MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_022119	AAT	2	6	913909	913914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424690
18003	NC_022119	ATG	2	6	913964	913969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424690
18004	NC_022119	A	6	6	914068	914073	100 %	0 %	0 %	0 %	532424690
18005	NC_022119	AAG	2	6	914110	914115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424690
18006	NC_022119	GTT	2	6	914259	914264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424690
18007	NC_022119	TTGA	2	8	914266	914273	25 %	50 %	25 %	0 %	532424690
18008	NC_022119	G	6	6	914278	914283	0 %	0 %	100 %	0 %	532424690
18009	NC_022119	GGA	2	6	914289	914294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424690
18010	NC_022119	AAT	2	6	914295	914300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424690
18011	NC_022119	GTT	2	6	914304	914309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424690
18012	NC_022119	CTG	2	6	914328	914333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424690
18013	NC_022119	GAAT	2	8	914346	914353	50 %	25 %	25 %	0 %	532424690
18014	NC_022119	TCA	2	6	914403	914408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424690
18015	NC_022119	AGT	2	6	914441	914446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424690
18016	NC_022119	A	6	6	914628	914633	100 %	0 %	0 %	0 %	532424690
18017	NC_022119	AGA	2	6	914713	914718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424690
18018	NC_022119	AAC	2	6	914788	914793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424690
18019	NC_022119	CAG	2	6	914823	914828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424690
18020	NC_022119	TTG	2	6	915032	915037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424859
18021	NC_022119	CAAA	2	8	915048	915055	75 %	0 %	0 %	25 %	532424859
18022	NC_022119	T	6	6	915089	915094	0 %	100 %	0 %	0 %	532424859
18023	NC_022119	AAAGA	2	10	915156	915165	80 %	0 %	20 %	0 %	532424859
18024	NC_022119	AGT	2	6	915259	915264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424859
18025	NC_022119	GA	3	6	915272	915277	50 %	0 %	50 %	0 %	532424859
18026	NC_022119	AGA	2	6	915379	915384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424859
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18028	NC_022119	TTC	2	6	915459	915464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424859
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18033	NC_022119	AGGA	2	8	915876	915883	50 %	0 %	50 %	0 %	532424691
18034	NC_022119	TGG	2	6	915999	916004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424691
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18036	NC_022119	CAA	2	6	916021	916026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424691
18037	NC_022119	CCCTA	2	10	916093	916102	20 %	20 %	0 %	60 %	532424691
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18040	NC_022119	CG	3	6	916211	916216	0 %	0 %	50 %	50 %	532424691
18041	NC_022119	AAGA	2	8	916267	916274	75 %	0 %	25 %	0 %	532424860
18042	NC_022119	AAGC	2	8	916310	916317	50 %	0 %	25 %	25 %	532424860
18043	NC_022119	CT	4	8	916326	916333	0 %	50 %	0 %	50 %	532424860
18044	NC_022119	ATG	2	6	916360	916365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424860
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18047	NC_022119	GAC	2	6	916650	916655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424692
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18050	NC_022119	TCTTT	2	10	916843	916852	0 %	80 %	0 %	20 %	532424692
18051	NC_022119	ACTC	2	8	916853	916860	25 %	25 %	0 %	50 %	532424692
18052	NC_022119	GTT	2	6	916894	916899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424692
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18054	NC_022119	CAG	2	6	917060	917065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424692
18055	NC_022119	GGA	2	6	917108	917113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424692
18056	NC_022119	A	6	6	917195	917200	100 %	0 %	0 %	0 %	532424692
18057	NC_022119	TTG	2	6	917205	917210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424692
18058	NC_022119	ATG	2	6	917325	917330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424692
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18060	NC_022119	TTG	2	6	917352	917357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424692
18061	NC_022119	GTT	2	6	917429	917434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424692
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18063	NC_022119	GGC	2	6	917489	917494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424692
18064	NC_022119	GAG	2	6	917586	917591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424692
18065	NC_022119	TGA	2	6	917611	917616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424692
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18088	NC_022119	A	6	6	918392	918397	100 %	0 %	0 %	0 %	532424693
18089	NC_022119	ATG	2	6	918428	918433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424693
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18101	NC_022119	CA	3	6	918909	918914	50 %	0 %	0 %	50 %	532424693
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18104	NC_022119	GTGG	2	8	919102	919109	0 %	25 %	75 %	0 %	532424693
18105	NC_022119	A	7	7	919159	919165	100 %	0 %	0 %	0 %	532424693
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18123	NC_022119	GA	3	6	920233	920238	50 %	0 %	50 %	0 %	532424694
18124	NC_022119	GAT	2	6	920397	920402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424694
18125	NC_022119	GAA	2	6	920477	920482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424694
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18127	NC_022119	GAT	2	6	920672	920677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424694
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18162	NC_022119	A	8	8	922847	922854	100 %	0 %	0 %	0 %	532424861
18163	NC_022119	TGGG	2	8	922881	922888	0 %	25 %	75 %	0 %	532424861
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18231	NC_022119	T	6	6	926179	926184	0 %	100 %	0 %	0 %	532424702
18232	NC_022119	CTA	2	6	926208	926213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424702
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18235	NC_022119	ATCT	2	8	926283	926290	25 %	50 %	0 %	25 %	532424702
18236	NC_022119	CTA	2	6	926394	926399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424702
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18238	NC_022119	TAG	2	6	926575	926580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424702
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18241	NC_022119	AGA	2	6	927050	927055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424702
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18487	NC_022119	GAA	2	6	939489	939494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424712
18488	NC_022119	TTA	2	6	939519	939524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424713
18489	NC_022119	TTG	2	6	939559	939564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424713
18490	NC_022119	GCAA	2	8	939644	939651	50 %	0 %	25 %	25 %	532424713
18491	NC_022119	AGC	2	6	939661	939666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424713
18492	NC_022119	TGC	2	6	939670	939675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424713
18493	NC_022119	AGA	2	6	939692	939697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424713
18494	NC_022119	AAT	2	6	939765	939770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424713
18495	NC_022119	ATGAT	2	10	939793	939802	40 %	40 %	20 %	0 %	532424713
18496	NC_022119	TGC	2	6	939806	939811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424713
18497	NC_022119	CAA	2	6	939816	939821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424713
18498	NC_022119	GTT	2	6	939825	939830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424713
18499	NC_022119	AAG	2	6	939907	939912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424713
18500	NC_022119	AGA	2	6	939986	939991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424713

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