MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022121	CAA	2	6	658375	658380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431725
13002	NC_022121	CTTTT	2	10	658383	658392	0 %	80 %	0 %	20 %	532431725
13003	NC_022121	T	7	7	658389	658395	0 %	100 %	0 %	0 %	532431725
13004	NC_022121	ATT	2	6	658410	658415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431725
13005	NC_022121	AAG	2	6	658439	658444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431725
13006	NC_022121	CTC	2	6	658447	658452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431725
13007	NC_022121	CTT	2	6	658498	658503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431725
13008	NC_022121	GAC	2	6	658528	658533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431725
13009	NC_022121	AAC	2	6	658559	658564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431725
13010	NC_022121	ACA	2	6	658669	658674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431726
13011	NC_022121	T	6	6	658687	658692	0 %	100 %	0 %	0 %	532431726
13012	NC_022121	GTT	2	6	658717	658722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431726
13013	NC_022121	ATG	2	6	658778	658783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431726
13014	NC_022121	TCA	2	6	658824	658829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431726
13015	NC_022121	CT	3	6	658886	658891	0 %	50 %	0 %	50 %	532431726
13016	NC_022121	A	7	7	658983	658989	100 %	0 %	0 %	0 %	532431726
13017	NC_022121	A	7	7	659001	659007	100 %	0 %	0 %	0 %	532431726
13018	NC_022121	AAG	2	6	659022	659027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431726
13019	NC_022121	GAA	2	6	659054	659059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431726
13020	NC_022121	A	9	9	659279	659287	100 %	0 %	0 %	0 %	532431727
13021	NC_022121	TTC	2	6	659393	659398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431727
13022	NC_022121	ACT	2	6	659423	659428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431727
13023	NC_022121	AGA	2	6	659440	659445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431727
13024	NC_022121	T	6	6	659571	659576	0 %	100 %	0 %	0 %	532431727
13025	NC_022121	GAA	2	6	659651	659656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431727
13026	NC_022121	A	6	6	659937	659942	100 %	0 %	0 %	0 %	532431727
13027	NC_022121	TTTA	3	12	660010	660021	25 %	75 %	0 %	0 %	532431727
13028	NC_022121	GAA	2	6	660047	660052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431727
13029	NC_022121	AGA	2	6	660055	660060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431727
13030	NC_022121	AGA	2	6	660121	660126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431727
13031	NC_022121	AATC	2	8	660127	660134	50 %	25 %	0 %	25 %	532431727
13032	NC_022121	CAA	2	6	660206	660211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431727
13033	NC_022121	A	6	6	660219	660224	100 %	0 %	0 %	0 %	532431727
13034	NC_022121	TAAA	2	8	660310	660317	75 %	25 %	0 %	0 %	532431727
13035	NC_022121	A	6	6	660315	660320	100 %	0 %	0 %	0 %	532431727
13036	NC_022121	GGA	3	9	660344	660352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431728
13037	NC_022121	TCC	2	6	660387	660392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431728
13038	NC_022121	ATA	2	6	660549	660554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431728
13039	NC_022121	CTT	2	6	660592	660597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431728
13040	NC_022121	CTA	2	6	660628	660633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431728
13041	NC_022121	TAC	2	6	660638	660643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431728
13042	NC_022121	A	6	6	660684	660689	100 %	0 %	0 %	0 %	532431728
13043	NC_022121	CTT	2	6	660692	660697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431728
13044	NC_022121	ATG	2	6	660702	660707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431728
13045	NC_022121	ACT	2	6	660813	660818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431728
13046	NC_022121	CT	3	6	660869	660874	0 %	50 %	0 %	50 %	532431728
13047	NC_022121	CCT	2	6	660903	660908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431728
13048	NC_022121	TCT	2	6	660957	660962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431728
13049	NC_022121	ACC	2	6	661061	661066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431728
13050	NC_022121	CT	3	6	661077	661082	0 %	50 %	0 %	50 %	532431728
13051	NC_022121	GAA	2	6	661145	661150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431728
13052	NC_022121	T	8	8	661167	661174	0 %	100 %	0 %	0 %	532431728
13053	NC_022121	ATT	2	6	661269	661274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431728
13054	NC_022121	GCT	2	6	661292	661297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431728
13055	NC_022121	GCC	2	6	661306	661311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431728
13056	NC_022121	CCT	2	6	661318	661323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431728
13057	NC_022121	GAT	2	6	661337	661342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431728
13058	NC_022121	GAG	2	6	661401	661406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431728
13059	NC_022121	TAG	2	6	661428	661433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431728
13060	NC_022121	GAA	2	6	661484	661489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431728
13061	NC_022121	TCG	2	6	661492	661497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431728
13062	NC_022121	ATC	2	6	661568	661573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431728
13063	NC_022121	GAT	2	6	661643	661648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431728
13064	NC_022121	AGA	2	6	661654	661659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431728
13065	NC_022121	A	6	6	661689	661694	100 %	0 %	0 %	0 %	532431728
13066	NC_022121	A	7	7	661714	661720	100 %	0 %	0 %	0 %	532431728
13067	NC_022121	TGC	2	6	661762	661767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431728
13068	NC_022121	CAG	2	6	661794	661799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431728
13069	NC_022121	ATTG	2	8	661846	661853	25 %	50 %	25 %	0 %	532431728
13070	NC_022121	TCT	2	6	661861	661866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431728
13071	NC_022121	AAG	2	6	661923	661928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431728
13072	NC_022121	GTA	2	6	661938	661943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431728
13073	NC_022121	CT	3	6	661948	661953	0 %	50 %	0 %	50 %	532431728
13074	NC_022121	ACG	2	6	662056	662061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431728
13075	NC_022121	CAA	2	6	662087	662092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431728
13076	NC_022121	TAT	2	6	662113	662118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431728
13077	NC_022121	AAG	2	6	662148	662153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431728
13078	NC_022121	AAG	2	6	662160	662165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431728
13079	NC_022121	AGC	2	6	662239	662244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431728
13080	NC_022121	TGA	2	6	662286	662291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431728
13081	NC_022121	GCA	2	6	662294	662299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431728
13082	NC_022121	A	7	7	662299	662305	100 %	0 %	0 %	0 %	532431728
13083	NC_022121	CTC	2	6	662309	662314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431728
13084	NC_022121	GAA	3	9	662327	662335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431728
13085	NC_022121	GTC	2	6	662518	662523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431729
13086	NC_022121	GA	3	6	662541	662546	50 %	0 %	50 %	0 %	532431729
13087	NC_022121	TCA	2	6	662588	662593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431729
13088	NC_022121	GCGT	2	8	662617	662624	0 %	25 %	50 %	25 %	532431729
13089	NC_022121	TGAT	2	8	662795	662802	25 %	50 %	25 %	0 %	532431729
13090	NC_022121	GCT	2	6	662875	662880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431729
13091	NC_022121	TGG	2	6	662916	662921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431729
13092	NC_022121	ATG	2	6	662950	662955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431729
13093	NC_022121	ATGC	2	8	662974	662981	25 %	25 %	25 %	25 %	532431729
13094	NC_022121	A	8	8	663081	663088	100 %	0 %	0 %	0 %	532431729
13095	NC_022121	TGA	2	6	663123	663128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431729
13096	NC_022121	AGA	2	6	663216	663221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431729
13097	NC_022121	GCT	2	6	663244	663249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431729
13098	NC_022121	TCT	2	6	663250	663255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431729
13099	NC_022121	ATG	2	6	663281	663286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431729
13100	NC_022121	GAA	2	6	663370	663375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431729
13101	NC_022121	GAC	2	6	663436	663441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431729
13102	NC_022121	ATTG	2	8	663462	663469	25 %	50 %	25 %	0 %	532431729
13103	NC_022121	TCA	2	6	663506	663511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431729
13104	NC_022121	AACCA	2	10	663512	663521	60 %	0 %	0 %	40 %	532431729
13105	NC_022121	GCTAC	2	10	663575	663584	20 %	20 %	20 %	40 %	532431729
13106	NC_022121	AGA	2	6	663612	663617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431729
13107	NC_022121	TAC	2	6	663618	663623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431729
13108	NC_022121	GAA	2	6	663724	663729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431729
13109	NC_022121	AATA	2	8	663931	663938	75 %	25 %	0 %	0 %	532431730
13110	NC_022121	CACG	2	8	663956	663963	25 %	0 %	25 %	50 %	532431730
13111	NC_022121	TG	3	6	663988	663993	0 %	50 %	50 %	0 %	532431730
13112	NC_022121	TAT	2	6	663999	664004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431730
13113	NC_022121	CTC	2	6	664062	664067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431730
13114	NC_022121	TTTA	2	8	664095	664102	25 %	75 %	0 %	0 %	532431730
13115	NC_022121	ACA	2	6	664116	664121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431730
13116	NC_022121	CT	3	6	664151	664156	0 %	50 %	0 %	50 %	532431730
13117	NC_022121	CTG	2	6	664190	664195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431730
13118	NC_022121	A	7	7	664266	664272	100 %	0 %	0 %	0 %	532431730
13119	NC_022121	AAC	2	6	664316	664321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431730
13120	NC_022121	AAG	2	6	664451	664456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431730
13121	NC_022121	TATT	2	8	664492	664499	25 %	75 %	0 %	0 %	532431730
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13228	NC_022121	TTC	2	6	669088	669093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431732
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13231	NC_022121	CT	3	6	669190	669195	0 %	50 %	0 %	50 %	532431732
13232	NC_022121	T	7	7	669279	669285	0 %	100 %	0 %	0 %	532431732
13233	NC_022121	GCA	2	6	669299	669304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431732
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13240	NC_022121	TGCT	2	8	669664	669671	0 %	50 %	25 %	25 %	532431732
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13242	NC_022121	AGAAAG	2	12	669781	669792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431732
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13245	NC_022121	TAG	2	6	669886	669891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431732
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13272	NC_022121	TC	3	6	670968	670973	0 %	50 %	0 %	50 %	532431733
13273	NC_022121	T	6	6	671031	671036	0 %	100 %	0 %	0 %	532431733
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13485	NC_022121	TAA	2	6	681222	681227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431741
13486	NC_022121	CCT	2	6	681309	681314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431741
13487	NC_022121	TCA	2	6	681328	681333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431741
13488	NC_022121	ACCT	2	8	681414	681421	25 %	25 %	0 %	50 %	532431741
13489	NC_022121	TCT	2	6	681506	681511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431741
13490	NC_022121	AAAT	2	8	681517	681524	75 %	25 %	0 %	0 %	532431741
13491	NC_022121	CAA	2	6	681536	681541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431741
13492	NC_022121	A	8	8	681546	681553	100 %	0 %	0 %	0 %	532431741
13493	NC_022121	CATATT	2	12	681656	681667	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532431741
13494	NC_022121	GA	3	6	681678	681683	50 %	0 %	50 %	0 %	532431741
13495	NC_022121	CGT	2	6	681718	681723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431741
13496	NC_022121	A	7	7	681730	681736	100 %	0 %	0 %	0 %	532431741
13497	NC_022121	TAA	2	6	681739	681744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431741
13498	NC_022121	GCT	2	6	681802	681807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431741
13499	NC_022121	AAC	2	6	681960	681965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431742
13500	NC_022121	TAT	2	6	682016	682021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431742

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