MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_022119	TAC	2	6	726508	726513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424552
14502	NC_022119	T	6	6	726569	726574	0 %	100 %	0 %	0 %	532424552
14503	NC_022119	AGA	2	6	726625	726630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424552
14504	NC_022119	CTTA	2	8	726702	726709	25 %	50 %	0 %	25 %	532424552
14505	NC_022119	TTGAA	2	10	726726	726735	40 %	40 %	20 %	0 %	532424552
14506	NC_022119	TTCG	2	8	726762	726769	0 %	50 %	25 %	25 %	532424552
14507	NC_022119	T	6	6	726836	726841	0 %	100 %	0 %	0 %	532424552
14508	NC_022119	AGA	2	6	726883	726888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424552
14509	NC_022119	TTG	2	6	727036	727041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424553
14510	NC_022119	ATT	2	6	727050	727055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424553
14511	NC_022119	TTCG	2	8	727104	727111	0 %	50 %	25 %	25 %	532424553
14512	NC_022119	GT	3	6	727113	727118	0 %	50 %	50 %	0 %	532424553
14513	NC_022119	TTC	2	6	727126	727131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424553
14514	NC_022119	TTG	2	6	727162	727167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424553
14515	NC_022119	GAAA	2	8	727190	727197	75 %	0 %	25 %	0 %	532424553
14516	NC_022119	A	6	6	727195	727200	100 %	0 %	0 %	0 %	532424553
14517	NC_022119	TTCT	2	8	727222	727229	0 %	75 %	0 %	25 %	532424553
14518	NC_022119	TTG	2	6	727343	727348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424553
14519	NC_022119	TGT	2	6	727391	727396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424553
14520	NC_022119	GTT	2	6	727407	727412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424553
14521	NC_022119	TGG	2	6	727420	727425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424553
14522	NC_022119	TTG	2	6	727429	727434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424553
14523	NC_022119	TCA	2	6	727459	727464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424553
14524	NC_022119	GTG	2	6	727501	727506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424553
14525	NC_022119	TTGT	2	8	727678	727685	0 %	75 %	25 %	0 %	532424553
14526	NC_022119	TTC	2	6	727846	727851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424553
14527	NC_022119	T	6	6	727922	727927	0 %	100 %	0 %	0 %	532424553
14528	NC_022119	ACC	2	6	727934	727939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424553
14529	NC_022119	AGT	2	6	727990	727995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424553
14530	NC_022119	ATG	2	6	728087	728092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424554
14531	NC_022119	GCT	2	6	728119	728124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424554
14532	NC_022119	TC	3	6	728136	728141	0 %	50 %	0 %	50 %	532424554
14533	NC_022119	TCTA	2	8	728145	728152	25 %	50 %	0 %	25 %	532424554
14534	NC_022119	AAGA	2	8	728215	728222	75 %	0 %	25 %	0 %	532424554
14535	NC_022119	GAT	2	6	728235	728240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424554
14536	NC_022119	A	6	6	728241	728246	100 %	0 %	0 %	0 %	532424554
14537	NC_022119	A	6	6	728262	728267	100 %	0 %	0 %	0 %	532424554
14538	NC_022119	CGA	2	6	728273	728278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424554
14539	NC_022119	CTT	3	9	728297	728305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424554
14540	NC_022119	GTA	2	6	728306	728311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424554
14541	NC_022119	GAA	2	6	728371	728376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424554
14542	NC_022119	T	6	6	728408	728413	0 %	100 %	0 %	0 %	532424554
14543	NC_022119	AAT	2	6	728418	728423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424554
14544	NC_022119	AAT	2	6	728455	728460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424554
14545	NC_022119	TTC	2	6	728481	728486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424554
14546	NC_022119	AGC	2	6	728493	728498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424554
14547	NC_022119	AG	3	6	728548	728553	50 %	0 %	50 %	0 %	532424554
14548	NC_022119	AG	3	6	728569	728574	50 %	0 %	50 %	0 %	532424554
14549	NC_022119	AGA	2	6	728622	728627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424554
14550	NC_022119	TGTT	2	8	728673	728680	0 %	75 %	25 %	0 %	532424554
14551	NC_022119	AG	3	6	728707	728712	50 %	0 %	50 %	0 %	532424554
14552	NC_022119	AGG	2	6	728718	728723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424554
14553	NC_022119	CTA	2	6	728771	728776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424554
14554	NC_022119	ATG	2	6	728790	728795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424554
14555	NC_022119	T	7	7	728832	728838	0 %	100 %	0 %	0 %	532424554
14556	NC_022119	AATA	2	8	728874	728881	75 %	25 %	0 %	0 %	532424554
14557	NC_022119	T	6	6	728886	728891	0 %	100 %	0 %	0 %	532424554
14558	NC_022119	ACAT	2	8	728908	728915	50 %	25 %	0 %	25 %	532424554
14559	NC_022119	TAC	2	6	728973	728978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424554
14560	NC_022119	CGA	2	6	729045	729050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424554
14561	NC_022119	GAAA	2	8	729051	729058	75 %	0 %	25 %	0 %	532424554
14562	NC_022119	TCA	2	6	729064	729069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424554
14563	NC_022119	TGA	2	6	729092	729097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424554
14564	NC_022119	AAT	2	6	729196	729201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424554
14565	NC_022119	AGA	2	6	729303	729308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424554
14566	NC_022119	TCA	2	6	729362	729367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424554
14567	NC_022119	TTG	2	6	729384	729389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424554
14568	NC_022119	TAG	2	6	729417	729422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424554
14569	NC_022119	ATGGA	2	10	729554	729563	40 %	20 %	40 %	0 %	532424554
14570	NC_022119	AAG	2	6	729581	729586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424554
14571	NC_022119	TCT	2	6	729610	729615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424554
14572	NC_022119	GAG	2	6	729628	729633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424554
14573	NC_022119	CTT	2	6	729812	729817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424554
14574	NC_022119	TTGC	2	8	729833	729840	0 %	50 %	25 %	25 %	532424554
14575	NC_022119	GAC	2	6	730023	730028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424554
14576	NC_022119	AGA	2	6	730045	730050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424554
14577	NC_022119	TCA	2	6	730072	730077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424554
14578	NC_022119	TGT	2	6	730111	730116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424554
14579	NC_022119	A	6	6	730192	730197	100 %	0 %	0 %	0 %	532424554
14580	NC_022119	T	6	6	730227	730232	0 %	100 %	0 %	0 %	532424554
14581	NC_022119	TCC	2	6	730246	730251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424554
14582	NC_022119	TTG	2	6	730314	730319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424554
14583	NC_022119	AG	3	6	730347	730352	50 %	0 %	50 %	0 %	532424554
14584	NC_022119	AG	3	6	730372	730377	50 %	0 %	50 %	0 %	532424554
14585	NC_022119	GAGAGG	2	12	730395	730406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424554
14586	NC_022119	AGT	2	6	730504	730509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424554
14587	NC_022119	CT	3	6	730510	730515	0 %	50 %	0 %	50 %	532424554
14588	NC_022119	GTA	2	6	730537	730542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424554
14589	NC_022119	TGA	2	6	730549	730554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424554
14590	NC_022119	TAAGA	2	10	730555	730564	60 %	20 %	20 %	0 %	532424554
14591	NC_022119	GA	4	8	730580	730587	50 %	0 %	50 %	0 %	532424554
14592	NC_022119	AGT	2	6	730613	730618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424554
14593	NC_022119	TGT	2	6	730630	730635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424554
14594	NC_022119	TTCAT	2	10	730738	730747	20 %	60 %	0 %	20 %	532424554
14595	NC_022119	GA	3	6	730841	730846	50 %	0 %	50 %	0 %	532424554
14596	NC_022119	GCTT	2	8	730881	730888	0 %	50 %	25 %	25 %	532424554
14597	NC_022119	TAA	2	6	730971	730976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424554
14598	NC_022119	GAA	2	6	730982	730987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424554
14599	NC_022119	A	6	6	731069	731074	100 %	0 %	0 %	0 %	532424554
14600	NC_022119	TTG	2	6	731098	731103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424554
14601	NC_022119	AG	3	6	731121	731126	50 %	0 %	50 %	0 %	532424555
14602	NC_022119	AAG	2	6	731128	731133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424555
14603	NC_022119	AG	3	6	731152	731157	50 %	0 %	50 %	0 %	532424555
14604	NC_022119	TCT	2	6	731171	731176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424555
14605	NC_022119	ACC	2	6	731193	731198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424555
14606	NC_022119	ACT	2	6	731203	731208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424555
14607	NC_022119	TCT	2	6	731219	731224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424555
14608	NC_022119	T	7	7	731239	731245	0 %	100 %	0 %	0 %	532424555
14609	NC_022119	T	7	7	731268	731274	0 %	100 %	0 %	0 %	532424555
14610	NC_022119	GAAG	2	8	731297	731304	50 %	0 %	50 %	0 %	532424555
14611	NC_022119	GGA	2	6	731368	731373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424555
14612	NC_022119	AGG	2	6	731377	731382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424555
14613	NC_022119	GGA	2	6	731415	731420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424555
14614	NC_022119	CTT	2	6	731427	731432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424555
14615	NC_022119	GTA	2	6	731454	731459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424555
14616	NC_022119	TAGG	2	8	731470	731477	25 %	25 %	50 %	0 %	532424555
14617	NC_022119	T	6	6	731621	731626	0 %	100 %	0 %	0 %	532424555
14618	NC_022119	GA	3	6	731632	731637	50 %	0 %	50 %	0 %	532424555
14619	NC_022119	TTG	2	6	731656	731661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424555
14620	NC_022119	ACA	2	6	731705	731710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424555
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14986	NC_022119	TGA	2	6	749414	749419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424567
14987	NC_022119	GAG	2	6	749470	749475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424567
14988	NC_022119	TCC	2	6	749537	749542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424567
14989	NC_022119	CTA	2	6	749614	749619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424567
14990	NC_022119	AGCG	2	8	749654	749661	25 %	0 %	50 %	25 %	532424567
14991	NC_022119	AAG	2	6	749710	749715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424567
14992	NC_022119	AGC	2	6	749747	749752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424567
14993	NC_022119	AAG	2	6	749755	749760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424567
14994	NC_022119	T	6	6	749807	749812	0 %	100 %	0 %	0 %	532424567
14995	NC_022119	GTT	3	9	749825	749833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424567
14996	NC_022119	ATC	2	6	749874	749879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424567
14997	NC_022119	CAA	2	6	749946	749951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424567
14998	NC_022119	GA	3	6	749968	749973	50 %	0 %	50 %	0 %	532424567
14999	NC_022119	TAT	2	6	749997	750002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424567
15000	NC_022119	ATGTC	2	10	750013	750022	20 %	40 %	20 %	20 %	532424567

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