MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022119	ATG	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423943
2	NC_022119	GTG	2	6	1341	1346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423943
3	NC_022119	TCC	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532423943
4	NC_022119	AGC	2	6	1364	1369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423943
5	NC_022119	T	6	6	1383	1388	0 %	100 %	0 %	0 %	532423943
6	NC_022119	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423943
7	NC_022119	AAG	2	6	1402	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423943
8	NC_022119	TAC	2	6	1440	1445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423943
9	NC_022119	GCT	2	6	1450	1455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423943
10	NC_022119	AGTA	2	8	1488	1495	50 %	25 %	25 %	0 %	532423943
11	NC_022119	AAC	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532423943
12	NC_022119	AGA	2	6	1560	1565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423943
13	NC_022119	AGA	2	6	1816	1821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423944
14	NC_022119	ATC	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423944
15	NC_022119	TGC	2	6	1843	1848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423944
16	NC_022119	ATGA	2	8	1892	1899	50 %	25 %	25 %	0 %	532423944
17	NC_022119	GATA	2	8	1930	1937	50 %	25 %	25 %	0 %	532423944
18	NC_022119	CAT	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423944
19	NC_022119	AGA	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423944
20	NC_022119	AAG	2	6	2025	2030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423944
21	NC_022119	GGA	2	6	2060	2065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423944
22	NC_022119	AG	3	6	2152	2157	50 %	0 %	50 %	0 %	532423945
23	NC_022119	ATC	2	6	2189	2194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423945
24	NC_022119	TTTC	2	8	2227	2234	0 %	75 %	0 %	25 %	532423945
25	NC_022119	ATA	2	6	2339	2344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423945
26	NC_022119	AAC	2	6	2364	2369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532423945
27	NC_022119	GGT	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423945
28	NC_022119	AAT	2	6	2524	2529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423945
29	NC_022119	TTC	2	6	2559	2564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423945
30	NC_022119	GCA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423945
31	NC_022119	GGA	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423945
32	NC_022119	CAG	2	6	2645	2650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423945
33	NC_022119	GTT	2	6	2662	2667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423945
34	NC_022119	GGT	2	6	2754	2759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423945
35	NC_022119	GA	3	6	2820	2825	50 %	0 %	50 %	0 %	532423945
36	NC_022119	T	6	6	2827	2832	0 %	100 %	0 %	0 %	532423945
37	NC_022119	AAG	2	6	2912	2917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423945
38	NC_022119	ATT	2	6	2974	2979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423945
39	NC_022119	TTG	2	6	3026	3031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423945
40	NC_022119	CATG	2	8	3108	3115	25 %	25 %	25 %	25 %	532423945
41	NC_022119	AAG	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423945
42	NC_022119	AAG	2	6	3152	3157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423945
43	NC_022119	CAG	2	6	3194	3199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423945
44	NC_022119	GCT	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423945
45	NC_022119	TGTGA	2	10	3280	3289	20 %	40 %	40 %	0 %	532423945
46	NC_022119	TTCC	2	8	3413	3420	0 %	50 %	0 %	50 %	532423945
47	NC_022119	AAG	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423945
48	NC_022119	CAG	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423945
49	NC_022119	GGA	2	6	3568	3573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423945
50	NC_022119	AAT	2	6	3578	3583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423945
51	NC_022119	TTGAA	2	10	3636	3645	40 %	40 %	20 %	0 %	532423946
52	NC_022119	ATT	2	6	3658	3663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423946
53	NC_022119	TGA	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423946
54	NC_022119	TTTA	2	8	3811	3818	25 %	75 %	0 %	0 %	532423946
55	NC_022119	GTA	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423946
56	NC_022119	GAGAA	2	10	3930	3939	60 %	0 %	40 %	0 %	532423946
57	NC_022119	AGA	2	6	3967	3972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423946
58	NC_022119	ATCC	2	8	4111	4118	25 %	25 %	0 %	50 %	532423946
59	NC_022119	GAA	2	6	4151	4156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423946
60	NC_022119	CGT	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423946
61	NC_022119	A	7	7	4327	4333	100 %	0 %	0 %	0 %	532423946
62	NC_022119	GTT	2	6	4334	4339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423946
63	NC_022119	GAAAA	2	10	4367	4376	80 %	0 %	20 %	0 %	532423946
64	NC_022119	A	7	7	4373	4379	100 %	0 %	0 %	0 %	532423946
65	NC_022119	TGA	2	6	4471	4476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423946
66	NC_022119	AT	3	6	4513	4518	50 %	50 %	0 %	0 %	532423946
67	NC_022119	TTACA	2	10	4522	4531	40 %	40 %	0 %	20 %	532423946
68	NC_022119	TTG	2	6	4566	4571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423946
69	NC_022119	TTC	2	6	4707	4712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423946
70	NC_022119	TCT	2	6	4799	4804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423946
71	NC_022119	AGA	2	6	4819	4824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423946
72	NC_022119	GTT	2	6	4846	4851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423946
73	NC_022119	GACG	2	8	4858	4865	25 %	0 %	50 %	25 %	532423946
74	NC_022119	GGT	2	6	4894	4899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423946
75	NC_022119	AAAGCT	2	12	4940	4951	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532423946
76	NC_022119	TTGG	2	8	4961	4968	0 %	50 %	50 %	0 %	532423946
77	NC_022119	CTC	2	6	4998	5003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532423946
78	NC_022119	AGC	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423946
79	NC_022119	ATT	2	6	5146	5151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423947
80	NC_022119	TCT	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423947
81	NC_022119	GCT	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423947
82	NC_022119	GTCTT	2	10	5216	5225	0 %	60 %	20 %	20 %	532423947
83	NC_022119	GAT	2	6	5245	5250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423947
84	NC_022119	TC	3	6	5261	5266	0 %	50 %	0 %	50 %	532423947
85	NC_022119	GA	3	6	5272	5277	50 %	0 %	50 %	0 %	532423947
86	NC_022119	ACG	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423947
87	NC_022119	GAA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423947
88	NC_022119	TGGA	2	8	5320	5327	25 %	25 %	50 %	0 %	532423947
89	NC_022119	AT	3	6	5376	5381	50 %	50 %	0 %	0 %	532423947
90	NC_022119	AGA	3	9	5384	5392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423947
91	NC_022119	GCT	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423947
92	NC_022119	AGA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423947
93	NC_022119	TGG	2	6	5438	5443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423947
94	NC_022119	AGA	3	9	5456	5464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423947
95	NC_022119	GGA	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423947
96	NC_022119	TG	3	6	5529	5534	0 %	50 %	50 %	0 %	532423947
97	NC_022119	T	6	6	5607	5612	0 %	100 %	0 %	0 %	532423947
98	NC_022119	TCA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423947
99	NC_022119	GGA	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423947
100	NC_022119	CTTT	2	8	5697	5704	0 %	75 %	0 %	25 %	532423947
101	NC_022119	CTT	2	6	5747	5752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423947
102	NC_022119	CTG	2	6	5753	5758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423947
103	NC_022119	CAG	2	6	5908	5913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423947
104	NC_022119	AG	3	6	5937	5942	50 %	0 %	50 %	0 %	532423947
105	NC_022119	GCA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423947
106	NC_022119	GGGA	2	8	6212	6219	25 %	0 %	75 %	0 %	532423947
107	NC_022119	AG	3	6	6411	6416	50 %	0 %	50 %	0 %	532423948
108	NC_022119	AGG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423948
109	NC_022119	GAA	2	6	6481	6486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423948
110	NC_022119	GGTG	2	8	6515	6522	0 %	25 %	75 %	0 %	532423948
111	NC_022119	AAAT	2	8	6581	6588	75 %	25 %	0 %	0 %	532423948
112	NC_022119	GCA	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423948
113	NC_022119	AAG	2	6	6786	6791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423948
114	NC_022119	TGC	2	6	6819	6824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423948
115	NC_022119	ATTT	2	8	7093	7100	25 %	75 %	0 %	0 %	532424783
116	NC_022119	TTA	2	6	7151	7156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424783
117	NC_022119	ATTT	2	8	7184	7191	25 %	75 %	0 %	0 %	532424783
118	NC_022119	GAA	2	6	7200	7205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424783
119	NC_022119	TCG	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423949
120	NC_022119	TCC	2	6	7356	7361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532423949
121	NC_022119	GTT	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423949
122	NC_022119	AC	3	6	7646	7651	50 %	0 %	0 %	50 %	532423949
123	NC_022119	T	6	6	7682	7687	0 %	100 %	0 %	0 %	532423949
124	NC_022119	TGGTA	2	10	7689	7698	20 %	40 %	40 %	0 %	532423949
125	NC_022119	AAGC	2	8	7819	7826	50 %	0 %	25 %	25 %	532423949
126	NC_022119	TTA	2	6	7834	7839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423949
127	NC_022119	A	6	6	7966	7971	100 %	0 %	0 %	0 %	532423949
128	NC_022119	T	6	6	8051	8056	0 %	100 %	0 %	0 %	532423949
129	NC_022119	TTC	2	6	8157	8162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423949
130	NC_022119	ATTG	2	8	8217	8224	25 %	50 %	25 %	0 %	532423950
131	NC_022119	GAA	2	6	8301	8306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423950
132	NC_022119	AG	3	6	8389	8394	50 %	0 %	50 %	0 %	532423950
133	NC_022119	ACC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532423950
134	NC_022119	CTT	2	6	8482	8487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423950
135	NC_022119	CT	4	8	8508	8515	0 %	50 %	0 %	50 %	532423950
136	NC_022119	GAG	2	6	8562	8567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423950
137	NC_022119	ATA	2	6	8579	8584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423950
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139	NC_022119	AGG	2	6	8603	8608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423950
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141	NC_022119	AAAG	2	8	8705	8712	75 %	0 %	25 %	0 %	532423950
142	NC_022119	GAA	2	6	8783	8788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423950
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145	NC_022119	TGT	2	6	8870	8875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423950
146	NC_022119	GAG	2	6	8885	8890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423950
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149	NC_022119	CTTT	2	8	9045	9052	0 %	75 %	0 %	25 %	532423950
150	NC_022119	GTT	2	6	9057	9062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423950
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154	NC_022119	TTA	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423951
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158	NC_022119	A	6	6	9559	9564	100 %	0 %	0 %	0 %	532423951
159	NC_022119	T	6	6	9573	9578	0 %	100 %	0 %	0 %	532423951
160	NC_022119	ATGG	2	8	9583	9590	25 %	25 %	50 %	0 %	532423951
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164	NC_022119	TCG	2	6	9749	9754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423951
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168	NC_022119	AGC	2	6	9983	9988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423952
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262	NC_022119	CTT	2	6	14488	14493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423955
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383	NC_022119	CT	4	8	21902	21909	0 %	50 %	0 %	50 %	532423961
384	NC_022119	GAC	2	6	22014	22019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423961
385	NC_022119	TTTGC	2	10	22038	22047	0 %	60 %	20 %	20 %	532423961
386	NC_022119	TCT	2	6	22064	22069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423961
387	NC_022119	AT	3	6	22172	22177	50 %	50 %	0 %	0 %	532423961
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389	NC_022119	TTC	2	6	22327	22332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423961
390	NC_022119	T	6	6	22404	22409	0 %	100 %	0 %	0 %	532423961
391	NC_022119	AT	3	6	22496	22501	50 %	50 %	0 %	0 %	532423961
392	NC_022119	CTG	2	6	22507	22512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423961
393	NC_022119	TCG	2	6	22526	22531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423961
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