MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022119	TCT	2	6	627841	627846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424471
12502	NC_022119	ATT	2	6	627870	627875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424471
12503	NC_022119	AGA	2	6	627941	627946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424471
12504	NC_022119	TGC	2	6	628001	628006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424471
12505	NC_022119	TGG	2	6	628059	628064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424471
12506	NC_022119	A	7	7	628114	628120	100 %	0 %	0 %	0 %	532424471
12507	NC_022119	ACT	2	6	628174	628179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424471
12508	NC_022119	A	7	7	628188	628194	100 %	0 %	0 %	0 %	532424471
12509	NC_022119	CT	3	6	628275	628280	0 %	50 %	0 %	50 %	532424471
12510	NC_022119	AAG	2	6	628315	628320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424471
12511	NC_022119	A	7	7	628336	628342	100 %	0 %	0 %	0 %	532424471
12512	NC_022119	AAG	2	6	628528	628533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424472
12513	NC_022119	GAAG	2	8	628563	628570	50 %	0 %	50 %	0 %	532424472
12514	NC_022119	TCC	2	6	628622	628627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424472
12515	NC_022119	TCT	2	6	628647	628652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424472
12516	NC_022119	A	8	8	628683	628690	100 %	0 %	0 %	0 %	532424472
12517	NC_022119	GAG	2	6	628761	628766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424472
12518	NC_022119	CT	3	6	628825	628830	0 %	50 %	0 %	50 %	532424472
12519	NC_022119	TC	3	6	628898	628903	0 %	50 %	0 %	50 %	532424472
12520	NC_022119	TGCT	2	8	628948	628955	0 %	50 %	25 %	25 %	532424472
12521	NC_022119	CT	3	6	628970	628975	0 %	50 %	0 %	50 %	532424472
12522	NC_022119	AGG	2	6	629244	629249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424473
12523	NC_022119	GCA	2	6	629257	629262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424473
12524	NC_022119	AGGA	2	8	629458	629465	50 %	0 %	50 %	0 %	532424473
12525	NC_022119	GCA	2	6	629510	629515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424473
12526	NC_022119	TCT	2	6	629528	629533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424473
12527	NC_022119	A	6	6	629723	629728	100 %	0 %	0 %	0 %	532424473
12528	NC_022119	ATT	2	6	629734	629739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424473
12529	NC_022119	GGT	2	6	629743	629748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424473
12530	NC_022119	AAGC	2	8	629810	629817	50 %	0 %	25 %	25 %	532424473
12531	NC_022119	AAT	2	6	629836	629841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424473
12532	NC_022119	GAA	2	6	629968	629973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424473
12533	NC_022119	TGA	2	6	630051	630056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424473
12534	NC_022119	TCA	2	6	630159	630164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424473
12535	NC_022119	GCA	2	6	630175	630180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424473
12536	NC_022119	CAG	2	6	630278	630283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424473
12537	NC_022119	CAA	3	9	630286	630294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424473
12538	NC_022119	A	6	6	630293	630298	100 %	0 %	0 %	0 %	532424473
12539	NC_022119	ACT	2	6	630394	630399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424473
12540	NC_022119	CAG	2	6	630400	630405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424473
12541	NC_022119	TCA	2	6	630439	630444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424473
12542	NC_022119	GTT	2	6	630552	630557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424473
12543	NC_022119	GCT	2	6	630559	630564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424473
12544	NC_022119	A	6	6	630592	630597	100 %	0 %	0 %	0 %	532424473
12545	NC_022119	A	6	6	630624	630629	100 %	0 %	0 %	0 %	532424474
12546	NC_022119	ATA	2	6	630700	630705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424474
12547	NC_022119	TTG	2	6	630767	630772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424474
12548	NC_022119	GAA	2	6	630876	630881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424474
12549	NC_022119	TCA	2	6	630931	630936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424474
12550	NC_022119	TGA	2	6	630950	630955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424474
12551	NC_022119	GGA	2	6	630966	630971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424474
12552	NC_022119	ATT	2	6	630990	630995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424474
12553	NC_022119	CA	3	6	631005	631010	50 %	0 %	0 %	50 %	532424474
12554	NC_022119	TGC	2	6	631064	631069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424474
12555	NC_022119	CTAT	2	8	631099	631106	25 %	50 %	0 %	25 %	532424474
12556	NC_022119	ACTC	2	8	631133	631140	25 %	25 %	0 %	50 %	532424474
12557	NC_022119	CTAC	2	8	631159	631166	25 %	25 %	0 %	50 %	532424474
12558	NC_022119	ATG	2	6	631179	631184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424474
12559	NC_022119	TGA	2	6	631216	631221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424474
12560	NC_022119	ATT	2	6	631387	631392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424474
12561	NC_022119	TTTA	2	8	631422	631429	25 %	75 %	0 %	0 %	532424474
12562	NC_022119	TTCG	2	8	631440	631447	0 %	50 %	25 %	25 %	532424474
12563	NC_022119	AACCTC	2	12	631496	631507	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532424474
12564	NC_022119	T	6	6	631666	631671	0 %	100 %	0 %	0 %	532424475
12565	NC_022119	TCT	2	6	631685	631690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424475
12566	NC_022119	AC	3	6	631720	631725	50 %	0 %	0 %	50 %	532424475
12567	NC_022119	AGC	2	6	631803	631808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424475
12568	NC_022119	AGG	2	6	631818	631823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424475
12569	NC_022119	AAC	2	6	631832	631837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424475
12570	NC_022119	GCA	2	6	631858	631863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424475
12571	NC_022119	CTT	2	6	631927	631932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424475
12572	NC_022119	A	6	6	631976	631981	100 %	0 %	0 %	0 %	532424475
12573	NC_022119	AAG	2	6	631991	631996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424475
12574	NC_022119	TCG	2	6	632042	632047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424475
12575	NC_022119	GAA	3	9	632077	632085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424475
12576	NC_022119	TA	3	6	632111	632116	50 %	50 %	0 %	0 %	532424475
12577	NC_022119	TAT	2	6	632151	632156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424475
12578	NC_022119	CTT	2	6	632237	632242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424475
12579	NC_022119	AC	5	10	632416	632425	50 %	0 %	0 %	50 %	532424475
12580	NC_022119	CT	3	6	632482	632487	0 %	50 %	0 %	50 %	532424475
12581	NC_022119	AGC	2	6	632526	632531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424475
12582	NC_022119	AAC	2	6	632561	632566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424475
12583	NC_022119	AAG	2	6	632591	632596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424475
12584	NC_022119	TGA	2	6	632651	632656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424476
12585	NC_022119	TGA	2	6	632670	632675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424476
12586	NC_022119	TCT	2	6	632700	632705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424476
12587	NC_022119	CAT	2	6	632719	632724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424476
12588	NC_022119	TCCT	2	8	632781	632788	0 %	50 %	0 %	50 %	532424476
12589	NC_022119	TCCC	2	8	632813	632820	0 %	25 %	0 %	75 %	532424476
12590	NC_022119	ATT	2	6	632835	632840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424476
12591	NC_022119	ACT	2	6	632871	632876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424476
12592	NC_022119	GCT	2	6	632915	632920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424476
12593	NC_022119	CTAC	2	8	632937	632944	25 %	25 %	0 %	50 %	532424476
12594	NC_022119	TCC	2	6	632970	632975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424476
12595	NC_022119	AGA	2	6	632985	632990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424476
12596	NC_022119	ATGCT	2	10	633017	633026	20 %	40 %	20 %	20 %	532424476
12597	NC_022119	ACGGA	2	10	633151	633160	40 %	0 %	40 %	20 %	532424476
12598	NC_022119	ATT	2	6	633170	633175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424476
12599	NC_022119	GGA	2	6	633228	633233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424476
12600	NC_022119	CTT	2	6	633276	633281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424476
12601	NC_022119	AGA	2	6	633300	633305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424476
12602	NC_022119	GATA	2	8	633384	633391	50 %	25 %	25 %	0 %	532424476
12603	NC_022119	A	6	6	633597	633602	100 %	0 %	0 %	0 %	532424839
12604	NC_022119	CCTG	2	8	633688	633695	0 %	25 %	25 %	50 %	532424839
12605	NC_022119	GTC	2	6	633768	633773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424477
12606	NC_022119	TAA	2	6	633776	633781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424477
12607	NC_022119	A	6	6	633780	633785	100 %	0 %	0 %	0 %	532424477
12608	NC_022119	TC	3	6	633788	633793	0 %	50 %	0 %	50 %	532424477
12609	NC_022119	AAG	2	6	633847	633852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424477
12610	NC_022119	GAA	2	6	633882	633887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424477
12611	NC_022119	AGGA	2	8	633928	633935	50 %	0 %	50 %	0 %	532424477
12612	NC_022119	TTA	2	6	633967	633972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424477
12613	NC_022119	CCTC	2	8	634006	634013	0 %	25 %	0 %	75 %	532424477
12614	NC_022119	ATC	2	6	634044	634049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424477
12615	NC_022119	AAC	2	6	634171	634176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424477
12616	NC_022119	A	7	7	634190	634196	100 %	0 %	0 %	0 %	532424477
12617	NC_022119	CT	3	6	634224	634229	0 %	50 %	0 %	50 %	532424477
12618	NC_022119	A	6	6	634350	634355	100 %	0 %	0 %	0 %	532424477
12619	NC_022119	ACA	2	6	634371	634376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424477
12620	NC_022119	AAGA	2	8	634392	634399	75 %	0 %	25 %	0 %	532424477
12621	NC_022119	TGA	2	6	634423	634428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424478
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12623	NC_022119	GCA	2	6	634491	634496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424478
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12729	NC_022119	A	7	7	638885	638891	100 %	0 %	0 %	0 %	532424484
12730	NC_022119	ATGC	2	8	638901	638908	25 %	25 %	25 %	25 %	532424484
12731	NC_022119	ACGA	2	8	638941	638948	50 %	0 %	25 %	25 %	532424484
12732	NC_022119	GA	4	8	639000	639007	50 %	0 %	50 %	0 %	532424484
12733	NC_022119	AAG	2	6	639008	639013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424484
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12737	NC_022119	ATC	2	6	639111	639116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424485
12738	NC_022119	TCAT	2	8	639124	639131	25 %	50 %	0 %	25 %	532424485
12739	NC_022119	AAG	2	6	639138	639143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424485
12740	NC_022119	TCT	2	6	639145	639150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424485
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12742	NC_022119	TTTC	2	8	639171	639178	0 %	75 %	0 %	25 %	532424485
12743	NC_022119	CAC	2	6	639187	639192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424485
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12862	NC_022119	ATC	2	6	644881	644886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424489
12863	NC_022119	AAG	2	6	645079	645084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424489
12864	NC_022119	CA	3	6	645100	645105	50 %	0 %	0 %	50 %	532424489
12865	NC_022119	GCT	2	6	645114	645119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424489
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12882	NC_022119	CT	3	6	645964	645969	0 %	50 %	0 %	50 %	532424490
12883	NC_022119	ATGA	2	8	645991	645998	50 %	25 %	25 %	0 %	532424490
12884	NC_022119	TCCAT	2	10	646007	646016	20 %	40 %	0 %	40 %	532424490
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12890	NC_022119	TTC	2	6	646447	646452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424490
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12972	NC_022119	GCTTCT	2	12	650202	650213	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532424494
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12975	NC_022119	AGCT	2	8	650315	650322	25 %	25 %	25 %	25 %	532424494
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12982	NC_022119	AGC	2	6	650576	650581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424494
12983	NC_022119	A	7	7	650682	650688	100 %	0 %	0 %	0 %	532424494
12984	NC_022119	TGA	2	6	650746	650751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424494
12985	NC_022119	GTA	2	6	650784	650789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424494
12986	NC_022119	ATT	2	6	650795	650800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424494
12987	NC_022119	CTG	3	9	650827	650835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424494
12988	NC_022119	CAG	2	6	650845	650850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424494
12989	NC_022119	CAG	3	9	650866	650874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424494
12990	NC_022119	ACA	2	6	650898	650903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424494
12991	NC_022119	TAT	2	6	650954	650959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424494
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12993	NC_022119	GGC	2	6	651044	651049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424494
12994	NC_022119	TAGGAG	2	12	651169	651180	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532424494
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12996	NC_022119	AGAA	2	8	651241	651248	75 %	0 %	25 %	0 %	532424494
12997	NC_022119	AAG	2	6	651265	651270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424494
12998	NC_022119	ATG	2	6	651297	651302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424494
12999	NC_022119	CAA	2	6	651324	651329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424494
13000	NC_022119	AAAC	2	8	651348	651355	75 %	0 %	0 %	25 %	532424494

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