MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_022121	CTG	2	6	480444	480449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9502	NC_022121	TGC	2	6	480454	480459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9503	NC_022121	CTC	2	6	480466	480471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431561
9504	NC_022121	ATG	2	6	480566	480571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431561
9505	NC_022121	ACA	2	6	480579	480584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431561
9506	NC_022121	GCT	2	6	480596	480601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9507	NC_022121	TAG	4	12	480658	480669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431561
9508	NC_022121	TCTTCA	2	12	480698	480709	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532431561
9509	NC_022121	TGA	2	6	480721	480726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431561
9510	NC_022121	AGA	3	9	480733	480741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431561
9511	NC_022121	AG	3	6	480770	480775	50 %	0 %	50 %	0 %	532431561
9512	NC_022121	ACTA	2	8	480778	480785	50 %	25 %	0 %	25 %	532431561
9513	NC_022121	CT	5	10	480802	480811	0 %	50 %	0 %	50 %	532431561
9514	NC_022121	TTC	2	6	480845	480850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431561
9515	NC_022121	GGA	2	6	480896	480901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431561
9516	NC_022121	GA	3	6	480912	480917	50 %	0 %	50 %	0 %	532431561
9517	NC_022121	CTA	2	6	480947	480952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431561
9518	NC_022121	TCC	2	6	481040	481045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431561
9519	NC_022121	TGG	2	6	481048	481053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431561
9520	NC_022121	GGT	3	9	481061	481069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431561
9521	NC_022121	CAA	2	6	481108	481113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431561
9522	NC_022121	TGC	2	6	481132	481137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9523	NC_022121	CAG	2	6	481146	481151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9524	NC_022121	GAA	2	6	481169	481174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431561
9525	NC_022121	AGA	2	6	481288	481293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431561
9526	NC_022121	CGA	2	6	481333	481338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9527	NC_022121	GGT	3	9	481352	481360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431561
9528	NC_022121	GGA	3	9	481523	481531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431561
9529	NC_022121	ACT	2	6	481583	481588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431561
9530	NC_022121	GGT	3	9	481640	481648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431561
9531	NC_022121	CTTT	2	8	481664	481671	0 %	75 %	0 %	25 %	532431561
9532	NC_022121	GGA	2	6	481721	481726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431561
9533	NC_022121	TCT	2	6	481775	481780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431561
9534	NC_022121	TCC	2	6	481790	481795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431561
9535	NC_022121	AGT	2	6	481816	481821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431561
9536	NC_022121	AAAT	2	8	481833	481840	75 %	25 %	0 %	0 %	532431561
9537	NC_022121	ATCA	2	8	481976	481983	50 %	25 %	0 %	25 %	532431561
9538	NC_022121	A	6	6	481997	482002	100 %	0 %	0 %	0 %	532431561
9539	NC_022121	A	6	6	482021	482026	100 %	0 %	0 %	0 %	532431561
9540	NC_022121	AGG	3	9	482083	482091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431561
9541	NC_022121	CTG	2	6	482154	482159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9542	NC_022121	AAG	2	6	482163	482168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431561
9543	NC_022121	ATTC	2	8	482177	482184	25 %	50 %	0 %	25 %	532431561
9544	NC_022121	TAG	2	6	482250	482255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431561
9545	NC_022121	AGA	2	6	482275	482280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431561
9546	NC_022121	TCC	2	6	482284	482289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431561
9547	NC_022121	AGA	2	6	482317	482322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431561
9548	NC_022121	GAAG	2	8	482339	482346	50 %	0 %	50 %	0 %	532431561
9549	NC_022121	CTG	2	6	482385	482390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9550	NC_022121	AAC	2	6	482460	482465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431561
9551	NC_022121	GAA	2	6	482489	482494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431561
9552	NC_022121	ATC	2	6	482545	482550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431561
9553	NC_022121	ATC	2	6	482608	482613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431561
9554	NC_022121	CTC	2	6	482616	482621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431561
9555	NC_022121	GGA	2	6	482627	482632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431561
9556	NC_022121	CTT	2	6	482637	482642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431561
9557	NC_022121	ATCT	2	8	482665	482672	25 %	50 %	0 %	25 %	532431561
9558	NC_022121	TGC	2	6	482701	482706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9559	NC_022121	TTC	2	6	482734	482739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431561
9560	NC_022121	AGA	2	6	482746	482751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431561
9561	NC_022121	CTT	3	9	482760	482768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431561
9562	NC_022121	TCT	2	6	482789	482794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431561
9563	NC_022121	GAA	2	6	482840	482845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431561
9564	NC_022121	ACA	2	6	482870	482875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431561
9565	NC_022121	AGG	3	9	482893	482901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431561
9566	NC_022121	CTAT	2	8	482904	482911	25 %	50 %	0 %	25 %	532431561
9567	NC_022121	CTC	2	6	482992	482997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431561
9568	NC_022121	TCT	2	6	483101	483106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431561
9569	NC_022121	ACA	2	6	483113	483118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431561
9570	NC_022121	GGA	2	6	483131	483136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431561
9571	NC_022121	GTA	2	6	483173	483178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431561
9572	NC_022121	CAA	2	6	483195	483200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431561
9573	NC_022121	TAA	2	6	483208	483213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431561
9574	NC_022121	GGA	2	6	483245	483250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431561
9575	NC_022121	CTG	2	6	483267	483272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9576	NC_022121	AGG	2	6	483283	483288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431561
9577	NC_022121	CA	3	6	483346	483351	50 %	0 %	0 %	50 %	532431561
9578	NC_022121	CTA	2	6	483385	483390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431561
9579	NC_022121	A	7	7	483396	483402	100 %	0 %	0 %	0 %	532431561
9580	NC_022121	CTA	2	6	483420	483425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431561
9581	NC_022121	AGA	2	6	483487	483492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431561
9582	NC_022121	TTTAC	2	10	483504	483513	20 %	60 %	0 %	20 %	532431561
9583	NC_022121	AAG	2	6	483516	483521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431561
9584	NC_022121	TGC	2	6	483637	483642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9585	NC_022121	AGG	2	6	483712	483717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431561
9586	NC_022121	CTT	2	6	483753	483758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431561
9587	NC_022121	GTA	2	6	483783	483788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431561
9588	NC_022121	CTA	2	6	483864	483869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431561
9589	NC_022121	TAA	2	6	483913	483918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431561
9590	NC_022121	AAAT	2	8	483988	483995	75 %	25 %	0 %	0 %	532431561
9591	NC_022121	AGAA	2	8	484080	484087	75 %	0 %	25 %	0 %	532431561
9592	NC_022121	TC	3	6	484094	484099	0 %	50 %	0 %	50 %	532431561
9593	NC_022121	ATAA	2	8	484157	484164	75 %	25 %	0 %	0 %	532431561
9594	NC_022121	CTC	2	6	484224	484229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431561
9595	NC_022121	ACT	2	6	484250	484255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431561
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9597	NC_022121	GAG	2	6	484319	484324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431561
9598	NC_022121	ATA	2	6	484329	484334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431561
9599	NC_022121	TCT	2	6	484373	484378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431561
9600	NC_022121	GCT	2	6	484388	484393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9601	NC_022121	CA	4	8	484395	484402	50 %	0 %	0 %	50 %	532431561
9602	NC_022121	ACA	2	6	484448	484453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431561
9603	NC_022121	CTACAA	2	12	484461	484472	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532431561
9604	NC_022121	AGG	2	6	484492	484497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431561
9605	NC_022121	CTT	2	6	484528	484533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431561
9606	NC_022121	CAA	2	6	484559	484564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431561
9607	NC_022121	TCA	2	6	484592	484597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431561
9608	NC_022121	CTC	2	6	484638	484643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431561
9609	NC_022121	ACTC	2	8	484663	484670	25 %	25 %	0 %	50 %	532431561
9610	NC_022121	AAC	2	6	484868	484873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431561
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9612	NC_022121	TTA	2	6	484939	484944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431561
9613	NC_022121	CAG	2	6	484945	484950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431561
9614	NC_022121	ATG	2	6	484986	484991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431561
9615	NC_022121	TTG	2	6	484995	485000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431561
9616	NC_022121	GAT	2	6	485017	485022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431561
9617	NC_022121	AG	3	6	485045	485050	50 %	0 %	50 %	0 %	532431561
9618	NC_022121	A	7	7	485132	485138	100 %	0 %	0 %	0 %	532431561
9619	NC_022121	AT	3	6	485185	485190	50 %	50 %	0 %	0 %	532431561
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9621	NC_022121	CT	3	6	485462	485467	0 %	50 %	0 %	50 %	532431561
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9991	NC_022121	CTT	2	6	506162	506167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431584
9992	NC_022121	TCT	2	6	506175	506180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431584
9993	NC_022121	AT	3	6	506265	506270	50 %	50 %	0 %	0 %	532431584
9994	NC_022121	ACG	2	6	506351	506356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431584
9995	NC_022121	GAT	2	6	506383	506388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431584
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