	NC_022439	GTA	2	6	630373	630378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631288
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12089	NC_022439	GTACA	2	10	630825	630834	40 %	20 %	20 %	20 %	545631288
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12102	NC_022439	CAA	2	6	631643	631648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631289
12103	NC_022439	ATA	2	6	631672	631677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631289
12104	NC_022439	TAA	2	6	631748	631753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631289
12105	NC_022439	T	7	7	631894	631900	0 %	100 %	0 %	0 %	545631289
12106	NC_022439	AT	3	6	632047	632052	50 %	50 %	0 %	0 %	545631290
12107	NC_022439	GGT	2	6	632101	632106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545631290
12108	NC_022439	C	6	6	632149	632154	0 %	0 %	0 %	100 %	545631290
12109	NC_022439	CAAAAA	2	12	632277	632288	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	545631290
12110	NC_022439	TCC	2	6	632359	632364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631290
12111	NC_022439	CCT	2	6	632405	632410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631290
12112	NC_022439	AAC	2	6	632445	632450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631290
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12116	NC_022439	CAAA	2	8	632654	632661	75 %	0 %	0 %	25 %	545631291
12117	NC_022439	GCG	2	6	632668	632673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545631291
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12121	NC_022439	AAGC	2	8	632918	632925	50 %	0 %	25 %	25 %	545631291
12122	NC_022439	CCTG	2	8	632926	632933	0 %	25 %	25 %	50 %	545631291
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12229	NC_022439	CT	3	6	637701	637706	0 %	50 %	0 %	50 %	545631295
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12233	NC_022439	A	6	6	637876	637881	100 %	0 %	0 %	0 %	545631295
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12238	NC_022439	GATC	2	8	637987	637994	25 %	25 %	25 %	25 %	545631295
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12488	NC_022439	T	6	6	652308	652313	0 %	100 %	0 %	0 %	545631305
12489	NC_022439	T	7	7	652320	652326	0 %	100 %	0 %	0 %	545631305
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12492	NC_022439	ATG	2	6	652574	652579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631305
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