MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_022121	ACC	2	6	381593	381598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431484
7502	NC_022121	TC	3	6	381605	381610	0 %	50 %	0 %	50 %	532431484
7503	NC_022121	ATCT	2	8	381683	381690	25 %	50 %	0 %	25 %	532431484
7504	NC_022121	AAG	2	6	381940	381945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431485
7505	NC_022121	GCA	2	6	382028	382033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431485
7506	NC_022121	AAC	2	6	382072	382077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431485
7507	NC_022121	TC	3	6	382167	382172	0 %	50 %	0 %	50 %	532431485
7508	NC_022121	TAT	2	6	382291	382296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431485
7509	NC_022121	TGA	2	6	382297	382302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431485
7510	NC_022121	CTAA	2	8	382313	382320	50 %	25 %	0 %	25 %	532431485
7511	NC_022121	CTA	2	6	382337	382342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431485
7512	NC_022121	CCT	2	6	382358	382363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431485
7513	NC_022121	CAT	2	6	382468	382473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431485
7514	NC_022121	AAG	2	6	382500	382505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431485
7515	NC_022121	GCT	2	6	382547	382552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431485
7516	NC_022121	GTA	2	6	382592	382597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431485
7517	NC_022121	ACAGC	2	10	382626	382635	40 %	0 %	20 %	40 %	532431485
7518	NC_022121	TAC	2	6	382690	382695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431485
7519	NC_022121	TTC	2	6	382764	382769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431485
7520	NC_022121	CTC	2	6	382846	382851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431485
7521	NC_022121	A	6	6	382920	382925	100 %	0 %	0 %	0 %	532431485
7522	NC_022121	ATT	2	6	382943	382948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431485
7523	NC_022121	TCT	2	6	382951	382956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431485
7524	NC_022121	TC	3	6	382980	382985	0 %	50 %	0 %	50 %	532431485
7525	NC_022121	CAC	2	6	383064	383069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431485
7526	NC_022121	AAATC	2	10	383070	383079	60 %	20 %	0 %	20 %	532431485
7527	NC_022121	ATC	2	6	383101	383106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431485
7528	NC_022121	CAAC	2	8	383111	383118	50 %	0 %	0 %	50 %	532431485
7529	NC_022121	TCA	2	6	383162	383167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431485
7530	NC_022121	AAGA	2	8	383174	383181	75 %	0 %	25 %	0 %	532431485
7531	NC_022121	C	6	6	383204	383209	0 %	0 %	0 %	100 %	532431485
7532	NC_022121	TC	3	6	383210	383215	0 %	50 %	0 %	50 %	532431485
7533	NC_022121	TGT	2	6	383269	383274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431485
7534	NC_022121	A	6	6	383334	383339	100 %	0 %	0 %	0 %	532431486
7535	NC_022121	CT	3	6	383381	383386	0 %	50 %	0 %	50 %	532431486
7536	NC_022121	AGT	2	6	383507	383512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431486
7537	NC_022121	GCA	2	6	383529	383534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431486
7538	NC_022121	AGC	2	6	383540	383545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431486
7539	NC_022121	AGC	2	6	383549	383554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431486
7540	NC_022121	T	6	6	383601	383606	0 %	100 %	0 %	0 %	532431486
7541	NC_022121	TGA	2	6	383626	383631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431487
7542	NC_022121	TAA	2	6	383700	383705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431487
7543	NC_022121	AGA	2	6	383779	383784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431487
7544	NC_022121	TC	3	6	383801	383806	0 %	50 %	0 %	50 %	532431487
7545	NC_022121	TTC	2	6	383827	383832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431487
7546	NC_022121	ACA	2	6	383848	383853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431487
7547	NC_022121	TGA	2	6	383854	383859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431487
7548	NC_022121	TAA	2	6	383867	383872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431487
7549	NC_022121	CT	3	6	383916	383921	0 %	50 %	0 %	50 %	532431487
7550	NC_022121	CT	3	6	383977	383982	0 %	50 %	0 %	50 %	532431487
7551	NC_022121	ATC	2	6	383998	384003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431487
7552	NC_022121	TCT	2	6	384076	384081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431487
7553	NC_022121	GTC	2	6	384146	384151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431487
7554	NC_022121	CAATAG	2	12	384164	384175	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431487
7555	NC_022121	TAA	2	6	384210	384215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431487
7556	NC_022121	CAAA	2	8	384275	384282	75 %	0 %	0 %	25 %	532431487
7557	NC_022121	ACTGAA	2	12	384305	384316	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431487
7558	NC_022121	TTC	2	6	384342	384347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431487
7559	NC_022121	TTC	2	6	384441	384446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431487
7560	NC_022121	TACT	2	8	384449	384456	25 %	50 %	0 %	25 %	532431487
7561	NC_022121	GA	5	10	384466	384475	50 %	0 %	50 %	0 %	532431487
7562	NC_022121	CTGCAC	2	12	384498	384509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532431487
7563	NC_022121	GCTT	2	8	384532	384539	0 %	50 %	25 %	25 %	532431487
7564	NC_022121	ATA	2	6	384543	384548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431487
7565	NC_022121	TC	3	6	384584	384589	0 %	50 %	0 %	50 %	532431487
7566	NC_022121	GTA	2	6	384652	384657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431487
7567	NC_022121	ACA	2	6	384843	384848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431487
7568	NC_022121	GTC	2	6	384913	384918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431487
7569	NC_022121	TC	3	6	384947	384952	0 %	50 %	0 %	50 %	532431487
7570	NC_022121	AGA	2	6	384960	384965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431487
7571	NC_022121	A	6	6	384965	384970	100 %	0 %	0 %	0 %	532431487
7572	NC_022121	ACC	2	6	385009	385014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431487
7573	NC_022121	CTT	2	6	385100	385105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431487
7574	NC_022121	AGC	2	6	385113	385118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431487
7575	NC_022121	GTA	2	6	385149	385154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431487
7576	NC_022121	CTT	3	9	385175	385183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431487
7577	NC_022121	AGA	2	6	385212	385217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431487
7578	NC_022121	CAA	2	6	385224	385229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431487
7579	NC_022121	TTA	2	6	385300	385305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431487
7580	NC_022121	AAG	2	6	385423	385428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431488
7581	NC_022121	TTC	2	6	385502	385507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431488
7582	NC_022121	AGA	2	6	385556	385561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431488
7583	NC_022121	CTG	2	6	385579	385584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431488
7584	NC_022121	GAA	2	6	385627	385632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431488
7585	NC_022121	C	6	6	385643	385648	0 %	0 %	0 %	100 %	532431488
7586	NC_022121	TTC	2	6	385659	385664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431488
7587	NC_022121	ATG	2	6	385685	385690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431488
7588	NC_022121	CCAG	2	8	385820	385827	25 %	0 %	25 %	50 %	532431489
7589	NC_022121	GAT	2	6	385953	385958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431489
7590	NC_022121	AAC	2	6	385961	385966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431489
7591	NC_022121	TAA	2	6	386052	386057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431489
7592	NC_022121	TCT	2	6	386059	386064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431489
7593	NC_022121	AAG	2	6	386067	386072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431489
7594	NC_022121	A	8	8	386147	386154	100 %	0 %	0 %	0 %	532431489
7595	NC_022121	TGA	2	6	386155	386160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431489
7596	NC_022121	AAC	2	6	386187	386192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431489
7597	NC_022121	AGG	2	6	386208	386213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431489
7598	NC_022121	CAT	2	6	386258	386263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431489
7599	NC_022121	A	7	7	386318	386324	100 %	0 %	0 %	0 %	532432045
7600	NC_022121	CTT	2	6	386464	386469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432045
7601	NC_022121	GA	3	6	386498	386503	50 %	0 %	50 %	0 %	532432045
7602	NC_022121	GTT	2	6	386518	386523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432045
7603	NC_022121	ACA	2	6	386634	386639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431490
7604	NC_022121	TGCT	2	8	386678	386685	0 %	50 %	25 %	25 %	532431490
7605	NC_022121	CTG	2	6	386700	386705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431490
7606	NC_022121	CTA	2	6	386794	386799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431490
7607	NC_022121	TC	3	6	386801	386806	0 %	50 %	0 %	50 %	532431490
7608	NC_022121	TTAA	2	8	386890	386897	50 %	50 %	0 %	0 %	532431490
7609	NC_022121	A	9	9	386896	386904	100 %	0 %	0 %	0 %	532431490
7610	NC_022121	CTCA	2	8	386905	386912	25 %	25 %	0 %	50 %	532431490
7611	NC_022121	CAT	2	6	386982	386987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431490
7612	NC_022121	CTA	2	6	386990	386995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431490
7613	NC_022121	TCA	2	6	387070	387075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431490
7614	NC_022121	TTC	2	6	387120	387125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431490
7615	NC_022121	TTCT	2	8	387163	387170	0 %	75 %	0 %	25 %	532431490
7616	NC_022121	TCA	2	6	387171	387176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431490
7617	NC_022121	CT	3	6	387247	387252	0 %	50 %	0 %	50 %	532431490
7618	NC_022121	T	6	6	387296	387301	0 %	100 %	0 %	0 %	532431490
7619	NC_022121	CTT	3	9	387339	387347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431490
7620	NC_022121	TTA	2	6	387349	387354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431490
7621	NC_022121	A	6	6	387370	387375	100 %	0 %	0 %	0 %	532431490
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