MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 36483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_022351	CTG	2	6	1636547	1636552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947089
36002	NC_022351	CAT	2	6	1636571	1636576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947089
36003	NC_022351	AT	3	6	1636588	1636593	50 %	50 %	0 %	0 %	543947089
36004	NC_022351	T	8	8	1636664	1636671	0 %	100 %	0 %	0 %	543947089
36005	NC_022351	AGTT	2	8	1636686	1636693	25 %	50 %	25 %	0 %	543947089
36006	NC_022351	CTT	2	6	1636731	1636736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947090
36007	NC_022351	TCA	2	6	1636768	1636773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947090
36008	NC_022351	AGC	2	6	1636830	1636835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947090
36009	NC_022351	TAAT	2	8	1636921	1636928	50 %	50 %	0 %	0 %	543947090
36010	NC_022351	TGTC	2	8	1637086	1637093	0 %	50 %	25 %	25 %	543947090
36011	NC_022351	A	6	6	1637108	1637113	100 %	0 %	0 %	0 %	543947090
36012	NC_022351	ATT	2	6	1637118	1637123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947090
36013	NC_022351	ACATTT	2	12	1637137	1637148	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543947090
36014	NC_022351	T	6	6	1637181	1637186	0 %	100 %	0 %	0 %	543947090
36015	NC_022351	CTG	2	6	1637225	1637230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947090
36016	NC_022351	GTT	2	6	1637243	1637248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947090
36017	NC_022351	T	6	6	1637339	1637344	0 %	100 %	0 %	0 %	543947091
36018	NC_022351	CGC	2	6	1637366	1637371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543947091
36019	NC_022351	TCA	2	6	1637392	1637397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947091
36020	NC_022351	ACG	2	6	1637484	1637489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947091
36021	NC_022351	TCT	2	6	1637578	1637583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947091
36022	NC_022351	GTT	2	6	1637668	1637673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947091
36023	NC_022351	GAGT	2	8	1637705	1637712	25 %	25 %	50 %	0 %	543947091
36024	NC_022351	ATA	2	6	1637722	1637727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947091
36025	NC_022351	T	6	6	1637922	1637927	0 %	100 %	0 %	0 %	543947092
36026	NC_022351	TAA	2	6	1637971	1637976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947093
36027	NC_022351	TGT	2	6	1638004	1638009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947093
36028	NC_022351	TCA	2	6	1638080	1638085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947093
36029	NC_022351	AATT	2	8	1638169	1638176	50 %	50 %	0 %	0 %	543947093
36030	NC_022351	CATA	2	8	1638189	1638196	50 %	25 %	0 %	25 %	543947093
36031	NC_022351	TTTTC	2	10	1638197	1638206	0 %	80 %	0 %	20 %	543947093
36032	NC_022351	T	6	6	1638265	1638270	0 %	100 %	0 %	0 %	543947093
36033	NC_022351	ACT	2	6	1638377	1638382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947093
36034	NC_022351	TCA	2	6	1638474	1638479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947093
36035	NC_022351	ACC	2	6	1638541	1638546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947094
36036	NC_022351	T	6	6	1638577	1638582	0 %	100 %	0 %	0 %	543947094
36037	NC_022351	ATC	2	6	1638658	1638663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947094
36038	NC_022351	T	6	6	1638691	1638696	0 %	100 %	0 %	0 %	543947094
36039	NC_022351	TTTAA	2	10	1638701	1638710	40 %	60 %	0 %	0 %	543947094
36040	NC_022351	CCA	2	6	1638757	1638762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947095
36041	NC_022351	CT	3	6	1638810	1638815	0 %	50 %	0 %	50 %	543947095
36042	NC_022351	TGT	2	6	1638818	1638823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947095
36043	NC_022351	GCA	2	6	1638835	1638840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947095
36044	NC_022351	TCA	2	6	1638844	1638849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947095
36045	NC_022351	T	6	6	1638885	1638890	0 %	100 %	0 %	0 %	543947095
36046	NC_022351	T	6	6	1638924	1638929	0 %	100 %	0 %	0 %	543947095
36047	NC_022351	T	6	6	1638951	1638956	0 %	100 %	0 %	0 %	543947095
36048	NC_022351	TCT	2	6	1638993	1638998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947095
36049	NC_022351	TAT	2	6	1639046	1639051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947095
36050	NC_022351	CAA	2	6	1639159	1639164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947096
36051	NC_022351	TC	3	6	1639190	1639195	0 %	50 %	0 %	50 %	543947096
36052	NC_022351	T	6	6	1639211	1639216	0 %	100 %	0 %	0 %	543947096
36053	NC_022351	TTTC	2	8	1639257	1639264	0 %	75 %	0 %	25 %	543947096
36054	NC_022351	T	6	6	1639282	1639287	0 %	100 %	0 %	0 %	543947096
36055	NC_022351	AAC	3	9	1639301	1639309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947096
36056	NC_022351	TATT	2	8	1639369	1639376	25 %	75 %	0 %	0 %	543947097
36057	NC_022351	T	7	7	1639388	1639394	0 %	100 %	0 %	0 %	543947097
36058	NC_022351	T	7	7	1639467	1639473	0 %	100 %	0 %	0 %	543947097
36059	NC_022351	TTG	2	6	1639483	1639488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947097
36060	NC_022351	GCT	2	6	1639497	1639502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947097
36061	NC_022351	CT	4	8	1639537	1639544	0 %	50 %	0 %	50 %	543947098
36062	NC_022351	TTC	2	6	1639608	1639613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947098
36063	NC_022351	ACCTTT	2	12	1639680	1639691	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543947098
36064	NC_022351	T	7	7	1639713	1639719	0 %	100 %	0 %	0 %	543947098
36065	NC_022351	GCT	2	6	1639795	1639800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947098
36066	NC_022351	TCA	2	6	1639904	1639909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947098
36067	NC_022351	ATT	2	6	1639945	1639950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947099
36068	NC_022351	CTT	2	6	1639956	1639961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947099
36069	NC_022351	T	6	6	1639999	1640004	0 %	100 %	0 %	0 %	543947099
36070	NC_022351	AGT	2	6	1640072	1640077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947099
36071	NC_022351	GAAACT	2	12	1640187	1640198	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	543947099
36072	NC_022351	T	6	6	1640240	1640245	0 %	100 %	0 %	0 %	543947099
36073	NC_022351	T	6	6	1640269	1640274	0 %	100 %	0 %	0 %	543947099
36074	NC_022351	AGTTG	2	10	1640277	1640286	20 %	40 %	40 %	0 %	543947099
36075	NC_022351	CAG	2	6	1640296	1640301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947099
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36077	NC_022351	TGATAT	2	12	1640338	1640349	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543947099
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36079	NC_022351	T	6	6	1640408	1640413	0 %	100 %	0 %	0 %	543947099
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36083	NC_022351	TTCT	2	8	1640470	1640477	0 %	75 %	0 %	25 %	543947099
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36087	NC_022351	TTG	2	6	1640682	1640687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947100
36088	NC_022351	T	7	7	1640688	1640694	0 %	100 %	0 %	0 %	543947100
36089	NC_022351	TGT	2	6	1640707	1640712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947100
36090	NC_022351	AGT	2	6	1640713	1640718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947100
36091	NC_022351	T	7	7	1640718	1640724	0 %	100 %	0 %	0 %	543947100
36092	NC_022351	T	7	7	1640733	1640739	0 %	100 %	0 %	0 %	543947100
36093	NC_022351	CTA	2	6	1640772	1640777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947100
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36096	NC_022351	TAAT	2	8	1641054	1641061	50 %	50 %	0 %	0 %	543947100
36097	NC_022351	CTTA	2	8	1641082	1641089	25 %	50 %	0 %	25 %	543947101
36098	NC_022351	TATCA	2	10	1641230	1641239	40 %	40 %	0 %	20 %	543947101
36099	NC_022351	CTT	3	9	1641252	1641260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947101
36100	NC_022351	TAT	2	6	1641280	1641285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947101
36101	NC_022351	AGC	2	6	1641299	1641304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947101
36102	NC_022351	T	6	6	1641311	1641316	0 %	100 %	0 %	0 %	543947101
36103	NC_022351	ATC	2	6	1641326	1641331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947101
36104	NC_022351	T	7	7	1641344	1641350	0 %	100 %	0 %	0 %	543947101
36105	NC_022351	TCT	2	6	1641378	1641383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947102
36106	NC_022351	ATT	2	6	1641388	1641393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947102
36107	NC_022351	ACG	2	6	1641414	1641419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947102
36108	NC_022351	TGGT	2	8	1641434	1641441	0 %	50 %	50 %	0 %	543947102
36109	NC_022351	GCGG	2	8	1641539	1641546	0 %	0 %	75 %	25 %	543947102
36110	NC_022351	TTC	2	6	1641597	1641602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947102
36111	NC_022351	TCT	2	6	1641688	1641693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947102
36112	NC_022351	CAG	2	6	1641839	1641844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947102
36113	NC_022351	GAA	2	6	1641881	1641886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947102
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36115	NC_022351	ACG	2	6	1641987	1641992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947102
36116	NC_022351	AAT	2	6	1642002	1642007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947102
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36118	NC_022351	CTT	2	6	1642031	1642036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947102
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36339	NC_022351	A	6	6	1655749	1655754	100 %	0 %	0 %	0 %	543947117
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