MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022119	CAG	2	6	651378	651383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424494
13002	NC_022119	GCC	2	6	651441	651446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424494
13003	NC_022119	T	6	6	651463	651468	0 %	100 %	0 %	0 %	532424494
13004	NC_022119	AGCTC	2	10	651533	651542	20 %	20 %	20 %	40 %	532424495
13005	NC_022119	A	6	6	651581	651586	100 %	0 %	0 %	0 %	532424495
13006	NC_022119	CTTC	2	8	651840	651847	0 %	50 %	0 %	50 %	532424495
13007	NC_022119	GTT	2	6	651873	651878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424495
13008	NC_022119	GCAA	2	8	651935	651942	50 %	0 %	25 %	25 %	532424495
13009	NC_022119	CAA	3	9	651969	651977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424495
13010	NC_022119	CCAAGC	2	12	652049	652060	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532424495
13011	NC_022119	CAG	2	6	652077	652082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424495
13012	NC_022119	TAG	2	6	652108	652113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424495
13013	NC_022119	AGG	3	9	652130	652138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424495
13014	NC_022119	GCA	2	6	652206	652211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424495
13015	NC_022119	GAT	2	6	652257	652262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424495
13016	NC_022119	AGC	2	6	652307	652312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424495
13017	NC_022119	CT	3	6	652377	652382	0 %	50 %	0 %	50 %	532424495
13018	NC_022119	AGG	2	6	652403	652408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424495
13019	NC_022119	ATT	2	6	652409	652414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424495
13020	NC_022119	TCT	2	6	652521	652526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424495
13021	NC_022119	TCG	2	6	652579	652584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424495
13022	NC_022119	CAA	2	6	652701	652706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424495
13023	NC_022119	CTCTG	2	10	652769	652778	0 %	40 %	20 %	40 %	532424495
13024	NC_022119	CTTT	2	8	652810	652817	0 %	75 %	0 %	25 %	532424495
13025	NC_022119	AGG	2	6	652976	652981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424496
13026	NC_022119	AAG	2	6	652994	652999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424496
13027	NC_022119	CAAC	2	8	653000	653007	50 %	0 %	0 %	50 %	532424496
13028	NC_022119	A	6	6	653009	653014	100 %	0 %	0 %	0 %	532424496
13029	NC_022119	GAA	2	6	653061	653066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424496
13030	NC_022119	CAAAT	2	10	653100	653109	60 %	20 %	0 %	20 %	532424496
13031	NC_022119	A	6	6	653113	653118	100 %	0 %	0 %	0 %	532424496
13032	NC_022119	CACAGG	2	12	653162	653173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424496
13033	NC_022119	CAG	2	6	653191	653196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424496
13034	NC_022119	ACA	2	6	653209	653214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424496
13035	NC_022119	AAG	2	6	653305	653310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424496
13036	NC_022119	GCT	2	6	653322	653327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424496
13037	NC_022119	CAG	2	6	653393	653398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424496
13038	NC_022119	CT	3	6	653459	653464	0 %	50 %	0 %	50 %	532424496
13039	NC_022119	ATAA	2	8	653510	653517	75 %	25 %	0 %	0 %	532424496
13040	NC_022119	ATA	2	6	653650	653655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424496
13041	NC_022119	ACT	2	6	653670	653675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424496
13042	NC_022119	AC	3	6	653815	653820	50 %	0 %	0 %	50 %	532424496
13043	NC_022119	AAC	2	6	653844	653849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424496
13044	NC_022119	CCA	2	6	653860	653865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424496
13045	NC_022119	T	6	6	654150	654155	0 %	100 %	0 %	0 %	532424497
13046	NC_022119	AAG	2	6	654193	654198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424497
13047	NC_022119	TTA	2	6	654277	654282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424497
13048	NC_022119	CCA	2	6	654304	654309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424497
13049	NC_022119	GAT	2	6	654348	654353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424497
13050	NC_022119	AC	3	6	654377	654382	50 %	0 %	0 %	50 %	532424497
13051	NC_022119	CTA	2	6	654467	654472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424497
13052	NC_022119	GAA	2	6	654498	654503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424497
13053	NC_022119	AGA	2	6	654542	654547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424497
13054	NC_022119	GCT	2	6	654588	654593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424497
13055	NC_022119	GAA	2	6	654648	654653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424497
13056	NC_022119	CCTT	2	8	654710	654717	0 %	50 %	0 %	50 %	532424497
13057	NC_022119	TCT	2	6	654756	654761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424497
13058	NC_022119	AT	3	6	654804	654809	50 %	50 %	0 %	0 %	532424497
13059	NC_022119	TCA	2	6	654851	654856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424497
13060	NC_022119	AGA	2	6	654860	654865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424497
13061	NC_022119	A	7	7	654869	654875	100 %	0 %	0 %	0 %	532424497
13062	NC_022119	TC	3	6	654913	654918	0 %	50 %	0 %	50 %	532424497
13063	NC_022119	CTG	2	6	654931	654936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424497
13064	NC_022119	T	6	6	654944	654949	0 %	100 %	0 %	0 %	532424497
13065	NC_022119	GTT	2	6	654966	654971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424497
13066	NC_022119	ACT	2	6	654988	654993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424497
13067	NC_022119	TCA	2	6	655004	655009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424497
13068	NC_022119	AG	3	6	655053	655058	50 %	0 %	50 %	0 %	532424497
13069	NC_022119	GAA	2	6	655122	655127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424497
13070	NC_022119	GAT	2	6	655443	655448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424497
13071	NC_022119	GA	3	6	655657	655662	50 %	0 %	50 %	0 %	532424497
13072	NC_022119	TAT	2	6	655673	655678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424497
13073	NC_022119	TTTG	2	8	655691	655698	0 %	75 %	25 %	0 %	532424497
13074	NC_022119	ATT	2	6	655782	655787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424497
13075	NC_022119	GT	3	6	655993	655998	0 %	50 %	50 %	0 %	532424497
13076	NC_022119	TC	3	6	656023	656028	0 %	50 %	0 %	50 %	532424497
13077	NC_022119	TCCT	2	8	656066	656073	0 %	50 %	0 %	50 %	532424497
13078	NC_022119	GGC	2	6	656559	656564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424498
13079	NC_022119	GTT	2	6	656709	656714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424498
13080	NC_022119	A	7	7	656725	656731	100 %	0 %	0 %	0 %	532424498
13081	NC_022119	AGA	2	6	656735	656740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424498
13082	NC_022119	TTGG	2	8	656792	656799	0 %	50 %	50 %	0 %	532424498
13083	NC_022119	GCT	2	6	656826	656831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424498
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13085	NC_022119	AC	3	6	656905	656910	50 %	0 %	0 %	50 %	532424498
13086	NC_022119	CTT	2	6	656914	656919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424498
13087	NC_022119	GCT	2	6	656949	656954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424498
13088	NC_022119	A	6	6	657127	657132	100 %	0 %	0 %	0 %	532424498
13089	NC_022119	CTT	2	6	657147	657152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424498
13090	NC_022119	GAA	2	6	657264	657269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424498
13091	NC_022119	CT	3	6	657430	657435	0 %	50 %	0 %	50 %	532424499
13092	NC_022119	AGA	2	6	657468	657473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424499
13093	NC_022119	CAA	2	6	657511	657516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424499
13094	NC_022119	TCA	3	9	657549	657557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424499
13095	NC_022119	A	6	6	657586	657591	100 %	0 %	0 %	0 %	532424499
13096	NC_022119	ATT	2	6	657600	657605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424499
13097	NC_022119	TTA	2	6	657687	657692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424499
13098	NC_022119	A	6	6	657793	657798	100 %	0 %	0 %	0 %	532424499
13099	NC_022119	ATC	2	6	657894	657899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424499
13100	NC_022119	CAA	2	6	657907	657912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424499
13101	NC_022119	CTTTT	2	10	657915	657924	0 %	80 %	0 %	20 %	532424499
13102	NC_022119	T	7	7	657921	657927	0 %	100 %	0 %	0 %	532424499
13103	NC_022119	ATT	2	6	657942	657947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424499
13104	NC_022119	AAG	2	6	657971	657976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424499
13105	NC_022119	CTC	2	6	657979	657984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424499
13106	NC_022119	CTT	2	6	658030	658035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424499
13107	NC_022119	GAC	2	6	658060	658065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424499
13108	NC_022119	AAC	2	6	658091	658096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424499
13109	NC_022119	ACA	2	6	658201	658206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424500
13110	NC_022119	T	6	6	658219	658224	0 %	100 %	0 %	0 %	532424500
13111	NC_022119	GTT	2	6	658249	658254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424500
13112	NC_022119	ATG	2	6	658310	658315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424500
13113	NC_022119	TCA	2	6	658356	658361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424500
13114	NC_022119	CT	3	6	658418	658423	0 %	50 %	0 %	50 %	532424500
13115	NC_022119	A	7	7	658515	658521	100 %	0 %	0 %	0 %	532424500
13116	NC_022119	A	7	7	658533	658539	100 %	0 %	0 %	0 %	532424500
13117	NC_022119	AAG	2	6	658554	658559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424500
13118	NC_022119	GAA	2	6	658586	658591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424500
13119	NC_022119	A	9	9	658810	658818	100 %	0 %	0 %	0 %	532424501
13120	NC_022119	GTC	2	6	658886	658891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424501
13121	NC_022119	TTC	2	6	658924	658929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424501
13122	NC_022119	ACT	2	6	658954	658959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424501
13123	NC_022119	AGA	2	6	658971	658976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424501
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13125	NC_022119	GAA	2	6	659182	659187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424501
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13130	NC_022119	AGA	2	6	659652	659657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424501
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13134	NC_022119	TAAA	2	8	659841	659848	75 %	25 %	0 %	0 %	532424501
13135	NC_022119	A	6	6	659846	659851	100 %	0 %	0 %	0 %	532424501
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13142	NC_022119	TAC	2	6	660169	660174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424502
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13152	NC_022119	GAA	2	6	660676	660681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424502
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13154	NC_022119	GAA	2	6	660706	660711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424502
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13211	NC_022119	AATA	2	8	663462	663469	75 %	25 %	0 %	0 %	532424504
13212	NC_022119	CACG	2	8	663487	663494	25 %	0 %	25 %	50 %	532424504
13213	NC_022119	TG	3	6	663519	663524	0 %	50 %	50 %	0 %	532424504
13214	NC_022119	TAT	2	6	663530	663535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424504
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13216	NC_022119	TTTA	2	8	663626	663633	25 %	75 %	0 %	0 %	532424504
13217	NC_022119	ACA	2	6	663647	663652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424504
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13219	NC_022119	CTG	2	6	663721	663726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424504
13220	NC_022119	A	7	7	663797	663803	100 %	0 %	0 %	0 %	532424504
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13223	NC_022119	TATT	2	8	664023	664030	25 %	75 %	0 %	0 %	532424504
13224	NC_022119	CT	3	6	664057	664062	0 %	50 %	0 %	50 %	532424504
13225	NC_022119	TC	3	6	664079	664084	0 %	50 %	0 %	50 %	532424504
13226	NC_022119	CAT	2	6	664094	664099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424504
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13229	NC_022119	TAC	2	6	664210	664215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424504
13230	NC_022119	C	6	6	664217	664222	0 %	0 %	0 %	100 %	532424504
13231	NC_022119	AT	3	6	664295	664300	50 %	50 %	0 %	0 %	532424504
13232	NC_022119	CT	3	6	664304	664309	0 %	50 %	0 %	50 %	532424504
13233	NC_022119	GAA	2	6	664341	664346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424504
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13235	NC_022119	CGA	2	6	664374	664379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424504
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13238	NC_022119	ATG	2	6	664485	664490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424504
13239	NC_022119	TCG	2	6	664496	664501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424504
13240	NC_022119	CCAT	2	8	664511	664518	25 %	25 %	0 %	50 %	532424504
13241	NC_022119	ATC	2	6	664549	664554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424504
13242	NC_022119	A	7	7	664612	664618	100 %	0 %	0 %	0 %	532424504
13243	NC_022119	GAA	2	6	664662	664667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424504
13244	NC_022119	CAA	2	6	664671	664676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424504
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13247	NC_022119	TGCG	2	8	664844	664851	0 %	25 %	50 %	25 %	532424504
13248	NC_022119	TGAG	2	8	664891	664898	25 %	25 %	50 %	0 %	532424504
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13254	NC_022119	ACAG	2	8	664949	664956	50 %	0 %	25 %	25 %	532424504
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13271	NC_022119	AACA	2	8	666091	666098	75 %	0 %	0 %	25 %	532424505
13272	NC_022119	TCT	2	6	666111	666116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424505
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13274	NC_022119	CT	4	8	666209	666216	0 %	50 %	0 %	50 %	532424505
13275	NC_022119	CTT	2	6	666227	666232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424505
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13284	NC_022119	TC	3	6	666727	666732	0 %	50 %	0 %	50 %	532424505
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13350	NC_022119	AC	3	6	669568	669573	50 %	0 %	0 %	50 %	532424506
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13484	NC_022119	TCG	2	6	678294	678299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424512
13485	NC_022119	A	6	6	678370	678375	100 %	0 %	0 %	0 %	532424512
13486	NC_022119	A	6	6	678392	678397	100 %	0 %	0 %	0 %	532424512
13487	NC_022119	CAAA	2	8	678447	678454	75 %	0 %	0 %	25 %	532424512
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13489	NC_022119	A	6	6	678488	678493	100 %	0 %	0 %	0 %	532424512
13490	NC_022119	A	6	6	678506	678511	100 %	0 %	0 %	0 %	532424512
13491	NC_022119	CAG	2	6	678650	678655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424512
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