MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_022121	TTG	2	6	754679	754684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431800
15002	NC_022121	CT	3	6	754713	754718	0 %	50 %	0 %	50 %	532431800
15003	NC_022121	A	6	6	754747	754752	100 %	0 %	0 %	0 %	532431800
15004	NC_022121	GAAA	2	8	754831	754838	75 %	0 %	25 %	0 %	532431800
15005	NC_022121	CCA	2	6	754954	754959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431800
15006	NC_022121	ACAA	2	8	755049	755056	75 %	0 %	0 %	25 %	532431800
15007	NC_022121	GTTTT	2	10	755221	755230	0 %	80 %	20 %	0 %	532431800
15008	NC_022121	A	6	6	755347	755352	100 %	0 %	0 %	0 %	532431801
15009	NC_022121	TTG	2	6	755355	755360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431801
15010	NC_022121	AAG	2	6	755460	755465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431801
15011	NC_022121	TCT	2	6	755706	755711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431802
15012	NC_022121	TC	3	6	755756	755761	0 %	50 %	0 %	50 %	532431802
15013	NC_022121	GGTA	2	8	755762	755769	25 %	25 %	50 %	0 %	532431802
15014	NC_022121	TCA	2	6	755772	755777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431802
15015	NC_022121	AGC	2	6	755826	755831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431802
15016	NC_022121	T	6	6	755855	755860	0 %	100 %	0 %	0 %	532431802
15017	NC_022121	TTTCT	2	10	755894	755903	0 %	80 %	0 %	20 %	532431802
15018	NC_022121	TCA	2	6	755934	755939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431802
15019	NC_022121	T	7	7	755950	755956	0 %	100 %	0 %	0 %	532431802
15020	NC_022121	GCT	2	6	755967	755972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431802
15021	NC_022121	TTGC	2	8	755983	755990	0 %	50 %	25 %	25 %	532431802
15022	NC_022121	TGA	2	6	756059	756064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431802
15023	NC_022121	TCTT	2	8	756073	756080	0 %	75 %	0 %	25 %	532431802
15024	NC_022121	TCT	2	6	756171	756176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431802
15025	NC_022121	T	7	7	756191	756197	0 %	100 %	0 %	0 %	532431802
15026	NC_022121	GTT	2	6	756246	756251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431802
15027	NC_022121	TA	3	6	756319	756324	50 %	50 %	0 %	0 %	532431802
15028	NC_022121	GAGG	2	8	756379	756386	25 %	0 %	75 %	0 %	532431802
15029	NC_022121	GAATC	2	10	756403	756412	40 %	20 %	20 %	20 %	532431802
15030	NC_022121	TGC	2	6	756434	756439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431802
15031	NC_022121	TAA	2	6	756514	756519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431802
15032	NC_022121	TTG	2	6	756526	756531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431802
15033	NC_022121	CATC	2	8	756574	756581	25 %	25 %	0 %	50 %	532431802
15034	NC_022121	CCT	2	6	756585	756590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431802
15035	NC_022121	GA	3	6	756608	756613	50 %	0 %	50 %	0 %	532431802
15036	NC_022121	TAG	2	6	756650	756655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431802
15037	NC_022121	AGT	2	6	756723	756728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431802
15038	NC_022121	CT	3	6	756764	756769	0 %	50 %	0 %	50 %	532431802
15039	NC_022121	CCT	2	6	756817	756822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431802
15040	NC_022121	TA	3	6	756848	756853	50 %	50 %	0 %	0 %	532431802
15041	NC_022121	CAT	2	6	757024	757029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431802
15042	NC_022121	CTT	2	6	757056	757061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431802
15043	NC_022121	TG	3	6	757128	757133	0 %	50 %	50 %	0 %	532431802
15044	NC_022121	AAT	2	6	757207	757212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431803
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15046	NC_022121	GT	3	6	757260	757265	0 %	50 %	50 %	0 %	532431803
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15048	NC_022121	TCT	3	9	757424	757432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431803
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15052	NC_022121	GAA	2	6	757534	757539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431803
15053	NC_022121	AG	3	6	757622	757627	50 %	0 %	50 %	0 %	532431803
15054	NC_022121	GTA	2	6	757649	757654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431803
15055	NC_022121	A	6	6	757659	757664	100 %	0 %	0 %	0 %	532431803
15056	NC_022121	TCT	2	6	757688	757693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431803
15057	NC_022121	GGA	2	6	757696	757701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431803
15058	NC_022121	TG	3	6	757742	757747	0 %	50 %	50 %	0 %	532431803
15059	NC_022121	T	8	8	757885	757892	0 %	100 %	0 %	0 %	532431803
15060	NC_022121	CTTG	2	8	757908	757915	0 %	50 %	25 %	25 %	532431803
15061	NC_022121	TTC	2	6	757928	757933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431803
15062	NC_022121	T	6	6	757938	757943	0 %	100 %	0 %	0 %	532431803
15063	NC_022121	AGA	2	6	757999	758004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431803
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15065	NC_022121	TTTGG	2	10	758068	758077	0 %	60 %	40 %	0 %	532431803
15066	NC_022121	CAGC	2	8	758114	758121	25 %	0 %	25 %	50 %	532431803
15067	NC_022121	T	6	6	758153	758158	0 %	100 %	0 %	0 %	532431803
15068	NC_022121	A	6	6	758161	758166	100 %	0 %	0 %	0 %	532431803
15069	NC_022121	GTT	2	6	758225	758230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431803
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15075	NC_022121	GAAA	2	8	758470	758477	75 %	0 %	25 %	0 %	532431803
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15077	NC_022121	TG	3	6	758551	758556	0 %	50 %	50 %	0 %	532431803
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15080	NC_022121	CAAT	2	8	758729	758736	50 %	25 %	0 %	25 %	532431803
15081	NC_022121	TCA	2	6	758765	758770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431803
15082	NC_022121	TCA	2	6	758834	758839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431803
15083	NC_022121	ACT	2	6	758852	758857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431803
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15090	NC_022121	GCA	2	6	759460	759465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431804
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15093	NC_022121	AAG	2	6	759528	759533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431804
15094	NC_022121	AG	3	6	759532	759537	50 %	0 %	50 %	0 %	532431804
15095	NC_022121	ATTT	2	8	759678	759685	25 %	75 %	0 %	0 %	532431804
15096	NC_022121	GA	3	6	759720	759725	50 %	0 %	50 %	0 %	532431804
15097	NC_022121	GCT	2	6	759764	759769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431804
15098	NC_022121	AG	3	6	759770	759775	50 %	0 %	50 %	0 %	532431804
15099	NC_022121	CTTT	2	8	759782	759789	0 %	75 %	0 %	25 %	532431804
15100	NC_022121	AAGG	2	8	759821	759828	50 %	0 %	50 %	0 %	532431804
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15103	NC_022121	TTAT	2	8	759935	759942	25 %	75 %	0 %	0 %	532431804
15104	NC_022121	CAG	2	6	760022	760027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431804
15105	NC_022121	GTA	2	6	760052	760057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431804
15106	NC_022121	AG	3	6	760058	760063	50 %	0 %	50 %	0 %	532431804
15107	NC_022121	CGT	2	6	760090	760095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431804
15108	NC_022121	TTC	2	6	760105	760110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431804
15109	NC_022121	AG	3	6	760265	760270	50 %	0 %	50 %	0 %	532431804
15110	NC_022121	GA	3	6	760309	760314	50 %	0 %	50 %	0 %	532431804
15111	NC_022121	CT	3	6	760336	760341	0 %	50 %	0 %	50 %	532431804
15112	NC_022121	AGC	2	6	761200	761205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431805
15113	NC_022121	TGA	2	6	761235	761240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431805
15114	NC_022121	ATC	2	6	761248	761253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431805
15115	NC_022121	T	6	6	761259	761264	0 %	100 %	0 %	0 %	532431805
15116	NC_022121	GA	3	6	761267	761272	50 %	0 %	50 %	0 %	532431805
15117	NC_022121	ATG	2	6	761311	761316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431805
15118	NC_022121	TTTG	2	8	761325	761332	0 %	75 %	25 %	0 %	532431805
15119	NC_022121	AAG	2	6	761417	761422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431805
15120	NC_022121	TA	3	6	761434	761439	50 %	50 %	0 %	0 %	532431805
15121	NC_022121	AGA	2	6	761472	761477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431805
15122	NC_022121	TAT	2	6	761680	761685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431806
15123	NC_022121	T	6	6	761797	761802	0 %	100 %	0 %	0 %	532431806
15124	NC_022121	CAGA	2	8	761842	761849	50 %	0 %	25 %	25 %	532431806
15125	NC_022121	GGT	2	6	761851	761856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431806
15126	NC_022121	CTTC	2	8	761935	761942	0 %	50 %	0 %	50 %	532431806
15127	NC_022121	GCG	2	6	762001	762006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431806
15128	NC_022121	AAG	2	6	762047	762052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431806
15129	NC_022121	AAG	2	6	762077	762082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431806
15130	NC_022121	A	7	7	762107	762113	100 %	0 %	0 %	0 %	532431806
15131	NC_022121	AAC	2	6	762143	762148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431806
15132	NC_022121	AAAC	2	8	762151	762158	75 %	0 %	0 %	25 %	532431806
15133	NC_022121	GTG	2	6	762173	762178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431806
15134	NC_022121	AACC	2	8	762179	762186	50 %	0 %	0 %	50 %	532431806
15135	NC_022121	GAA	2	6	762208	762213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431806
15136	NC_022121	CAG	2	6	762238	762243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431806
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15142	NC_022121	GAA	2	6	762454	762459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431806
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15151	NC_022121	GTA	2	6	762845	762850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431806
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15154	NC_022121	GTT	2	6	762913	762918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431806
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15224	NC_022121	TTCT	2	8	766753	766760	0 %	75 %	0 %	25 %	532431811
15225	NC_022121	AAC	2	6	766846	766851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431811
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15228	NC_022121	TCG	2	6	766928	766933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431811
15229	NC_022121	GGATC	2	10	766935	766944	20 %	20 %	40 %	20 %	532431811
15230	NC_022121	TAAAT	2	10	766976	766985	60 %	40 %	0 %	0 %	532431811
15231	NC_022121	A	6	6	767011	767016	100 %	0 %	0 %	0 %	532431811
15232	NC_022121	GCT	2	6	767031	767036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431811
15233	NC_022121	AAG	2	6	767122	767127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431812
15234	NC_022121	CAGAG	2	10	767139	767148	40 %	0 %	40 %	20 %	532431812
15235	NC_022121	GTT	2	6	767152	767157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431812
15236	NC_022121	AAC	2	6	767283	767288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431812
15237	NC_022121	GCGAT	2	10	767291	767300	20 %	20 %	40 %	20 %	532431812
15238	NC_022121	AGT	2	6	767325	767330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431812
15239	NC_022121	GAA	4	12	767347	767358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431812
15240	NC_022121	AGAA	2	8	767372	767379	75 %	0 %	25 %	0 %	532431812
15241	NC_022121	GCA	3	9	767389	767397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431812
15242	NC_022121	ACG	2	6	767433	767438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431812
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15245	NC_022121	AGA	2	6	767469	767474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431812
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15361	NC_022121	CAATT	2	10	772626	772635	40 %	40 %	0 %	20 %	532431816
15362	NC_022121	CTG	3	9	772692	772700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431816
15363	NC_022121	GCT	2	6	772718	772723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431816
15364	NC_022121	CTT	2	6	772741	772746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431816
15365	NC_022121	ACA	2	6	772823	772828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431816
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15372	NC_022121	ATG	2	6	773195	773200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431816
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15393	NC_022121	AAAG	2	8	774879	774886	75 %	0 %	25 %	0 %	532431817
15394	NC_022121	TGT	2	6	774891	774896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431817
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15421	NC_022121	TCC	2	6	776757	776762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431820
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15432	NC_022121	CAT	2	6	777480	777485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431820
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15441	NC_022121	TTTCCA	2	12	777856	777867	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532431821
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15462	NC_022121	CAATT	2	10	778826	778835	40 %	40 %	0 %	20 %	532431822
15463	NC_022121	GCC	2	6	778886	778891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431822
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15465	NC_022121	T	7	7	778961	778967	0 %	100 %	0 %	0 %	532431822
15466	NC_022121	CAA	2	6	778972	778977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431822
15467	NC_022121	GTT	2	6	779004	779009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431822
15468	NC_022121	GCAA	2	8	779015	779022	50 %	0 %	25 %	25 %	532431822
15469	NC_022121	GAT	2	6	779060	779065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431822
15470	NC_022121	T	7	7	779076	779082	0 %	100 %	0 %	0 %	532431822
15471	NC_022121	AGTG	2	8	779168	779175	25 %	25 %	50 %	0 %	532431822
15472	NC_022121	AGGA	2	8	779430	779437	50 %	0 %	50 %	0 %	532432070
15473	NC_022121	A	7	7	779459	779465	100 %	0 %	0 %	0 %	532432070
15474	NC_022121	CCGA	2	8	779472	779479	25 %	0 %	25 %	50 %	532432070
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15477	NC_022121	CT	3	6	779592	779597	0 %	50 %	0 %	50 %	532431823
15478	NC_022121	AGT	2	6	779791	779796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431823
15479	NC_022121	CTTG	2	8	779924	779931	0 %	50 %	25 %	25 %	532431823
15480	NC_022121	TTA	2	6	780032	780037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431823
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15482	NC_022121	AG	3	6	780141	780146	50 %	0 %	50 %	0 %	532431823
15483	NC_022121	AAT	2	6	780272	780277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431823
15484	NC_022121	GAAG	2	8	780289	780296	50 %	0 %	50 %	0 %	532431823
15485	NC_022121	AGC	2	6	780379	780384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431823
15486	NC_022121	TGT	2	6	780448	780453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431823
15487	NC_022121	GTA	2	6	780485	780490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431823
15488	NC_022121	GTG	2	6	780596	780601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431823
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15491	NC_022121	T	6	6	780745	780750	0 %	100 %	0 %	0 %	532431823
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15499	NC_022121	T	6	6	781721	781726	0 %	100 %	0 %	0 %	532431824
15500	NC_022121	T	6	6	781838	781843	0 %	100 %	0 %	0 %	532431824

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