MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 36483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_022351	CTA	2	6	1541504	1541509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946987
34002	NC_022351	ATA	2	6	1541578	1541583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946987
34003	NC_022351	AC	3	6	1541700	1541705	50 %	0 %	0 %	50 %	543946987
34004	NC_022351	GCT	2	6	1541746	1541751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946987
34005	NC_022351	CCA	2	6	1541778	1541783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543946987
34006	NC_022351	TTTTA	2	10	1541844	1541853	20 %	80 %	0 %	0 %	543946987
34007	NC_022351	TCA	2	6	1541863	1541868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946987
34008	NC_022351	TCA	2	6	1541950	1541955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946987
34009	NC_022351	ATT	2	6	1541989	1541994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946987
34010	NC_022351	CAG	2	6	1541996	1542001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946987
34011	NC_022351	GCA	2	6	1542043	1542048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946987
34012	NC_022351	A	6	6	1542063	1542068	100 %	0 %	0 %	0 %	543946987
34013	NC_022351	ATC	2	6	1542096	1542101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946987
34014	NC_022351	TCA	3	9	1542181	1542189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946987
34015	NC_022351	CAA	2	6	1542194	1542199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946987
34016	NC_022351	T	6	6	1542240	1542245	0 %	100 %	0 %	0 %	543946987
34017	NC_022351	ATT	2	6	1542247	1542252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946987
34018	NC_022351	TCT	2	6	1542283	1542288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946987
34019	NC_022351	TC	3	6	1542293	1542298	0 %	50 %	0 %	50 %	543946987
34020	NC_022351	ATTA	2	8	1542306	1542313	50 %	50 %	0 %	0 %	543946987
34021	NC_022351	T	6	6	1542315	1542320	0 %	100 %	0 %	0 %	543946987
34022	NC_022351	TAC	2	6	1542371	1542376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946987
34023	NC_022351	CTT	2	6	1542400	1542405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946987
34024	NC_022351	TAT	2	6	1542419	1542424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946987
34025	NC_022351	TTAT	2	8	1542457	1542464	25 %	75 %	0 %	0 %	543946987
34026	NC_022351	TAG	2	6	1542491	1542496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946987
34027	NC_022351	T	7	7	1542512	1542518	0 %	100 %	0 %	0 %	543946987
34028	NC_022351	A	6	6	1542523	1542528	100 %	0 %	0 %	0 %	543946987
34029	NC_022351	CTA	2	6	1542554	1542559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946987
34030	NC_022351	ATTTTT	2	12	1542598	1542609	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	543946987
34031	NC_022351	T	7	7	1542605	1542611	0 %	100 %	0 %	0 %	543946987
34032	NC_022351	CTG	2	6	1542674	1542679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946987
34033	NC_022351	AAT	2	6	1542720	1542725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946987
34034	NC_022351	AAT	2	6	1542753	1542758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946987
34035	NC_022351	ACG	2	6	1542785	1542790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946987
34036	NC_022351	AGCAT	2	10	1542804	1542813	40 %	20 %	20 %	20 %	543946987
34037	NC_022351	ATC	2	6	1543060	1543065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946988
34038	NC_022351	TG	3	6	1543072	1543077	0 %	50 %	50 %	0 %	543946988
34039	NC_022351	A	7	7	1543088	1543094	100 %	0 %	0 %	0 %	543946988
34040	NC_022351	AAT	2	6	1543125	1543130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946988
34041	NC_022351	AAC	2	6	1543190	1543195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946988
34042	NC_022351	GGC	2	6	1543224	1543229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543946988
34043	NC_022351	TTG	2	6	1543265	1543270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946988
34044	NC_022351	AGA	2	6	1543308	1543313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946988
34045	NC_022351	TGA	2	6	1543371	1543376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946988
34046	NC_022351	A	7	7	1543439	1543445	100 %	0 %	0 %	0 %	543946988
34047	NC_022351	ATAA	2	8	1543454	1543461	75 %	25 %	0 %	0 %	543946988
34048	NC_022351	CTA	2	6	1543495	1543500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946989
34049	NC_022351	CAT	3	9	1543594	1543602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946989
34050	NC_022351	T	6	6	1543652	1543657	0 %	100 %	0 %	0 %	543946989
34051	NC_022351	A	7	7	1543660	1543666	100 %	0 %	0 %	0 %	543946989
34052	NC_022351	TCT	2	6	1543667	1543672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946989
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34054	NC_022351	TCA	2	6	1543701	1543706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946989
34055	NC_022351	CAAG	2	8	1543729	1543736	50 %	0 %	25 %	25 %	543946989
34056	NC_022351	T	7	7	1543758	1543764	0 %	100 %	0 %	0 %	543946989
34057	NC_022351	CCAA	2	8	1543837	1543844	50 %	0 %	0 %	50 %	543946989
34058	NC_022351	T	6	6	1543852	1543857	0 %	100 %	0 %	0 %	543946989
34059	NC_022351	TTTA	2	8	1543877	1543884	25 %	75 %	0 %	0 %	543946989
34060	NC_022351	CAG	2	6	1543918	1543923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946989
34061	NC_022351	ATC	2	6	1543955	1543960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946989
34062	NC_022351	ATC	2	6	1543970	1543975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946989
34063	NC_022351	T	6	6	1544078	1544083	0 %	100 %	0 %	0 %	543946989
34064	NC_022351	TTC	2	6	1544117	1544122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946989
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34066	NC_022351	T	7	7	1544179	1544185	0 %	100 %	0 %	0 %	543946989
34067	NC_022351	TA	3	6	1544195	1544200	50 %	50 %	0 %	0 %	543946989
34068	NC_022351	ATC	2	6	1544201	1544206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946989
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34071	NC_022351	TTTTTC	2	12	1544448	1544459	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543946989
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34078	NC_022351	TTA	2	6	1544625	1544630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946989
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34083	NC_022351	AT	3	6	1544764	1544769	50 %	50 %	0 %	0 %	543946989
34084	NC_022351	AAG	2	6	1544788	1544793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946989
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34089	NC_022351	A	6	6	1544962	1544967	100 %	0 %	0 %	0 %	543946989
34090	NC_022351	AAT	2	6	1544995	1545000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946989
34091	NC_022351	TAA	2	6	1545040	1545045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946989
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34094	NC_022351	ATTT	2	8	1545076	1545083	25 %	75 %	0 %	0 %	543946989
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34098	NC_022351	AT	4	8	1545226	1545233	50 %	50 %	0 %	0 %	543946990
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34100	NC_022351	AAGAAA	2	12	1545338	1545349	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543946990
34101	NC_022351	A	6	6	1545421	1545426	100 %	0 %	0 %	0 %	543946990
34102	NC_022351	AAT	2	6	1545429	1545434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946990
34103	NC_022351	AC	3	6	1545447	1545452	50 %	0 %	0 %	50 %	543946990
34104	NC_022351	A	6	6	1545493	1545498	100 %	0 %	0 %	0 %	543946990
34105	NC_022351	A	7	7	1545500	1545506	100 %	0 %	0 %	0 %	543946990
34106	NC_022351	AAAGA	2	10	1545517	1545526	80 %	0 %	20 %	0 %	543946990
34107	NC_022351	TAAA	2	8	1545539	1545546	75 %	25 %	0 %	0 %	543946990
34108	NC_022351	CTTC	2	8	1545622	1545629	0 %	50 %	0 %	50 %	543946990
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34112	NC_022351	T	6	6	1545736	1545741	0 %	100 %	0 %	0 %	543946990
34113	NC_022351	TAAA	2	8	1545758	1545765	75 %	25 %	0 %	0 %	543946990
34114	NC_022351	GAT	2	6	1545790	1545795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946990
34115	NC_022351	T	6	6	1545798	1545803	0 %	100 %	0 %	0 %	543946990
34116	NC_022351	AAAT	2	8	1545844	1545851	75 %	25 %	0 %	0 %	543946990
34117	NC_022351	AAT	2	6	1545855	1545860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946990
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34471	NC_022351	A	6	6	1563274	1563279	100 %	0 %	0 %	0 %	543947011
34472	NC_022351	ATG	2	6	1563325	1563330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947011
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34475	NC_022351	ATT	2	6	1563396	1563401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947012
34476	NC_022351	T	8	8	1563408	1563415	0 %	100 %	0 %	0 %	543947012
34477	NC_022351	A	6	6	1563429	1563434	100 %	0 %	0 %	0 %	543947012
34478	NC_022351	GCT	2	6	1563460	1563465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947012
34479	NC_022351	T	7	7	1563477	1563483	0 %	100 %	0 %	0 %	543947012
34480	NC_022351	TTG	2	6	1563536	1563541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947012
34481	NC_022351	GAT	2	6	1563559	1563564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947012
34482	NC_022351	A	9	9	1563569	1563577	100 %	0 %	0 %	0 %	543947012
34483	NC_022351	CTTG	2	8	1563631	1563638	0 %	50 %	25 %	25 %	543947012
34484	NC_022351	GCA	2	6	1563646	1563651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947012
34485	NC_022351	ATTTT	2	10	1563674	1563683	20 %	80 %	0 %	0 %	543947012
34486	NC_022351	TAT	2	6	1563726	1563731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947012
34487	NC_022351	AGAT	2	8	1563737	1563744	50 %	25 %	25 %	0 %	543947012
34488	NC_022351	A	6	6	1563745	1563750	100 %	0 %	0 %	0 %	543947012
34489	NC_022351	TGA	2	6	1563777	1563782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947012
34490	NC_022351	ATTTA	2	10	1563843	1563852	40 %	60 %	0 %	0 %	543947012
34491	NC_022351	T	6	6	1563854	1563859	0 %	100 %	0 %	0 %	543947012
34492	NC_022351	ATTT	2	8	1563878	1563885	25 %	75 %	0 %	0 %	543947012
34493	NC_022351	CTG	2	6	1563983	1563988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947013
34494	NC_022351	A	6	6	1563989	1563994	100 %	0 %	0 %	0 %	543947013
34495	NC_022351	A	7	7	1564012	1564018	100 %	0 %	0 %	0 %	543947013
34496	NC_022351	AGAA	2	8	1564020	1564027	75 %	0 %	25 %	0 %	543947013
34497	NC_022351	GCA	2	6	1564081	1564086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947013
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34499	NC_022351	TAA	2	6	1564128	1564133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947013
34500	NC_022351	A	6	6	1564168	1564173	100 %	0 %	0 %	0 %	543947013

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