MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8003	NC_022121	A	6	6	407045	407050	100 %	0 %	0 %	0 %	532431506
8004	NC_022121	GAC	2	6	407085	407090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431506
8005	NC_022121	ATGG	2	8	407124	407131	25 %	25 %	50 %	0 %	532431506
8006	NC_022121	A	6	6	407201	407206	100 %	0 %	0 %	0 %	532431506
8007	NC_022121	ACT	2	6	407245	407250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431506
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8010	NC_022121	CAAA	2	8	407361	407368	75 %	0 %	0 %	25 %	532431506
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8014	NC_022121	TC	3	6	407679	407684	0 %	50 %	0 %	50 %	532431507
8015	NC_022121	AACCA	2	10	407729	407738	60 %	0 %	0 %	40 %	532431507
8016	NC_022121	GAA	2	6	407751	407756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431507
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8020	NC_022121	TCT	2	6	407921	407926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431507
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8023	NC_022121	CTTT	2	8	408030	408037	0 %	75 %	0 %	25 %	532431507
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8042	NC_022121	AT	3	6	408779	408784	50 %	50 %	0 %	0 %	532431507
8043	NC_022121	CAT	2	6	408808	408813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431507
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8045	NC_022121	ATC	2	6	408862	408867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431507
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8091	NC_022121	TA	3	6	410969	410974	50 %	50 %	0 %	0 %	532431508
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8103	NC_022121	ATGC	2	8	411899	411906	25 %	25 %	25 %	25 %	532432048
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8105	NC_022121	AT	3	6	411958	411963	50 %	50 %	0 %	0 %	532432048
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8107	NC_022121	TTC	2	6	412020	412025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431510
8108	NC_022121	CT	3	6	412038	412043	0 %	50 %	0 %	50 %	532431510
8109	NC_022121	TC	3	6	412065	412070	0 %	50 %	0 %	50 %	532431510
8110	NC_022121	A	6	6	412072	412077	100 %	0 %	0 %	0 %	532431510
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8113	NC_022121	CT	3	6	412168	412173	0 %	50 %	0 %	50 %	532431510
8114	NC_022121	A	6	6	412252	412257	100 %	0 %	0 %	0 %	532431510
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8118	NC_022121	CT	3	6	412402	412407	0 %	50 %	0 %	50 %	532431510
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8121	NC_022121	AGCA	2	8	412507	412514	50 %	0 %	25 %	25 %	532431510
8122	NC_022121	AAG	2	6	412733	412738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431511
8123	NC_022121	TCTCT	2	10	412785	412794	0 %	60 %	0 %	40 %	532431511
8124	NC_022121	TTC	2	6	412911	412916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431511
8125	NC_022121	GAC	2	6	412930	412935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431511
8126	NC_022121	GTC	2	6	413033	413038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431511
8127	NC_022121	AATC	2	8	413317	413324	50 %	25 %	0 %	25 %	532431511
8128	NC_022121	AAAC	2	8	413395	413402	75 %	0 %	0 %	25 %	532431511
8129	NC_022121	TAC	2	6	413452	413457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431511
8130	NC_022121	AAATA	2	10	413459	413468	80 %	20 %	0 %	0 %	532431511
8131	NC_022121	CGAA	2	8	413492	413499	50 %	0 %	25 %	25 %	532431511
8132	NC_022121	CT	3	6	413505	413510	0 %	50 %	0 %	50 %	532431511
8133	NC_022121	AGC	2	6	413513	413518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431511
8134	NC_022121	CAA	2	6	413606	413611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431512
8135	NC_022121	TTA	2	6	413637	413642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431512
8136	NC_022121	AATTA	2	10	413645	413654	60 %	40 %	0 %	0 %	532431512
8137	NC_022121	AGCT	2	8	413732	413739	25 %	25 %	25 %	25 %	532431512
8138	NC_022121	CTT	2	6	414043	414048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431512
8139	NC_022121	CT	3	6	414251	414256	0 %	50 %	0 %	50 %	532431512
8140	NC_022121	AG	3	6	414279	414284	50 %	0 %	50 %	0 %	532431512
8141	NC_022121	C	6	6	414299	414304	0 %	0 %	0 %	100 %	532431512
8142	NC_022121	TCT	2	6	414372	414377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431512
8143	NC_022121	CCGC	2	8	414427	414434	0 %	0 %	25 %	75 %	532431512
8144	NC_022121	CAG	2	6	414501	414506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431512
8145	NC_022121	AGAA	2	8	414569	414576	75 %	0 %	25 %	0 %	532431512
8146	NC_022121	CT	3	6	414694	414699	0 %	50 %	0 %	50 %	532431512
8147	NC_022121	AAC	3	9	414758	414766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431512
8148	NC_022121	TCTT	2	8	414776	414783	0 %	75 %	0 %	25 %	532431512
8149	NC_022121	TCG	2	6	414803	414808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431512
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8151	NC_022121	CT	3	6	414889	414894	0 %	50 %	0 %	50 %	532431513
8152	NC_022121	TGA	2	6	414895	414900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431513
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8154	NC_022121	CTC	2	6	414956	414961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431513
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8156	NC_022121	ATC	2	6	415044	415049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431513
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8158	NC_022121	TCT	2	6	415138	415143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431513
8159	NC_022121	TC	3	6	415271	415276	0 %	50 %	0 %	50 %	532431513
8160	NC_022121	TCT	2	6	415283	415288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431513
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8162	NC_022121	ACA	2	6	415406	415411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431513
8163	NC_022121	ACA	2	6	415446	415451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431513
8164	NC_022121	TAA	2	6	415463	415468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431513
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8166	NC_022121	TTC	2	6	415488	415493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431513
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8175	NC_022121	TCT	2	6	415970	415975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431514
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8183	NC_022121	GCT	2	6	416272	416277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431514
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8234	NC_022121	ACT	2	6	418526	418531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431515
8235	NC_022121	A	7	7	418553	418559	100 %	0 %	0 %	0 %	532431515
8236	NC_022121	CTT	2	6	418743	418748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431516
8237	NC_022121	TCC	2	6	418784	418789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431516
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8239	NC_022121	CCT	2	6	418825	418830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431516
8240	NC_022121	TCTCT	2	10	418862	418871	0 %	60 %	0 %	40 %	532431516
8241	NC_022121	AGA	2	6	418923	418928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431516
8242	NC_022121	CCCCCA	2	12	419047	419058	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	532431516
8243	NC_022121	CA	3	6	419076	419081	50 %	0 %	0 %	50 %	532431516
8244	NC_022121	ACG	2	6	419087	419092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431516
8245	NC_022121	A	6	6	419146	419151	100 %	0 %	0 %	0 %	532431516
8246	NC_022121	TCT	3	9	419154	419162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431516
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8248	NC_022121	CTTT	2	8	419274	419281	0 %	75 %	0 %	25 %	532431516
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8495	NC_022121	AT	3	6	430049	430054	50 %	50 %	0 %	0 %	532431525
8496	NC_022121	AGC	2	6	430061	430066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431525
8497	NC_022121	TGC	2	6	430082	430087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431525
8498	NC_022121	ATA	2	6	430155	430160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431525
8499	NC_022121	TTCT	2	8	430359	430366	0 %	75 %	0 %	25 %	532431525
8500	NC_022121	AAT	2	6	430368	430373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431525

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