MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_022119	CTT	2	6	777241	777246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424594
15503	NC_022119	AG	3	6	777439	777444	50 %	0 %	50 %	0 %	532424594
15504	NC_022119	AAGG	2	8	777510	777517	50 %	0 %	50 %	0 %	532424594
15505	NC_022119	AAG	2	6	777572	777577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424594
15506	NC_022119	TGT	2	6	777616	777621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424594
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15509	NC_022119	CAC	2	6	777664	777669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424594
15510	NC_022119	TCA	2	6	777672	777677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424594
15511	NC_022119	GCA	2	6	777684	777689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424594
15512	NC_022119	CTT	2	6	777697	777702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424594
15513	NC_022119	T	6	6	777719	777724	0 %	100 %	0 %	0 %	532424594
15514	NC_022119	TAAA	2	8	777752	777759	75 %	25 %	0 %	0 %	532424594
15515	NC_022119	TCT	2	6	777768	777773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424594
15516	NC_022119	CTG	2	6	777830	777835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424594
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15518	NC_022119	CTT	2	6	777918	777923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424595
15519	NC_022119	AGA	2	6	777925	777930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424595
15520	NC_022119	CTT	2	6	777978	777983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424595
15521	NC_022119	CTT	2	6	778036	778041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424595
15522	NC_022119	ATC	2	6	778099	778104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424595
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15525	NC_022119	GTT	2	6	778273	778278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424595
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15528	NC_022119	CAATT	2	10	778354	778363	40 %	40 %	0 %	20 %	532424595
15529	NC_022119	ACC	2	6	778414	778419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424595
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15533	NC_022119	TC	3	6	778516	778521	0 %	50 %	0 %	50 %	532424595
15534	NC_022119	T	6	6	778533	778538	0 %	100 %	0 %	0 %	532424595
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15537	NC_022119	AGTG	2	8	778696	778703	25 %	25 %	50 %	0 %	532424595
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15539	NC_022119	A	7	7	778988	778994	100 %	0 %	0 %	0 %	532424847
15540	NC_022119	CCGA	2	8	779001	779008	25 %	0 %	25 %	50 %	532424847
15541	NC_022119	TTA	2	6	779035	779040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424847
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15544	NC_022119	GTT	2	6	779180	779185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424596
15545	NC_022119	GTA	2	6	779321	779326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424596
15546	NC_022119	TAGCTG	2	12	779334	779345	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532424596
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15548	NC_022119	CTTG	2	8	779450	779457	0 %	50 %	25 %	25 %	532424596
15549	NC_022119	GCA	2	6	779498	779503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424596
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15551	NC_022119	TTA	2	6	779558	779563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424596
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15556	NC_022119	CAA	2	6	779721	779726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424596
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15558	NC_022119	AAG	2	6	779814	779819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424596
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15561	NC_022119	TGGA	2	8	779973	779980	25 %	25 %	50 %	0 %	532424596
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15593	NC_022119	T	6	6	782161	782166	0 %	100 %	0 %	0 %	532424597
15594	NC_022119	ATTTT	2	10	782169	782178	20 %	80 %	0 %	0 %	532424597
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15598	NC_022119	ATCT	2	8	782457	782464	25 %	50 %	0 %	25 %	532424597
15599	NC_022119	TTA	2	6	782537	782542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424597
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15601	NC_022119	CA	3	6	782680	782685	50 %	0 %	0 %	50 %	532424597
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15608	NC_022119	T	6	6	782821	782826	0 %	100 %	0 %	0 %	532424597
15609	NC_022119	CCT	2	6	782843	782848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424597
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15745	NC_022119	GCT	2	6	788481	788486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424601
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15749	NC_022119	TTA	2	6	788685	788690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424601
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15986	NC_022119	AGA	2	6	800937	800942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424613
15987	NC_022119	GTA	2	6	800956	800961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424613
15988	NC_022119	GAG	3	9	801053	801061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424613
15989	NC_022119	TAG	2	6	801113	801118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424613
15990	NC_022119	CTT	2	6	801203	801208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424613
15991	NC_022119	TCT	2	6	801286	801291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424613
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15993	NC_022119	GGAT	2	8	801359	801366	25 %	25 %	50 %	0 %	532424613
15994	NC_022119	TCA	2	6	801430	801435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424613
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15997	NC_022119	TA	3	6	801543	801548	50 %	50 %	0 %	0 %	532424613
15998	NC_022119	CAG	2	6	801647	801652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424613
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16000	NC_022119	TGC	2	6	801735	801740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424613

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