MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_022119	GAA	2	6	888555	888560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424670
17502	NC_022119	TCT	2	6	888564	888569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424670
17503	NC_022119	TTA	2	6	888573	888578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424670
17504	NC_022119	CTCG	2	8	888592	888599	0 %	25 %	25 %	50 %	532424670
17505	NC_022119	GAA	2	6	888602	888607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424670
17506	NC_022119	T	6	6	888657	888662	0 %	100 %	0 %	0 %	532424670
17507	NC_022119	AGC	2	6	888707	888712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424670
17508	NC_022119	TGC	2	6	888728	888733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424670
17509	NC_022119	ACT	2	6	888885	888890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424670
17510	NC_022119	TCT	2	6	888915	888920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424670
17511	NC_022119	T	6	6	889007	889012	0 %	100 %	0 %	0 %	532424670
17512	NC_022119	TAA	2	6	889040	889045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424670
17513	NC_022119	GAA	2	6	889049	889054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424670
17514	NC_022119	CA	3	6	889091	889096	50 %	0 %	0 %	50 %	532424670
17515	NC_022119	GCA	2	6	889106	889111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424670
17516	NC_022119	TCG	2	6	889147	889152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424670
17517	NC_022119	A	6	6	889156	889161	100 %	0 %	0 %	0 %	532424670
17518	NC_022119	CTT	2	6	889207	889212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424670
17519	NC_022119	T	6	6	889221	889226	0 %	100 %	0 %	0 %	532424670
17520	NC_022119	A	6	6	889229	889234	100 %	0 %	0 %	0 %	532424670
17521	NC_022119	GCA	2	6	889242	889247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424670
17522	NC_022119	TTTTCT	2	12	889254	889265	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532424670
17523	NC_022119	TAT	2	6	889290	889295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424670
17524	NC_022119	ATTC	2	8	889302	889309	25 %	50 %	0 %	25 %	532424670
17525	NC_022119	TTA	2	6	889321	889326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424670
17526	NC_022119	TGCC	2	8	889351	889358	0 %	25 %	25 %	50 %	532424670
17527	NC_022119	TAT	2	6	889391	889396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424670
17528	NC_022119	AGTC	2	8	889452	889459	25 %	25 %	25 %	25 %	532424670
17529	NC_022119	TGCC	2	8	889468	889475	0 %	25 %	25 %	50 %	532424670
17530	NC_022119	ATG	2	6	889519	889524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424670
17531	NC_022119	GCT	2	6	889554	889559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424670
17532	NC_022119	CTGTTC	2	12	889567	889578	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532424670
17533	NC_022119	CAT	2	6	889688	889693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424670
17534	NC_022119	T	6	6	889695	889700	0 %	100 %	0 %	0 %	532424670
17535	NC_022119	GA	3	6	889705	889710	50 %	0 %	50 %	0 %	532424670
17536	NC_022119	TGT	2	6	889820	889825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424670
17537	NC_022119	GTT	2	6	889826	889831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424670
17538	NC_022119	TTA	2	6	889863	889868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424670
17539	NC_022119	TGT	2	6	890052	890057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424671
17540	NC_022119	T	6	6	890080	890085	0 %	100 %	0 %	0 %	532424671
17541	NC_022119	T	7	7	890090	890096	0 %	100 %	0 %	0 %	532424671
17542	NC_022119	A	7	7	890121	890127	100 %	0 %	0 %	0 %	532424671
17543	NC_022119	AGA	2	6	890172	890177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424671
17544	NC_022119	AT	3	6	890196	890201	50 %	50 %	0 %	0 %	532424671
17545	NC_022119	GTTTTT	2	12	890221	890232	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	532424671
17546	NC_022119	CTATT	2	10	890300	890309	20 %	60 %	0 %	20 %	532424671
17547	NC_022119	GAT	2	6	890332	890337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424671
17548	NC_022119	GGC	2	6	890409	890414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424671
17549	NC_022119	TTC	2	6	890423	890428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424671
17550	NC_022119	TAT	2	6	890430	890435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424671
17551	NC_022119	AAAG	2	8	890446	890453	75 %	0 %	25 %	0 %	532424671
17552	NC_022119	CAT	2	6	890500	890505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424671
17553	NC_022119	TGG	2	6	890506	890511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424671
17554	NC_022119	TTG	2	6	890549	890554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424671
17555	NC_022119	TGGAT	2	10	890583	890592	20 %	40 %	40 %	0 %	532424671
17556	NC_022119	TGT	2	6	890677	890682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424671
17557	NC_022119	TTC	2	6	890684	890689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424671
17558	NC_022119	ACA	2	6	890729	890734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424671
17559	NC_022119	TG	3	6	890798	890803	0 %	50 %	50 %	0 %	532424671
17560	NC_022119	TAT	2	6	890807	890812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424671
17561	NC_022119	TCT	2	6	890826	890831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424671
17562	NC_022119	GGGA	2	8	890841	890848	25 %	0 %	75 %	0 %	532424671
17563	NC_022119	AAGA	2	8	890901	890908	75 %	0 %	25 %	0 %	532424671
17564	NC_022119	TCTT	2	8	890915	890922	0 %	75 %	0 %	25 %	532424671
17565	NC_022119	CAT	2	6	890938	890943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424671
17566	NC_022119	GTA	2	6	891010	891015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424671
17567	NC_022119	GTGTAT	2	12	891133	891144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532424672
17568	NC_022119	TGT	2	6	891239	891244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424672
17569	NC_022119	AG	3	6	891357	891362	50 %	0 %	50 %	0 %	532424672
17570	NC_022119	ATT	2	6	891404	891409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424672
17571	NC_022119	TTG	2	6	891508	891513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424672
17572	NC_022119	ATCCT	2	10	891548	891557	20 %	40 %	0 %	40 %	532424672
17573	NC_022119	GGA	2	6	891567	891572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424672
17574	NC_022119	CAAGC	2	10	891633	891642	40 %	0 %	20 %	40 %	532424672
17575	NC_022119	TATG	2	8	891655	891662	25 %	50 %	25 %	0 %	532424672
17576	NC_022119	AGA	2	6	891719	891724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424672
17577	NC_022119	TTA	2	6	891744	891749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424672
17578	NC_022119	AAAG	2	8	891753	891760	75 %	0 %	25 %	0 %	532424672
17579	NC_022119	ACT	2	6	891796	891801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424672
17580	NC_022119	TGCT	2	8	891814	891821	0 %	50 %	25 %	25 %	532424672
17581	NC_022119	CCT	2	6	891882	891887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424672
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17583	NC_022119	CTT	2	6	892044	892049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424672
17584	NC_022119	AGA	2	6	892121	892126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424672
17585	NC_022119	AGCA	2	8	892180	892187	50 %	0 %	25 %	25 %	532424672
17586	NC_022119	TGT	2	6	892207	892212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424672
17587	NC_022119	TTGG	2	8	892278	892285	0 %	50 %	50 %	0 %	532424672
17588	NC_022119	GAT	2	6	892321	892326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424672
17589	NC_022119	CTG	2	6	892335	892340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424673
17590	NC_022119	CG	3	6	892375	892380	0 %	0 %	50 %	50 %	532424673
17591	NC_022119	GTT	2	6	892448	892453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424673
17592	NC_022119	TGC	2	6	892540	892545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424673
17593	NC_022119	CGA	2	6	892626	892631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424673
17594	NC_022119	GTA	2	6	892670	892675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424673
17595	NC_022119	AAGG	2	8	892904	892911	50 %	0 %	50 %	0 %	532424673
17596	NC_022119	CATTG	2	10	892927	892936	20 %	40 %	20 %	20 %	532424673
17597	NC_022119	GTT	2	6	892960	892965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424673
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17599	NC_022119	TGTT	2	8	893072	893079	0 %	75 %	25 %	0 %	532424674
17600	NC_022119	T	6	6	893085	893090	0 %	100 %	0 %	0 %	532424674
17601	NC_022119	TCA	2	6	893120	893125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424674
17602	NC_022119	GTA	2	6	893154	893159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424674
17603	NC_022119	CA	3	6	893160	893165	50 %	0 %	0 %	50 %	532424674
17604	NC_022119	AAC	2	6	893425	893430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424674
17605	NC_022119	GTA	2	6	893445	893450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424674
17606	NC_022119	TGT	2	6	893481	893486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424674
17607	NC_022119	TCA	2	6	893713	893718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424674
17608	NC_022119	GCA	2	6	893738	893743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424674
17609	NC_022119	GGA	2	6	893750	893755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424674
17610	NC_022119	TGC	2	6	893827	893832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424674
17611	NC_022119	AGA	2	6	893842	893847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424674
17612	NC_022119	TTC	2	6	893877	893882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424674
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17614	NC_022119	ATT	2	6	893972	893977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424674
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17618	NC_022119	TG	3	6	894084	894089	0 %	50 %	50 %	0 %	532424674
17619	NC_022119	TGA	2	6	894115	894120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424674
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17863	NC_022119	ATC	2	6	906203	906208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424685
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