MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022119	CTT	2	6	128709	128714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424047
2502	NC_022119	AGAA	2	8	128719	128726	75 %	0 %	25 %	0 %	532424047
2503	NC_022119	GTA	2	6	128788	128793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424047
2504	NC_022119	TCA	2	6	128831	128836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424047
2505	NC_022119	TTC	2	6	128896	128901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424047
2506	NC_022119	AGC	2	6	128950	128955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424047
2507	NC_022119	AG	3	6	128996	129001	50 %	0 %	50 %	0 %	532424047
2508	NC_022119	TCT	2	6	129018	129023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424047
2509	NC_022119	CTT	2	6	129024	129029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424047
2510	NC_022119	ACC	2	6	129166	129171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424047
2511	NC_022119	CGT	2	6	129192	129197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424047
2512	NC_022119	GAA	2	6	129219	129224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424047
2513	NC_022119	CATC	2	8	129299	129306	25 %	25 %	0 %	50 %	532424047
2514	NC_022119	CTT	2	6	129384	129389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424047
2515	NC_022119	AAT	2	6	129396	129401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424047
2516	NC_022119	CAT	2	6	129438	129443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424047
2517	NC_022119	GA	3	6	129458	129463	50 %	0 %	50 %	0 %	532424047
2518	NC_022119	GT	5	10	129505	129514	0 %	50 %	50 %	0 %	532424047
2519	NC_022119	TGC	2	6	129574	129579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424047
2520	NC_022119	GA	3	6	129655	129660	50 %	0 %	50 %	0 %	532424047
2521	NC_022119	AGA	2	6	129862	129867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424047
2522	NC_022119	T	6	6	129876	129881	0 %	100 %	0 %	0 %	532424047
2523	NC_022119	TG	4	8	129898	129905	0 %	50 %	50 %	0 %	532424047
2524	NC_022119	T	6	6	129922	129927	0 %	100 %	0 %	0 %	532424047
2525	NC_022119	GAGG	2	8	129987	129994	25 %	0 %	75 %	0 %	532424047
2526	NC_022119	ATG	2	6	130035	130040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424047
2527	NC_022119	AAG	2	6	130046	130051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424047
2528	NC_022119	CTT	2	6	130077	130082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424047
2529	NC_022119	TCA	2	6	130097	130102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424047
2530	NC_022119	AGC	2	6	130166	130171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424047
2531	NC_022119	GAAGA	2	10	130176	130185	60 %	0 %	40 %	0 %	532424047
2532	NC_022119	GTT	2	6	130188	130193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424047
2533	NC_022119	T	7	7	130252	130258	0 %	100 %	0 %	0 %	532424047
2534	NC_022119	CAG	2	6	130307	130312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424047
2535	NC_022119	AGT	2	6	130357	130362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424047
2536	NC_022119	TC	3	6	130378	130383	0 %	50 %	0 %	50 %	532424047
2537	NC_022119	ATC	2	6	130418	130423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424796
2538	NC_022119	AG	3	6	130455	130460	50 %	0 %	50 %	0 %	532424796
2539	NC_022119	AG	3	6	130480	130485	50 %	0 %	50 %	0 %	532424796
2540	NC_022119	TTTG	2	8	130807	130814	0 %	75 %	25 %	0 %	532424048
2541	NC_022119	CTG	2	6	130855	130860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424048
2542	NC_022119	GAC	2	6	130863	130868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424048
2543	NC_022119	CAG	2	6	130932	130937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424048
2544	NC_022119	TTG	2	6	130938	130943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424048
2545	NC_022119	AAG	2	6	130957	130962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424048
2546	NC_022119	CTT	2	6	131041	131046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424048
2547	NC_022119	AATT	2	8	131086	131093	50 %	50 %	0 %	0 %	532424048
2548	NC_022119	GAA	2	6	131136	131141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424048
2549	NC_022119	TTCT	2	8	131251	131258	0 %	75 %	0 %	25 %	532424048
2550	NC_022119	AAT	2	6	131271	131276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424048
2551	NC_022119	AG	3	6	131360	131365	50 %	0 %	50 %	0 %	532424048
2552	NC_022119	TGTA	2	8	131383	131390	25 %	50 %	25 %	0 %	532424048
2553	NC_022119	GAG	2	6	131428	131433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424048
2554	NC_022119	TGA	2	6	131504	131509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424048
2555	NC_022119	TAG	2	6	131521	131526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424048
2556	NC_022119	TGAA	2	8	131620	131627	50 %	25 %	25 %	0 %	532424048
2557	NC_022119	AT	3	6	131636	131641	50 %	50 %	0 %	0 %	532424048
2558	NC_022119	CTT	2	6	131695	131700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424048
2559	NC_022119	ATTC	2	8	131714	131721	25 %	50 %	0 %	25 %	532424048
2560	NC_022119	TTCT	2	8	131797	131804	0 %	75 %	0 %	25 %	532424048
2561	NC_022119	TTC	2	6	131827	131832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424048
2562	NC_022119	TGA	2	6	131855	131860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424048
2563	NC_022119	TGA	2	6	131909	131914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424048
2564	NC_022119	AAG	2	6	131950	131955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424048
2565	NC_022119	AGCA	2	8	131968	131975	50 %	0 %	25 %	25 %	532424048
2566	NC_022119	GAA	2	6	132063	132068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424048
2567	NC_022119	AAAAG	2	10	132089	132098	80 %	0 %	20 %	0 %	532424048
2568	NC_022119	CTT	2	6	132193	132198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424048
2569	NC_022119	GGA	2	6	132200	132205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424048
2570	NC_022119	TGA	2	6	132269	132274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424048
2571	NC_022119	GTT	2	6	132291	132296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424048
2572	NC_022119	A	6	6	132322	132327	100 %	0 %	0 %	0 %	532424048
2573	NC_022119	GGAG	2	8	132332	132339	25 %	0 %	75 %	0 %	532424048
2574	NC_022119	GGA	2	6	132362	132367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424048
2575	NC_022119	AGA	2	6	132374	132379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424048
2576	NC_022119	CAGT	2	8	132412	132419	25 %	25 %	25 %	25 %	532424048
2577	NC_022119	GATTC	2	10	132420	132429	20 %	40 %	20 %	20 %	532424048
2578	NC_022119	GCT	2	6	132432	132437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424048
2579	NC_022119	TAA	2	6	132545	132550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424048
2580	NC_022119	GAA	2	6	132552	132557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424048
2581	NC_022119	GAT	2	6	132560	132565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424048
2582	NC_022119	AT	3	6	132584	132589	50 %	50 %	0 %	0 %	532424048
2583	NC_022119	TCC	2	6	132623	132628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424048
2584	NC_022119	GAA	2	6	132645	132650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424048
2585	NC_022119	GGAG	2	8	132651	132658	25 %	0 %	75 %	0 %	532424048
2586	NC_022119	TC	3	6	132659	132664	0 %	50 %	0 %	50 %	532424048
2587	NC_022119	AAG	2	6	132674	132679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424048
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2589	NC_022119	TGA	2	6	132704	132709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424048
2590	NC_022119	AAG	2	6	132727	132732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424048
2591	NC_022119	TGA	2	6	132758	132763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424048
2592	NC_022119	AAG	2	6	132783	132788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424048
2593	NC_022119	ATT	2	6	132856	132861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424048
2594	NC_022119	AAG	2	6	132889	132894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424048
2595	NC_022119	TGT	2	6	132905	132910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424048
2596	NC_022119	ATT	2	6	132928	132933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424048
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2598	NC_022119	GAT	2	6	133074	133079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424048
2599	NC_022119	AGT	2	6	133160	133165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424048
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2601	NC_022119	TTAAAA	2	12	133252	133263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424048
2602	NC_022119	TCT	2	6	133329	133334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424049
2603	NC_022119	ACCG	2	8	133338	133345	25 %	0 %	25 %	50 %	532424049
2604	NC_022119	GCGA	2	8	133350	133357	25 %	0 %	50 %	25 %	532424049
2605	NC_022119	CAA	2	6	133399	133404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424049
2606	NC_022119	AGA	2	6	133515	133520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424049
2607	NC_022119	GGA	2	6	133587	133592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424049
2608	NC_022119	GAT	2	6	133648	133653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424049
2609	NC_022119	AG	3	6	133756	133761	50 %	0 %	50 %	0 %	532424049
2610	NC_022119	TGC	2	6	133773	133778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424049
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2612	NC_022119	GCT	2	6	133903	133908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424049
2613	NC_022119	CCT	2	6	134002	134007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424049
2614	NC_022119	TTAC	2	8	134016	134023	25 %	50 %	0 %	25 %	532424049
2615	NC_022119	GGA	2	6	134059	134064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424049
2616	NC_022119	CTTT	2	8	134168	134175	0 %	75 %	0 %	25 %	532424049
2617	NC_022119	TTC	2	6	134192	134197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424049
2618	NC_022119	GGC	2	6	134292	134297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424049
2619	NC_022119	ATCT	2	8	134346	134353	25 %	50 %	0 %	25 %	532424049
2620	NC_022119	AT	3	6	134370	134375	50 %	50 %	0 %	0 %	532424049
2621	NC_022119	GTT	2	6	134397	134402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424049
2622	NC_022119	A	7	7	134445	134451	100 %	0 %	0 %	0 %	532424049
2623	NC_022119	AAG	2	6	134467	134472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424049
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2631	NC_022119	CT	3	6	134717	134722	0 %	50 %	0 %	50 %	532424049
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2657	NC_022119	TG	3	6	136087	136092	0 %	50 %	50 %	0 %	532424052
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2744	NC_022119	GCA	2	6	140121	140126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424058
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2746	NC_022119	GCT	2	6	140157	140162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424058
2747	NC_022119	TCA	2	6	140422	140427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424058
2748	NC_022119	TAA	2	6	140531	140536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424058
2749	NC_022119	GTACA	2	10	140641	140650	40 %	20 %	20 %	20 %	532424058
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2752	NC_022119	TAA	2	6	140990	140995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424058
2753	NC_022119	TAGAT	2	10	141014	141023	40 %	40 %	20 %	0 %	532424058
2754	NC_022119	TAT	2	6	141024	141029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424058
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2756	NC_022119	CTG	2	6	141046	141051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424058
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2763	NC_022119	T	8	8	141336	141343	0 %	100 %	0 %	0 %	532424058
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2767	NC_022119	T	6	6	141450	141455	0 %	100 %	0 %	0 %	532424798
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2777	NC_022119	AAG	2	6	142474	142479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424061
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2866	NC_022119	A	6	6	146814	146819	100 %	0 %	0 %	0 %	532424065
2867	NC_022119	GCC	2	6	146851	146856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424065
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2995	NC_022119	GCA	2	6	152893	152898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424069
2996	NC_022119	GCA	2	6	152911	152916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424069
2997	NC_022119	GTT	2	6	153133	153138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424069
2998	NC_022119	AG	3	6	153217	153222	50 %	0 %	50 %	0 %	532424069
2999	NC_022119	CTTT	2	8	153246	153253	0 %	75 %	0 %	25 %	532424069
3000	NC_022119	AT	3	6	153371	153376	50 %	50 %	0 %	0 %	532424070

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