MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022119	CATT	2	8	603820	603827	25 %	50 %	0 %	25 %	532424452
12002	NC_022119	GAT	2	6	603847	603852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424452
12003	NC_022119	TGA	2	6	603858	603863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424452
12004	NC_022119	ATT	2	6	603899	603904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424452
12005	NC_022119	TATC	2	8	603940	603947	25 %	50 %	0 %	25 %	532424452
12006	NC_022119	ATG	2	6	603953	603958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424452
12007	NC_022119	CGA	2	6	604033	604038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424452
12008	NC_022119	CTG	2	6	604144	604149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424452
12009	NC_022119	GCTC	2	8	604155	604162	0 %	25 %	25 %	50 %	532424452
12010	NC_022119	AAT	2	6	604190	604195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424452
12011	NC_022119	TCA	2	6	604197	604202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424452
12012	NC_022119	GCA	2	6	604218	604223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424452
12013	NC_022119	T	6	6	604242	604247	0 %	100 %	0 %	0 %	532424452
12014	NC_022119	GTT	2	6	604260	604265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424452
12015	NC_022119	AAAC	2	8	604275	604282	75 %	0 %	0 %	25 %	532424452
12016	NC_022119	A	6	6	604328	604333	100 %	0 %	0 %	0 %	532424453
12017	NC_022119	TACT	2	8	604363	604370	25 %	50 %	0 %	25 %	532424453
12018	NC_022119	AGCG	2	8	604389	604396	25 %	0 %	50 %	25 %	532424453
12019	NC_022119	CA	3	6	604403	604408	50 %	0 %	0 %	50 %	532424453
12020	NC_022119	TCT	2	6	604470	604475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424453
12021	NC_022119	ATA	2	6	604687	604692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424453
12022	NC_022119	AAC	2	6	604694	604699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424453
12023	NC_022119	TAG	2	6	604729	604734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424453
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12025	NC_022119	TCC	2	6	604850	604855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424454
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12030	NC_022119	ATAG	2	8	605014	605021	50 %	25 %	25 %	0 %	532424454
12031	NC_022119	ATC	2	6	605074	605079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424454
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12033	NC_022119	CT	3	6	605119	605124	0 %	50 %	0 %	50 %	532424454
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12037	NC_022119	TCT	2	6	605289	605294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424454
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12041	NC_022119	TTTG	2	8	605454	605461	0 %	75 %	25 %	0 %	532424454
12042	NC_022119	T	7	7	606268	606274	0 %	100 %	0 %	0 %	532424455
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12047	NC_022119	CATA	2	8	606596	606603	50 %	25 %	0 %	25 %	532424456
12048	NC_022119	CT	4	8	606750	606757	0 %	50 %	0 %	50 %	532424456
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12054	NC_022119	AAT	2	6	606866	606871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424456
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12057	NC_022119	GAA	2	6	607001	607006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424456
12058	NC_022119	A	6	6	607017	607022	100 %	0 %	0 %	0 %	532424456
12059	NC_022119	TCG	2	6	607054	607059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424457
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12062	NC_022119	ATGT	2	8	607140	607147	25 %	50 %	25 %	0 %	532424457
12063	NC_022119	CTT	2	6	607166	607171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424457
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12067	NC_022119	TTA	2	6	607360	607365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424457
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12071	NC_022119	TTC	2	6	607768	607773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424457
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12073	NC_022119	CAT	2	6	608021	608026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424458
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12078	NC_022119	GAAC	2	8	608229	608236	50 %	0 %	25 %	25 %	532424458
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12082	NC_022119	CAA	2	6	608733	608738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424458
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12088	NC_022119	GATA	2	8	609070	609077	50 %	25 %	25 %	0 %	532424458
12089	NC_022119	AGT	2	6	609091	609096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424458
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12094	NC_022119	CA	3	6	609416	609421	50 %	0 %	0 %	50 %	532424458
12095	NC_022119	TGA	2	6	609456	609461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424458
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12097	NC_022119	CACC	2	8	609560	609567	25 %	0 %	0 %	75 %	532424458
12098	NC_022119	AACC	2	8	609639	609646	50 %	0 %	0 %	50 %	532424458
12099	NC_022119	TTG	2	6	609660	609665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424459
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12101	NC_022119	TTG	2	6	609759	609764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424459
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12104	NC_022119	CTGC	2	8	609872	609879	0 %	25 %	25 %	50 %	532424459
12105	NC_022119	CCAAAA	2	12	609973	609984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424459
12106	NC_022119	TCA	2	6	610021	610026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424459
12107	NC_022119	CGCC	2	8	610030	610037	0 %	0 %	25 %	75 %	532424459
12108	NC_022119	TAA	2	6	610099	610104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424459
12109	NC_022119	GATT	2	8	610127	610134	25 %	50 %	25 %	0 %	532424459
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12120	NC_022119	CAG	2	6	610595	610600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424459
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12122	NC_022119	AAC	2	6	610620	610625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424459
12123	NC_022119	TGC	2	6	610626	610631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424459
12124	NC_022119	T	7	7	610664	610670	0 %	100 %	0 %	0 %	532424459
12125	NC_022119	AAG	2	6	610675	610680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424459
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12131	NC_022119	T	8	8	610964	610971	0 %	100 %	0 %	0 %	532424838
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12195	NC_022119	GAA	2	6	613282	613287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424461
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12218	NC_022119	A	6	6	614365	614370	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
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12223	NC_022119	TC	3	6	614648	614653	0 %	50 %	0 %	50 %	532424461
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12233	NC_022119	CCT	2	6	615274	615279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424461
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12235	NC_022119	AG	4	8	615387	615394	50 %	0 %	50 %	0 %	532424461
12236	NC_022119	A	7	7	615395	615401	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
12237	NC_022119	A	6	6	615448	615453	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
12238	NC_022119	TGG	2	6	615479	615484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424461
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12240	NC_022119	A	8	8	615569	615576	100 %	0 %	0 %	0 %	532424461
12241	NC_022119	GCT	2	6	615580	615585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424461
12242	NC_022119	T	7	7	615601	615607	0 %	100 %	0 %	0 %	532424461
12243	NC_022119	TC	3	6	615647	615652	0 %	50 %	0 %	50 %	532424461
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12490	NC_022119	TAC	2	6	627481	627486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424471
12491	NC_022119	AAG	2	6	627512	627517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424471
12492	NC_022119	A	7	7	627521	627527	100 %	0 %	0 %	0 %	532424471
12493	NC_022119	TTC	2	6	627605	627610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424471
12494	NC_022119	A	6	6	627618	627623	100 %	0 %	0 %	0 %	532424471
12495	NC_022119	CAA	2	6	627639	627644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424471
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12499	NC_022119	CT	3	6	627812	627817	0 %	50 %	0 %	50 %	532424471
12500	NC_022119	GTT	2	6	627834	627839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424471

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