MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_022121	TCT	2	6	706217	706222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431762
14002	NC_022121	AAC	3	9	706261	706269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431762
14003	NC_022121	CTG	2	6	706306	706311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431762
14004	NC_022121	TTG	2	6	706312	706317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431762
14005	NC_022121	GAT	2	6	706322	706327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431762
14006	NC_022121	GCA	2	6	706331	706336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431762
14007	NC_022121	TGC	3	9	706346	706354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431762
14008	NC_022121	GCAC	2	8	706388	706395	25 %	0 %	25 %	50 %	532431762
14009	NC_022121	GAA	2	6	706401	706406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431762
14010	NC_022121	CAT	2	6	706414	706419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431762
14011	NC_022121	CTC	2	6	706441	706446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431762
14012	NC_022121	TAG	2	6	706452	706457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431762
14013	NC_022121	AG	3	6	706475	706480	50 %	0 %	50 %	0 %	532431762
14014	NC_022121	GCT	2	6	706595	706600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431762
14015	NC_022121	TGAGA	2	10	706707	706716	40 %	20 %	40 %	0 %	532431762
14016	NC_022121	TTC	2	6	706744	706749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431762
14017	NC_022121	CTT	2	6	706755	706760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431762
14018	NC_022121	CTT	2	6	706776	706781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431762
14019	NC_022121	CAT	2	6	706950	706955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431762
14020	NC_022121	GAAAGA	2	12	706958	706969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431762
14021	NC_022121	CTTG	2	8	707001	707008	0 %	50 %	25 %	25 %	532431762
14022	NC_022121	TTC	3	9	707056	707064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431762
14023	NC_022121	CAA	2	6	707196	707201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431762
14024	NC_022121	CT	3	6	707252	707257	0 %	50 %	0 %	50 %	532431762
14025	NC_022121	TCTA	2	8	707275	707282	25 %	50 %	0 %	25 %	532431762
14026	NC_022121	AAG	2	6	707350	707355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431762
14027	NC_022121	CTT	2	6	707367	707372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431762
14028	NC_022121	TTG	2	6	707415	707420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431762
14029	NC_022121	TCT	2	6	707439	707444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431762
14030	NC_022121	TAT	2	6	707466	707471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431762
14031	NC_022121	AAGA	2	8	707741	707748	75 %	0 %	25 %	0 %	532431763
14032	NC_022121	TGAA	2	8	707788	707795	50 %	25 %	25 %	0 %	532431763
14033	NC_022121	CAA	2	6	707852	707857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431763
14034	NC_022121	CT	3	6	707859	707864	0 %	50 %	0 %	50 %	532431763
14035	NC_022121	GCA	2	6	707875	707880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431763
14036	NC_022121	CAG	2	6	707912	707917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431763
14037	NC_022121	TCT	2	6	707971	707976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431763
14038	NC_022121	TA	3	6	708038	708043	50 %	50 %	0 %	0 %	532431763
14039	NC_022121	CTG	2	6	708080	708085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431763
14040	NC_022121	CGC	2	6	708188	708193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431763
14041	NC_022121	TGC	3	9	708252	708260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431763
14042	NC_022121	GAA	2	6	708271	708276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431763
14043	NC_022121	GAA	2	6	708280	708285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431763
14044	NC_022121	CCT	2	6	708346	708351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431763
14045	NC_022121	GTT	2	6	708413	708418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431763
14046	NC_022121	TTGCA	2	10	708588	708597	20 %	40 %	20 %	20 %	532431763
14047	NC_022121	CAT	2	6	708620	708625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431763
14048	NC_022121	CAA	2	6	708630	708635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431763
14049	NC_022121	TTC	2	6	708641	708646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431763
14050	NC_022121	AGC	2	6	708693	708698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431763
14051	NC_022121	CTC	2	6	708780	708785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431763
14052	NC_022121	T	6	6	708789	708794	0 %	100 %	0 %	0 %	532431763
14053	NC_022121	GCA	2	6	708856	708861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431763
14054	NC_022121	AATT	2	8	708864	708871	50 %	50 %	0 %	0 %	532431763
14055	NC_022121	TAG	2	6	708875	708880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431763
14056	NC_022121	TAT	2	6	708899	708904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431763
14057	NC_022121	GAA	2	6	708917	708922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431763
14058	NC_022121	AGA	2	6	708993	708998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431763
14059	NC_022121	TTG	2	6	709090	709095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431763
14060	NC_022121	ATCTG	2	10	709123	709132	20 %	40 %	20 %	20 %	532431763
14061	NC_022121	GTT	2	6	709144	709149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431763
14062	NC_022121	TAAC	2	8	709187	709194	50 %	25 %	0 %	25 %	532431763
14063	NC_022121	CTT	2	6	709235	709240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431763
14064	NC_022121	TTC	2	6	709266	709271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431763
14065	NC_022121	TTTCG	2	10	709326	709335	0 %	60 %	20 %	20 %	532431763
14066	NC_022121	GA	5	10	709460	709469	50 %	0 %	50 %	0 %	532431763
14067	NC_022121	AG	3	6	709510	709515	50 %	0 %	50 %	0 %	532431763
14068	NC_022121	ATGC	2	8	709520	709527	25 %	25 %	25 %	25 %	532431763
14069	NC_022121	A	6	6	709540	709545	100 %	0 %	0 %	0 %	532431763
14070	NC_022121	GCT	2	6	709551	709556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431763
14071	NC_022121	TAA	2	6	709637	709642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431763
14072	NC_022121	AGA	2	6	709665	709670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431763
14073	NC_022121	GAA	2	6	709809	709814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431764
14074	NC_022121	AGC	2	6	709883	709888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431764
14075	NC_022121	GAAA	2	8	709898	709905	75 %	0 %	25 %	0 %	532431764
14076	NC_022121	TAGT	2	8	709950	709957	25 %	50 %	25 %	0 %	532431764
14077	NC_022121	TCG	2	6	710114	710119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431764
14078	NC_022121	AG	3	6	710130	710135	50 %	0 %	50 %	0 %	532431764
14079	NC_022121	GTT	2	6	710190	710195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431764
14080	NC_022121	T	6	6	710262	710267	0 %	100 %	0 %	0 %	532431764
14081	NC_022121	CAAC	2	8	710305	710312	50 %	0 %	0 %	50 %	532431764
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14084	NC_022121	CAA	2	6	710413	710418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431764
14085	NC_022121	ACC	2	6	710513	710518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431764
14086	NC_022121	AAG	2	6	710697	710702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431764
14087	NC_022121	CTG	2	6	710722	710727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431764
14088	NC_022121	AGA	2	6	710729	710734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431764
14089	NC_022121	AGC	2	6	710786	710791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431764
14090	NC_022121	GGTA	2	8	710834	710841	25 %	25 %	50 %	0 %	532431764
14091	NC_022121	TAA	2	6	711056	711061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431764
14092	NC_022121	GC	3	6	711064	711069	0 %	0 %	50 %	50 %	532431764
14093	NC_022121	T	6	6	711092	711097	0 %	100 %	0 %	0 %	532431764
14094	NC_022121	AAG	2	6	711384	711389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431765
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14097	NC_022121	A	6	6	711488	711493	100 %	0 %	0 %	0 %	532431765
14098	NC_022121	TTG	2	6	711507	711512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431765
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14100	NC_022121	TAA	2	6	711576	711581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431765
14101	NC_022121	GCT	2	6	711584	711589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431765
14102	NC_022121	CT	3	6	711617	711622	0 %	50 %	0 %	50 %	532431765
14103	NC_022121	AAG	2	6	711711	711716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431765
14104	NC_022121	GCA	2	6	711788	711793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431765
14105	NC_022121	CTT	2	6	711827	711832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431765
14106	NC_022121	ATAGA	2	10	711835	711844	60 %	20 %	20 %	0 %	532431765
14107	NC_022121	GAG	2	6	711855	711860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431765
14108	NC_022121	AAT	2	6	711874	711879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431765
14109	NC_022121	GCAAA	2	10	711969	711978	60 %	0 %	20 %	20 %	532431765
14110	NC_022121	ACC	2	6	712001	712006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431765
14111	NC_022121	TTG	2	6	712054	712059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431765
14112	NC_022121	TCTTGA	2	12	712064	712075	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532431765
14113	NC_022121	AAAT	2	8	712123	712130	75 %	25 %	0 %	0 %	532431765
14114	NC_022121	TGT	2	6	712142	712147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431765
14115	NC_022121	AT	3	6	712190	712195	50 %	50 %	0 %	0 %	532431765
14116	NC_022121	CG	3	6	712196	712201	0 %	0 %	50 %	50 %	532431765
14117	NC_022121	ACA	2	6	712373	712378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431765
14118	NC_022121	AAC	2	6	712459	712464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431765
14119	NC_022121	CTT	2	6	712492	712497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431765
14120	NC_022121	CAT	2	6	712531	712536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431765
14121	NC_022121	ATA	2	6	712647	712652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431765
14122	NC_022121	A	8	8	712784	712791	100 %	0 %	0 %	0 %	532431765
14123	NC_022121	AGCC	2	8	712804	712811	25 %	0 %	25 %	50 %	532431765
14124	NC_022121	CTA	2	6	712821	712826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431765
14125	NC_022121	GAC	2	6	712881	712886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431765
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14127	NC_022121	TCA	2	6	712937	712942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431765
14128	NC_022121	TCA	2	6	712950	712955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431765
14129	NC_022121	TCC	3	9	713137	713145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431766
14130	NC_022121	GCT	2	6	713177	713182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431766
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14136	NC_022121	CAT	2	6	713338	713343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431766
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14141	NC_022121	C	6	6	713541	713546	0 %	0 %	0 %	100 %	532431766
14142	NC_022121	TCC	2	6	713560	713565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431766
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14150	NC_022121	A	9	9	714029	714037	100 %	0 %	0 %	0 %	532432067
14151	NC_022121	CAA	2	6	714175	714180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431767
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14155	NC_022121	TTTC	2	8	714286	714293	0 %	75 %	0 %	25 %	532431767
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14227	NC_022121	CAT	2	6	717799	717804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431771
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14229	NC_022121	AAG	2	6	717938	717943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431771
14230	NC_022121	TAA	2	6	717973	717978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431771
14231	NC_022121	GAAA	2	8	718116	718123	75 %	0 %	25 %	0 %	532431771
14232	NC_022121	TCA	2	6	718212	718217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431771
14233	NC_022121	A	7	7	718217	718223	100 %	0 %	0 %	0 %	532431771
14234	NC_022121	AAAAC	2	10	718236	718245	80 %	0 %	0 %	20 %	532431771
14235	NC_022121	GAAC	2	8	718266	718273	50 %	0 %	25 %	25 %	532431771
14236	NC_022121	CT	3	6	718274	718279	0 %	50 %	0 %	50 %	532431771
14237	NC_022121	TGC	2	6	718335	718340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431771
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14239	NC_022121	ATAA	2	8	718442	718449	75 %	25 %	0 %	0 %	532431771
14240	NC_022121	AAC	2	6	718637	718642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431772
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14242	NC_022121	G	7	7	718715	718721	0 %	0 %	100 %	0 %	532431772
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14487	NC_022121	AATA	2	8	729352	729359	75 %	25 %	0 %	0 %	532431780
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