MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_022121	CA	3	6	455808	455813	50 %	0 %	0 %	50 %	532431544
9002	NC_022121	CCT	2	6	455818	455823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431544
9003	NC_022121	GAA	2	6	455827	455832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431544
9004	NC_022121	ACT	2	6	456038	456043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431544
9005	NC_022121	AC	4	8	456044	456051	50 %	0 %	0 %	50 %	532431544
9006	NC_022121	CCG	2	6	456066	456071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431544
9007	NC_022121	CT	4	8	456110	456117	0 %	50 %	0 %	50 %	532431544
9008	NC_022121	AGA	3	9	456120	456128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431544
9009	NC_022121	AAG	2	6	456208	456213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431544
9010	NC_022121	CTT	2	6	456219	456224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431544
9011	NC_022121	A	6	6	456226	456231	100 %	0 %	0 %	0 %	532431544
9012	NC_022121	AGA	2	6	456237	456242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431544
9013	NC_022121	ATT	2	6	456271	456276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431544
9014	NC_022121	TCC	2	6	456305	456310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431544
9015	NC_022121	CAAA	2	8	456370	456377	75 %	0 %	0 %	25 %	532431544
9016	NC_022121	AGA	2	6	456387	456392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431544
9017	NC_022121	CA	3	6	456456	456461	50 %	0 %	0 %	50 %	532431544
9018	NC_022121	GTTG	2	8	456477	456484	0 %	50 %	50 %	0 %	532431544
9019	NC_022121	CTAAAG	2	12	456494	456505	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431544
9020	NC_022121	A	7	7	456526	456532	100 %	0 %	0 %	0 %	532431544
9021	NC_022121	AAAGA	2	10	456550	456559	80 %	0 %	20 %	0 %	532431544
9022	NC_022121	A	6	6	456580	456585	100 %	0 %	0 %	0 %	532431544
9023	NC_022121	GAA	2	6	456600	456605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431544
9024	NC_022121	CATG	2	8	456879	456886	25 %	25 %	25 %	25 %	532431545
9025	NC_022121	A	6	6	456952	456957	100 %	0 %	0 %	0 %	532431545
9026	NC_022121	GAA	2	6	457018	457023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431545
9027	NC_022121	AGATC	2	10	457050	457059	40 %	20 %	20 %	20 %	532431545
9028	NC_022121	GATCA	2	10	457093	457102	40 %	20 %	20 %	20 %	532431545
9029	NC_022121	GCT	2	6	457123	457128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431545
9030	NC_022121	A	8	8	457131	457138	100 %	0 %	0 %	0 %	532431545
9031	NC_022121	TAA	2	6	457179	457184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431545
9032	NC_022121	AAGC	2	8	457228	457235	50 %	0 %	25 %	25 %	532431545
9033	NC_022121	TCT	2	6	457248	457253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431545
9034	NC_022121	TC	3	6	457256	457261	0 %	50 %	0 %	50 %	532431545
9035	NC_022121	GAAA	2	8	457263	457270	75 %	0 %	25 %	0 %	532431545
9036	NC_022121	TC	3	6	457272	457277	0 %	50 %	0 %	50 %	532431545
9037	NC_022121	TAG	2	6	457290	457295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431545
9038	NC_022121	GAA	3	9	457306	457314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431545
9039	NC_022121	GA	3	6	457319	457324	50 %	0 %	50 %	0 %	532431545
9040	NC_022121	GAA	2	6	457342	457347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431545
9041	NC_022121	GAAA	2	8	457380	457387	75 %	0 %	25 %	0 %	532431545
9042	NC_022121	ATT	2	6	457401	457406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431545
9043	NC_022121	CAA	3	9	457428	457436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431545
9044	NC_022121	GTT	2	6	457447	457452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431545
9045	NC_022121	ATC	2	6	457532	457537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431545
9046	NC_022121	CAG	2	6	457595	457600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431545
9047	NC_022121	CGT	5	15	457618	457632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431545
9048	NC_022121	TAA	2	6	458070	458075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431546
9049	NC_022121	GCAT	2	8	458092	458099	25 %	25 %	25 %	25 %	532431546
9050	NC_022121	GTA	2	6	458102	458107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431546
9051	NC_022121	CAA	2	6	458111	458116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431546
9052	NC_022121	GTT	3	9	458123	458131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431546
9053	NC_022121	CAT	2	6	458175	458180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431546
9054	NC_022121	TGT	2	6	458242	458247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431546
9055	NC_022121	TCC	2	6	458268	458273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431546
9056	NC_022121	TAA	2	6	458319	458324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431546
9057	NC_022121	TAC	2	6	458340	458345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431546
9058	NC_022121	AC	3	6	458350	458355	50 %	0 %	0 %	50 %	532431546
9059	NC_022121	GAA	2	6	458368	458373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431546
9060	NC_022121	AGT	2	6	458397	458402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431546
9061	NC_022121	AAT	2	6	458441	458446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431546
9062	NC_022121	AGA	2	6	458548	458553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431546
9063	NC_022121	A	6	6	458558	458563	100 %	0 %	0 %	0 %	532431546
9064	NC_022121	GCA	2	6	458674	458679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431546
9065	NC_022121	CAA	2	6	458687	458692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431546
9066	NC_022121	TTC	2	6	458707	458712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431546
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9068	NC_022121	CAC	2	6	458747	458752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431546
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9070	NC_022121	TCG	2	6	458855	458860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431546
9071	NC_022121	A	7	7	458903	458909	100 %	0 %	0 %	0 %	532431546
9072	NC_022121	TGA	2	6	458920	458925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431546
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9074	NC_022121	TGA	2	6	458947	458952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431546
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9077	NC_022121	AC	3	6	459182	459187	50 %	0 %	0 %	50 %	532431547
9078	NC_022121	TCA	3	9	459212	459220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431547
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9088	NC_022121	TC	3	6	459800	459805	0 %	50 %	0 %	50 %	532431547
9089	NC_022121	C	6	6	459848	459853	0 %	0 %	0 %	100 %	532431547
9090	NC_022121	CT	3	6	459943	459948	0 %	50 %	0 %	50 %	532431547
9091	NC_022121	TTCTC	2	10	459962	459971	0 %	60 %	0 %	40 %	532431547
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9094	NC_022121	TATCT	2	10	460123	460132	20 %	60 %	0 %	20 %	532431547
9095	NC_022121	TCAA	2	8	460142	460149	50 %	25 %	0 %	25 %	532431547
9096	NC_022121	ACA	2	6	460196	460201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431547
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9098	NC_022121	AGA	2	6	460536	460541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431548
9099	NC_022121	AT	3	6	460567	460572	50 %	50 %	0 %	0 %	532431548
9100	NC_022121	CAA	2	6	460577	460582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431548
9101	NC_022121	TC	3	6	460621	460626	0 %	50 %	0 %	50 %	532431548
9102	NC_022121	CGAT	2	8	460630	460637	25 %	25 %	25 %	25 %	532431548
9103	NC_022121	CAG	2	6	460736	460741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431548
9104	NC_022121	AAG	2	6	460764	460769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431548
9105	NC_022121	AAAG	2	8	460780	460787	75 %	0 %	25 %	0 %	532431548
9106	NC_022121	GAA	2	6	460897	460902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431548
9107	NC_022121	T	6	6	460912	460917	0 %	100 %	0 %	0 %	532431548
9108	NC_022121	ACT	2	6	460953	460958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431548
9109	NC_022121	CATC	2	8	460985	460992	25 %	25 %	0 %	50 %	532431548
9110	NC_022121	CGA	2	6	460995	461000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431548
9111	NC_022121	ATA	2	6	461082	461087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431548
9112	NC_022121	ACA	2	6	461089	461094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431548
9113	NC_022121	TGC	2	6	461157	461162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431548
9114	NC_022121	GCA	2	6	461204	461209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431548
9115	NC_022121	AGC	2	6	461250	461255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431548
9116	NC_022121	CAAAG	2	10	461289	461298	60 %	0 %	20 %	20 %	532431548
9117	NC_022121	ATG	2	6	461299	461304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431548
9118	NC_022121	A	6	6	461374	461379	100 %	0 %	0 %	0 %	532431548
9119	NC_022121	GAT	2	6	461392	461397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431548
9120	NC_022121	CCAATA	2	12	461479	461490	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532431548
9121	NC_022121	CTT	2	6	461524	461529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431548
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9123	NC_022121	TAC	2	6	461607	461612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431548
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9493	NC_022121	TTC	2	6	479822	479827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431560
9494	NC_022121	GAT	2	6	479916	479921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431560
9495	NC_022121	TAA	2	6	479999	480004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431560
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9497	NC_022121	CTGT	2	8	480046	480053	0 %	50 %	25 %	25 %	532431560
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