MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022121	TGT	2	6	582283	582288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431648
11502	NC_022121	CTT	2	6	582339	582344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431648
11503	NC_022121	ACA	2	6	582386	582391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431648
11504	NC_022121	TTC	2	6	582468	582473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431648
11505	NC_022121	ACA	2	6	582524	582529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431648
11506	NC_022121	GAA	2	6	582857	582862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431649
11507	NC_022121	TCT	2	6	582884	582889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431649
11508	NC_022121	GCT	2	6	582903	582908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431649
11509	NC_022121	TTC	2	6	582916	582921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431649
11510	NC_022121	AAC	2	6	582949	582954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431649
11511	NC_022121	TTC	2	6	583066	583071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431649
11512	NC_022121	AATC	2	8	583084	583091	50 %	25 %	0 %	25 %	532431649
11513	NC_022121	AGG	3	9	583096	583104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431649
11514	NC_022121	AGA	2	6	583144	583149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431649
11515	NC_022121	ATC	2	6	583184	583189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431649
11516	NC_022121	CGA	2	6	583232	583237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431649
11517	NC_022121	T	6	6	583246	583251	0 %	100 %	0 %	0 %	532431649
11518	NC_022121	TC	3	6	583288	583293	0 %	50 %	0 %	50 %	532431649
11519	NC_022121	CTT	2	6	583359	583364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431649
11520	NC_022121	TAT	2	6	583377	583382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431649
11521	NC_022121	CAA	2	6	583443	583448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431649
11522	NC_022121	A	6	6	583565	583570	100 %	0 %	0 %	0 %	532431649
11523	NC_022121	TC	3	6	583575	583580	0 %	50 %	0 %	50 %	532431649
11524	NC_022121	TAA	2	6	583674	583679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431649
11525	NC_022121	ACGA	2	8	583712	583719	50 %	0 %	25 %	25 %	532431649
11526	NC_022121	TTTA	2	8	583723	583730	25 %	75 %	0 %	0 %	532431650
11527	NC_022121	GTAC	2	8	583741	583748	25 %	25 %	25 %	25 %	532431650
11528	NC_022121	TAA	2	6	583751	583756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431650
11529	NC_022121	ATCG	2	8	583816	583823	25 %	25 %	25 %	25 %	532431650
11530	NC_022121	AGA	2	6	583883	583888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431650
11531	NC_022121	CTT	2	6	583897	583902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431650
11532	NC_022121	GTA	2	6	583907	583912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431650
11533	NC_022121	ATA	2	6	583914	583919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431650
11534	NC_022121	TTC	2	6	583920	583925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431650
11535	NC_022121	TGC	2	6	583937	583942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431650
11536	NC_022121	CGT	2	6	583973	583978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431650
11537	NC_022121	CTA	2	6	584005	584010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431650
11538	NC_022121	AGC	2	6	584093	584098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431650
11539	NC_022121	ATA	2	6	584115	584120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431650
11540	NC_022121	CTC	2	6	584131	584136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431650
11541	NC_022121	TGT	2	6	584204	584209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431650
11542	NC_022121	CTT	2	6	584218	584223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431650
11543	NC_022121	TGG	2	6	584272	584277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431650
11544	NC_022121	ATG	2	6	584295	584300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431650
11545	NC_022121	CTG	2	6	584318	584323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431650
11546	NC_022121	CT	3	6	584383	584388	0 %	50 %	0 %	50 %	532431650
11547	NC_022121	CAT	2	6	584416	584421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431650
11548	NC_022121	ACAA	2	8	584430	584437	75 %	0 %	0 %	25 %	532431650
11549	NC_022121	CGA	3	9	584449	584457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431650
11550	NC_022121	CTTT	2	8	584519	584526	0 %	75 %	0 %	25 %	532431650
11551	NC_022121	CATC	2	8	584541	584548	25 %	25 %	0 %	50 %	532431650
11552	NC_022121	GAG	2	6	584563	584568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431650
11553	NC_022121	GT	3	6	584579	584584	0 %	50 %	50 %	0 %	532431650
11554	NC_022121	TAAA	2	8	584596	584603	75 %	25 %	0 %	0 %	532431650
11555	NC_022121	GAA	2	6	584860	584865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431651
11556	NC_022121	TAT	2	6	584972	584977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431651
11557	NC_022121	TCT	2	6	585006	585011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431651
11558	NC_022121	ATC	2	6	585043	585048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431651
11559	NC_022121	T	7	7	585177	585183	0 %	100 %	0 %	0 %	532431651
11560	NC_022121	T	6	6	585256	585261	0 %	100 %	0 %	0 %	532431652
11561	NC_022121	ATTTC	2	10	585316	585325	20 %	60 %	0 %	20 %	532431652
11562	NC_022121	AG	3	6	585349	585354	50 %	0 %	50 %	0 %	532431652
11563	NC_022121	CTT	2	6	585356	585361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431652
11564	NC_022121	GAA	2	6	585499	585504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431652
11565	NC_022121	TTTC	2	8	585517	585524	0 %	75 %	0 %	25 %	532431652
11566	NC_022121	TTCTC	2	10	585553	585562	0 %	60 %	0 %	40 %	532431652
11567	NC_022121	T	6	6	585568	585573	0 %	100 %	0 %	0 %	532431652
11568	NC_022121	CTT	2	6	585622	585627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431652
11569	NC_022121	CAA	2	6	585706	585711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431652
11570	NC_022121	AAC	2	6	585725	585730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431652
11571	NC_022121	GA	3	6	585733	585738	50 %	0 %	50 %	0 %	532431652
11572	NC_022121	TCAT	2	8	585759	585766	25 %	50 %	0 %	25 %	532431652
11573	NC_022121	TTC	2	6	585773	585778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431652
11574	NC_022121	CTT	2	6	585901	585906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431652
11575	NC_022121	CTTC	2	8	585928	585935	0 %	50 %	0 %	50 %	532431652
11576	NC_022121	CAG	3	9	585943	585951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431652
11577	NC_022121	TTCAAA	2	12	586050	586061	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532431652
11578	NC_022121	AT	3	6	586101	586106	50 %	50 %	0 %	0 %	532431652
11579	NC_022121	CAA	2	6	586225	586230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431652
11580	NC_022121	GCC	2	6	586250	586255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431652
11581	NC_022121	TG	3	6	586321	586326	0 %	50 %	50 %	0 %	532431652
11582	NC_022121	TCG	2	6	586369	586374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431653
11583	NC_022121	AGA	2	6	586441	586446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431653
11584	NC_022121	CAG	2	6	586461	586466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431653
11585	NC_022121	CTT	2	6	586506	586511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431653
11586	NC_022121	AGC	2	6	586528	586533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431653
11587	NC_022121	AGC	2	6	586537	586542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431653
11588	NC_022121	GCA	2	6	586562	586567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431653
11589	NC_022121	CAG	2	6	586608	586613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431653
11590	NC_022121	CAG	2	6	586635	586640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431653
11591	NC_022121	TAT	2	6	586662	586667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431653
11592	NC_022121	T	6	6	586706	586711	0 %	100 %	0 %	0 %	532431653
11593	NC_022121	T	8	8	586732	586739	0 %	100 %	0 %	0 %	532431653
11594	NC_022121	ATT	3	9	586776	586784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431654
11595	NC_022121	TCT	2	6	586785	586790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431654
11596	NC_022121	TTTGTT	2	12	586832	586843	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	532431654
11597	NC_022121	AAAG	2	8	586862	586869	75 %	0 %	25 %	0 %	532431654
11598	NC_022121	ACG	2	6	586930	586935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431654
11599	NC_022121	CAA	2	6	586950	586955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431654
11600	NC_022121	AT	3	6	587084	587089	50 %	50 %	0 %	0 %	532431654
11601	NC_022121	ATG	2	6	587135	587140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431654
11602	NC_022121	TCTT	2	8	587226	587233	0 %	75 %	0 %	25 %	532431655
11603	NC_022121	ACA	2	6	587394	587399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431655
11604	NC_022121	GGTT	2	8	587459	587466	0 %	50 %	50 %	0 %	532431655
11605	NC_022121	TTC	2	6	587502	587507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431655
11606	NC_022121	ATA	2	6	587568	587573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431655
11607	NC_022121	A	6	6	587584	587589	100 %	0 %	0 %	0 %	532431655
11608	NC_022121	AAG	2	6	587641	587646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431655
11609	NC_022121	GAAA	2	8	587655	587662	75 %	0 %	25 %	0 %	532431655
11610	NC_022121	CCT	2	6	587757	587762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431655
11611	NC_022121	CT	3	6	587768	587773	0 %	50 %	0 %	50 %	532431655
11612	NC_022121	AAT	2	6	587780	587785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431655
11613	NC_022121	AAT	2	6	587825	587830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431655
11614	NC_022121	GGAA	2	8	587951	587958	50 %	0 %	50 %	0 %	532431655
11615	NC_022121	AAATA	2	10	588081	588090	80 %	20 %	0 %	0 %	532431655
11616	NC_022121	ACA	2	6	588118	588123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431655
11617	NC_022121	AAC	2	6	588146	588151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431655
11618	NC_022121	ATTC	2	8	588155	588162	25 %	50 %	0 %	25 %	532431655
11619	NC_022121	GAC	2	6	588296	588301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431655
11620	NC_022121	AAG	2	6	588302	588307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431655
11621	NC_022121	AAC	2	6	588338	588343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431655
11622	NC_022121	A	6	6	588385	588390	100 %	0 %	0 %	0 %	532431655
11623	NC_022121	GCAA	2	8	588504	588511	50 %	0 %	25 %	25 %	532431655
11624	NC_022121	T	6	6	588529	588534	0 %	100 %	0 %	0 %	532431655
11625	NC_022121	GCA	2	6	588646	588651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431656
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11627	NC_022121	TCTT	2	8	588729	588736	0 %	75 %	0 %	25 %	532431656
11628	NC_022121	GTTGT	2	10	588788	588797	0 %	60 %	40 %	0 %	532431656
11629	NC_022121	TTC	2	6	588801	588806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431656
11630	NC_022121	AGA	2	6	588957	588962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431656
11631	NC_022121	TTC	2	6	588986	588991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431656
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11634	NC_022121	AGG	2	6	589082	589087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431657
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11636	NC_022121	CAT	2	6	589245	589250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431657
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11652	NC_022121	T	6	6	589935	589940	0 %	100 %	0 %	0 %	532431659
11653	NC_022121	GCT	2	6	589951	589956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431659
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11656	NC_022121	TCTA	2	8	590301	590308	25 %	50 %	0 %	25 %	532431659
11657	NC_022121	AACA	2	8	590328	590335	75 %	0 %	0 %	25 %	532431659
11658	NC_022121	CTT	2	6	590363	590368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431659
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11676	NC_022121	TA	3	6	591448	591453	50 %	50 %	0 %	0 %	532431661
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11694	NC_022121	ATA	2	6	592312	592317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431664
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11701	NC_022121	TGA	2	6	592527	592532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432062
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11704	NC_022121	AG	3	6	592579	592584	50 %	0 %	50 %	0 %	532432062
11705	NC_022121	T	6	6	592586	592591	0 %	100 %	0 %	0 %	532432062
11706	NC_022121	TC	3	6	592630	592635	0 %	50 %	0 %	50 %	532432062
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11709	NC_022121	GCA	2	6	592720	592725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431665
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11723	NC_022121	CCGA	2	8	593299	593306	25 %	0 %	25 %	50 %	532431666
11724	NC_022121	GAAA	2	8	593405	593412	75 %	0 %	25 %	0 %	532431666
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11728	NC_022121	GCA	2	6	593637	593642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431666
11729	NC_022121	AAG	2	6	593650	593655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431666
11730	NC_022121	TCT	2	6	593659	593664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431666
11731	NC_022121	ATT	2	6	593717	593722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431666
11732	NC_022121	CT	3	6	593812	593817	0 %	50 %	0 %	50 %	532431667
11733	NC_022121	CAA	2	6	593821	593826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431667
11734	NC_022121	T	6	6	593996	594001	0 %	100 %	0 %	0 %	532431667
11735	NC_022121	TCA	2	6	594070	594075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431667
11736	NC_022121	GTAT	2	8	594112	594119	25 %	50 %	25 %	0 %	532431667
11737	NC_022121	T	6	6	594164	594169	0 %	100 %	0 %	0 %	532432063
11738	NC_022121	TTG	2	6	594193	594198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432063
11739	NC_022121	GA	3	6	594199	594204	50 %	0 %	50 %	0 %	532432063
11740	NC_022121	ACG	2	6	594314	594319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432063
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11742	NC_022121	TGA	2	6	594384	594389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432063
11743	NC_022121	CAA	2	6	594391	594396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432063
11744	NC_022121	TTA	2	6	594458	594463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431668
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11774	NC_022121	GTAA	2	8	595767	595774	50 %	25 %	25 %	0 %	532431670
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11985	NC_022121	CT	3	6	607345	607350	0 %	50 %	0 %	50 %	532431683
11986	NC_022121	CA	3	6	607415	607420	50 %	0 %	0 %	50 %	532431683
11987	NC_022121	GAA	2	6	607465	607470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431683
11988	NC_022121	A	6	6	607481	607486	100 %	0 %	0 %	0 %	532431683
11989	NC_022121	TCG	2	6	607518	607523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431684
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11992	NC_022121	ATGT	2	8	607604	607611	25 %	50 %	25 %	0 %	532431684
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