MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_022119	CTG	2	6	990483	990488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424750
19502	NC_022119	AAG	2	6	990588	990593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424750
19503	NC_022119	CT	3	6	990683	990688	0 %	50 %	0 %	50 %	532424750
19504	NC_022119	TGC	2	6	990742	990747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424750
19505	NC_022119	A	7	7	990871	990877	100 %	0 %	0 %	0 %	532424750
19506	NC_022119	GAA	2	6	991007	991012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424750
19507	NC_022119	ATT	2	6	991078	991083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424750
19508	NC_022119	TGA	2	6	991093	991098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424750
19509	NC_022119	CT	3	6	991169	991174	0 %	50 %	0 %	50 %	532424750
19510	NC_022119	GCA	2	6	991244	991249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424750
19511	NC_022119	AAAT	2	8	991258	991265	75 %	25 %	0 %	0 %	532424750
19512	NC_022119	AGA	2	6	991311	991316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424750
19513	NC_022119	TTAT	2	8	991354	991361	25 %	75 %	0 %	0 %	532424750
19514	NC_022119	ATT	2	6	991376	991381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424750
19515	NC_022119	CTG	2	6	991388	991393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424750
19516	NC_022119	GC	3	6	991466	991471	0 %	0 %	50 %	50 %	532424750
19517	NC_022119	ACAAA	2	10	991486	991495	80 %	0 %	0 %	20 %	532424750
19518	NC_022119	AGA	2	6	991534	991539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424750
19519	NC_022119	GAA	2	6	991564	991569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424750
19520	NC_022119	CTA	2	6	991572	991577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424750
19521	NC_022119	AGG	2	6	991591	991596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424750
19522	NC_022119	TTC	2	6	991614	991619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424750
19523	NC_022119	CAGGGA	2	12	991632	991643	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	532424750
19524	NC_022119	TCT	2	6	991689	991694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424750
19525	NC_022119	TGTT	2	8	991722	991729	0 %	75 %	25 %	0 %	532424750
19526	NC_022119	TGA	2	6	991801	991806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424750
19527	NC_022119	GTG	2	6	991830	991835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424750
19528	NC_022119	GGT	2	6	991847	991852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424750
19529	NC_022119	GA	4	8	991859	991866	50 %	0 %	50 %	0 %	532424750
19530	NC_022119	TAG	2	6	991887	991892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424750
19531	NC_022119	ATGG	2	8	991895	991902	25 %	25 %	50 %	0 %	532424750
19532	NC_022119	GCT	2	6	991934	991939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424750
19533	NC_022119	CCGG	2	8	991945	991952	0 %	0 %	50 %	50 %	532424750
19534	NC_022119	TTG	2	6	991970	991975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424750
19535	NC_022119	TCG	2	6	991993	991998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424750
19536	NC_022119	TGT	3	9	991999	992007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424750
19537	NC_022119	TCT	2	6	992140	992145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424750
19538	NC_022119	AGC	2	6	992152	992157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424750
19539	NC_022119	ATT	2	6	992158	992163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424750
19540	NC_022119	GCT	2	6	992165	992170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424750
19541	NC_022119	CAG	2	6	992193	992198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424750
19542	NC_022119	GATG	2	8	992257	992264	25 %	25 %	50 %	0 %	532424750
19543	NC_022119	A	7	7	992273	992279	100 %	0 %	0 %	0 %	532424750
19544	NC_022119	ATT	2	6	992357	992362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424750
19545	NC_022119	A	7	7	992403	992409	100 %	0 %	0 %	0 %	532424750
19546	NC_022119	GAA	2	6	992425	992430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424750
19547	NC_022119	TGC	2	6	992470	992475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424750
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19549	NC_022119	CAA	2	6	992532	992537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424750
19550	NC_022119	A	7	7	992646	992652	100 %	0 %	0 %	0 %	532424750
19551	NC_022119	TGC	2	6	992707	992712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424750
19552	NC_022119	CAT	2	6	992731	992736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424750
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19554	NC_022119	GAAG	2	8	992863	992870	50 %	0 %	50 %	0 %	532424750
19555	NC_022119	AAG	2	6	992885	992890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424750
19556	NC_022119	CCG	2	6	992909	992914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424750
19557	NC_022119	CCT	2	6	992915	992920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424750
19558	NC_022119	CTT	2	6	993268	993273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424751
19559	NC_022119	CTT	2	6	993334	993339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424751
19560	NC_022119	GGA	2	6	993346	993351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424751
19561	NC_022119	TCA	2	6	993498	993503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424751
19562	NC_022119	TCC	2	6	993554	993559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424751
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19564	NC_022119	GAT	2	6	993842	993847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424751
19565	NC_022119	GGA	2	6	993956	993961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424751
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19569	NC_022119	TAGA	2	8	994139	994146	50 %	25 %	25 %	0 %	532424751
19570	NC_022119	AGCG	2	8	994147	994154	25 %	0 %	50 %	25 %	532424751
19571	NC_022119	CTCCAT	2	12	994156	994167	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532424751
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19573	NC_022119	GT	3	6	994259	994264	0 %	50 %	50 %	0 %	532424751
19574	NC_022119	GAA	2	6	994270	994275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424751
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19582	NC_022119	TA	3	6	994640	994645	50 %	50 %	0 %	0 %	532424751
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19587	NC_022119	TCC	2	6	995048	995053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424751
19588	NC_022119	TTC	2	6	995059	995064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424751
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19592	NC_022119	A	6	6	995149	995154	100 %	0 %	0 %	0 %	532424751
19593	NC_022119	CTGGC	2	10	995190	995199	0 %	20 %	40 %	40 %	532424751
19594	NC_022119	TCAGTA	2	12	995344	995355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532424752
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19597	NC_022119	TCAG	2	8	995470	995477	25 %	25 %	25 %	25 %	532424752
19598	NC_022119	T	6	6	995529	995534	0 %	100 %	0 %	0 %	532424752
19599	NC_022119	TCT	2	6	995542	995547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424752
19600	NC_022119	ATTT	2	8	995812	995819	25 %	75 %	0 %	0 %	532424753
19601	NC_022119	GAA	2	6	995825	995830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424753
19602	NC_022119	GTTG	2	8	995877	995884	0 %	50 %	50 %	0 %	532424753
19603	NC_022119	ATC	2	6	995886	995891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424753
19604	NC_022119	ATC	2	6	995907	995912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424753
19605	NC_022119	ATA	2	6	995923	995928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424753
19606	NC_022119	GCA	3	9	995982	995990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424753
19607	NC_022119	TG	3	6	996055	996060	0 %	50 %	50 %	0 %	532424753
19608	NC_022119	G	6	6	996100	996105	0 %	0 %	100 %	0 %	532424753
19609	NC_022119	GGAG	2	8	996129	996136	25 %	0 %	75 %	0 %	532424753
19610	NC_022119	T	7	7	996148	996154	0 %	100 %	0 %	0 %	532424753
19611	NC_022119	GTT	2	6	996184	996189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424753
19612	NC_022119	T	8	8	996231	996238	0 %	100 %	0 %	0 %	532424753
19613	NC_022119	AGAGA	2	10	996239	996248	60 %	0 %	40 %	0 %	532424753
19614	NC_022119	GAAG	2	8	996261	996268	50 %	0 %	50 %	0 %	532424753
19615	NC_022119	TA	3	6	996293	996298	50 %	50 %	0 %	0 %	532424753
19616	NC_022119	GAC	2	6	996330	996335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424754
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19618	NC_022119	GAG	2	6	996394	996399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424754
19619	NC_022119	CTT	2	6	996404	996409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424754
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19621	NC_022119	GA	3	6	996443	996448	50 %	0 %	50 %	0 %	532424754
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19736	NC_022119	AAT	2	6	1002057	1002062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424762
19737	NC_022119	AG	3	6	1002078	1002083	50 %	0 %	50 %	0 %	532424762
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19976	NC_022119	CTG	2	6	1014144	1014149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424769
19977	NC_022119	GAA	2	6	1014170	1014175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424769
19978	NC_022119	TTG	2	6	1014184	1014189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424769
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19981	NC_022119	TGC	2	6	1014307	1014312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424769
19982	NC_022119	AGC	2	6	1014326	1014331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424769
19983	NC_022119	CTT	2	6	1014357	1014362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424769
19984	NC_022119	AAG	2	6	1014366	1014371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424769
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19987	NC_022119	GTT	2	6	1014515	1014520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424870
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19990	NC_022119	TTA	2	6	1014587	1014592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424870
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19996	NC_022119	CGA	2	6	1015010	1015015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424870
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20000	NC_022119	TGA	2	6	1015223	1015228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424870

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