MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_022119	AAG	2	6	939994	939999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424713
18502	NC_022119	TGTT	2	8	940011	940018	0 %	75 %	25 %	0 %	532424713
18503	NC_022119	TTCTT	2	10	940030	940039	0 %	80 %	0 %	20 %	532424714
18504	NC_022119	T	8	8	940049	940056	0 %	100 %	0 %	0 %	532424714
18505	NC_022119	T	6	6	940058	940063	0 %	100 %	0 %	0 %	532424714
18506	NC_022119	CTTT	2	8	940073	940080	0 %	75 %	0 %	25 %	532424714
18507	NC_022119	GAT	2	6	940128	940133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424714
18508	NC_022119	TC	3	6	940209	940214	0 %	50 %	0 %	50 %	532424714
18509	NC_022119	TAAT	2	8	940219	940226	50 %	50 %	0 %	0 %	532424714
18510	NC_022119	AGG	2	6	940355	940360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424714
18511	NC_022119	AGT	2	6	940362	940367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424714
18512	NC_022119	GCA	2	6	940371	940376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424714
18513	NC_022119	TGA	2	6	940421	940426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424714
18514	NC_022119	T	6	6	940469	940474	0 %	100 %	0 %	0 %	532424714
18515	NC_022119	AGC	2	6	940487	940492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424714
18516	NC_022119	ATA	2	6	940518	940523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424714
18517	NC_022119	AGA	2	6	940529	940534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424714
18518	NC_022119	AGAT	2	8	940544	940551	50 %	25 %	25 %	0 %	532424714
18519	NC_022119	GCC	2	6	940599	940604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424714
18520	NC_022119	TCC	2	6	940623	940628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424714
18521	NC_022119	A	6	6	940631	940636	100 %	0 %	0 %	0 %	532424714
18522	NC_022119	GAAA	2	8	940694	940701	75 %	0 %	25 %	0 %	532424714
18523	NC_022119	CTT	2	6	940810	940815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424714
18524	NC_022119	GGA	2	6	940851	940856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424714
18525	NC_022119	CTT	2	6	940951	940956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424863
18526	NC_022119	AGAA	2	8	941012	941019	75 %	0 %	25 %	0 %	532424863
18527	NC_022119	TGA	2	6	941024	941029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424863
18528	NC_022119	GCA	2	6	941031	941036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424863
18529	NC_022119	CAT	2	6	941048	941053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424863
18530	NC_022119	AAGC	2	8	941056	941063	50 %	0 %	25 %	25 %	532424863
18531	NC_022119	TG	3	6	941096	941101	0 %	50 %	50 %	0 %	532424863
18532	NC_022119	TAATT	2	10	941330	941339	40 %	60 %	0 %	0 %	532424715
18533	NC_022119	CAA	2	6	941386	941391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424715
18534	NC_022119	CCT	2	6	941421	941426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424715
18535	NC_022119	CCAA	2	8	941439	941446	50 %	0 %	0 %	50 %	532424715
18536	NC_022119	AAG	2	6	941517	941522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424715
18537	NC_022119	AT	3	6	941532	941537	50 %	50 %	0 %	0 %	532424715
18538	NC_022119	TCA	2	6	941542	941547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424715
18539	NC_022119	CCA	2	6	941588	941593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424715
18540	NC_022119	ACT	2	6	941616	941621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424715
18541	NC_022119	A	6	6	941677	941682	100 %	0 %	0 %	0 %	532424715
18542	NC_022119	ATAA	2	8	941712	941719	75 %	25 %	0 %	0 %	532424715
18543	NC_022119	CA	3	6	941756	941761	50 %	0 %	0 %	50 %	532424715
18544	NC_022119	CAA	2	6	941764	941769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424715
18545	NC_022119	AAC	2	6	941771	941776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424715
18546	NC_022119	ATGA	2	8	941777	941784	50 %	25 %	25 %	0 %	532424715
18547	NC_022119	AAT	2	6	941786	941791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424715
18548	NC_022119	GAAG	2	8	941796	941803	50 %	0 %	50 %	0 %	532424715
18549	NC_022119	TCAT	2	8	941808	941815	25 %	50 %	0 %	25 %	532424715
18550	NC_022119	A	7	7	941874	941880	100 %	0 %	0 %	0 %	532424715
18551	NC_022119	TTG	2	6	941881	941886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424715
18552	NC_022119	CAA	2	6	941916	941921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424715
18553	NC_022119	GAA	2	6	941962	941967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424715
18554	NC_022119	GAA	2	6	941985	941990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424715
18555	NC_022119	GAA	2	6	941994	941999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424715
18556	NC_022119	ATA	2	6	942028	942033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424715
18557	NC_022119	GA	3	6	942067	942072	50 %	0 %	50 %	0 %	532424715
18558	NC_022119	AAT	2	6	942107	942112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424715
18559	NC_022119	A	6	6	942135	942140	100 %	0 %	0 %	0 %	532424715
18560	NC_022119	TGC	2	6	942152	942157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424715
18561	NC_022119	CCA	3	9	942170	942178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424715
18562	NC_022119	CT	3	6	942223	942228	0 %	50 %	0 %	50 %	532424715
18563	NC_022119	ATA	2	6	942276	942281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424715
18564	NC_022119	TA	3	6	942343	942348	50 %	50 %	0 %	0 %	532424715
18565	NC_022119	ATC	2	6	942459	942464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424715
18566	NC_022119	A	7	7	942532	942538	100 %	0 %	0 %	0 %	532424715
18567	NC_022119	GAG	2	6	942567	942572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424715
18568	NC_022119	CGA	2	6	942780	942785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424716
18569	NC_022119	GAG	2	6	942801	942806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424716
18570	NC_022119	TTC	2	6	942840	942845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424716
18571	NC_022119	GCA	2	6	942883	942888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424716
18572	NC_022119	T	6	6	942893	942898	0 %	100 %	0 %	0 %	532424716
18573	NC_022119	T	6	6	942921	942926	0 %	100 %	0 %	0 %	532424716
18574	NC_022119	AAT	2	6	942946	942951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424716
18575	NC_022119	T	6	6	942951	942956	0 %	100 %	0 %	0 %	532424716
18576	NC_022119	AT	3	6	943000	943005	50 %	50 %	0 %	0 %	532424716
18577	NC_022119	CTC	2	6	943101	943106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424716
18578	NC_022119	GTT	2	6	943193	943198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424716
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18581	NC_022119	AGC	3	9	943300	943308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424716
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18584	NC_022119	GA	3	6	943354	943359	50 %	0 %	50 %	0 %	532424716
18585	NC_022119	ATA	2	6	943374	943379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424716
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18587	NC_022119	AG	4	8	943419	943426	50 %	0 %	50 %	0 %	532424716
18588	NC_022119	ATA	2	6	943430	943435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424716
18589	NC_022119	GA	3	6	943441	943446	50 %	0 %	50 %	0 %	532424716
18590	NC_022119	AGT	2	6	943498	943503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424716
18591	NC_022119	TCT	2	6	943561	943566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424716
18592	NC_022119	CAA	2	6	943580	943585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424716
18593	NC_022119	GGCA	2	8	943625	943632	25 %	0 %	50 %	25 %	532424716
18594	NC_022119	TTC	2	6	943639	943644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424716
18595	NC_022119	TTC	2	6	943689	943694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424716
18596	NC_022119	AGA	2	6	943713	943718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424716
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18598	NC_022119	TAG	2	6	943860	943865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424716
18599	NC_022119	TA	3	6	943868	943873	50 %	50 %	0 %	0 %	532424716
18600	NC_022119	GAG	2	6	943916	943921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424716
18601	NC_022119	TA	3	6	943979	943984	50 %	50 %	0 %	0 %	532424716
18602	NC_022119	GTT	2	6	944039	944044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424716
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18604	NC_022119	GAG	4	12	944110	944121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424716
18605	NC_022119	GTC	2	6	944163	944168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424716
18606	NC_022119	GGTAG	2	10	944212	944221	20 %	20 %	60 %	0 %	532424716
18607	NC_022119	AGATA	2	10	944223	944232	60 %	20 %	20 %	0 %	532424716
18608	NC_022119	TCT	2	6	944281	944286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424716
18609	NC_022119	AG	3	6	944308	944313	50 %	0 %	50 %	0 %	532424716
18610	NC_022119	TAT	2	6	944561	944566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424716
18611	NC_022119	CAA	2	6	944627	944632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424716
18612	NC_022119	CAT	2	6	944702	944707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424716
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18614	NC_022119	TTA	2	6	944767	944772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424716
18615	NC_022119	AGT	2	6	944778	944783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424716
18616	NC_022119	GT	3	6	944813	944818	0 %	50 %	50 %	0 %	532424716
18617	NC_022119	TGC	2	6	944901	944906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424716
18618	NC_022119	AGT	2	6	944921	944926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424716
18619	NC_022119	AGT	2	6	944955	944960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424716
18620	NC_022119	AG	3	6	944976	944981	50 %	0 %	50 %	0 %	532424716
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18622	NC_022119	ACG	2	6	945048	945053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424716
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18987	NC_022119	GTT	2	6	963826	963831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424729
18988	NC_022119	AGT	2	6	963880	963885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424729
18989	NC_022119	TCG	2	6	963901	963906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424729
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18997	NC_022119	TCA	2	6	964379	964384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424730
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