MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022121	GAA	2	6	682056	682061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431742
13502	NC_022121	CTT	2	6	682064	682069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431742
13503	NC_022121	ACTA	2	8	682118	682125	50 %	25 %	0 %	25 %	532431742
13504	NC_022121	ATC	2	6	682128	682133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431742
13505	NC_022121	ATT	2	6	682167	682172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431742
13506	NC_022121	CT	3	6	682186	682191	0 %	50 %	0 %	50 %	532431742
13507	NC_022121	CTT	2	6	682209	682214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431742
13508	NC_022121	AGA	2	6	682366	682371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431743
13509	NC_022121	AAC	2	6	682445	682450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431743
13510	NC_022121	AGCG	2	8	682484	682491	25 %	0 %	50 %	25 %	532431743
13511	NC_022121	AAG	2	6	682534	682539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431743
13512	NC_022121	TCC	2	6	682574	682579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431743
13513	NC_022121	GTC	2	6	682622	682627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431743
13514	NC_022121	ATCT	2	8	682675	682682	25 %	50 %	0 %	25 %	532431743
13515	NC_022121	AGA	2	6	682735	682740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431743
13516	NC_022121	AG	3	6	682770	682775	50 %	0 %	50 %	0 %	532431743
13517	NC_022121	TTTC	2	8	682777	682784	0 %	75 %	0 %	25 %	532431743
13518	NC_022121	TCT	2	6	682785	682790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431743
13519	NC_022121	AAC	2	6	682796	682801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431743
13520	NC_022121	ATA	2	6	682848	682853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431743
13521	NC_022121	TTC	2	6	683061	683066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431744
13522	NC_022121	CT	3	6	683076	683081	0 %	50 %	0 %	50 %	532431744
13523	NC_022121	AAC	2	6	683122	683127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431744
13524	NC_022121	GTC	2	6	683134	683139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431744
13525	NC_022121	GA	3	6	683255	683260	50 %	0 %	50 %	0 %	532431744
13526	NC_022121	CCT	3	9	683276	683284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431744
13527	NC_022121	CTG	2	6	683293	683298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431744
13528	NC_022121	GAAT	2	8	683408	683415	50 %	25 %	25 %	0 %	532431744
13529	NC_022121	CACC	2	8	683419	683426	25 %	0 %	0 %	75 %	532431744
13530	NC_022121	AGA	2	6	683472	683477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431744
13531	NC_022121	TCC	2	6	683494	683499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431744
13532	NC_022121	GCA	2	6	683515	683520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431744
13533	NC_022121	ATAC	2	8	683527	683534	50 %	25 %	0 %	25 %	532431744
13534	NC_022121	GAA	2	6	683542	683547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431744
13535	NC_022121	CTT	2	6	683585	683590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431744
13536	NC_022121	A	6	6	683617	683622	100 %	0 %	0 %	0 %	532431744
13537	NC_022121	AGA	2	6	683682	683687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431744
13538	NC_022121	TC	3	6	683727	683732	0 %	50 %	0 %	50 %	532431744
13539	NC_022121	CG	3	6	683809	683814	0 %	0 %	50 %	50 %	532431744
13540	NC_022121	CACAG	2	10	683832	683841	40 %	0 %	20 %	40 %	532431744
13541	NC_022121	CT	3	6	683854	683859	0 %	50 %	0 %	50 %	532431744
13542	NC_022121	TAA	2	6	683883	683888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431744
13543	NC_022121	AAC	2	6	683940	683945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431744
13544	NC_022121	GAA	2	6	683951	683956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431744
13545	NC_022121	A	6	6	683962	683967	100 %	0 %	0 %	0 %	532431744
13546	NC_022121	AAT	2	6	683978	683983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431744
13547	NC_022121	ACTA	2	8	683997	684004	50 %	25 %	0 %	25 %	532431744
13548	NC_022121	TAA	2	6	684050	684055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431744
13549	NC_022121	CA	3	6	684082	684087	50 %	0 %	0 %	50 %	532431744
13550	NC_022121	TTC	2	6	684129	684134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431744
13551	NC_022121	TTC	2	6	684151	684156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431744
13552	NC_022121	CG	3	6	684211	684216	0 %	0 %	50 %	50 %	532431744
13553	NC_022121	ATAC	2	8	684224	684231	50 %	25 %	0 %	25 %	532431744
13554	NC_022121	A	6	6	684272	684277	100 %	0 %	0 %	0 %	532431744
13555	NC_022121	TTTTC	2	10	684287	684296	0 %	80 %	0 %	20 %	532431744
13556	NC_022121	AAG	2	6	684300	684305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431744
13557	NC_022121	TAA	2	6	684366	684371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431744
13558	NC_022121	CG	3	6	684601	684606	0 %	0 %	50 %	50 %	532431744
13559	NC_022121	GAAG	2	8	684756	684763	50 %	0 %	50 %	0 %	532431745
13560	NC_022121	CA	3	6	684801	684806	50 %	0 %	0 %	50 %	532431745
13561	NC_022121	TAA	2	6	684871	684876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431745
13562	NC_022121	TAA	3	9	684913	684921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431745
13563	NC_022121	GAA	2	6	684993	684998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431745
13564	NC_022121	A	6	6	685060	685065	100 %	0 %	0 %	0 %	532431745
13565	NC_022121	CATA	2	8	685071	685078	50 %	25 %	0 %	25 %	532431745
13566	NC_022121	GAA	2	6	685083	685088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431745
13567	NC_022121	TTTA	2	8	685111	685118	25 %	75 %	0 %	0 %	532431745
13568	NC_022121	CATC	2	8	685140	685147	25 %	25 %	0 %	50 %	532431745
13569	NC_022121	GATA	2	8	685201	685208	50 %	25 %	25 %	0 %	532431745
13570	NC_022121	TGT	2	6	685225	685230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431745
13571	NC_022121	AATC	2	8	685285	685292	50 %	25 %	0 %	25 %	532431745
13572	NC_022121	TCCC	2	8	685467	685474	0 %	25 %	0 %	75 %	532431745
13573	NC_022121	AATT	2	8	685498	685505	50 %	50 %	0 %	0 %	532431745
13574	NC_022121	CTT	2	6	685507	685512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431745
13575	NC_022121	GCT	2	6	685513	685518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431745
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13577	NC_022121	ATGA	2	8	685553	685560	50 %	25 %	25 %	0 %	532431745
13578	NC_022121	CAG	2	6	685623	685628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431745
13579	NC_022121	TCT	2	6	685667	685672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431745
13580	NC_022121	TCT	2	6	685868	685873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431745
13581	NC_022121	TAG	2	6	685927	685932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431745
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13583	NC_022121	TCT	2	6	686245	686250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431746
13584	NC_022121	ACC	2	6	686272	686277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431746
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13588	NC_022121	TGA	2	6	686366	686371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431746
13589	NC_022121	CTT	2	6	686422	686427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431746
13590	NC_022121	ATC	2	6	686455	686460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431746
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13592	NC_022121	CTT	2	6	686469	686474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431746
13593	NC_022121	TGC	2	6	686526	686531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431746
13594	NC_022121	TTTG	2	8	686636	686643	0 %	75 %	25 %	0 %	532431746
13595	NC_022121	AG	3	6	686780	686785	50 %	0 %	50 %	0 %	532431746
13596	NC_022121	CT	3	6	686797	686802	0 %	50 %	0 %	50 %	532431747
13597	NC_022121	TCTGC	2	10	686837	686846	0 %	40 %	20 %	40 %	532431747
13598	NC_022121	ATC	2	6	687009	687014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431748
13599	NC_022121	T	6	6	687026	687031	0 %	100 %	0 %	0 %	532431748
13600	NC_022121	TAAT	2	8	687039	687046	50 %	50 %	0 %	0 %	532431748
13601	NC_022121	GCAA	2	8	687107	687114	50 %	0 %	25 %	25 %	532431748
13602	NC_022121	GCA	2	6	687165	687170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431748
13603	NC_022121	AATT	2	8	687209	687216	50 %	50 %	0 %	0 %	532431748
13604	NC_022121	GA	3	6	687262	687267	50 %	0 %	50 %	0 %	532431748
13605	NC_022121	AGA	2	6	687306	687311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431748
13606	NC_022121	TGCC	2	8	687410	687417	0 %	25 %	25 %	50 %	532431748
13607	NC_022121	T	6	6	687539	687544	0 %	100 %	0 %	0 %	532431748
13608	NC_022121	A	6	6	687579	687584	100 %	0 %	0 %	0 %	532431748
13609	NC_022121	GCAA	2	8	687585	687592	50 %	0 %	25 %	25 %	532431748
13610	NC_022121	G	6	6	687645	687650	0 %	0 %	100 %	0 %	532431748
13611	NC_022121	GCA	2	6	687781	687786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431749
13612	NC_022121	AGCTGG	2	12	687831	687842	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532431749
13613	NC_022121	AGT	2	6	687858	687863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431749
13614	NC_022121	TTTA	2	8	687878	687885	25 %	75 %	0 %	0 %	532431749
13615	NC_022121	AGA	2	6	687888	687893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431749
13616	NC_022121	AGC	2	6	687942	687947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431749
13617	NC_022121	TAGA	2	8	688067	688074	50 %	25 %	25 %	0 %	532431749
13618	NC_022121	TTAT	2	8	688088	688095	25 %	75 %	0 %	0 %	532431749
13619	NC_022121	ATTA	2	8	688116	688123	50 %	50 %	0 %	0 %	532431749
13620	NC_022121	TGCAA	3	15	688162	688176	40 %	20 %	20 %	20 %	532431749
13621	NC_022121	TC	3	6	688184	688189	0 %	50 %	0 %	50 %	532431749
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13623	NC_022121	TGC	2	6	688287	688292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431749
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13740	NC_022121	GATA	2	8	693512	693519	50 %	25 %	25 %	0 %	532431754
13741	NC_022121	TTG	2	6	693530	693535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431754
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13744	NC_022121	CCGCT	2	10	693548	693557	0 %	20 %	20 %	60 %	532431754
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13867	NC_022121	CTT	2	6	700016	700021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431760
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13986	NC_022121	CTG	2	6	705157	705162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431762
13987	NC_022121	ATG	2	6	705366	705371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431762
13988	NC_022121	TTG	2	6	705380	705385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431762
13989	NC_022121	TCA	2	6	705458	705463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431762
13990	NC_022121	TTG	2	6	705478	705483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431762
13991	NC_022121	GCT	2	6	705503	705508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431762
13992	NC_022121	TTTCT	2	10	705538	705547	0 %	80 %	0 %	20 %	532431762
13993	NC_022121	ACA	2	6	705611	705616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431762
13994	NC_022121	TACA	2	8	705664	705671	50 %	25 %	0 %	25 %	532431762
13995	NC_022121	AGACG	2	10	705728	705737	40 %	0 %	40 %	20 %	532431762
13996	NC_022121	TCAA	2	8	705779	705786	50 %	25 %	0 %	25 %	532431762
13997	NC_022121	TTC	2	6	705929	705934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431762
13998	NC_022121	GAAT	2	8	705951	705958	50 %	25 %	25 %	0 %	532431762
13999	NC_022121	TCA	2	6	706052	706057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431762
14000	NC_022121	TTA	2	6	706181	706186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431762

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