MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 36483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022351	GTT	2	6	253271	253276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945675
5502	NC_022351	T	6	6	253284	253289	0 %	100 %	0 %	0 %	543945675
5503	NC_022351	CAT	2	6	253344	253349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945675
5504	NC_022351	CAC	2	6	253385	253390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945675
5505	NC_022351	AAT	2	6	253427	253432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945675
5506	NC_022351	TAA	2	6	253445	253450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945675
5507	NC_022351	TCT	2	6	253456	253461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945675
5508	NC_022351	CTA	2	6	253478	253483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945675
5509	NC_022351	GCTT	2	8	253493	253500	0 %	50 %	25 %	25 %	543945675
5510	NC_022351	AAC	2	6	253515	253520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945675
5511	NC_022351	ATC	2	6	253641	253646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945675
5512	NC_022351	TCAATT	2	12	253789	253800	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543945675
5513	NC_022351	AAC	2	6	253830	253835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945675
5514	NC_022351	CTT	2	6	253916	253921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945675
5515	NC_022351	TGTC	2	8	253922	253929	0 %	50 %	25 %	25 %	543945675
5516	NC_022351	GCTTTT	2	12	253972	253983	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543945675
5517	NC_022351	TTC	2	6	254196	254201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945675
5518	NC_022351	AAC	2	6	254253	254258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945675
5519	NC_022351	TAA	2	6	254333	254338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945675
5520	NC_022351	TTC	2	6	254367	254372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945675
5521	NC_022351	CAT	2	6	254405	254410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945675
5522	NC_022351	TAC	2	6	254522	254527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945675
5523	NC_022351	T	6	6	254541	254546	0 %	100 %	0 %	0 %	543945675
5524	NC_022351	TGT	2	6	254604	254609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945675
5525	NC_022351	CGA	2	6	254626	254631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945675
5526	NC_022351	AGC	2	6	254727	254732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945675
5527	NC_022351	TGA	2	6	255042	255047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945675
5528	NC_022351	TAA	2	6	255084	255089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945675
5529	NC_022351	TCT	2	6	255097	255102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945675
5530	NC_022351	CTA	2	6	255119	255124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945675
5531	NC_022351	CAA	2	6	255143	255148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945675
5532	NC_022351	T	6	6	255228	255233	0 %	100 %	0 %	0 %	543945676
5533	NC_022351	GAA	2	6	255255	255260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945676
5534	NC_022351	CCA	2	6	255295	255300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945676
5535	NC_022351	CTT	2	6	255302	255307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945676
5536	NC_022351	TCAT	2	8	255319	255326	25 %	50 %	0 %	25 %	543945676
5537	NC_022351	TCT	2	6	255382	255387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945676
5538	NC_022351	GCA	2	6	255397	255402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945676
5539	NC_022351	CCAT	2	8	255412	255419	25 %	25 %	0 %	50 %	543945676
5540	NC_022351	TTC	2	6	255492	255497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945676
5541	NC_022351	CAA	2	6	255533	255538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945676
5542	NC_022351	CAT	2	6	255558	255563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945676
5543	NC_022351	TCA	2	6	255595	255600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945676
5544	NC_022351	CAA	2	6	255680	255685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945676
5545	NC_022351	TCA	2	6	255715	255720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945676
5546	NC_022351	TAA	3	9	255872	255880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945676
5547	NC_022351	CCTTA	2	10	256035	256044	20 %	40 %	0 %	40 %	543945676
5548	NC_022351	CATTT	2	10	256119	256128	20 %	60 %	0 %	20 %	543945676
5549	NC_022351	TCA	2	6	256150	256155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945676
5550	NC_022351	CTA	2	6	256209	256214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945677
5551	NC_022351	A	7	7	256216	256222	100 %	0 %	0 %	0 %	543945677
5552	NC_022351	TC	3	6	256225	256230	0 %	50 %	0 %	50 %	543945677
5553	NC_022351	TTGAT	2	10	256274	256283	20 %	60 %	20 %	0 %	543945677
5554	NC_022351	TGA	2	6	256289	256294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945677
5555	NC_022351	T	7	7	256344	256350	0 %	100 %	0 %	0 %	543945677
5556	NC_022351	A	6	6	256380	256385	100 %	0 %	0 %	0 %	543945677
5557	NC_022351	T	8	8	256388	256395	0 %	100 %	0 %	0 %	543945677
5558	NC_022351	TTTTGA	2	12	256397	256408	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945677
5559	NC_022351	TAA	2	6	256437	256442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945677
5560	NC_022351	A	6	6	256448	256453	100 %	0 %	0 %	0 %	543945677
5561	NC_022351	AAT	2	6	256470	256475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945677
5562	NC_022351	GGT	2	6	256511	256516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945677
5563	NC_022351	A	7	7	256517	256523	100 %	0 %	0 %	0 %	543945677
5564	NC_022351	ATT	2	6	256552	256557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945677
5565	NC_022351	ATT	2	6	256567	256572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945677
5566	NC_022351	GCT	2	6	256605	256610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945677
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5568	NC_022351	AAGA	2	8	256647	256654	75 %	0 %	25 %	0 %	543945677
5569	NC_022351	TTC	2	6	256705	256710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945677
5570	NC_022351	ATC	2	6	256996	257001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945678
5571	NC_022351	CTT	2	6	257004	257009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945678
5572	NC_022351	T	7	7	257008	257014	0 %	100 %	0 %	0 %	543945678
5573	NC_022351	CTA	2	6	257085	257090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945678
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5576	NC_022351	GCTT	2	8	257240	257247	0 %	50 %	25 %	25 %	543945678
5577	NC_022351	GCA	2	6	257255	257260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945678
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5581	NC_022351	A	6	6	257496	257501	100 %	0 %	0 %	0 %	543945679
5582	NC_022351	CTT	2	6	257582	257587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945679
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5587	NC_022351	T	6	6	257948	257953	0 %	100 %	0 %	0 %	543945679
5588	NC_022351	CAT	2	6	257954	257959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945679
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5590	NC_022351	TCT	2	6	257986	257991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945679
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5592	NC_022351	A	6	6	258051	258056	100 %	0 %	0 %	0 %	543945679
5593	NC_022351	T	6	6	258123	258128	0 %	100 %	0 %	0 %	543945679
5594	NC_022351	ATA	2	6	258153	258158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945679
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5596	NC_022351	T	7	7	258183	258189	0 %	100 %	0 %	0 %	543945679
5597	NC_022351	ATTT	2	8	258243	258250	25 %	75 %	0 %	0 %	543945679
5598	NC_022351	T	6	6	258248	258253	0 %	100 %	0 %	0 %	543945679
5599	NC_022351	T	7	7	258288	258294	0 %	100 %	0 %	0 %	543945679
5600	NC_022351	TCA	2	6	258397	258402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945679
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5602	NC_022351	CTT	2	6	258455	258460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945679
5603	NC_022351	A	6	6	258511	258516	100 %	0 %	0 %	0 %	543945679
5604	NC_022351	TC	3	6	258613	258618	0 %	50 %	0 %	50 %	543945680
5605	NC_022351	T	6	6	258627	258632	0 %	100 %	0 %	0 %	543945680
5606	NC_022351	CTT	2	6	258698	258703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945680
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5608	NC_022351	T	6	6	258990	258995	0 %	100 %	0 %	0 %	543945680
5609	NC_022351	AGTA	2	8	259044	259051	50 %	25 %	25 %	0 %	543945680
5610	NC_022351	AAATA	2	10	259149	259158	80 %	20 %	0 %	0 %	543945680
5611	NC_022351	T	6	6	259167	259172	0 %	100 %	0 %	0 %	543945680
5612	NC_022351	ATTTAC	2	12	259206	259217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543945680
5613	NC_022351	T	6	6	259229	259234	0 %	100 %	0 %	0 %	543945680
5614	NC_022351	TTTG	2	8	259242	259249	0 %	75 %	25 %	0 %	543945680
5615	NC_022351	GT	3	6	259267	259272	0 %	50 %	50 %	0 %	543945680
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5618	NC_022351	TA	3	6	259748	259753	50 %	50 %	0 %	0 %	543945681
5619	NC_022351	ATT	2	6	259799	259804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945681
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5621	NC_022351	AAT	2	6	259835	259840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945681
5622	NC_022351	AGG	2	6	259859	259864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543945681
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5624	NC_022351	AAGTA	2	10	259907	259916	60 %	20 %	20 %	0 %	543945681
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