MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022121	T	6	6	257097	257102	0 %	100 %	0 %	0 %	532431382
5002	NC_022121	CT	4	8	257165	257172	0 %	50 %	0 %	50 %	532431382
5003	NC_022121	TTA	2	6	257230	257235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431382
5004	NC_022121	GCC	2	6	257364	257369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431382
5005	NC_022121	TTCG	2	8	257427	257434	0 %	50 %	25 %	25 %	532431382
5006	NC_022121	CTT	2	6	257463	257468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431382
5007	NC_022121	CTA	2	6	257499	257504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431382
5008	NC_022121	TC	3	6	257518	257523	0 %	50 %	0 %	50 %	532431382
5009	NC_022121	TTC	2	6	257626	257631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431382
5010	NC_022121	CTT	2	6	257634	257639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431382
5011	NC_022121	TC	3	6	257656	257661	0 %	50 %	0 %	50 %	532431382
5012	NC_022121	TCT	2	6	257718	257723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431382
5013	NC_022121	CAA	2	6	257779	257784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431382
5014	NC_022121	GTTTT	2	10	257791	257800	0 %	80 %	20 %	0 %	532431382
5015	NC_022121	TTA	2	6	257815	257820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431382
5016	NC_022121	CATT	2	8	257839	257846	25 %	50 %	0 %	25 %	532431382
5017	NC_022121	CAC	2	6	257849	257854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431382
5018	NC_022121	GCT	2	6	257934	257939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431382
5019	NC_022121	TCA	2	6	257982	257987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431382
5020	NC_022121	TCT	2	6	258017	258022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431382
5021	NC_022121	TTC	2	6	258031	258036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431382
5022	NC_022121	TGC	2	6	258090	258095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431382
5023	NC_022121	GTT	2	6	258096	258101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431382
5024	NC_022121	TAAT	2	8	258106	258113	50 %	50 %	0 %	0 %	532431382
5025	NC_022121	A	6	6	258114	258119	100 %	0 %	0 %	0 %	532431382
5026	NC_022121	AGA	2	6	258131	258136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431382
5027	NC_022121	A	8	8	258357	258364	100 %	0 %	0 %	0 %	532431383
5028	NC_022121	TCA	2	6	258375	258380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431383
5029	NC_022121	GAT	2	6	258401	258406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431383
5030	NC_022121	GGC	2	6	258465	258470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431383
5031	NC_022121	TTC	2	6	258481	258486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431383
5032	NC_022121	ATT	2	6	258504	258509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431383
5033	NC_022121	CT	3	6	258537	258542	0 %	50 %	0 %	50 %	532431383
5034	NC_022121	AGG	2	6	258614	258619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431383
5035	NC_022121	TAC	2	6	258654	258659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431383
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5037	NC_022121	TAA	2	6	258851	258856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431383
5038	NC_022121	CTT	3	9	259038	259046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431383
5039	NC_022121	AAAC	2	8	259068	259075	75 %	0 %	0 %	25 %	532431383
5040	NC_022121	AAT	2	6	259113	259118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431383
5041	NC_022121	TTTCT	2	10	259123	259132	0 %	80 %	0 %	20 %	532431383
5042	NC_022121	TTTA	2	8	259230	259237	25 %	75 %	0 %	0 %	532431383
5043	NC_022121	TC	3	6	259277	259282	0 %	50 %	0 %	50 %	532431383
5044	NC_022121	T	6	6	259287	259292	0 %	100 %	0 %	0 %	532431383
5045	NC_022121	TCT	3	9	259300	259308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431383
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5050	NC_022121	TCT	2	6	259407	259412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431383
5051	NC_022121	TGC	2	6	259421	259426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431383
5052	NC_022121	T	6	6	259464	259469	0 %	100 %	0 %	0 %	532431383
5053	NC_022121	TATT	2	8	259523	259530	25 %	75 %	0 %	0 %	532431383
5054	NC_022121	ACTT	2	8	259605	259612	25 %	50 %	0 %	25 %	532431383
5055	NC_022121	TGG	2	6	259704	259709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431383
5056	NC_022121	TCTT	2	8	259774	259781	0 %	75 %	0 %	25 %	532431383
5057	NC_022121	AAC	2	6	259815	259820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431383
5058	NC_022121	A	6	6	260009	260014	100 %	0 %	0 %	0 %	532431384
5059	NC_022121	GCA	2	6	260057	260062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431384
5060	NC_022121	TCT	2	6	260104	260109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431384
5061	NC_022121	TGC	2	6	260110	260115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431384
5062	NC_022121	TTA	2	6	260180	260185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431384
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5067	NC_022121	CTT	2	6	260507	260512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431385
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5069	NC_022121	TGCAA	2	10	260543	260552	40 %	20 %	20 %	20 %	532431385
5070	NC_022121	AAC	2	6	260553	260558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431385
5071	NC_022121	A	6	6	260595	260600	100 %	0 %	0 %	0 %	532431385
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5074	NC_022121	TTGT	2	8	260743	260750	0 %	75 %	25 %	0 %	532431385
5075	NC_022121	CTGG	2	8	260751	260758	0 %	25 %	50 %	25 %	532431385
5076	NC_022121	TTG	2	6	260810	260815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431385
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5085	NC_022121	TC	3	6	261211	261216	0 %	50 %	0 %	50 %	532431386
5086	NC_022121	CT	3	6	261223	261228	0 %	50 %	0 %	50 %	532431386
5087	NC_022121	ACCTTT	2	12	261262	261273	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532431386
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5089	NC_022121	T	6	6	261390	261395	0 %	100 %	0 %	0 %	532431386
5090	NC_022121	T	6	6	261455	261460	0 %	100 %	0 %	0 %	532431386
5091	NC_022121	AGA	2	6	261587	261592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431386
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5103	NC_022121	TTA	2	6	262020	262025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431386
5104	NC_022121	TAA	2	6	262040	262045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431386
5105	NC_022121	TTG	2	6	262081	262086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431386
5106	NC_022121	ACT	2	6	262112	262117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431386
5107	NC_022121	TAT	2	6	262151	262156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431386
5108	NC_022121	CCG	2	6	262162	262167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431386
5109	NC_022121	CACT	2	8	262196	262203	25 %	25 %	0 %	50 %	532431386
5110	NC_022121	TC	4	8	262226	262233	0 %	50 %	0 %	50 %	532431386
5111	NC_022121	ATGA	2	8	262281	262288	50 %	25 %	25 %	0 %	532431386
5112	NC_022121	A	6	6	262331	262336	100 %	0 %	0 %	0 %	532431386
5113	NC_022121	TTG	2	6	262374	262379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431386
5114	NC_022121	A	6	6	262385	262390	100 %	0 %	0 %	0 %	532431386
5115	NC_022121	CTT	2	6	262413	262418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431386
5116	NC_022121	A	6	6	262469	262474	100 %	0 %	0 %	0 %	532431386
5117	NC_022121	ACT	2	6	262508	262513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431386
5118	NC_022121	AGC	2	6	262524	262529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431386
5119	NC_022121	AGC	3	9	262550	262558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431386
5120	NC_022121	GAT	2	6	262611	262616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431386
5121	NC_022121	TC	3	6	262712	262717	0 %	50 %	0 %	50 %	532431386
5122	NC_022121	TAA	2	6	262747	262752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431386
5123	NC_022121	AAG	2	6	262781	262786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431386
5124	NC_022121	TAT	2	6	262802	262807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431386
5125	NC_022121	CTT	2	6	262814	262819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431386
5126	NC_022121	AC	3	6	262936	262941	50 %	0 %	0 %	50 %	532431386
5127	NC_022121	GTTC	2	8	263003	263010	0 %	50 %	25 %	25 %	532431386
5128	NC_022121	CT	3	6	263066	263071	0 %	50 %	0 %	50 %	532431386
5129	NC_022121	GCA	2	6	263145	263150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431386
5130	NC_022121	ATAG	2	8	263166	263173	50 %	25 %	25 %	0 %	532431386
5131	NC_022121	GCT	2	6	263217	263222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431386
5132	NC_022121	TCG	2	6	263356	263361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431386
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5135	NC_022121	A	6	6	263532	263537	100 %	0 %	0 %	0 %	532431386
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5137	NC_022121	CCTTT	2	10	263589	263598	0 %	60 %	0 %	40 %	532431386
5138	NC_022121	AGA	2	6	263627	263632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431386
5139	NC_022121	TCT	2	6	263658	263663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431386
5140	NC_022121	A	6	6	263689	263694	100 %	0 %	0 %	0 %	532431386
5141	NC_022121	TAT	2	6	263701	263706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431386
5142	NC_022121	A	7	7	263791	263797	100 %	0 %	0 %	0 %	532431387
5143	NC_022121	TG	3	6	263935	263940	0 %	50 %	50 %	0 %	532431387
5144	NC_022121	GAA	2	6	264001	264006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431387
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5148	NC_022121	CAT	2	6	264294	264299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431388
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5150	NC_022121	TCT	2	6	264377	264382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431388
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5154	NC_022121	CTT	2	6	265061	265066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431389
5155	NC_022121	AAT	2	6	265089	265094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431389
5156	NC_022121	GCT	2	6	265105	265110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431389
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5158	NC_022121	CTG	2	6	265205	265210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431389
5159	NC_022121	TA	3	6	265222	265227	50 %	50 %	0 %	0 %	532431389
5160	NC_022121	TTC	3	9	265260	265268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431389
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5163	NC_022121	AG	4	8	265428	265435	50 %	0 %	50 %	0 %	532431389
5164	NC_022121	AGC	2	6	265440	265445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431389
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5193	NC_022121	CA	3	6	267105	267110	50 %	0 %	0 %	50 %	532431391
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5215	NC_022121	TAAAA	2	10	268782	268791	80 %	20 %	0 %	0 %	532431393
5216	NC_022121	GTT	2	6	268806	268811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431393
5217	NC_022121	TGA	2	6	268827	268832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431393
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5219	NC_022121	AG	3	6	268939	268944	50 %	0 %	50 %	0 %	532431393
5220	NC_022121	ATT	2	6	269031	269036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431393
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5222	NC_022121	TCATAA	2	12	269109	269120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532431393
5223	NC_022121	AAG	2	6	269159	269164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431393
5224	NC_022121	A	7	7	269181	269187	100 %	0 %	0 %	0 %	532431393
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5229	NC_022121	TTAA	2	8	269698	269705	50 %	50 %	0 %	0 %	532431393
5230	NC_022121	ATG	2	6	269732	269737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431393
5231	NC_022121	AAGTGT	2	12	269835	269846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431393
5232	NC_022121	ATTT	2	8	269972	269979	25 %	75 %	0 %	0 %	532431393
5233	NC_022121	ATTT	2	8	270011	270018	25 %	75 %	0 %	0 %	532431393
5234	NC_022121	A	6	6	270037	270042	100 %	0 %	0 %	0 %	532431393
5235	NC_022121	GGT	2	6	270061	270066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431393
5236	NC_022121	CTT	2	6	270141	270146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431393
5237	NC_022121	TAA	2	6	270189	270194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431393
5238	NC_022121	ACT	2	6	270209	270214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431393
5239	NC_022121	ACC	2	6	270244	270249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431393
5240	NC_022121	A	7	7	270319	270325	100 %	0 %	0 %	0 %	532431393
5241	NC_022121	TAA	2	6	270363	270368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431393
5242	NC_022121	CTA	2	6	270431	270436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431393
5243	NC_022121	ACTAA	2	10	270496	270505	60 %	20 %	0 %	20 %	532431393
5244	NC_022121	TCTA	2	8	270517	270524	25 %	50 %	0 %	25 %	532431393
5245	NC_022121	TTA	2	6	270529	270534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431393
5246	NC_022121	A	6	6	270538	270543	100 %	0 %	0 %	0 %	532431393
5247	NC_022121	AAC	3	9	270591	270599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431393
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5403	NC_022121	ATTGT	2	10	276877	276886	20 %	60 %	20 %	0 %	532431399
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5489	NC_022121	TAAT	2	8	281024	281031	50 %	50 %	0 %	0 %	532431402
5490	NC_022121	TTC	2	6	281034	281039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431402
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5492	NC_022121	GAA	2	6	281121	281126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431402
5493	NC_022121	CTT	2	6	281129	281134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431402
5494	NC_022121	TCC	2	6	281304	281309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431402
5495	NC_022121	CAG	2	6	281312	281317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431402
5496	NC_022121	GAA	2	6	281417	281422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431402
5497	NC_022121	CACGCG	2	12	281571	281582	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532431402
5498	NC_022121	ATT	3	9	281595	281603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431402
5499	NC_022121	TTTCTT	2	12	281750	281761	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532431402
5500	NC_022121	TCT	2	6	281874	281879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431403

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