MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022121	CCTT	2	8	557905	557912	0 %	50 %	0 %	50 %	532431624
11002	NC_022121	AAC	2	6	557914	557919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431624
11003	NC_022121	ATA	2	6	557954	557959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431624
11004	NC_022121	T	7	7	558040	558046	0 %	100 %	0 %	0 %	532431624
11005	NC_022121	ACA	2	6	558149	558154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431624
11006	NC_022121	TATC	2	8	558191	558198	25 %	50 %	0 %	25 %	532431624
11007	NC_022121	CTT	2	6	558484	558489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432059
11008	NC_022121	AAC	2	6	558509	558514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432059
11009	NC_022121	AGA	2	6	558518	558523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432059
11010	NC_022121	CTT	2	6	558526	558531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432059
11011	NC_022121	TCT	2	6	558534	558539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432059
11012	NC_022121	TCA	2	6	558546	558551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432059
11013	NC_022121	CAG	2	6	558565	558570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432059
11014	NC_022121	GCA	2	6	558573	558578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432059
11015	NC_022121	T	6	6	558605	558610	0 %	100 %	0 %	0 %	532432059
11016	NC_022121	TG	3	6	558916	558921	0 %	50 %	50 %	0 %	532431625
11017	NC_022121	TAC	2	6	558993	558998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431625
11018	NC_022121	GAAA	2	8	559016	559023	75 %	0 %	25 %	0 %	532431625
11019	NC_022121	ATA	2	6	559070	559075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431625
11020	NC_022121	TG	3	6	559083	559088	0 %	50 %	50 %	0 %	532431625
11021	NC_022121	AGG	2	6	559095	559100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431625
11022	NC_022121	GAA	2	6	559132	559137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431625
11023	NC_022121	CT	3	6	559176	559181	0 %	50 %	0 %	50 %	532431625
11024	NC_022121	TGA	2	6	559198	559203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431625
11025	NC_022121	A	6	6	559231	559236	100 %	0 %	0 %	0 %	532431625
11026	NC_022121	GAA	2	6	559337	559342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431625
11027	NC_022121	TG	3	6	559354	559359	0 %	50 %	50 %	0 %	532431625
11028	NC_022121	AG	3	6	559453	559458	50 %	0 %	50 %	0 %	532431625
11029	NC_022121	TCT	2	6	559566	559571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432060
11030	NC_022121	ATA	2	6	559596	559601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432060
11031	NC_022121	TTC	2	6	559619	559624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432060
11032	NC_022121	CTG	2	6	559636	559641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432060
11033	NC_022121	GAG	2	6	559671	559676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432060
11034	NC_022121	CTG	2	6	559719	559724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431626
11035	NC_022121	AAG	2	6	559910	559915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431626
11036	NC_022121	GAG	2	6	559993	559998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431626
11037	NC_022121	AAT	2	6	560041	560046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431626
11038	NC_022121	CTC	2	6	560050	560055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431626
11039	NC_022121	ACC	2	6	560120	560125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431626
11040	NC_022121	GCATAG	2	12	560146	560157	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532431626
11041	NC_022121	AGC	2	6	560189	560194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431626
11042	NC_022121	AAC	2	6	560258	560263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431626
11043	NC_022121	GAAA	2	8	560274	560281	75 %	0 %	25 %	0 %	532431626
11044	NC_022121	ACA	2	6	560292	560297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431626
11045	NC_022121	AAC	2	6	560309	560314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431626
11046	NC_022121	AAG	2	6	560320	560325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431626
11047	NC_022121	T	6	6	560331	560336	0 %	100 %	0 %	0 %	532431626
11048	NC_022121	GCTT	2	8	560588	560595	0 %	50 %	25 %	25 %	532432061
11049	NC_022121	ACC	2	6	560614	560619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532432061
11050	NC_022121	CGAA	2	8	560637	560644	50 %	0 %	25 %	25 %	532432061
11051	NC_022121	CTTT	2	8	560674	560681	0 %	75 %	0 %	25 %	532432061
11052	NC_022121	T	8	8	560693	560700	0 %	100 %	0 %	0 %	532432061
11053	NC_022121	TCT	2	6	560713	560718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432061
11054	NC_022121	GGAT	2	8	560819	560826	25 %	25 %	50 %	0 %	532431627
11055	NC_022121	TGT	2	6	560835	560840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431627
11056	NC_022121	AGG	2	6	560878	560883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431627
11057	NC_022121	CT	3	6	560904	560909	0 %	50 %	0 %	50 %	532431627
11058	NC_022121	TTG	2	6	560951	560956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431627
11059	NC_022121	T	6	6	561077	561082	0 %	100 %	0 %	0 %	532431627
11060	NC_022121	CTC	2	6	561103	561108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431627
11061	NC_022121	AGG	2	6	561111	561116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431627
11062	NC_022121	TCTT	2	8	561119	561126	0 %	75 %	0 %	25 %	532431627
11063	NC_022121	CAG	2	6	561136	561141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431627
11064	NC_022121	CGC	2	6	561146	561151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431627
11065	NC_022121	CTCTT	2	10	561153	561162	0 %	60 %	0 %	40 %	532431627
11066	NC_022121	CTA	2	6	561173	561178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431627
11067	NC_022121	T	6	6	561198	561203	0 %	100 %	0 %	0 %	532431628
11068	NC_022121	TTC	2	6	561208	561213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431628
11069	NC_022121	CATT	2	8	561257	561264	25 %	50 %	0 %	25 %	532431628
11070	NC_022121	CTG	2	6	561267	561272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431628
11071	NC_022121	ATT	2	6	561295	561300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431628
11072	NC_022121	TTTCAA	2	12	561318	561329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532431628
11073	NC_022121	TTTC	2	8	561350	561357	0 %	75 %	0 %	25 %	532431628
11074	NC_022121	TTC	2	6	561444	561449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431628
11075	NC_022121	A	6	6	561471	561476	100 %	0 %	0 %	0 %	532431628
11076	NC_022121	GGA	2	6	561508	561513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431628
11077	NC_022121	TC	3	6	561671	561676	0 %	50 %	0 %	50 %	532431628
11078	NC_022121	GAAA	2	8	561678	561685	75 %	0 %	25 %	0 %	532431628
11079	NC_022121	AAT	2	6	561686	561691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431628
11080	NC_022121	CAAAAA	2	12	561697	561708	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	532431628
11081	NC_022121	T	6	6	561717	561722	0 %	100 %	0 %	0 %	532431628
11082	NC_022121	A	6	6	561761	561766	100 %	0 %	0 %	0 %	532431628
11083	NC_022121	CTG	2	6	561809	561814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431628
11084	NC_022121	TCC	2	6	561832	561837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431628
11085	NC_022121	TGA	2	6	561871	561876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431628
11086	NC_022121	TAGA	2	8	561917	561924	50 %	25 %	25 %	0 %	532431628
11087	NC_022121	CAGGC	2	10	561970	561979	20 %	0 %	40 %	40 %	532431628
11088	NC_022121	AGAAA	2	10	562007	562016	80 %	0 %	20 %	0 %	532431628
11089	NC_022121	A	6	6	562014	562019	100 %	0 %	0 %	0 %	532431628
11090	NC_022121	AAAG	2	8	562022	562029	75 %	0 %	25 %	0 %	532431628
11091	NC_022121	AAG	2	6	562343	562348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431629
11092	NC_022121	TGC	2	6	562374	562379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431629
11093	NC_022121	AG	3	6	562381	562386	50 %	0 %	50 %	0 %	532431629
11094	NC_022121	AGA	2	6	562398	562403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431629
11095	NC_022121	GCA	2	6	562445	562450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431629
11096	NC_022121	GAT	2	6	562466	562471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431629
11097	NC_022121	AAG	2	6	562652	562657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431629
11098	NC_022121	A	6	6	562721	562726	100 %	0 %	0 %	0 %	532431629
11099	NC_022121	TCC	2	6	562738	562743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431629
11100	NC_022121	CTG	2	6	562752	562757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431629
11101	NC_022121	TGT	2	6	562855	562860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431629
11102	NC_022121	AAT	2	6	562909	562914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431629
11103	NC_022121	GA	3	6	563021	563026	50 %	0 %	50 %	0 %	532431629
11104	NC_022121	TC	3	6	563040	563045	0 %	50 %	0 %	50 %	532431629
11105	NC_022121	CCT	2	6	563071	563076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431629
11106	NC_022121	GGAA	2	8	563151	563158	50 %	0 %	50 %	0 %	532431629
11107	NC_022121	TCC	2	6	563163	563168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431629
11108	NC_022121	CGA	2	6	563332	563337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431630
11109	NC_022121	TCC	3	9	563382	563390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431630
11110	NC_022121	CTA	2	6	563468	563473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431630
11111	NC_022121	CAT	2	6	563507	563512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431630
11112	NC_022121	AATC	2	8	563561	563568	50 %	25 %	0 %	25 %	532431630
11113	NC_022121	TA	3	6	563615	563620	50 %	50 %	0 %	0 %	532431630
11114	NC_022121	GA	3	6	563649	563654	50 %	0 %	50 %	0 %	532431630
11115	NC_022121	ACA	2	6	563677	563682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431630
11116	NC_022121	TAA	2	6	563697	563702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431630
11117	NC_022121	TCT	2	6	563774	563779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431630
11118	NC_022121	ATC	2	6	563781	563786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431630
11119	NC_022121	CCTT	2	8	563839	563846	0 %	50 %	0 %	50 %	532431630
11120	NC_022121	TTG	2	6	563910	563915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431630
11121	NC_022121	CGA	2	6	563939	563944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431630
11122	NC_022121	TC	3	6	563957	563962	0 %	50 %	0 %	50 %	532431630
11123	NC_022121	GAAA	2	8	564157	564164	75 %	0 %	25 %	0 %	532431631
11124	NC_022121	C	6	6	564168	564173	0 %	0 %	0 %	100 %	532431631
11125	NC_022121	TGT	2	6	564271	564276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431631
11126	NC_022121	GAA	2	6	564299	564304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431631
11127	NC_022121	AGG	2	6	564324	564329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431631
11128	NC_022121	TA	3	6	564333	564338	50 %	50 %	0 %	0 %	532431631
11129	NC_022121	GAAC	2	8	564385	564392	50 %	0 %	25 %	25 %	532431631
11130	NC_022121	CTA	2	6	564505	564510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431631
11131	NC_022121	AGATCC	2	12	564528	564539	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532431631
11132	NC_022121	CAAA	2	8	564542	564549	75 %	0 %	0 %	25 %	532431631
11133	NC_022121	CCT	2	6	564599	564604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431631
11134	NC_022121	CAC	2	6	564606	564611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431631
11135	NC_022121	AGAA	2	8	564675	564682	75 %	0 %	25 %	0 %	532431631
11136	NC_022121	CAG	2	6	564721	564726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431632
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11138	NC_022121	GA	3	6	564811	564816	50 %	0 %	50 %	0 %	532431632
11139	NC_022121	CCAT	2	8	564822	564829	25 %	25 %	0 %	50 %	532431632
11140	NC_022121	GGA	2	6	564876	564881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431632
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11142	NC_022121	GCTC	2	8	564933	564940	0 %	25 %	25 %	50 %	532431632
11143	NC_022121	ATC	2	6	564971	564976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431632
11144	NC_022121	CT	3	6	564991	564996	0 %	50 %	0 %	50 %	532431632
11145	NC_022121	CAT	2	6	565003	565008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431632
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11148	NC_022121	TGA	2	6	565071	565076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431632
11149	NC_022121	AGA	2	6	565145	565150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431632
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11151	NC_022121	A	6	6	565212	565217	100 %	0 %	0 %	0 %	532431632
11152	NC_022121	CTT	2	6	565234	565239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431632
11153	NC_022121	ATC	2	6	565283	565288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431632
11154	NC_022121	TC	3	6	565302	565307	0 %	50 %	0 %	50 %	532431632
11155	NC_022121	T	6	6	565321	565326	0 %	100 %	0 %	0 %	532431632
11156	NC_022121	CCCA	2	8	565335	565342	25 %	0 %	0 %	75 %	532431632
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11159	NC_022121	CAG	2	6	565645	565650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431633
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11162	NC_022121	CA	3	6	565832	565837	50 %	0 %	0 %	50 %	532431633
11163	NC_022121	AAT	2	6	565866	565871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431633
11164	NC_022121	GAT	2	6	565883	565888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431633
11165	NC_022121	C	6	6	565908	565913	0 %	0 %	0 %	100 %	532431633
11166	NC_022121	TCA	2	6	565915	565920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431633
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11183	NC_022121	AAAG	2	8	567144	567151	75 %	0 %	25 %	0 %	532431634
11184	NC_022121	CTA	2	6	567192	567197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431634
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11218	NC_022121	ACAG	2	8	569330	569337	50 %	0 %	25 %	25 %	532431637
11219	NC_022121	TTC	2	6	569389	569394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431637
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11221	NC_022121	TAA	3	9	569431	569439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431637
11222	NC_022121	TTAA	2	8	569495	569502	50 %	50 %	0 %	0 %	532431637
11223	NC_022121	GCA	2	6	569507	569512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431637
11224	NC_022121	CT	3	6	569596	569601	0 %	50 %	0 %	50 %	532431637
11225	NC_022121	TAA	2	6	569655	569660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431637
11226	NC_022121	CTG	2	6	569664	569669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431637
11227	NC_022121	CTG	2	6	569755	569760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431637
11228	NC_022121	GCT	3	9	569802	569810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431637
11229	NC_022121	CT	3	6	569886	569891	0 %	50 %	0 %	50 %	532431637
11230	NC_022121	AAT	2	6	569943	569948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431637
11231	NC_022121	A	6	6	569957	569962	100 %	0 %	0 %	0 %	532431637
11232	NC_022121	T	6	6	569974	569979	0 %	100 %	0 %	0 %	532431637
11233	NC_022121	ACA	2	6	570153	570158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431637
11234	NC_022121	AAT	2	6	570193	570198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431637
11235	NC_022121	TCT	2	6	570209	570214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431637
11236	NC_022121	TTC	2	6	570358	570363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431637
11237	NC_022121	TCT	2	6	570497	570502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431637
11238	NC_022121	AAAT	2	8	570511	570518	75 %	25 %	0 %	0 %	532431637
11239	NC_022121	AAGC	2	8	570543	570550	50 %	0 %	25 %	25 %	532431637
11240	NC_022121	C	6	6	570606	570611	0 %	0 %	0 %	100 %	532431637
11241	NC_022121	A	7	7	570621	570627	100 %	0 %	0 %	0 %	532431637
11242	NC_022121	CTT	2	6	570633	570638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431637
11243	NC_022121	GAAA	2	8	570670	570677	75 %	0 %	25 %	0 %	532431637
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11348	NC_022121	AG	3	6	575134	575139	50 %	0 %	50 %	0 %	532431640
11349	NC_022121	CA	3	6	575160	575165	50 %	0 %	0 %	50 %	532431640
11350	NC_022121	A	8	8	575170	575177	100 %	0 %	0 %	0 %	532431640
11351	NC_022121	GCA	2	6	575272	575277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431640
11352	NC_022121	CAA	2	6	575286	575291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431640
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11354	NC_022121	AAG	2	6	575319	575324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431640
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11356	NC_022121	TCCCC	2	10	575793	575802	0 %	20 %	0 %	80 %	532431641
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11358	NC_022121	GA	3	6	575844	575849	50 %	0 %	50 %	0 %	532431641
11359	NC_022121	ACCA	2	8	575859	575866	50 %	0 %	0 %	50 %	532431641
11360	NC_022121	AAT	2	6	575871	575876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431641
11361	NC_022121	A	7	7	575900	575906	100 %	0 %	0 %	0 %	532431641
11362	NC_022121	CTC	2	6	575922	575927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431642
11363	NC_022121	TC	3	6	575926	575931	0 %	50 %	0 %	50 %	532431642
11364	NC_022121	TGC	2	6	576002	576007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431642
11365	NC_022121	CTT	2	6	576012	576017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431642
11366	NC_022121	GAT	2	6	576024	576029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431642
11367	NC_022121	CTT	2	6	576035	576040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431642
11368	NC_022121	TAT	2	6	576050	576055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431642
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11370	NC_022121	GAA	2	6	576117	576122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431642
11371	NC_022121	CT	4	8	576175	576182	0 %	50 %	0 %	50 %	532431642
11372	NC_022121	GAA	2	6	576210	576215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431642
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11374	NC_022121	GAT	2	6	576324	576329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431642
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11379	NC_022121	CTT	2	6	576431	576436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431642
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11487	NC_022121	AAT	2	6	581501	581506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431647
11488	NC_022121	CTT	2	6	581530	581535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431647
11489	NC_022121	CAG	2	6	581556	581561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431647
11490	NC_022121	T	6	6	581563	581568	0 %	100 %	0 %	0 %	532431647
11491	NC_022121	TAA	3	9	581620	581628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431647
11492	NC_022121	ACA	2	6	581696	581701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431647
11493	NC_022121	TTG	2	6	581716	581721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431647
11494	NC_022121	AAC	2	6	581744	581749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431647
11495	NC_022121	GA	3	6	581781	581786	50 %	0 %	50 %	0 %	532431647
11496	NC_022121	CTT	2	6	582014	582019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431648
11497	NC_022121	CTG	2	6	582102	582107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431648
11498	NC_022121	CAT	2	6	582146	582151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431648
11499	NC_022121	TGA	2	6	582154	582159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431648
11500	NC_022121	TTG	2	6	582165	582170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431648

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