MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022119	TGA	2	6	79895	79900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424007
1502	NC_022119	TGTCT	2	10	79910	79919	0 %	60 %	20 %	20 %	532424007
1503	NC_022119	TGAT	2	8	79984	79991	25 %	50 %	25 %	0 %	532424007
1504	NC_022119	TCAT	2	8	80006	80013	25 %	50 %	0 %	25 %	532424007
1505	NC_022119	T	6	6	80062	80067	0 %	100 %	0 %	0 %	532424007
1506	NC_022119	TCT	2	6	80174	80179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424007
1507	NC_022119	GAA	2	6	80184	80189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424007
1508	NC_022119	TGC	2	6	80234	80239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424007
1509	NC_022119	CAA	2	6	80268	80273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424007
1510	NC_022119	GAA	2	6	80286	80291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424007
1511	NC_022119	GGA	2	6	80330	80335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424007
1512	NC_022119	TC	4	8	80358	80365	0 %	50 %	0 %	50 %	532424007
1513	NC_022119	A	7	7	80377	80383	100 %	0 %	0 %	0 %	532424007
1514	NC_022119	TTACT	2	10	80417	80426	20 %	60 %	0 %	20 %	532424007
1515	NC_022119	TATC	2	8	80433	80440	25 %	50 %	0 %	25 %	532424007
1516	NC_022119	GA	3	6	80451	80456	50 %	0 %	50 %	0 %	532424007
1517	NC_022119	TAT	2	6	80531	80536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424007
1518	NC_022119	TA	3	6	80671	80676	50 %	50 %	0 %	0 %	532424007
1519	NC_022119	AGA	2	6	80735	80740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424007
1520	NC_022119	GGGA	2	8	80744	80751	25 %	0 %	75 %	0 %	532424007
1521	NC_022119	CTGC	2	8	80848	80855	0 %	25 %	25 %	50 %	532424008
1522	NC_022119	GCT	2	6	80866	80871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424008
1523	NC_022119	ATT	2	6	80872	80877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424008
1524	NC_022119	CTT	2	6	80915	80920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424008
1525	NC_022119	CTT	2	6	80936	80941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424008
1526	NC_022119	CAT	2	6	80983	80988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424008
1527	NC_022119	TGA	2	6	81105	81110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424008
1528	NC_022119	AGG	2	6	81116	81121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424008
1529	NC_022119	GGTT	2	8	81141	81148	0 %	50 %	50 %	0 %	532424008
1530	NC_022119	CT	3	6	81181	81186	0 %	50 %	0 %	50 %	532424008
1531	NC_022119	GGA	2	6	81187	81192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424008
1532	NC_022119	CAA	2	6	81193	81198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424008
1533	NC_022119	AG	3	6	81200	81205	50 %	0 %	50 %	0 %	532424008
1534	NC_022119	T	6	6	81207	81212	0 %	100 %	0 %	0 %	532424008
1535	NC_022119	CGAT	2	8	81269	81276	25 %	25 %	25 %	25 %	532424008
1536	NC_022119	TCAT	2	8	81344	81351	25 %	50 %	0 %	25 %	532424008
1537	NC_022119	TTA	2	6	81394	81399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424008
1538	NC_022119	TG	3	6	81411	81416	0 %	50 %	50 %	0 %	532424008
1539	NC_022119	AGA	2	6	81429	81434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424008
1540	NC_022119	AAG	2	6	81446	81451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424008
1541	NC_022119	AC	3	6	81494	81499	50 %	0 %	0 %	50 %	532424008
1542	NC_022119	T	6	6	81579	81584	0 %	100 %	0 %	0 %	532424009
1543	NC_022119	GAC	2	6	81606	81611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424009
1544	NC_022119	GA	3	6	81640	81645	50 %	0 %	50 %	0 %	532424009
1545	NC_022119	TTA	2	6	81652	81657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424009
1546	NC_022119	CTT	2	6	81706	81711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424009
1547	NC_022119	TTA	2	6	81749	81754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424009
1548	NC_022119	T	6	6	81757	81762	0 %	100 %	0 %	0 %	532424009
1549	NC_022119	AGAAA	2	10	81807	81816	80 %	0 %	20 %	0 %	532424009
1550	NC_022119	T	6	6	81862	81867	0 %	100 %	0 %	0 %	532424009
1551	NC_022119	GTTA	2	8	81886	81893	25 %	50 %	25 %	0 %	532424009
1552	NC_022119	ACA	2	6	81920	81925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424009
1553	NC_022119	GCG	2	6	81952	81957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424009
1554	NC_022119	T	6	6	81995	82000	0 %	100 %	0 %	0 %	532424009
1555	NC_022119	TGG	3	9	82021	82029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424009
1556	NC_022119	CAG	2	6	82097	82102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424009
1557	NC_022119	GTT	2	6	82108	82113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424009
1558	NC_022119	TATT	2	8	82118	82125	25 %	75 %	0 %	0 %	532424009
1559	NC_022119	GTG	2	6	82142	82147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424009
1560	NC_022119	CCT	2	6	82192	82197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424009
1561	NC_022119	GGAAG	2	10	82320	82329	40 %	0 %	60 %	0 %	532424009
1562	NC_022119	ATT	2	6	82339	82344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424009
1563	NC_022119	TTG	2	6	82361	82366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424009
1564	NC_022119	TTC	2	6	82369	82374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424009
1565	NC_022119	T	6	6	82403	82408	0 %	100 %	0 %	0 %	532424009
1566	NC_022119	GAA	2	6	82442	82447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424009
1567	NC_022119	GAA	2	6	82471	82476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424009
1568	NC_022119	GA	3	6	82533	82538	50 %	0 %	50 %	0 %	532424009
1569	NC_022119	GTTC	2	8	82543	82550	0 %	50 %	25 %	25 %	532424009
1570	NC_022119	GCT	2	6	82678	82683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424009
1571	NC_022119	GTGC	2	8	82690	82697	0 %	25 %	50 %	25 %	532424009
1572	NC_022119	TAA	2	6	82740	82745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424009
1573	NC_022119	CAT	2	6	82756	82761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424009
1574	NC_022119	GAA	2	6	82768	82773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424009
1575	NC_022119	GA	3	6	82853	82858	50 %	0 %	50 %	0 %	532424009
1576	NC_022119	TAC	2	6	82904	82909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424010
1577	NC_022119	T	6	6	82928	82933	0 %	100 %	0 %	0 %	532424010
1578	NC_022119	T	7	7	82940	82946	0 %	100 %	0 %	0 %	532424010
1579	NC_022119	T	6	6	82953	82958	0 %	100 %	0 %	0 %	532424010
1580	NC_022119	GTA	2	6	83039	83044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424010
1581	NC_022119	T	6	6	83050	83055	0 %	100 %	0 %	0 %	532424010
1582	NC_022119	TATG	2	8	83074	83081	25 %	50 %	25 %	0 %	532424010
1583	NC_022119	TAT	2	6	83103	83108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424010
1584	NC_022119	GTCTGT	2	12	83117	83128	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532424010
1585	NC_022119	TCA	2	6	83137	83142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424010
1586	NC_022119	TCAT	2	8	83145	83152	25 %	50 %	0 %	25 %	532424010
1587	NC_022119	CAA	2	6	83187	83192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424010
1588	NC_022119	ACTG	2	8	83197	83204	25 %	25 %	25 %	25 %	532424010
1589	NC_022119	CATT	2	8	83212	83219	25 %	50 %	0 %	25 %	532424010
1590	NC_022119	AGA	2	6	83245	83250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424010
1591	NC_022119	AGCA	2	8	83251	83258	50 %	0 %	25 %	25 %	532424010
1592	NC_022119	TC	3	6	83273	83278	0 %	50 %	0 %	50 %	532424010
1593	NC_022119	ATTA	2	8	83404	83411	50 %	50 %	0 %	0 %	532424010
1594	NC_022119	TTTG	2	8	83444	83451	0 %	75 %	25 %	0 %	532424010
1595	NC_022119	TTG	2	6	83541	83546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424010
1596	NC_022119	GAT	2	6	83638	83643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424010
1597	NC_022119	TCTA	2	8	83728	83735	25 %	50 %	0 %	25 %	532424010
1598	NC_022119	CTA	2	6	83756	83761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424010
1599	NC_022119	TAT	2	6	83809	83814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424010
1600	NC_022119	TAAG	2	8	83833	83840	50 %	25 %	25 %	0 %	532424010
1601	NC_022119	AGT	2	6	83922	83927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424011
1602	NC_022119	TAT	2	6	83949	83954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424011
1603	NC_022119	TGC	2	6	83964	83969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424011
1604	NC_022119	AAG	2	6	83984	83989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424011
1605	NC_022119	TC	3	6	83996	84001	0 %	50 %	0 %	50 %	532424011
1606	NC_022119	AG	3	6	84007	84012	50 %	0 %	50 %	0 %	532424011
1607	NC_022119	GAA	2	6	84040	84045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424011
1608	NC_022119	CAG	2	6	84179	84184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424011
1609	NC_022119	TAA	2	6	84225	84230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424011
1610	NC_022119	AG	3	6	84274	84279	50 %	0 %	50 %	0 %	532424011
1611	NC_022119	TTC	2	6	84293	84298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424011
1612	NC_022119	GAAG	2	8	84337	84344	50 %	0 %	50 %	0 %	532424011
1613	NC_022119	A	6	6	84361	84366	100 %	0 %	0 %	0 %	532424011
1614	NC_022119	AGA	2	6	84411	84416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424011
1615	NC_022119	TTC	2	6	84489	84494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424011
1616	NC_022119	TAAA	2	8	84503	84510	75 %	25 %	0 %	0 %	532424011
1617	NC_022119	ATCC	2	8	84574	84581	25 %	25 %	0 %	50 %	532424011
1618	NC_022119	TGG	2	6	84602	84607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424011
1619	NC_022119	TGA	2	6	84635	84640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424011
1620	NC_022119	TCC	2	6	84642	84647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424011
1621	NC_022119	ACA	2	6	84666	84671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424011
1622	NC_022119	TTTC	2	8	84721	84728	0 %	75 %	0 %	25 %	532424011
1623	NC_022119	AGAT	2	8	84762	84769	50 %	25 %	25 %	0 %	532424011
1624	NC_022119	AGCGA	2	10	84786	84795	40 %	0 %	40 %	20 %	532424011
1625	NC_022119	CTT	2	6	84799	84804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424011
1626	NC_022119	T	6	6	84825	84830	0 %	100 %	0 %	0 %	532424011
1627	NC_022119	GAA	2	6	84952	84957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424011
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1629	NC_022119	AT	3	6	85210	85215	50 %	50 %	0 %	0 %	532424012
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1999	NC_022119	AGG	2	6	103545	103550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424028
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