MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 36483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_022351	TTA	2	6	1363196	1363201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946809
30003	NC_022351	A	6	6	1363229	1363234	100 %	0 %	0 %	0 %	543946810
30004	NC_022351	AAACT	2	10	1363244	1363253	60 %	20 %	0 %	20 %	543946810
30005	NC_022351	AAC	3	9	1363409	1363417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946811
30006	NC_022351	GGT	2	6	1363455	1363460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543946811
30007	NC_022351	GCA	2	6	1363491	1363496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946811
30008	NC_022351	GCAA	2	8	1363521	1363528	50 %	0 %	25 %	25 %	543946811
30009	NC_022351	T	6	6	1363538	1363543	0 %	100 %	0 %	0 %	543946811
30010	NC_022351	ATT	2	6	1363586	1363591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946811
30011	NC_022351	T	6	6	1363619	1363624	0 %	100 %	0 %	0 %	543946811
30012	NC_022351	AGA	2	6	1363646	1363651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946811
30013	NC_022351	A	6	6	1363651	1363656	100 %	0 %	0 %	0 %	543946811
30014	NC_022351	ATA	2	6	1363753	1363758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946811
30015	NC_022351	CGC	2	6	1363838	1363843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543946811
30016	NC_022351	TAG	2	6	1363885	1363890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946811
30017	NC_022351	ACA	2	6	1363947	1363952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946811
30018	NC_022351	TGA	2	6	1363958	1363963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946811
30019	NC_022351	CTTA	2	8	1363966	1363973	25 %	50 %	0 %	25 %	543946811
30020	NC_022351	A	6	6	1364020	1364025	100 %	0 %	0 %	0 %	543946811
30021	NC_022351	TGA	2	6	1364030	1364035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946811
30022	NC_022351	AGAAA	2	10	1364058	1364067	80 %	0 %	20 %	0 %	543946811
30023	NC_022351	CCCA	2	8	1364098	1364105	25 %	0 %	0 %	75 %	543946811
30024	NC_022351	GAT	2	6	1364184	1364189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946811
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30030	NC_022351	TGA	2	6	1364573	1364578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946812
30031	NC_022351	A	7	7	1364585	1364591	100 %	0 %	0 %	0 %	543946812
30032	NC_022351	TATGGA	2	12	1364606	1364617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946812
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30038	NC_022351	ACTTGA	2	12	1364954	1364965	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543946812
30039	NC_022351	A	6	6	1364965	1364970	100 %	0 %	0 %	0 %	543946812
30040	NC_022351	GCA	2	6	1364983	1364988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946812
30041	NC_022351	TAG	2	6	1364989	1364994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946812
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30044	NC_022351	CA	3	6	1365253	1365258	50 %	0 %	0 %	50 %	543946812
30045	NC_022351	ATGGA	2	10	1365378	1365387	40 %	20 %	40 %	0 %	543946812
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30050	NC_022351	TTGC	2	8	1365630	1365637	0 %	50 %	25 %	25 %	543946812
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30062	NC_022351	TCA	2	6	1366149	1366154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946813
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30114	NC_022351	T	6	6	1368353	1368358	0 %	100 %	0 %	0 %	543946817
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30118	NC_022351	TGA	2	6	1368668	1368673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946817
30119	NC_022351	TAA	2	6	1368740	1368745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946817
30120	NC_022351	A	6	6	1368762	1368767	100 %	0 %	0 %	0 %	543946817
30121	NC_022351	GAA	2	6	1368831	1368836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946817
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30123	NC_022351	GCT	2	6	1368972	1368977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946817
30124	NC_022351	TGA	2	6	1368985	1368990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946817
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30130	NC_022351	CT	3	6	1369180	1369185	0 %	50 %	0 %	50 %	543946817
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30133	NC_022351	ATG	2	6	1369276	1369281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946818
30134	NC_022351	AGAT	2	8	1369356	1369363	50 %	25 %	25 %	0 %	543946818
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30136	NC_022351	A	6	6	1369476	1369481	100 %	0 %	0 %	0 %	543946818
30137	NC_022351	TCA	2	6	1369569	1369574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946818
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30139	NC_022351	T	6	6	1369613	1369618	0 %	100 %	0 %	0 %	543946818
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30144	NC_022351	A	6	6	1369780	1369785	100 %	0 %	0 %	0 %	543946818
30145	NC_022351	AAG	2	6	1369876	1369881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946818
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30148	NC_022351	CTTT	2	8	1370018	1370025	0 %	75 %	0 %	25 %	543946818
30149	NC_022351	CA	3	6	1370026	1370031	50 %	0 %	0 %	50 %	543946818
30150	NC_022351	CA	3	6	1370058	1370063	50 %	0 %	0 %	50 %	543946818
30151	NC_022351	TCA	2	6	1370076	1370081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946818
30152	NC_022351	A	7	7	1370108	1370114	100 %	0 %	0 %	0 %	543946818
30153	NC_022351	GGA	2	6	1370145	1370150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543946818
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30158	NC_022351	A	6	6	1370339	1370344	100 %	0 %	0 %	0 %	543946818
30159	NC_022351	ACC	2	6	1370363	1370368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543946818
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30220	NC_022351	CTT	2	6	1372710	1372715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946821
30221	NC_022351	TTC	3	9	1372723	1372731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946821
30222	NC_022351	A	6	6	1372769	1372774	100 %	0 %	0 %	0 %	543946821
30223	NC_022351	TAA	2	6	1372819	1372824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946821
30224	NC_022351	CAA	2	6	1372866	1372871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946821
30225	NC_022351	TTGC	2	8	1372907	1372914	0 %	50 %	25 %	25 %	543946821
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30227	NC_022351	A	6	6	1372966	1372971	100 %	0 %	0 %	0 %	543946821
30228	NC_022351	CAT	2	6	1373022	1373027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946821
30229	NC_022351	TCA	2	6	1373072	1373077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946821
30230	NC_022351	AAG	2	6	1373113	1373118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946821
30231	NC_022351	ATC	2	6	1373350	1373355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946821
30232	NC_022351	A	6	6	1373366	1373371	100 %	0 %	0 %	0 %	543946821
30233	NC_022351	T	6	6	1373410	1373415	0 %	100 %	0 %	0 %	543946821
30234	NC_022351	ATA	2	6	1373444	1373449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946821
30235	NC_022351	AT	3	6	1373476	1373481	50 %	50 %	0 %	0 %	543946822
30236	NC_022351	CTA	2	6	1373492	1373497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946822
30237	NC_022351	GAC	2	6	1373498	1373503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946822
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30239	NC_022351	ATC	2	6	1373550	1373555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946822
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30473	NC_022351	TATCA	2	10	1383945	1383954	40 %	40 %	0 %	20 %	543946833
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30476	NC_022351	TGA	2	6	1384013	1384018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946833
30477	NC_022351	AAT	2	6	1384046	1384051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946833
30478	NC_022351	TTA	2	6	1384072	1384077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946833
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30480	NC_022351	T	6	6	1384116	1384121	0 %	100 %	0 %	0 %	543946833
30481	NC_022351	GCTT	2	8	1384123	1384130	0 %	50 %	25 %	25 %	543946833
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30491	NC_022351	T	7	7	1384440	1384446	0 %	100 %	0 %	0 %	543946833
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30497	NC_022351	TA	3	6	1384658	1384663	50 %	50 %	0 %	0 %	543946834
30498	NC_022351	ATA	2	6	1384670	1384675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946834
30499	NC_022351	T	6	6	1384677	1384682	0 %	100 %	0 %	0 %	543946834
30500	NC_022351	CAT	2	6	1384742	1384747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946834

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