MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_022121	TCA	2	6	356335	356340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431465
7004	NC_022121	CTG	2	6	356365	356370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431465
7005	NC_022121	AGG	2	6	356406	356411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431465
7006	NC_022121	AG	3	6	356419	356424	50 %	0 %	50 %	0 %	532431465
7007	NC_022121	CCG	2	6	356438	356443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431465
7008	NC_022121	TC	3	6	356447	356452	0 %	50 %	0 %	50 %	532431465
7009	NC_022121	CAA	2	6	356466	356471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431465
7010	NC_022121	TCT	2	6	356626	356631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431465
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7012	NC_022121	GAT	2	6	356718	356723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431465
7013	NC_022121	CTA	2	6	356765	356770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431465
7014	NC_022121	T	6	6	356907	356912	0 %	100 %	0 %	0 %	532431465
7015	NC_022121	ATT	2	6	356940	356945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431465
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7018	NC_022121	GCA	2	6	357031	357036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431465
7019	NC_022121	CAA	2	6	357056	357061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431465
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7021	NC_022121	AAT	2	6	357079	357084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431465
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7024	NC_022121	TCT	2	6	357319	357324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431465
7025	NC_022121	CTG	2	6	357332	357337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431465
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7029	NC_022121	AAT	2	6	357678	357683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431465
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7031	NC_022121	ATTC	2	8	357723	357730	25 %	50 %	0 %	25 %	532431465
7032	NC_022121	TCG	2	6	357807	357812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431465
7033	NC_022121	ATC	2	6	357831	357836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431465
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7038	NC_022121	ATTTA	2	10	357960	357969	40 %	60 %	0 %	0 %	532431465
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7042	NC_022121	TAGCA	2	10	358206	358215	40 %	20 %	20 %	20 %	532431465
7043	NC_022121	TC	3	6	358226	358231	0 %	50 %	0 %	50 %	532431465
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7053	NC_022121	TCA	2	6	358681	358686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431465
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7057	NC_022121	CTT	2	6	358841	358846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431465
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7061	NC_022121	CTT	2	6	359394	359399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431466
7062	NC_022121	TCT	2	6	359407	359412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431466
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7064	NC_022121	CTT	2	6	359474	359479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431466
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7089	NC_022121	TCT	2	6	360284	360289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431467
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7091	NC_022121	GAAA	2	8	360475	360482	75 %	0 %	25 %	0 %	532431468
7092	NC_022121	TGT	2	6	360574	360579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431468
7093	NC_022121	CT	3	6	360646	360651	0 %	50 %	0 %	50 %	532431468
7094	NC_022121	CAT	2	6	360652	360657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431468
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7099	NC_022121	GATC	2	8	360861	360868	25 %	25 %	25 %	25 %	532431468
7100	NC_022121	TC	3	6	361082	361087	0 %	50 %	0 %	50 %	532431469
7101	NC_022121	AAC	2	6	361103	361108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431469
7102	NC_022121	T	6	6	361217	361222	0 %	100 %	0 %	0 %	532431469
7103	NC_022121	GAA	2	6	361230	361235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431469
7104	NC_022121	ACA	2	6	361290	361295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431469
7105	NC_022121	GCA	2	6	361368	361373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431469
7106	NC_022121	TGG	2	6	361391	361396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431469
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7108	NC_022121	TTCTTA	2	12	361559	361570	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532431470
7109	NC_022121	ATC	2	6	361619	361624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431470
7110	NC_022121	TC	3	6	361633	361638	0 %	50 %	0 %	50 %	532431470
7111	NC_022121	GCC	2	6	361666	361671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431470
7112	NC_022121	CAA	2	6	361702	361707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431470
7113	NC_022121	AACA	2	8	361712	361719	75 %	0 %	0 %	25 %	532431470
7114	NC_022121	AAC	2	6	361769	361774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431470
7115	NC_022121	T	6	6	361781	361786	0 %	100 %	0 %	0 %	532431470
7116	NC_022121	T	6	6	361809	361814	0 %	100 %	0 %	0 %	532431470
7117	NC_022121	CTT	3	9	361816	361824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431470
7118	NC_022121	CAGA	2	8	361825	361832	50 %	0 %	25 %	25 %	532431470
7119	NC_022121	TCT	2	6	361876	361881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431470
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7121	NC_022121	GAT	2	6	362003	362008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431470
7122	NC_022121	CTG	2	6	362009	362014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431470
7123	NC_022121	CTT	2	6	362038	362043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431470
7124	NC_022121	TCT	2	6	362049	362054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431470
7125	NC_022121	T	6	6	362061	362066	0 %	100 %	0 %	0 %	532431470
7126	NC_022121	CTTT	2	8	362068	362075	0 %	75 %	0 %	25 %	532431470
7127	NC_022121	GAC	2	6	362096	362101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431470
7128	NC_022121	CA	3	6	362183	362188	50 %	0 %	0 %	50 %	532431471
7129	NC_022121	TCA	2	6	362218	362223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431471
7130	NC_022121	TCT	2	6	362272	362277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431471
7131	NC_022121	TTC	2	6	362282	362287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431471
7132	NC_022121	GCT	2	6	362307	362312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431471
7133	NC_022121	T	7	7	362315	362321	0 %	100 %	0 %	0 %	532431471
7134	NC_022121	TTC	2	6	362347	362352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431471
7135	NC_022121	ACC	2	6	362553	362558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431472
7136	NC_022121	CTT	2	6	362582	362587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431472
7137	NC_022121	TGT	2	6	362688	362693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431472
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7139	NC_022121	GAA	2	6	362724	362729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431472
7140	NC_022121	GTC	2	6	362738	362743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431472
7141	NC_022121	CTT	3	9	362747	362755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431472
7142	NC_022121	AAC	2	6	362817	362822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431472
7143	NC_022121	GAG	2	6	362859	362864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431472
7144	NC_022121	TC	3	6	362876	362881	0 %	50 %	0 %	50 %	532431472
7145	NC_022121	GACC	2	8	362954	362961	25 %	0 %	25 %	50 %	532431472
7146	NC_022121	TAC	2	6	363012	363017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431472
7147	NC_022121	ATC	2	6	363102	363107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431472
7148	NC_022121	TATG	2	8	363138	363145	25 %	50 %	25 %	0 %	532431472
7149	NC_022121	TGA	2	6	363182	363187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431472
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7151	NC_022121	CAAC	2	8	363224	363231	50 %	0 %	0 %	50 %	532431472
7152	NC_022121	TCT	2	6	363262	363267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431472
7153	NC_022121	AAC	2	6	363297	363302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431472
7154	NC_022121	ACT	2	6	363379	363384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431472
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7162	NC_022121	TCT	2	6	364248	364253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431473
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7164	NC_022121	TTC	2	6	364702	364707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431474
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7183	NC_022121	T	6	6	365920	365925	0 %	100 %	0 %	0 %	532431475
7184	NC_022121	GGA	2	6	365965	365970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431475
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7195	NC_022121	ATC	2	6	366493	366498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432043
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7198	NC_022121	CAA	2	6	366591	366596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432043
7199	NC_022121	AGGC	2	8	366609	366616	25 %	0 %	50 %	25 %	532432043
7200	NC_022121	TCCA	2	8	366665	366672	25 %	25 %	0 %	50 %	532432043
7201	NC_022121	A	7	7	366672	366678	100 %	0 %	0 %	0 %	532432043
7202	NC_022121	AGC	2	6	366716	366721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432043
7203	NC_022121	ACCA	2	8	366767	366774	50 %	0 %	0 %	50 %	532432043
7204	NC_022121	CTT	2	6	366830	366835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432043
7205	NC_022121	CTC	2	6	366873	366878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532432043
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7207	NC_022121	AGT	2	6	366985	366990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432043
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7209	NC_022121	AGGGA	2	10	367021	367030	40 %	0 %	60 %	0 %	532432043
7210	NC_022121	GCT	2	6	367034	367039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432043
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7213	NC_022121	TAC	2	6	367111	367116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432043
7214	NC_022121	TAG	2	6	367155	367160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432043
7215	NC_022121	GCAT	2	8	367231	367238	25 %	25 %	25 %	25 %	532432043
7216	NC_022121	TGAG	2	8	367264	367271	25 %	25 %	50 %	0 %	532432043
7217	NC_022121	AC	3	6	367292	367297	50 %	0 %	0 %	50 %	532432043
7218	NC_022121	A	6	6	367393	367398	100 %	0 %	0 %	0 %	532432043
7219	NC_022121	CAA	2	6	367413	367418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432043
7220	NC_022121	CT	4	8	367464	367471	0 %	50 %	0 %	50 %	532432043
7221	NC_022121	CAA	2	6	367552	367557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432043
7222	NC_022121	TGA	2	6	367574	367579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432043
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7224	NC_022121	TGA	2	6	367670	367675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432043
7225	NC_022121	CT	3	6	367697	367702	0 %	50 %	0 %	50 %	532432043
7226	NC_022121	CA	3	6	367706	367711	50 %	0 %	0 %	50 %	532432043
7227	NC_022121	C	8	8	367875	367882	0 %	0 %	0 %	100 %	532432044
7228	NC_022121	TCT	2	6	367953	367958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432044
7229	NC_022121	GAA	2	6	367962	367967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432044
7230	NC_022121	TCG	2	6	367998	368003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432044
7231	NC_022121	TATG	2	8	368005	368012	25 %	50 %	25 %	0 %	532432044
7232	NC_022121	GT	3	6	368023	368028	0 %	50 %	50 %	0 %	532432044
7233	NC_022121	TAT	2	6	368035	368040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432044
7234	NC_022121	TCT	2	6	368061	368066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432044
7235	NC_022121	CCT	2	6	368253	368258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431476
7236	NC_022121	CAT	2	6	368306	368311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431476
7237	NC_022121	GA	3	6	368314	368319	50 %	0 %	50 %	0 %	532431476
7238	NC_022121	AAC	2	6	368321	368326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431476
7239	NC_022121	AACA	2	8	368350	368357	75 %	0 %	0 %	25 %	532431476
7240	NC_022121	CTG	3	9	368369	368377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431476
7241	NC_022121	GT	3	6	368422	368427	0 %	50 %	50 %	0 %	532431476
7242	NC_022121	AT	3	6	368430	368435	50 %	50 %	0 %	0 %	532431476
7243	NC_022121	A	7	7	369203	369209	100 %	0 %	0 %	0 %	532431477
7244	NC_022121	AGA	2	6	369244	369249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431477
7245	NC_022121	CTT	2	6	369285	369290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431477
7246	NC_022121	CTC	2	6	369309	369314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431477
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7249	NC_022121	ACA	2	6	369401	369406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431477
7250	NC_022121	TGC	2	6	369433	369438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431477
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7261	NC_022121	GCT	2	6	370379	370384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431478
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7279	NC_022121	TTCT	2	8	371281	371288	0 %	75 %	0 %	25 %	532431479
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7369	NC_022121	TGA	2	6	375230	375235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431483
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7493	NC_022121	A	8	8	381333	381340	100 %	0 %	0 %	0 %	532431484
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7496	NC_022121	A	6	6	381425	381430	100 %	0 %	0 %	0 %	532431484
7497	NC_022121	TTCC	2	8	381457	381464	0 %	50 %	0 %	50 %	532431484
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