MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022121	TA	3	6	806438	806443	50 %	50 %	0 %	0 %	532431843
16002	NC_022121	AAT	2	6	806461	806466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431843
16003	NC_022121	GGT	2	6	806515	806520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431843
16004	NC_022121	AGA	2	6	806526	806531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431843
16005	NC_022121	TGA	2	6	806537	806542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431843
16006	NC_022121	GAA	2	6	806572	806577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431843
16007	NC_022121	CAG	2	6	806594	806599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431843
16008	NC_022121	GAT	2	6	806725	806730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431843
16009	NC_022121	ATC	2	6	806740	806745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431843
16010	NC_022121	CGT	2	6	806776	806781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431843
16011	NC_022121	TGC	2	6	806963	806968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431843
16012	NC_022121	CTTG	2	8	806987	806994	0 %	50 %	25 %	25 %	532431843
16013	NC_022121	ATG	2	6	807008	807013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431843
16014	NC_022121	TTG	2	6	807050	807055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431843
16015	NC_022121	AAG	2	6	807194	807199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431843
16016	NC_022121	GACA	2	8	807267	807274	50 %	0 %	25 %	25 %	532431843
16017	NC_022121	GCT	2	6	807298	807303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431843
16018	NC_022121	GGA	2	6	807304	807309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431843
16019	NC_022121	GACA	2	8	807352	807359	50 %	0 %	25 %	25 %	532431843
16020	NC_022121	TGC	2	6	807396	807401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431843
16021	NC_022121	TTC	2	6	807406	807411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431843
16022	NC_022121	CTTT	2	8	807412	807419	0 %	75 %	0 %	25 %	532431843
16023	NC_022121	AGAT	2	8	807423	807430	50 %	25 %	25 %	0 %	532431843
16024	NC_022121	TGA	2	6	807431	807436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431843
16025	NC_022121	TCC	2	6	807483	807488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431843
16026	NC_022121	GATT	2	8	807524	807531	25 %	50 %	25 %	0 %	532431843
16027	NC_022121	ATG	2	6	807593	807598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431843
16028	NC_022121	AAC	2	6	807611	807616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431843
16029	NC_022121	ATG	2	6	807641	807646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431843
16030	NC_022121	TTGT	2	8	807664	807671	0 %	75 %	25 %	0 %	532431843
16031	NC_022121	TAGCCT	2	12	807704	807715	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532431843
16032	NC_022121	AGA	2	6	807765	807770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431843
16033	NC_022121	GAT	2	6	807802	807807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431843
16034	NC_022121	TTA	2	6	807862	807867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431843
16035	NC_022121	TGCT	2	8	807899	807906	0 %	50 %	25 %	25 %	532431843
16036	NC_022121	ATT	2	6	807919	807924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431843
16037	NC_022121	CAG	2	6	807929	807934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431843
16038	NC_022121	TTC	2	6	807962	807967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431843
16039	NC_022121	ATT	2	6	807976	807981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431843
16040	NC_022121	TTA	2	6	808027	808032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431843
16041	NC_022121	GAAT	2	8	808089	808096	50 %	25 %	25 %	0 %	532431843
16042	NC_022121	CTG	2	6	808102	808107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431843
16043	NC_022121	GAA	2	6	808276	808281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431843
16044	NC_022121	GAT	2	6	808446	808451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431844
16045	NC_022121	ATG	2	6	808505	808510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431844
16046	NC_022121	GTG	2	6	808577	808582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431844
16047	NC_022121	GAA	2	6	808599	808604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431844
16048	NC_022121	AGG	2	6	808642	808647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431844
16049	NC_022121	ACC	2	6	808656	808661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431844
16050	NC_022121	CAA	2	6	808667	808672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431844
16051	NC_022121	ATC	2	6	808786	808791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431844
16052	NC_022121	TTC	2	6	808792	808797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431844
16053	NC_022121	TA	3	6	808798	808803	50 %	50 %	0 %	0 %	532431844
16054	NC_022121	AGATG	2	10	808854	808863	40 %	20 %	40 %	0 %	532431844
16055	NC_022121	TCA	2	6	808889	808894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431844
16056	NC_022121	AATT	2	8	808986	808993	50 %	50 %	0 %	0 %	532431845
16057	NC_022121	TA	3	6	809041	809046	50 %	50 %	0 %	0 %	532431845
16058	NC_022121	GCT	2	6	809055	809060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431845
16059	NC_022121	T	6	6	809070	809075	0 %	100 %	0 %	0 %	532431845
16060	NC_022121	CAG	2	6	809099	809104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431845
16061	NC_022121	GTC	3	9	809142	809150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431845
16062	NC_022121	TAG	2	6	809163	809168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431845
16063	NC_022121	ATC	2	6	809279	809284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431845
16064	NC_022121	GCG	2	6	809312	809317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431845
16065	NC_022121	GC	3	6	809342	809347	0 %	0 %	50 %	50 %	532431845
16066	NC_022121	TA	3	6	809354	809359	50 %	50 %	0 %	0 %	532431845
16067	NC_022121	ATTT	2	8	809422	809429	25 %	75 %	0 %	0 %	532431845
16068	NC_022121	T	6	6	809447	809452	0 %	100 %	0 %	0 %	532431845
16069	NC_022121	ATAG	2	8	809466	809473	50 %	25 %	25 %	0 %	532431845
16070	NC_022121	GCT	2	6	809497	809502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431845
16071	NC_022121	GAA	2	6	809562	809567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431845
16072	NC_022121	TGT	2	6	809668	809673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431845
16073	NC_022121	CTC	2	6	809711	809716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431845
16074	NC_022121	AAG	2	6	809720	809725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431845
16075	NC_022121	GGA	2	6	809738	809743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431845
16076	NC_022121	CTT	3	9	809842	809850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431845
16077	NC_022121	TCA	2	6	809880	809885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431845
16078	NC_022121	AGC	2	6	809906	809911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431845
16079	NC_022121	TCT	2	6	809931	809936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431845
16080	NC_022121	TTC	2	6	809951	809956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431845
16081	NC_022121	CTG	2	6	810092	810097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431845
16082	NC_022121	CTT	2	6	810131	810136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431845
16083	NC_022121	CTA	2	6	810196	810201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431845
16084	NC_022121	AGC	2	6	810204	810209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431845
16085	NC_022121	CTG	3	9	810226	810234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431845
16086	NC_022121	TGA	2	6	810246	810251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431845
16087	NC_022121	TCGG	2	8	810266	810273	0 %	25 %	50 %	25 %	532431845
16088	NC_022121	ATA	2	6	810312	810317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431845
16089	NC_022121	CTT	2	6	810364	810369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431845
16090	NC_022121	AG	3	6	810412	810417	50 %	0 %	50 %	0 %	532431845
16091	NC_022121	T	6	6	810614	810619	0 %	100 %	0 %	0 %	532431846
16092	NC_022121	AGT	2	6	810667	810672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431846
16093	NC_022121	TTCT	2	8	810749	810756	0 %	75 %	0 %	25 %	532431846
16094	NC_022121	TGC	2	6	810762	810767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431846
16095	NC_022121	AATA	2	8	810798	810805	75 %	25 %	0 %	0 %	532431846
16096	NC_022121	AGC	2	6	810850	810855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431846
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16098	NC_022121	A	7	7	810876	810882	100 %	0 %	0 %	0 %	532431846
16099	NC_022121	TTTG	2	8	810905	810912	0 %	75 %	25 %	0 %	532431846
16100	NC_022121	TTG	2	6	810964	810969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431846
16101	NC_022121	GA	3	6	810983	810988	50 %	0 %	50 %	0 %	532431846
16102	NC_022121	CAA	2	6	811035	811040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431846
16103	NC_022121	T	6	6	811070	811075	0 %	100 %	0 %	0 %	532431846
16104	NC_022121	ATAGG	2	10	811133	811142	40 %	20 %	40 %	0 %	532431846
16105	NC_022121	GTAA	2	8	811159	811166	50 %	25 %	25 %	0 %	532431846
16106	NC_022121	T	7	7	811199	811205	0 %	100 %	0 %	0 %	532431846
16107	NC_022121	GA	3	6	811229	811234	50 %	0 %	50 %	0 %	532431846
16108	NC_022121	AAGG	2	8	811246	811253	50 %	0 %	50 %	0 %	532431846
16109	NC_022121	ATG	2	6	811264	811269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431846
16110	NC_022121	AAAGC	2	10	811291	811300	60 %	0 %	20 %	20 %	532431846
16111	NC_022121	GCA	2	6	811309	811314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431846
16112	NC_022121	TTTC	2	8	811390	811397	0 %	75 %	0 %	25 %	532431846
16113	NC_022121	CTA	2	6	811415	811420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431846
16114	NC_022121	TAG	2	6	811655	811660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431846
16115	NC_022121	CCA	2	6	811726	811731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431846
16116	NC_022121	T	6	6	811777	811782	0 %	100 %	0 %	0 %	532431846
16117	NC_022121	AAT	2	6	811850	811855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431847
16118	NC_022121	TG	3	6	811872	811877	0 %	50 %	50 %	0 %	532431847
16119	NC_022121	TCT	2	6	812055	812060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431847
16120	NC_022121	CAA	2	6	812116	812121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431847
16121	NC_022121	TCA	2	6	812124	812129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431847
16122	NC_022121	TTC	2	6	812138	812143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431847
16123	NC_022121	ACA	2	6	812151	812156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431847
16124	NC_022121	TCT	2	6	812205	812210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431847
16125	NC_022121	GAT	2	6	812230	812235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431847
16126	NC_022121	TTC	2	6	812261	812266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431847
16127	NC_022121	GTT	2	6	812280	812285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431847
16128	NC_022121	C	6	6	812331	812336	0 %	0 %	0 %	100 %	532431847
16129	NC_022121	TCC	2	6	812396	812401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431847
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16131	NC_022121	GAT	2	6	812432	812437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431847
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16133	NC_022121	TCA	2	6	812523	812528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431847
16134	NC_022121	AAT	2	6	812534	812539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431847
16135	NC_022121	CAT	2	6	812560	812565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431847
16136	NC_022121	CTG	2	6	812569	812574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431847
16137	NC_022121	TCT	2	6	812607	812612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431847
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16139	NC_022121	T	7	7	812818	812824	0 %	100 %	0 %	0 %	532431847
16140	NC_022121	CG	3	6	812825	812830	0 %	0 %	50 %	50 %	532431847
16141	NC_022121	TTG	2	6	812896	812901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431847
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16143	NC_022121	AGA	2	6	813128	813133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431848
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16146	NC_022121	T	6	6	813211	813216	0 %	100 %	0 %	0 %	532431848
16147	NC_022121	T	6	6	813260	813265	0 %	100 %	0 %	0 %	532431848
16148	NC_022121	CAG	2	6	813280	813285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431848
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16150	NC_022121	ATC	2	6	813339	813344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431848
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16152	NC_022121	CTG	2	6	813484	813489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431848
16153	NC_022121	AT	3	6	813492	813497	50 %	50 %	0 %	0 %	532431848
16154	NC_022121	TGA	2	6	813511	813516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431848
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16173	NC_022121	CTT	2	6	814325	814330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431849
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16181	NC_022121	TCT	2	6	814747	814752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431849
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16185	NC_022121	AAAC	2	8	814959	814966	75 %	0 %	0 %	25 %	532431849
16186	NC_022121	CAA	2	6	815006	815011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431849
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16201	NC_022121	TCTT	2	8	815876	815883	0 %	75 %	0 %	25 %	532431850
16202	NC_022121	GAG	2	6	815889	815894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431850
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16220	NC_022121	TGGA	2	8	816880	816887	25 %	25 %	50 %	0 %	532431850
16221	NC_022121	ACG	2	6	816916	816921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431850
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16224	NC_022121	AG	3	6	817016	817021	50 %	0 %	50 %	0 %	532431850
16225	NC_022121	AGA	2	6	817031	817036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431850
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16228	NC_022121	GCATC	2	10	817139	817148	20 %	20 %	20 %	40 %	532431850
16229	NC_022121	TTTA	2	8	817182	817189	25 %	75 %	0 %	0 %	532431850
16230	NC_022121	TGA	2	6	817190	817195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431850
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16232	NC_022121	ACTT	2	8	817291	817298	25 %	50 %	0 %	25 %	532431850
16233	NC_022121	GAA	2	6	817316	817321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431850
16234	NC_022121	CTT	2	6	817325	817330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431850
16235	NC_022121	A	6	6	817359	817364	100 %	0 %	0 %	0 %	532431850
16236	NC_022121	GCG	2	6	817367	817372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431850
16237	NC_022121	A	6	6	817423	817428	100 %	0 %	0 %	0 %	532431850
16238	NC_022121	GAT	2	6	817476	817481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431850
16239	NC_022121	TTG	2	6	817483	817488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431850
16240	NC_022121	AGA	2	6	817565	817570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431850
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16242	NC_022121	ATT	2	6	817758	817763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431850
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16362	NC_022121	A	6	6	823824	823829	100 %	0 %	0 %	0 %	532431853
16363	NC_022121	A	6	6	823866	823871	100 %	0 %	0 %	0 %	532431853
16364	NC_022121	TTA	2	6	823947	823952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431853
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16384	NC_022121	AG	3	6	824656	824661	50 %	0 %	50 %	0 %	532431854
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16477	NC_022121	A	7	7	828959	828965	100 %	0 %	0 %	0 %	532431857
16478	NC_022121	TTG	2	6	829007	829012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431857
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16483	NC_022121	TA	3	6	829251	829256	50 %	50 %	0 %	0 %	532431858
16484	NC_022121	CT	3	6	829267	829272	0 %	50 %	0 %	50 %	532431858
16485	NC_022121	TTGT	2	8	829327	829334	0 %	75 %	25 %	0 %	532431858
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16488	NC_022121	T	6	6	829477	829482	0 %	100 %	0 %	0 %	532431858
16489	NC_022121	GTT	2	6	829507	829512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431859
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