MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_022121	CAA	3	9	430423	430431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431525
8502	NC_022121	TGT	2	6	430454	430459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431525
8503	NC_022121	AGA	2	6	430506	430511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431525
8504	NC_022121	TCTCT	2	10	430512	430521	0 %	60 %	0 %	40 %	532431525
8505	NC_022121	CAT	2	6	430582	430587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431525
8506	NC_022121	ATG	2	6	430591	430596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431525
8507	NC_022121	TAA	2	6	430616	430621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431525
8508	NC_022121	CAT	2	6	430633	430638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431525
8509	NC_022121	TCC	2	6	430775	430780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431525
8510	NC_022121	ATG	2	6	431329	431334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431526
8511	NC_022121	CTT	2	6	431375	431380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431526
8512	NC_022121	GAG	2	6	431462	431467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431526
8513	NC_022121	GAA	2	6	431491	431496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431526
8514	NC_022121	AGCTAA	2	12	431547	431558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431526
8515	NC_022121	CAA	2	6	431567	431572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431526
8516	NC_022121	GAT	2	6	431593	431598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431526
8517	NC_022121	ATA	2	6	431609	431614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431526
8518	NC_022121	TGA	2	6	431680	431685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431526
8519	NC_022121	A	6	6	431695	431700	100 %	0 %	0 %	0 %	532431526
8520	NC_022121	AAT	2	6	431733	431738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431526
8521	NC_022121	CCTTC	2	10	431762	431771	0 %	40 %	0 %	60 %	532431526
8522	NC_022121	TC	3	6	431770	431775	0 %	50 %	0 %	50 %	532431526
8523	NC_022121	ATTCC	2	10	431795	431804	20 %	40 %	0 %	40 %	532431526
8524	NC_022121	TGT	2	6	431809	431814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431526
8525	NC_022121	CTG	2	6	431858	431863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431526
8526	NC_022121	AGA	2	6	431914	431919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431526
8527	NC_022121	TC	4	8	431927	431934	0 %	50 %	0 %	50 %	532431526
8528	NC_022121	AGC	2	6	431964	431969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431526
8529	NC_022121	CTC	2	6	432026	432031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431526
8530	NC_022121	ATC	2	6	432105	432110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431526
8531	NC_022121	TGC	2	6	432201	432206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431526
8532	NC_022121	GTT	2	6	432217	432222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431526
8533	NC_022121	CAA	2	6	432239	432244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431526
8534	NC_022121	ATCT	2	8	432261	432268	25 %	50 %	0 %	25 %	532431526
8535	NC_022121	GCA	2	6	432283	432288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431526
8536	NC_022121	A	6	6	432312	432317	100 %	0 %	0 %	0 %	532431526
8537	NC_022121	TA	3	6	432429	432434	50 %	50 %	0 %	0 %	532431526
8538	NC_022121	TCC	2	6	432460	432465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431526
8539	NC_022121	GCA	2	6	432484	432489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431526
8540	NC_022121	CTT	2	6	432491	432496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431526
8541	NC_022121	ATG	2	6	432583	432588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431526
8542	NC_022121	TTG	2	6	432594	432599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431526
8543	NC_022121	CT	3	6	432628	432633	0 %	50 %	0 %	50 %	532431526
8544	NC_022121	AGC	2	6	432659	432664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431526
8545	NC_022121	ATC	2	6	432666	432671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431526
8546	NC_022121	AATC	2	8	432764	432771	50 %	25 %	0 %	25 %	532431526
8547	NC_022121	A	6	6	432817	432822	100 %	0 %	0 %	0 %	532431526
8548	NC_022121	CAT	2	6	432831	432836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431526
8549	NC_022121	ATA	2	6	433027	433032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431527
8550	NC_022121	CA	3	6	433056	433061	50 %	0 %	0 %	50 %	532431527
8551	NC_022121	CTC	2	6	433117	433122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431527
8552	NC_022121	TCC	2	6	433133	433138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431527
8553	NC_022121	TAA	2	6	433147	433152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431527
8554	NC_022121	CTA	2	6	433353	433358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431527
8555	NC_022121	TAA	2	6	433363	433368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431527
8556	NC_022121	CTG	2	6	433545	433550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431527
8557	NC_022121	CAAT	2	8	433596	433603	50 %	25 %	0 %	25 %	532431527
8558	NC_022121	T	6	6	433627	433632	0 %	100 %	0 %	0 %	532431527
8559	NC_022121	ACG	2	6	433639	433644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431527
8560	NC_022121	T	6	6	433667	433672	0 %	100 %	0 %	0 %	532431527
8561	NC_022121	TTC	2	6	433710	433715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431527
8562	NC_022121	TC	3	6	433734	433739	0 %	50 %	0 %	50 %	532431527
8563	NC_022121	CCA	2	6	433760	433765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431527
8564	NC_022121	CCT	2	6	433769	433774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431527
8565	NC_022121	TAA	2	6	433819	433824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431527
8566	NC_022121	CAG	2	6	433863	433868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431527
8567	NC_022121	AATT	2	8	433897	433904	50 %	50 %	0 %	0 %	532431527
8568	NC_022121	ACA	3	9	433919	433927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431527
8569	NC_022121	GGGA	2	8	433956	433963	25 %	0 %	75 %	0 %	532431527
8570	NC_022121	TCA	2	6	433973	433978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431527
8571	NC_022121	TAG	2	6	433995	434000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431527
8572	NC_022121	TTC	2	6	434005	434010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431527
8573	NC_022121	TAAA	2	8	434047	434054	75 %	25 %	0 %	0 %	532431527
8574	NC_022121	GAA	3	9	434057	434065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431527
8575	NC_022121	CTC	2	6	434134	434139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431527
8576	NC_022121	AAC	2	6	434181	434186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431527
8577	NC_022121	CT	3	6	434218	434223	0 %	50 %	0 %	50 %	532431527
8578	NC_022121	TTC	2	6	434264	434269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431527
8579	NC_022121	TCTT	2	8	434282	434289	0 %	75 %	0 %	25 %	532431527
8580	NC_022121	TTTCT	2	10	434292	434301	0 %	80 %	0 %	20 %	532431527
8581	NC_022121	GTT	2	6	435137	435142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431528
8582	NC_022121	CTT	2	6	435178	435183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431528
8583	NC_022121	CATG	2	8	435370	435377	25 %	25 %	25 %	25 %	532431528
8584	NC_022121	TGAG	2	8	435489	435496	25 %	25 %	50 %	0 %	532431528
8585	NC_022121	TC	3	6	435514	435519	0 %	50 %	0 %	50 %	532431528
8586	NC_022121	TCC	2	6	435549	435554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431528
8587	NC_022121	ATA	2	6	435557	435562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431528
8588	NC_022121	TC	3	6	435709	435714	0 %	50 %	0 %	50 %	532431528
8589	NC_022121	CTC	2	6	435745	435750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431528
8590	NC_022121	CAA	2	6	435757	435762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431528
8591	NC_022121	AGG	2	6	435770	435775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431528
8592	NC_022121	CTT	2	6	435826	435831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431528
8593	NC_022121	AAC	2	6	435835	435840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431528
8594	NC_022121	CAAA	2	8	435845	435852	75 %	0 %	0 %	25 %	532431528
8595	NC_022121	A	6	6	435870	435875	100 %	0 %	0 %	0 %	532431528
8596	NC_022121	T	8	8	435886	435893	0 %	100 %	0 %	0 %	532431528
8597	NC_022121	ACTC	2	8	435908	435915	25 %	25 %	0 %	50 %	532431528
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8601	NC_022121	GCA	2	6	436136	436141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431529
8602	NC_022121	AAG	2	6	436206	436211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431529
8603	NC_022121	CTT	2	6	436216	436221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431529
8604	NC_022121	AGT	2	6	436258	436263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431529
8605	NC_022121	CT	3	6	436284	436289	0 %	50 %	0 %	50 %	532431529
8606	NC_022121	GCA	2	6	436337	436342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431529
8607	NC_022121	CTG	2	6	436473	436478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431529
8608	NC_022121	AAT	2	6	436520	436525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431529
8609	NC_022121	GTTC	2	8	436594	436601	0 %	50 %	25 %	25 %	532431529
8610	NC_022121	AAT	2	6	436705	436710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431529
8611	NC_022121	T	7	7	436801	436807	0 %	100 %	0 %	0 %	532431529
8612	NC_022121	CGT	2	6	437000	437005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432050
8613	NC_022121	TCA	2	6	437028	437033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432050
8614	NC_022121	AGT	2	6	437055	437060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432050
8615	NC_022121	AAT	2	6	437115	437120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432050
8616	NC_022121	ACA	2	6	437354	437359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431530
8617	NC_022121	TG	3	6	437399	437404	0 %	50 %	50 %	0 %	532431530
8618	NC_022121	TTG	2	6	437441	437446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431530
8619	NC_022121	CTCA	2	8	437465	437472	25 %	25 %	0 %	50 %	532431530
8620	NC_022121	CTGT	2	8	437482	437489	0 %	50 %	25 %	25 %	532431530
8621	NC_022121	TGG	2	6	437529	437534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431530
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8991	NC_022121	GCT	2	6	455317	455322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431544
8992	NC_022121	TGC	2	6	455366	455371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431544
8993	NC_022121	GTA	2	6	455498	455503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431544
8994	NC_022121	A	6	6	455545	455550	100 %	0 %	0 %	0 %	532431544
8995	NC_022121	T	6	6	455603	455608	0 %	100 %	0 %	0 %	532431544
8996	NC_022121	AAC	2	6	455621	455626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431544
8997	NC_022121	TTC	2	6	455645	455650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431544
8998	NC_022121	TTCA	2	8	455652	455659	25 %	50 %	0 %	25 %	532431544
8999	NC_022121	ACAA	2	8	455705	455712	75 %	0 %	0 %	25 %	532431544
9000	NC_022121	GCT	2	6	455716	455721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431544

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