MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022121	AT	3	6	608215	608220	50 %	50 %	0 %	0 %	532431684
12002	NC_022121	CAT	2	6	608421	608426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431685
12003	NC_022121	CAT	2	6	608496	608501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431685
12004	NC_022121	GGA	2	6	608536	608541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431685
12005	NC_022121	A	6	6	608565	608570	100 %	0 %	0 %	0 %	532431685
12006	NC_022121	TAA	2	6	608607	608612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431685
12007	NC_022121	ATTTT	2	10	608620	608629	20 %	80 %	0 %	0 %	532431685
12008	NC_022121	GAAC	2	8	608704	608711	50 %	0 %	25 %	25 %	532431685
12009	NC_022121	GAT	2	6	608768	608773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431685
12010	NC_022121	CT	3	6	608865	608870	0 %	50 %	0 %	50 %	532431685
12011	NC_022121	GCT	2	6	608923	608928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431685
12012	NC_022121	T	6	6	609036	609041	0 %	100 %	0 %	0 %	532431685
12013	NC_022121	CAA	2	6	609208	609213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431685
12014	NC_022121	CTT	2	6	609272	609277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431685
12015	NC_022121	CAA	2	6	609338	609343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431685
12016	NC_022121	CCA	2	6	609376	609381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431685
12017	NC_022121	CGCA	2	8	609426	609433	25 %	0 %	25 %	50 %	532431685
12018	NC_022121	TCA	2	6	609439	609444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431685
12019	NC_022121	AAC	2	6	609505	609510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431685
12020	NC_022121	GATA	2	8	609545	609552	50 %	25 %	25 %	0 %	532431685
12021	NC_022121	AGT	2	6	609566	609571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431685
12022	NC_022121	TTC	2	6	609738	609743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431685
12023	NC_022121	TCA	2	6	609760	609765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431685
12024	NC_022121	ACA	2	6	609797	609802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431685
12025	NC_022121	GAA	2	6	609811	609816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431685
12026	NC_022121	CA	3	6	609891	609896	50 %	0 %	0 %	50 %	532431685
12027	NC_022121	TGA	2	6	609931	609936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431685
12028	NC_022121	AC	3	6	609960	609965	50 %	0 %	0 %	50 %	532431685
12029	NC_022121	AAC	2	6	610005	610010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431685
12030	NC_022121	CACC	2	8	610035	610042	25 %	0 %	0 %	75 %	532431685
12031	NC_022121	AACC	2	8	610114	610121	50 %	0 %	0 %	50 %	532431685
12032	NC_022121	TTG	2	6	610135	610140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431686
12033	NC_022121	ACAA	2	8	610219	610226	75 %	0 %	0 %	25 %	532431686
12034	NC_022121	TTG	2	6	610234	610239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431686
12035	NC_022121	GCA	2	6	610244	610249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431686
12036	NC_022121	CTT	2	6	610270	610275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431686
12037	NC_022121	CTGC	2	8	610347	610354	0 %	25 %	25 %	50 %	532431686
12038	NC_022121	CCAAAA	2	12	610448	610459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431686
12039	NC_022121	TCA	2	6	610496	610501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431686
12040	NC_022121	CGCC	2	8	610505	610512	0 %	0 %	25 %	75 %	532431686
12041	NC_022121	TAA	2	6	610574	610579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431686
12042	NC_022121	GATT	2	8	610602	610609	25 %	50 %	25 %	0 %	532431686
12043	NC_022121	ATC	2	6	610672	610677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431686
12044	NC_022121	TCT	2	6	610721	610726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431686
12045	NC_022121	TCTT	2	8	610768	610775	0 %	75 %	0 %	25 %	532431686
12046	NC_022121	GAA	2	6	610810	610815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431686
12047	NC_022121	A	6	6	610862	610867	100 %	0 %	0 %	0 %	532431686
12048	NC_022121	AG	4	8	610922	610929	50 %	0 %	50 %	0 %	532431686
12049	NC_022121	TGA	2	6	610982	610987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431686
12050	NC_022121	TTG	2	6	611008	611013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431686
12051	NC_022121	ATA	2	6	611041	611046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431686
12052	NC_022121	TTA	2	6	611051	611056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431686
12053	NC_022121	CAG	2	6	611070	611075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431686
12054	NC_022121	CAA	2	6	611083	611088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431686
12055	NC_022121	AAC	2	6	611095	611100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431686
12056	NC_022121	TGC	2	6	611101	611106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431686
12057	NC_022121	T	7	7	611139	611145	0 %	100 %	0 %	0 %	532431686
12058	NC_022121	AAG	2	6	611150	611155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431686
12059	NC_022121	T	6	6	611168	611173	0 %	100 %	0 %	0 %	532431686
12060	NC_022121	A	6	6	611201	611206	100 %	0 %	0 %	0 %	532431686
12061	NC_022121	TCA	2	6	611240	611245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431686
12062	NC_022121	AGA	2	6	611299	611304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431686
12063	NC_022121	T	6	6	611318	611323	0 %	100 %	0 %	0 %	532431686
12064	NC_022121	CCT	2	6	611842	611847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431687
12065	NC_022121	TCT	2	6	611915	611920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431687
12066	NC_022121	TTC	2	6	611944	611949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431687
12067	NC_022121	TGCCA	2	10	611976	611985	20 %	20 %	20 %	40 %	532431687
12068	NC_022121	GTA	2	6	612035	612040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431687
12069	NC_022121	CT	3	6	612041	612046	0 %	50 %	0 %	50 %	532431687
12070	NC_022121	GATT	2	8	612125	612132	25 %	50 %	25 %	0 %	532431687
12071	NC_022121	TCT	2	6	612152	612157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431687
12072	NC_022121	TC	3	6	612162	612167	0 %	50 %	0 %	50 %	532431687
12073	NC_022121	GGTT	2	8	612208	612215	0 %	50 %	50 %	0 %	532431687
12074	NC_022121	GGATGG	2	12	612220	612231	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532431687
12075	NC_022121	AG	4	8	612273	612280	50 %	0 %	50 %	0 %	532431687
12076	NC_022121	TGG	2	6	612286	612291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431687
12077	NC_022121	ATA	2	6	612311	612316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431687
12078	NC_022121	GGCGC	2	10	612371	612380	0 %	0 %	60 %	40 %	532431687
12079	NC_022121	ATT	2	6	612397	612402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431687
12080	NC_022121	TAT	2	6	612405	612410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431687
12081	NC_022121	ATCG	2	8	612427	612434	25 %	25 %	25 %	25 %	532431687
12082	NC_022121	AGA	2	6	612489	612494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431687
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12084	NC_022121	AG	3	6	612550	612555	50 %	0 %	50 %	0 %	532431687
12085	NC_022121	CT	3	6	612556	612561	0 %	50 %	0 %	50 %	532431687
12086	NC_022121	TTAC	2	8	612578	612585	25 %	50 %	0 %	25 %	532431687
12087	NC_022121	TAA	2	6	612594	612599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431687
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12089	NC_022121	TTTA	2	8	612631	612638	25 %	75 %	0 %	0 %	532431687
12090	NC_022121	CT	3	6	612671	612676	0 %	50 %	0 %	50 %	532431687
12091	NC_022121	ATT	2	6	612695	612700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431687
12092	NC_022121	TTTG	2	8	612729	612736	0 %	75 %	25 %	0 %	532431687
12093	NC_022121	ATT	2	6	612747	612752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431687
12094	NC_022121	GGCT	2	8	612769	612776	0 %	25 %	50 %	25 %	532431687
12095	NC_022121	TCT	2	6	612821	612826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431687
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12097	NC_022121	TGG	2	6	612883	612888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431687
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12099	NC_022121	ATG	2	6	612940	612945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431687
12100	NC_022121	ATTGG	2	10	612946	612955	20 %	40 %	40 %	0 %	532431687
12101	NC_022121	A	6	6	612976	612981	100 %	0 %	0 %	0 %	532431687
12102	NC_022121	AGC	2	6	613029	613034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431687
12103	NC_022121	TTG	2	6	613091	613096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431687
12104	NC_022121	TCAA	2	8	613256	613263	50 %	25 %	0 %	25 %	532431688
12105	NC_022121	TTG	2	6	613269	613274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431688
12106	NC_022121	CGCT	2	8	613302	613309	0 %	25 %	25 %	50 %	532431688
12107	NC_022121	TTTG	2	8	613327	613334	0 %	75 %	25 %	0 %	532431688
12108	NC_022121	ATC	2	6	613382	613387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431688
12109	NC_022121	A	9	9	613427	613435	100 %	0 %	0 %	0 %	532431688
12110	NC_022121	CTT	2	6	613469	613474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431688
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12112	NC_022121	TTTG	2	8	613503	613510	0 %	75 %	25 %	0 %	532431688
12113	NC_022121	CTCTC	2	10	613511	613520	0 %	40 %	0 %	60 %	532431688
12114	NC_022121	ATAG	2	8	613556	613563	50 %	25 %	25 %	0 %	532431688
12115	NC_022121	GAA	2	6	613649	613654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431688
12116	NC_022121	AAG	2	6	613695	613700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431688
12117	NC_022121	AGA	2	6	613735	613740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431688
12118	NC_022121	GAA	2	6	613757	613762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431688
12119	NC_022121	AAAAC	2	10	613771	613780	80 %	0 %	0 %	20 %	532431688
12120	NC_022121	AAC	2	6	613800	613805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431688
12121	NC_022121	GCTC	2	8	613900	613907	0 %	25 %	25 %	50 %	532431688
12122	NC_022121	AG	3	6	613934	613939	50 %	0 %	50 %	0 %	532431688
12123	NC_022121	TAG	2	6	613999	614004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431688
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12235	NC_022121	A	6	6	619819	619824	100 %	0 %	0 %	0 %	532431692
12236	NC_022121	GCTT	2	8	619839	619846	0 %	50 %	25 %	25 %	532431692
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12239	NC_022121	GGAT	2	8	619903	619910	25 %	25 %	50 %	0 %	532431692
12240	NC_022121	CAT	2	6	620001	620006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431692
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12244	NC_022121	TGT	2	6	620112	620117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431692
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12350	NC_022121	CATA	2	8	626088	626095	50 %	25 %	0 %	25 %	532431697
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12354	NC_022121	TATC	2	8	626259	626266	25 %	50 %	0 %	25 %	532431697
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12367	NC_022121	A	6	6	627085	627090	100 %	0 %	0 %	0 %	532431697
12368	NC_022121	CTT	2	6	627093	627098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431697
12369	NC_022121	TCA	2	6	627197	627202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431697
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12371	NC_022121	GAA	2	6	627274	627279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431697
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12377	NC_022121	GTT	2	6	627517	627522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431697
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12453	NC_022121	CTAC	2	8	631631	631638	25 %	25 %	0 %	50 %	532431700
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12473	NC_022121	TAT	2	6	632623	632628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431701
12474	NC_022121	CTT	2	6	632709	632714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431701
12475	NC_022121	ATGAA	2	10	632754	632763	60 %	20 %	20 %	0 %	532431701
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12477	NC_022121	CT	3	6	632954	632959	0 %	50 %	0 %	50 %	532431701
12478	NC_022121	AGA	2	6	632983	632988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431701
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12482	NC_022121	TGA	2	6	633123	633128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431702
12483	NC_022121	TGA	2	6	633142	633147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431702
12484	NC_022121	TCT	2	6	633172	633177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431702
12485	NC_022121	CAT	2	6	633191	633196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431702
12486	NC_022121	TCCT	2	8	633253	633260	0 %	50 %	0 %	50 %	532431702
12487	NC_022121	TCCC	2	8	633285	633292	0 %	25 %	0 %	75 %	532431702
12488	NC_022121	ATT	2	6	633307	633312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431702
12489	NC_022121	ACT	2	6	633343	633348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431702
12490	NC_022121	GCT	2	6	633387	633392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431702
12491	NC_022121	CTAC	2	8	633409	633416	25 %	25 %	0 %	50 %	532431702
12492	NC_022121	TCC	2	6	633442	633447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431702
12493	NC_022121	AGA	2	6	633457	633462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431702
12494	NC_022121	ATGCT	2	10	633489	633498	20 %	40 %	20 %	20 %	532431702
12495	NC_022121	GT	3	6	633609	633614	0 %	50 %	50 %	0 %	532431702
12496	NC_022121	ACGGA	2	10	633623	633632	40 %	0 %	40 %	20 %	532431702
12497	NC_022121	ATT	2	6	633642	633647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431702
12498	NC_022121	GGA	2	6	633700	633705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431702
12499	NC_022121	CTT	2	6	633748	633753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431702
12500	NC_022121	AGA	2	6	633772	633777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431702

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