MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_022121	TAA	2	6	861495	861500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431881
17003	NC_022121	TGC	2	6	861556	861561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431881
17004	NC_022121	AGC	2	6	861776	861781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431882
17005	NC_022121	TG	3	6	861824	861829	0 %	50 %	50 %	0 %	532431882
17006	NC_022121	CTTTTT	2	12	861897	861908	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532431882
17007	NC_022121	GAC	2	6	861919	861924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431882
17008	NC_022121	GAG	2	6	862012	862017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431882
17009	NC_022121	A	6	6	862070	862075	100 %	0 %	0 %	0 %	532431882
17010	NC_022121	T	7	7	862347	862353	0 %	100 %	0 %	0 %	532431883
17011	NC_022121	GAG	2	6	862404	862409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431883
17012	NC_022121	GAAG	2	8	862433	862440	50 %	0 %	50 %	0 %	532431883
17013	NC_022121	AAT	2	6	862558	862563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431883
17014	NC_022121	T	8	8	862563	862570	0 %	100 %	0 %	0 %	532431883
17015	NC_022121	AG	3	6	862623	862628	50 %	0 %	50 %	0 %	532431883
17016	NC_022121	TCT	2	6	862631	862636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431883
17017	NC_022121	T	6	6	862674	862679	0 %	100 %	0 %	0 %	532431883
17018	NC_022121	CTT	2	6	862709	862714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431883
17019	NC_022121	TTG	2	6	862756	862761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431883
17020	NC_022121	TTC	2	6	862831	862836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431883
17021	NC_022121	TAA	2	6	862870	862875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431883
17022	NC_022121	TTG	2	6	862879	862884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431883
17023	NC_022121	TTC	2	6	862918	862923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431883
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17025	NC_022121	TTTA	2	8	863002	863009	25 %	75 %	0 %	0 %	532431883
17026	NC_022121	TGG	2	6	863011	863016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431883
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17030	NC_022121	T	6	6	863157	863162	0 %	100 %	0 %	0 %	532431883
17031	NC_022121	TTC	2	6	863202	863207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431883
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17034	NC_022121	TGGGA	2	10	863249	863258	20 %	20 %	60 %	0 %	532431883
17035	NC_022121	AAAT	2	8	863269	863276	75 %	25 %	0 %	0 %	532431883
17036	NC_022121	GAG	2	6	863325	863330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431883
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17040	NC_022121	T	7	7	863630	863636	0 %	100 %	0 %	0 %	532431884
17041	NC_022121	TAG	2	6	863656	863661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431884
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17046	NC_022121	AGC	2	6	863744	863749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431884
17047	NC_022121	GCTTT	2	10	863751	863760	0 %	60 %	20 %	20 %	532431884
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17049	NC_022121	T	6	6	863776	863781	0 %	100 %	0 %	0 %	532431884
17050	NC_022121	TGC	2	6	863855	863860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431884
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17052	NC_022121	CAA	2	6	863909	863914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431884
17053	NC_022121	GTCA	2	8	863915	863922	25 %	25 %	25 %	25 %	532431884
17054	NC_022121	T	8	8	863923	863930	0 %	100 %	0 %	0 %	532431884
17055	NC_022121	A	6	6	863952	863957	100 %	0 %	0 %	0 %	532431884
17056	NC_022121	CTTT	2	8	864427	864434	0 %	75 %	0 %	25 %	532431885
17057	NC_022121	TCG	2	6	864510	864515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431885
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17059	NC_022121	CTT	2	6	864722	864727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431885
17060	NC_022121	CTC	2	6	864765	864770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431885
17061	NC_022121	ATC	2	6	864782	864787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431885
17062	NC_022121	CTTT	2	8	864793	864800	0 %	75 %	0 %	25 %	532431885
17063	NC_022121	ATA	2	6	864803	864808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431885
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17068	NC_022121	A	7	7	865102	865108	100 %	0 %	0 %	0 %	532431885
17069	NC_022121	AAG	2	6	865136	865141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431885
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17089	NC_022121	CT	3	6	865843	865848	0 %	50 %	0 %	50 %	532431885
17090	NC_022121	GA	3	6	865889	865894	50 %	0 %	50 %	0 %	532431885
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17106	NC_022121	TTA	2	6	866692	866697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431885
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17108	NC_022121	AT	3	6	866745	866750	50 %	50 %	0 %	0 %	532431885
17109	NC_022121	GTA	2	6	866811	866816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431885
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17118	NC_022121	GA	3	6	867084	867089	50 %	0 %	50 %	0 %	532431886
17119	NC_022121	TAA	2	6	867145	867150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431886
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17122	NC_022121	AG	3	6	867226	867231	50 %	0 %	50 %	0 %	532431886
17123	NC_022121	TCT	2	6	867278	867283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431886
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17231	NC_022121	AG	3	6	873065	873070	50 %	0 %	50 %	0 %	532431889
17232	NC_022121	C	6	6	873112	873117	0 %	0 %	0 %	100 %	532431889
17233	NC_022121	CAA	2	6	873163	873168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431889
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17236	NC_022121	TTC	2	6	873266	873271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431889
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17239	NC_022121	ATC	2	6	873509	873514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431889
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17351	NC_022121	GCT	2	6	884737	884742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431892
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17355	NC_022121	T	7	7	884960	884966	0 %	100 %	0 %	0 %	532431892
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17358	NC_022121	GTTT	2	8	885118	885125	0 %	75 %	25 %	0 %	532432077
17359	NC_022121	TTC	2	6	885133	885138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432077
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17362	NC_022121	AGC	2	6	885406	885411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431893
17363	NC_022121	TCT	2	6	885419	885424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431893
17364	NC_022121	T	6	6	885484	885489	0 %	100 %	0 %	0 %	532431893
17365	NC_022121	TTA	2	6	885519	885524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431893
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17488	NC_022121	CAT	2	6	890962	890967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431898
17489	NC_022121	TGG	2	6	890968	890973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431898
17490	NC_022121	TTG	2	6	891011	891016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431898
17491	NC_022121	TGGAT	2	10	891045	891054	20 %	40 %	40 %	0 %	532431898
17492	NC_022121	TGT	2	6	891139	891144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431898
17493	NC_022121	TTC	2	6	891146	891151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431898
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