MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_022119	CTT	2	6	852003	852008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424653
17002	NC_022119	ATA	2	6	852119	852124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424653
17003	NC_022119	CAGA	2	8	852149	852156	50 %	0 %	25 %	25 %	532424653
17004	NC_022119	AAT	2	6	852181	852186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424653
17005	NC_022119	T	6	6	852235	852240	0 %	100 %	0 %	0 %	532424653
17006	NC_022119	GAA	2	6	852246	852251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424653
17007	NC_022119	TCT	2	6	852287	852292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424653
17008	NC_022119	GAT	2	6	852373	852378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424653
17009	NC_022119	T	6	6	852432	852437	0 %	100 %	0 %	0 %	532424653
17010	NC_022119	GGA	2	6	852459	852464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424653
17011	NC_022119	GGC	2	6	852472	852477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424653
17012	NC_022119	AGC	2	6	852508	852513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424653
17013	NC_022119	AGC	2	6	852550	852555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424653
17014	NC_022119	T	6	6	852560	852565	0 %	100 %	0 %	0 %	532424653
17015	NC_022119	TTC	2	6	852568	852573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424653
17016	NC_022119	AG	3	6	852576	852581	50 %	0 %	50 %	0 %	532424653
17017	NC_022119	ATGGGG	2	12	852657	852668	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532424653
17018	NC_022119	T	6	6	852744	852749	0 %	100 %	0 %	0 %	532424653
17019	NC_022119	GAG	2	6	852809	852814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424653
17020	NC_022119	AG	3	6	852914	852919	50 %	0 %	50 %	0 %	532424653
17021	NC_022119	T	6	6	852953	852958	0 %	100 %	0 %	0 %	532424653
17022	NC_022119	T	10	10	853033	853042	0 %	100 %	0 %	0 %	532424653
17023	NC_022119	GATAA	2	10	853060	853069	60 %	20 %	20 %	0 %	532424653
17024	NC_022119	AAAGAA	2	12	853136	853147	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532424653
17025	NC_022119	AGG	2	6	853195	853200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424653
17026	NC_022119	AAT	2	6	853277	853282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424653
17027	NC_022119	CAA	2	6	853289	853294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424653
17028	NC_022119	GCT	3	9	853313	853321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424653
17029	NC_022119	AGAAA	2	10	853361	853370	80 %	0 %	20 %	0 %	532424653
17030	NC_022119	TA	3	6	853416	853421	50 %	50 %	0 %	0 %	532424653
17031	NC_022119	AAG	2	6	853424	853429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424653
17032	NC_022119	TG	3	6	853466	853471	0 %	50 %	50 %	0 %	532424653
17033	NC_022119	GGCTAG	2	12	853519	853530	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532424653
17034	NC_022119	GAGAAA	2	12	853566	853577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424653
17035	NC_022119	GCTT	2	8	853579	853586	0 %	50 %	25 %	25 %	532424653
17036	NC_022119	CT	4	8	853611	853618	0 %	50 %	0 %	50 %	532424653
17037	NC_022119	T	7	7	854006	854012	0 %	100 %	0 %	0 %	532424853
17038	NC_022119	A	8	8	854017	854024	100 %	0 %	0 %	0 %	532424853
17039	NC_022119	A	7	7	854026	854032	100 %	0 %	0 %	0 %	532424853
17040	NC_022119	GT	3	6	854071	854076	0 %	50 %	50 %	0 %	532424853
17041	NC_022119	T	6	6	854109	854114	0 %	100 %	0 %	0 %	532424853
17042	NC_022119	A	6	6	854126	854131	100 %	0 %	0 %	0 %	532424853
17043	NC_022119	A	6	6	854141	854146	100 %	0 %	0 %	0 %	532424853
17044	NC_022119	CTTT	2	8	854169	854176	0 %	75 %	0 %	25 %	532424853
17045	NC_022119	ATC	2	6	859862	859867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424654
17046	NC_022119	AGA	2	6	859877	859882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424654
17047	NC_022119	CTA	2	6	859920	859925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424654
17048	NC_022119	TCT	2	6	859962	859967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424654
17049	NC_022119	GA	4	8	860077	860084	50 %	0 %	50 %	0 %	532424654
17050	NC_022119	TTCT	2	8	860111	860118	0 %	75 %	0 %	25 %	532424654
17051	NC_022119	CTT	2	6	860134	860139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424654
17052	NC_022119	CTT	2	6	860229	860234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424654
17053	NC_022119	AGA	2	6	860240	860245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424654
17054	NC_022119	CCT	2	6	860253	860258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424654
17055	NC_022119	AG	3	6	860343	860348	50 %	0 %	50 %	0 %	532424654
17056	NC_022119	AT	3	6	860350	860355	50 %	50 %	0 %	0 %	532424654
17057	NC_022119	GGTCG	2	10	860381	860390	0 %	20 %	60 %	20 %	532424654
17058	NC_022119	AGG	2	6	860408	860413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424654
17059	NC_022119	CTG	2	6	860452	860457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424654
17060	NC_022119	AAG	2	6	860461	860466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424654
17061	NC_022119	AGAT	2	8	860504	860511	50 %	25 %	25 %	0 %	532424654
17062	NC_022119	AGG	2	6	860606	860611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424654
17063	NC_022119	AGAA	2	8	860669	860676	75 %	0 %	25 %	0 %	532424654
17064	NC_022119	ACA	2	6	860715	860720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424654
17065	NC_022119	AAG	3	9	860731	860739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424654
17066	NC_022119	CTTCTA	2	12	860755	860766	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532424654
17067	NC_022119	TGC	2	6	860823	860828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424654
17068	NC_022119	TCA	2	6	860862	860867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424654
17069	NC_022119	AGC	2	6	860903	860908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424654
17070	NC_022119	TAA	2	6	860948	860953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424654
17071	NC_022119	ATC	2	6	860999	861004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424654
17072	NC_022119	ATT	2	6	861005	861010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424654
17073	NC_022119	TAA	2	6	861037	861042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424654
17074	NC_022119	TGC	2	6	861098	861103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424654
17075	NC_022119	AGC	2	6	861318	861323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424655
17076	NC_022119	TG	3	6	861366	861371	0 %	50 %	50 %	0 %	532424655
17077	NC_022119	CTTTTT	2	12	861439	861450	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532424655
17078	NC_022119	GAC	2	6	861461	861466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424655
17079	NC_022119	GAG	2	6	861554	861559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424655
17080	NC_022119	A	6	6	861612	861617	100 %	0 %	0 %	0 %	532424655
17081	NC_022119	T	7	7	861889	861895	0 %	100 %	0 %	0 %	532424656
17082	NC_022119	GAG	2	6	861946	861951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424656
17083	NC_022119	GAAG	2	8	861975	861982	50 %	0 %	50 %	0 %	532424656
17084	NC_022119	AAT	2	6	862100	862105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424656
17085	NC_022119	T	8	8	862105	862112	0 %	100 %	0 %	0 %	532424656
17086	NC_022119	AG	3	6	862165	862170	50 %	0 %	50 %	0 %	532424656
17087	NC_022119	TCT	2	6	862173	862178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424656
17088	NC_022119	T	6	6	862216	862221	0 %	100 %	0 %	0 %	532424656
17089	NC_022119	CTT	2	6	862251	862256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424656
17090	NC_022119	TTG	2	6	862298	862303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424656
17091	NC_022119	TTC	2	6	862373	862378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424656
17092	NC_022119	TAA	2	6	862412	862417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424656
17093	NC_022119	TTG	2	6	862421	862426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424656
17094	NC_022119	TTC	2	6	862460	862465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424656
17095	NC_022119	AAT	2	6	862484	862489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424656
17096	NC_022119	TTTA	2	8	862544	862551	25 %	75 %	0 %	0 %	532424656
17097	NC_022119	TGG	2	6	862553	862558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424656
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17100	NC_022119	T	6	6	862664	862669	0 %	100 %	0 %	0 %	532424656
17101	NC_022119	T	6	6	862699	862704	0 %	100 %	0 %	0 %	532424656
17102	NC_022119	TTC	2	6	862744	862749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424656
17103	NC_022119	GAA	2	6	862753	862758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424656
17104	NC_022119	GAG	2	6	862759	862764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424656
17105	NC_022119	TGGGA	2	10	862791	862800	20 %	20 %	60 %	0 %	532424656
17106	NC_022119	AAAT	2	8	862811	862818	75 %	25 %	0 %	0 %	532424656
17107	NC_022119	GAG	2	6	862867	862872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424656
17108	NC_022119	AAAG	2	8	862938	862945	75 %	0 %	25 %	0 %	532424656
17109	NC_022119	T	7	7	863135	863141	0 %	100 %	0 %	0 %	532424657
17110	NC_022119	T	7	7	863172	863178	0 %	100 %	0 %	0 %	532424657
17111	NC_022119	TAG	2	6	863198	863203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424657
17112	NC_022119	T	6	6	863226	863231	0 %	100 %	0 %	0 %	532424657
17113	NC_022119	CTT	2	6	863259	863264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424657
17114	NC_022119	AGC	3	9	863265	863273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424657
17115	NC_022119	T	6	6	863280	863285	0 %	100 %	0 %	0 %	532424657
17116	NC_022119	AGC	2	6	863286	863291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424657
17117	NC_022119	GCTTT	2	10	863293	863302	0 %	60 %	20 %	20 %	532424657
17118	NC_022119	T	7	7	863300	863306	0 %	100 %	0 %	0 %	532424657
17119	NC_022119	T	6	6	863318	863323	0 %	100 %	0 %	0 %	532424657
17120	NC_022119	TGC	2	6	863397	863402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424657
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