MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022119	GAT	2	6	179256	179261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424799
3502	NC_022119	ATT	3	9	179330	179338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424799
3503	NC_022119	CTG	3	9	179339	179347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424799
3504	NC_022119	GGAAT	2	10	179354	179363	40 %	20 %	40 %	0 %	532424799
3505	NC_022119	CTG	2	6	179511	179516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424088
3506	NC_022119	CTG	2	6	179519	179524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424088
3507	NC_022119	AGA	3	9	179553	179561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424088
3508	NC_022119	T	7	7	179586	179592	0 %	100 %	0 %	0 %	532424088
3509	NC_022119	TCA	2	6	179624	179629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424088
3510	NC_022119	TGTT	2	8	179636	179643	0 %	75 %	25 %	0 %	532424088
3511	NC_022119	CCT	2	6	179734	179739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424088
3512	NC_022119	CAG	2	6	179785	179790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424088
3513	NC_022119	TAG	2	6	179896	179901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424088
3514	NC_022119	TTG	2	6	179907	179912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424088
3515	NC_022119	CTC	2	6	179930	179935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424088
3516	NC_022119	AG	3	6	180007	180012	50 %	0 %	50 %	0 %	532424088
3517	NC_022119	ATT	2	6	180048	180053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424088
3518	NC_022119	AAG	2	6	180060	180065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424088
3519	NC_022119	TGA	2	6	180304	180309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424088
3520	NC_022119	AGAGT	2	10	180312	180321	40 %	20 %	40 %	0 %	532424088
3521	NC_022119	GAA	2	6	180367	180372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424088
3522	NC_022119	AGG	2	6	180389	180394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424088
3523	NC_022119	AAG	3	9	180395	180403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424088
3524	NC_022119	T	6	6	180819	180824	0 %	100 %	0 %	0 %	532424089
3525	NC_022119	TTGAA	2	10	180845	180854	40 %	40 %	20 %	0 %	532424089
3526	NC_022119	TTTG	2	8	180859	180866	0 %	75 %	25 %	0 %	532424089
3527	NC_022119	TGCA	2	8	180977	180984	25 %	25 %	25 %	25 %	532424089
3528	NC_022119	TGT	2	6	180995	181000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424089
3529	NC_022119	AGT	2	6	181014	181019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424089
3530	NC_022119	CT	3	6	181059	181064	0 %	50 %	0 %	50 %	532424089
3531	NC_022119	T	6	6	181064	181069	0 %	100 %	0 %	0 %	532424089
3532	NC_022119	CTC	2	6	181093	181098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424089
3533	NC_022119	GA	3	6	181138	181143	50 %	0 %	50 %	0 %	532424089
3534	NC_022119	GAT	2	6	181193	181198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424089
3535	NC_022119	AAAG	2	8	181346	181353	75 %	0 %	25 %	0 %	532424089
3536	NC_022119	CA	3	6	181451	181456	50 %	0 %	0 %	50 %	532424089
3537	NC_022119	ACA	2	6	181509	181514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424089
3538	NC_022119	CGA	2	6	181527	181532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424089
3539	NC_022119	AAT	2	6	181553	181558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424089
3540	NC_022119	ATT	2	6	181593	181598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424089
3541	NC_022119	GTTT	2	8	181649	181656	0 %	75 %	25 %	0 %	532424089
3542	NC_022119	CTT	2	6	181737	181742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424089
3543	NC_022119	AGA	2	6	181817	181822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424089
3544	NC_022119	TG	3	6	181850	181855	0 %	50 %	50 %	0 %	532424089
3545	NC_022119	G	7	7	181857	181863	0 %	0 %	100 %	0 %	532424089
3546	NC_022119	GA	3	6	181894	181899	50 %	0 %	50 %	0 %	532424089
3547	NC_022119	AGA	2	6	181922	181927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424089
3548	NC_022119	GAA	2	6	181935	181940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424089
3549	NC_022119	AGA	3	9	181979	181987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424089
3550	NC_022119	GATG	2	8	182254	182261	25 %	25 %	50 %	0 %	532424800
3551	NC_022119	TCT	2	6	182271	182276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424800
3552	NC_022119	AGG	2	6	182325	182330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424800
3553	NC_022119	GGA	2	6	182359	182364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424800
3554	NC_022119	TTGAG	2	10	182405	182414	20 %	40 %	40 %	0 %	532424800
3555	NC_022119	GAATG	2	10	182430	182439	40 %	20 %	40 %	0 %	532424800
3556	NC_022119	CT	3	6	182480	182485	0 %	50 %	0 %	50 %	532424800
3557	NC_022119	TGA	2	6	182494	182499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424800
3558	NC_022119	GA	4	8	182522	182529	50 %	0 %	50 %	0 %	532424800
3559	NC_022119	AAC	2	6	182577	182582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424800
3560	NC_022119	TGA	2	6	182596	182601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424800
3561	NC_022119	TGC	2	6	182632	182637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424800
3562	NC_022119	CCAG	2	8	182652	182659	25 %	0 %	25 %	50 %	532424800
3563	NC_022119	TTG	2	6	182661	182666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424800
3564	NC_022119	GAC	2	6	182670	182675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424800
3565	NC_022119	GAT	2	6	182700	182705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424800
3566	NC_022119	GA	3	6	182726	182731	50 %	0 %	50 %	0 %	532424800
3567	NC_022119	GCG	2	6	182734	182739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424800
3568	NC_022119	TAG	2	6	182816	182821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424801
3569	NC_022119	GCA	2	6	182871	182876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424801
3570	NC_022119	TCGC	2	8	182914	182921	0 %	25 %	25 %	50 %	532424801
3571	NC_022119	AGA	2	6	182925	182930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424801
3572	NC_022119	GCA	2	6	182934	182939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424801
3573	NC_022119	GAA	2	6	182962	182967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424801
3574	NC_022119	AGA	2	6	183001	183006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424801
3575	NC_022119	GA	3	6	183040	183045	50 %	0 %	50 %	0 %	532424801
3576	NC_022119	GTT	2	6	183057	183062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424801
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3578	NC_022119	CTT	2	6	183100	183105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424801
3579	NC_022119	GA	3	6	183143	183148	50 %	0 %	50 %	0 %	532424801
3580	NC_022119	GTT	2	6	183154	183159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424801
3581	NC_022119	GAG	2	6	183175	183180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424801
3582	NC_022119	GAA	2	6	183195	183200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424801
3583	NC_022119	TTG	2	6	183206	183211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424801
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3586	NC_022119	TGA	2	6	183363	183368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424801
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3588	NC_022119	GTA	2	6	183479	183484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424801
3589	NC_022119	GTTG	2	8	183519	183526	0 %	50 %	50 %	0 %	532424801
3590	NC_022119	GGA	3	9	183534	183542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424801
3591	NC_022119	TC	3	6	183550	183555	0 %	50 %	0 %	50 %	532424801
3592	NC_022119	ATT	2	6	183569	183574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424801
3593	NC_022119	A	7	7	183599	183605	100 %	0 %	0 %	0 %	532424801
3594	NC_022119	T	8	8	183611	183618	0 %	100 %	0 %	0 %	532424801
3595	NC_022119	ATA	2	6	183661	183666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424801
3596	NC_022119	A	6	6	183666	183671	100 %	0 %	0 %	0 %	532424801
3597	NC_022119	AGA	2	6	183824	183829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424090
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3600	NC_022119	TTTC	2	8	184025	184032	0 %	75 %	0 %	25 %	532424090
3601	NC_022119	CTG	2	6	184073	184078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424090
3602	NC_022119	GGA	2	6	184100	184105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424090
3603	NC_022119	TAG	2	6	184125	184130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424090
3604	NC_022119	AGT	2	6	184255	184260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424090
3605	NC_022119	ATCG	2	8	184282	184289	25 %	25 %	25 %	25 %	532424090
3606	NC_022119	TCA	2	6	184365	184370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424091
3607	NC_022119	GGA	2	6	184380	184385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424091
3608	NC_022119	AGAGA	2	10	184473	184482	60 %	0 %	40 %	0 %	532424091
3609	NC_022119	GCA	2	6	184569	184574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424091
3610	NC_022119	TTA	2	6	184866	184871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424091
3611	NC_022119	GAA	2	6	184935	184940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424091
3612	NC_022119	ATA	2	6	184995	185000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424091
3613	NC_022119	TCTA	2	8	185036	185043	25 %	50 %	0 %	25 %	532424091
3614	NC_022119	TGC	2	6	185237	185242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424092
3615	NC_022119	CA	3	6	185258	185263	50 %	0 %	0 %	50 %	532424092
3616	NC_022119	AGA	2	6	185373	185378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424092
3617	NC_022119	T	7	7	185729	185735	0 %	100 %	0 %	0 %	532424093
3618	NC_022119	TCT	2	6	185753	185758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424093
3619	NC_022119	TG	3	6	185763	185768	0 %	50 %	50 %	0 %	532424093
3620	NC_022119	GTC	2	6	185854	185859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424093
3621	NC_022119	ATT	2	6	185924	185929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424093
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3623	NC_022119	CTT	2	6	185959	185964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424093
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3862	NC_022119	GCT	2	6	199080	199085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424100
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3993	NC_022119	GATG	2	8	205957	205964	25 %	25 %	50 %	0 %	532424106
3994	NC_022119	ATTC	2	8	206030	206037	25 %	50 %	0 %	25 %	532424106
3995	NC_022119	GCT	2	6	206040	206045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424106
3996	NC_022119	CAA	3	9	206089	206097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424106
3997	NC_022119	T	6	6	206100	206105	0 %	100 %	0 %	0 %	532424107
3998	NC_022119	A	6	6	206122	206127	100 %	0 %	0 %	0 %	532424107
3999	NC_022119	CT	3	6	206199	206204	0 %	50 %	0 %	50 %	532424107
4000	NC_022119	TAT	2	6	206232	206237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424107

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