MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022121	TGA	2	6	533289	533294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432056
10502	NC_022121	GACA	2	8	533304	533311	50 %	0 %	25 %	25 %	532432056
10503	NC_022121	TGG	2	6	533328	533333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532432056
10504	NC_022121	AT	3	6	533345	533350	50 %	50 %	0 %	0 %	532432056
10505	NC_022121	GAT	2	6	533374	533379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432056
10506	NC_022121	CGT	2	6	533481	533486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432056
10507	NC_022121	CAA	2	6	533630	533635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432056
10508	NC_022121	GCT	2	6	533641	533646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432056
10509	NC_022121	GTAG	2	8	533647	533654	25 %	25 %	50 %	0 %	532432056
10510	NC_022121	GAT	2	6	533701	533706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432056
10511	NC_022121	GGA	2	6	533743	533748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432056
10512	NC_022121	TCTCC	2	10	533750	533759	0 %	40 %	0 %	60 %	532432056
10513	NC_022121	ATG	2	6	533795	533800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432056
10514	NC_022121	CGTA	2	8	533829	533836	25 %	25 %	25 %	25 %	532432056
10515	NC_022121	TGG	2	6	533868	533873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532432056
10516	NC_022121	ACA	2	6	533935	533940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432056
10517	NC_022121	CTT	2	6	533984	533989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432056
10518	NC_022121	CAG	2	6	533999	534004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432056
10519	NC_022121	ACT	2	6	534027	534032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432056
10520	NC_022121	CAC	2	6	534038	534043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532432056
10521	NC_022121	ACA	2	6	534061	534066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432056
10522	NC_022121	ACC	2	6	534088	534093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532432056
10523	NC_022121	TGA	2	6	534101	534106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432056
10524	NC_022121	GGA	2	6	534109	534114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432056
10525	NC_022121	ATA	2	6	534130	534135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432056
10526	NC_022121	TGG	2	6	534141	534146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532432056
10527	NC_022121	GGA	2	6	534148	534153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432056
10528	NC_022121	GGA	3	9	534163	534171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432056
10529	NC_022121	GCT	2	6	534183	534188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432056
10530	NC_022121	AGC	2	6	534399	534404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432056
10531	NC_022121	ATC	2	6	534474	534479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432056
10532	NC_022121	GAC	2	6	534490	534495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432056
10533	NC_022121	AGC	3	9	534528	534536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432056
10534	NC_022121	AAC	2	6	534540	534545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432056
10535	NC_022121	TGAT	2	8	534563	534570	25 %	50 %	25 %	0 %	532432056
10536	NC_022121	TCA	2	6	534719	534724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431604
10537	NC_022121	CT	3	6	534758	534763	0 %	50 %	0 %	50 %	532431604
10538	NC_022121	TAA	2	6	534787	534792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431604
10539	NC_022121	AAG	2	6	534836	534841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431604
10540	NC_022121	TTC	2	6	534844	534849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431604
10541	NC_022121	TCG	2	6	534851	534856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431604
10542	NC_022121	TCCTC	2	10	534866	534875	0 %	40 %	0 %	60 %	532431604
10543	NC_022121	TA	3	6	534957	534962	50 %	50 %	0 %	0 %	532431604
10544	NC_022121	CAA	2	6	535056	535061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431604
10545	NC_022121	CTC	2	6	535071	535076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431604
10546	NC_022121	CTT	2	6	535101	535106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431604
10547	NC_022121	TTC	2	6	535112	535117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431604
10548	NC_022121	AGA	2	6	535126	535131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431604
10549	NC_022121	CTTT	2	8	535134	535141	0 %	75 %	0 %	25 %	532431604
10550	NC_022121	C	7	7	535231	535237	0 %	0 %	0 %	100 %	532431604
10551	NC_022121	A	6	6	535275	535280	100 %	0 %	0 %	0 %	532431604
10552	NC_022121	CT	3	6	535543	535548	0 %	50 %	0 %	50 %	532431605
10553	NC_022121	TCT	2	6	535594	535599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431605
10554	NC_022121	CAAATC	2	12	535615	535626	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532431605
10555	NC_022121	AGA	2	6	535722	535727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431605
10556	NC_022121	TTG	2	6	535743	535748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431605
10557	NC_022121	ACA	2	6	535774	535779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431605
10558	NC_022121	ATG	2	6	535784	535789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431605
10559	NC_022121	CCG	2	6	535852	535857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431605
10560	NC_022121	ACT	2	6	535862	535867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431605
10561	NC_022121	GAA	2	6	535942	535947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431605
10562	NC_022121	TAA	2	6	536012	536017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431605
10563	NC_022121	CATC	2	8	536094	536101	25 %	25 %	0 %	50 %	532431606
10564	NC_022121	T	6	6	536203	536208	0 %	100 %	0 %	0 %	532431606
10565	NC_022121	T	6	6	536210	536215	0 %	100 %	0 %	0 %	532431606
10566	NC_022121	CTAT	2	8	536216	536223	25 %	50 %	0 %	25 %	532431606
10567	NC_022121	AAC	2	6	536249	536254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431606
10568	NC_022121	GC	3	6	536270	536275	0 %	0 %	50 %	50 %	532431606
10569	NC_022121	TGACA	2	10	536324	536333	40 %	20 %	20 %	20 %	532431606
10570	NC_022121	GT	3	6	536353	536358	0 %	50 %	50 %	0 %	532431606
10571	NC_022121	TGT	2	6	536390	536395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431606
10572	NC_022121	CTCCAG	2	12	536397	536408	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532431606
10573	NC_022121	ATC	2	6	536464	536469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431606
10574	NC_022121	CT	3	6	536561	536566	0 %	50 %	0 %	50 %	532431606
10575	NC_022121	CGA	2	6	536595	536600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431606
10576	NC_022121	ATCG	2	8	536643	536650	25 %	25 %	25 %	25 %	532431606
10577	NC_022121	TCC	2	6	536661	536666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431606
10578	NC_022121	ACT	2	6	536674	536679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431606
10579	NC_022121	GCA	3	9	536700	536708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431606
10580	NC_022121	C	6	6	536734	536739	0 %	0 %	0 %	100 %	532431606
10581	NC_022121	AGAA	2	8	536788	536795	75 %	0 %	25 %	0 %	532431606
10582	NC_022121	TTTTC	2	10	536820	536829	0 %	80 %	0 %	20 %	532431606
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10584	NC_022121	AGA	2	6	536878	536883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431606
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10586	NC_022121	T	6	6	536924	536929	0 %	100 %	0 %	0 %	532431606
10587	NC_022121	TGT	2	6	536951	536956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431606
10588	NC_022121	AAC	2	6	536995	537000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431606
10589	NC_022121	CTG	2	6	537028	537033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431606
10590	NC_022121	AAG	2	6	537585	537590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431607
10591	NC_022121	ACAA	2	8	537609	537616	75 %	0 %	0 %	25 %	532431607
10592	NC_022121	GAT	2	6	537633	537638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431607
10593	NC_022121	CAT	2	6	537710	537715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431607
10594	NC_022121	TAAA	2	8	537716	537723	75 %	25 %	0 %	0 %	532431607
10595	NC_022121	AAC	2	6	537812	537817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431608
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10598	NC_022121	A	7	7	537992	537998	100 %	0 %	0 %	0 %	532431608
10599	NC_022121	TCTCT	2	10	538012	538021	0 %	60 %	0 %	40 %	532431608
10600	NC_022121	TGTC	2	8	538055	538062	0 %	50 %	25 %	25 %	532431608
10601	NC_022121	TTGC	2	8	538132	538139	0 %	50 %	25 %	25 %	532431608
10602	NC_022121	ATT	2	6	538352	538357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431608
10603	NC_022121	T	7	7	538412	538418	0 %	100 %	0 %	0 %	532431608
10604	NC_022121	A	6	6	538437	538442	100 %	0 %	0 %	0 %	532431608
10605	NC_022121	TAT	2	6	538475	538480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431608
10606	NC_022121	TGT	2	6	538532	538537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431608
10607	NC_022121	T	6	6	538537	538542	0 %	100 %	0 %	0 %	532431608
10608	NC_022121	TC	3	6	538567	538572	0 %	50 %	0 %	50 %	532431608
10609	NC_022121	AGCT	2	8	538633	538640	25 %	25 %	25 %	25 %	532431608
10610	NC_022121	ATT	2	6	538646	538651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431608
10611	NC_022121	AG	3	6	538664	538669	50 %	0 %	50 %	0 %	532431608
10612	NC_022121	TGTA	2	8	538678	538685	25 %	50 %	25 %	0 %	532431608
10613	NC_022121	AGG	2	6	538697	538702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431608
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10616	NC_022121	CCAA	2	8	538821	538828	50 %	0 %	0 %	50 %	532431609
10617	NC_022121	AC	3	6	538835	538840	50 %	0 %	0 %	50 %	532431609
10618	NC_022121	TTC	2	6	538862	538867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431609
10619	NC_022121	GGT	2	6	538908	538913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431609
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10621	NC_022121	T	6	6	539000	539005	0 %	100 %	0 %	0 %	532431609
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10747	NC_022121	CTC	2	6	544915	544920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431615
10748	NC_022121	CTA	2	6	544970	544975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431615
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10982	NC_022121	AAAGA	2	10	556902	556911	80 %	0 %	20 %	0 %	532431624
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10986	NC_022121	AGC	2	6	556983	556988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431624
10987	NC_022121	AGG	2	6	557043	557048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431624
10988	NC_022121	AG	3	6	557090	557095	50 %	0 %	50 %	0 %	532431624
10989	NC_022121	ATATAG	2	12	557113	557124	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532431624
10990	NC_022121	TCA	2	6	557188	557193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431624
10991	NC_022121	GAA	2	6	557251	557256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431624
10992	NC_022121	TCT	2	6	557305	557310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431624
10993	NC_022121	TCT	2	6	557318	557323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431624
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10995	NC_022121	AACG	2	8	557450	557457	50 %	0 %	25 %	25 %	532431624
10996	NC_022121	CCGAA	2	10	557481	557490	40 %	0 %	20 %	40 %	532431624
10997	NC_022121	CAT	2	6	557576	557581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431624
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10999	NC_022121	AAAT	2	8	557680	557687	75 %	25 %	0 %	0 %	532431624
11000	NC_022121	CTC	2	6	557760	557765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431624

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