MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_022119	CTG	2	6	964517	964522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424730
19002	NC_022119	GCA	3	9	964546	964554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424730
19003	NC_022119	TCC	2	6	964557	964562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424730
19004	NC_022119	CAA	2	6	964603	964608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424730
19005	NC_022119	CGGAA	2	10	964628	964637	40 %	0 %	40 %	20 %	532424730
19006	NC_022119	ATA	2	6	964680	964685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424730
19007	NC_022119	GTT	2	6	964708	964713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424730
19008	NC_022119	AAT	2	6	964791	964796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424730
19009	NC_022119	AAGA	2	8	964804	964811	75 %	0 %	25 %	0 %	532424730
19010	NC_022119	TCA	2	6	964837	964842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424730
19011	NC_022119	TTC	2	6	964863	964868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424730
19012	NC_022119	TAA	2	6	964932	964937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424730
19013	NC_022119	AGA	2	6	964941	964946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424730
19014	NC_022119	T	8	8	964952	964959	0 %	100 %	0 %	0 %	532424730
19015	NC_022119	AG	3	6	964963	964968	50 %	0 %	50 %	0 %	532424730
19016	NC_022119	GTTT	2	8	964973	964980	0 %	75 %	25 %	0 %	532424730
19017	NC_022119	TTGA	2	8	965011	965018	25 %	50 %	25 %	0 %	532424730
19018	NC_022119	C	6	6	965124	965129	0 %	0 %	0 %	100 %	532424731
19019	NC_022119	GGA	2	6	965220	965225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424731
19020	NC_022119	A	6	6	965231	965236	100 %	0 %	0 %	0 %	532424731
19021	NC_022119	GGT	2	6	965243	965248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424731
19022	NC_022119	TTA	2	6	965271	965276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424731
19023	NC_022119	GCA	2	6	965277	965282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424731
19024	NC_022119	CAG	2	6	965323	965328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424731
19025	NC_022119	TAA	2	6	965345	965350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424731
19026	NC_022119	TAG	2	6	965368	965373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424731
19027	NC_022119	TAT	2	6	965388	965393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424731
19028	NC_022119	AGG	2	6	965450	965455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424731
19029	NC_022119	AGC	2	6	965482	965487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424731
19030	NC_022119	GCT	2	6	965495	965500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424731
19031	NC_022119	CTT	2	6	965515	965520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424731
19032	NC_022119	TTA	2	6	965616	965621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424731
19033	NC_022119	CTT	2	6	965644	965649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424731
19034	NC_022119	TACT	2	8	965671	965678	25 %	50 %	0 %	25 %	532424731
19035	NC_022119	TGA	2	6	965720	965725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424731
19036	NC_022119	CTG	2	6	965911	965916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424731
19037	NC_022119	AGG	2	6	965933	965938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424731
19038	NC_022119	AAG	2	6	965962	965967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424731
19039	NC_022119	G	6	6	966024	966029	0 %	0 %	100 %	0 %	532424731
19040	NC_022119	GTC	2	6	966045	966050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424731
19041	NC_022119	AGAA	2	8	966082	966089	75 %	0 %	25 %	0 %	532424731
19042	NC_022119	AAAGG	2	10	966132	966141	60 %	0 %	40 %	0 %	532424731
19043	NC_022119	ATT	2	6	966147	966152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424731
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19045	NC_022119	ATT	2	6	966272	966277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424732
19046	NC_022119	GGA	2	6	966350	966355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424732
19047	NC_022119	AAGC	2	8	966422	966429	50 %	0 %	25 %	25 %	532424732
19048	NC_022119	GAT	2	6	966448	966453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424732
19049	NC_022119	CAT	2	6	966649	966654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424732
19050	NC_022119	AAAG	2	8	966741	966748	75 %	0 %	25 %	0 %	532424732
19051	NC_022119	GT	4	8	966759	966766	0 %	50 %	50 %	0 %	532424732
19052	NC_022119	GA	3	6	966864	966869	50 %	0 %	50 %	0 %	532424732
19053	NC_022119	TGG	2	6	966871	966876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424732
19054	NC_022119	TAG	2	6	966916	966921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424732
19055	NC_022119	TAT	2	6	966991	966996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424732
19056	NC_022119	AAG	2	6	967029	967034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424732
19057	NC_022119	CAGG	2	8	967043	967050	25 %	0 %	50 %	25 %	532424732
19058	NC_022119	T	6	6	967118	967123	0 %	100 %	0 %	0 %	532424732
19059	NC_022119	ATT	2	6	967266	967271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424733
19060	NC_022119	TG	3	6	967273	967278	0 %	50 %	50 %	0 %	532424733
19061	NC_022119	AAAG	2	8	967329	967336	75 %	0 %	25 %	0 %	532424733
19062	NC_022119	AAG	2	6	967391	967396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424733
19063	NC_022119	AAG	2	6	967406	967411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424733
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19066	NC_022119	ATT	2	6	967544	967549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424733
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19068	NC_022119	T	6	6	967573	967578	0 %	100 %	0 %	0 %	532424733
19069	NC_022119	AG	3	6	967594	967599	50 %	0 %	50 %	0 %	532424733
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19072	NC_022119	TGT	2	6	967665	967670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424733
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19080	NC_022119	TGT	2	6	968241	968246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424733
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19085	NC_022119	TGCGT	2	10	968331	968340	0 %	40 %	40 %	20 %	532424733
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19088	NC_022119	TCGT	2	8	968387	968394	0 %	50 %	25 %	25 %	532424733
19089	NC_022119	AGA	2	6	968465	968470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424733
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19091	NC_022119	AGGC	2	8	968561	968568	25 %	0 %	50 %	25 %	532424733
19092	NC_022119	GA	3	6	968678	968683	50 %	0 %	50 %	0 %	532424733
19093	NC_022119	AGT	2	6	968744	968749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424733
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19096	NC_022119	AGTGG	2	10	969128	969137	20 %	20 %	60 %	0 %	532424734
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19103	NC_022119	TC	3	6	969403	969408	0 %	50 %	0 %	50 %	532424734
19104	NC_022119	AATGA	2	10	969428	969437	60 %	20 %	20 %	0 %	532424734
19105	NC_022119	AGCGA	2	10	969470	969479	40 %	0 %	40 %	20 %	532424734
19106	NC_022119	GAG	2	6	969525	969530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424734
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19108	NC_022119	TCT	2	6	969838	969843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424734
19109	NC_022119	TA	3	6	969972	969977	50 %	50 %	0 %	0 %	532424734
19110	NC_022119	TTGT	2	8	969978	969985	0 %	75 %	25 %	0 %	532424734
19111	NC_022119	AAGG	2	8	970111	970118	50 %	0 %	50 %	0 %	532424734
19112	NC_022119	TATTC	2	10	970130	970139	20 %	60 %	0 %	20 %	532424734
19113	NC_022119	CTA	2	6	970172	970177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424734
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19115	NC_022119	TTTG	2	8	970222	970229	0 %	75 %	25 %	0 %	532424734
19116	NC_022119	GA	3	6	970239	970244	50 %	0 %	50 %	0 %	532424734
19117	NC_022119	AGA	2	6	970360	970365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424734
19118	NC_022119	AC	3	6	970378	970383	50 %	0 %	0 %	50 %	532424734
19119	NC_022119	CAAATG	2	12	970388	970399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532424734
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19121	NC_022119	AG	4	8	970414	970421	50 %	0 %	50 %	0 %	532424734
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19485	NC_022119	TCTT	2	8	989462	989469	0 %	75 %	0 %	25 %	532424749
19486	NC_022119	TCA	2	6	989472	989477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424749
19487	NC_022119	TTA	2	6	989593	989598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424749
19488	NC_022119	GA	3	6	989700	989705	50 %	0 %	50 %	0 %	532424749
19489	NC_022119	GA	3	6	989790	989795	50 %	0 %	50 %	0 %	532424749
19490	NC_022119	T	6	6	989820	989825	0 %	100 %	0 %	0 %	532424749
19491	NC_022119	GA	3	6	989845	989850	50 %	0 %	50 %	0 %	532424749
19492	NC_022119	T	6	6	989955	989960	0 %	100 %	0 %	0 %	532424749
19493	NC_022119	ATC	2	6	989975	989980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424749
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19497	NC_022119	T	6	6	990283	990288	0 %	100 %	0 %	0 %	532424750
19498	NC_022119	TCA	2	6	990370	990375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424750
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