MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022119	GAA	2	6	553744	553749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424395
11002	NC_022119	GTT	2	6	553764	553769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424395
11003	NC_022119	CA	3	6	553908	553913	50 %	0 %	0 %	50 %	532424395
11004	NC_022119	TAAAA	2	10	553934	553943	80 %	20 %	0 %	0 %	532424395
11005	NC_022119	A	6	6	553940	553945	100 %	0 %	0 %	0 %	532424395
11006	NC_022119	A	6	6	553970	553975	100 %	0 %	0 %	0 %	532424395
11007	NC_022119	TAT	2	6	554152	554157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424395
11008	NC_022119	A	6	6	554165	554170	100 %	0 %	0 %	0 %	532424395
11009	NC_022119	CCTT	2	8	554207	554214	0 %	50 %	0 %	50 %	532424395
11010	NC_022119	TCT	2	6	554215	554220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424396
11011	NC_022119	AAG	2	6	554238	554243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424396
11012	NC_022119	CAC	2	6	554313	554318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424396
11013	NC_022119	CTC	2	6	554399	554404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424396
11014	NC_022119	AGT	2	6	554407	554412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424396
11015	NC_022119	AAG	2	6	554432	554437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424396
11016	NC_022119	TCT	2	6	554527	554532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424396
11017	NC_022119	GCA	2	6	554575	554580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424396
11018	NC_022119	AAG	2	6	554648	554653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424396
11019	NC_022119	TTTA	2	8	554727	554734	25 %	75 %	0 %	0 %	532424396
11020	NC_022119	AAT	2	6	554748	554753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424396
11021	NC_022119	CAA	2	6	554765	554770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424396
11022	NC_022119	AAAAT	2	10	554783	554792	80 %	20 %	0 %	0 %	532424396
11023	NC_022119	GAT	2	6	554813	554818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424396
11024	NC_022119	ATA	2	6	554867	554872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424396
11025	NC_022119	TCC	2	6	555035	555040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424396
11026	NC_022119	TTCA	2	8	555126	555133	25 %	50 %	0 %	25 %	532424396
11027	NC_022119	TCC	2	6	555190	555195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424396
11028	NC_022119	CAA	2	6	555209	555214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424396
11029	NC_022119	CCT	2	6	555229	555234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424396
11030	NC_022119	GAAT	2	8	555236	555243	50 %	25 %	25 %	0 %	532424396
11031	NC_022119	CTG	2	6	555248	555253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424396
11032	NC_022119	GAA	2	6	555280	555285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424396
11033	NC_022119	AGC	2	6	555301	555306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424396
11034	NC_022119	CTT	2	6	555375	555380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424396
11035	NC_022119	AAT	2	6	555396	555401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424396
11036	NC_022119	A	8	8	555453	555460	100 %	0 %	0 %	0 %	532424396
11037	NC_022119	CT	3	6	555483	555488	0 %	50 %	0 %	50 %	532424396
11038	NC_022119	TACG	2	8	555517	555524	25 %	25 %	25 %	25 %	532424396
11039	NC_022119	AGC	2	6	555591	555596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424396
11040	NC_022119	GAT	2	6	555621	555626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424396
11041	NC_022119	CTC	2	6	555686	555691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424396
11042	NC_022119	T	6	6	555777	555782	0 %	100 %	0 %	0 %	532424397
11043	NC_022119	TTA	2	6	555885	555890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424397
11044	NC_022119	GAT	2	6	555917	555922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424397
11045	NC_022119	TCT	2	6	556008	556013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424397
11046	NC_022119	AAT	2	6	556078	556083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424397
11047	NC_022119	TCGT	2	8	556156	556163	0 %	50 %	25 %	25 %	532424397
11048	NC_022119	TAG	2	6	556182	556187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424397
11049	NC_022119	CGGAAA	2	12	556194	556205	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532424397
11050	NC_022119	TGT	2	6	556327	556332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424397
11051	NC_022119	ATG	2	6	556333	556338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424397
11052	NC_022119	AG	3	6	556345	556350	50 %	0 %	50 %	0 %	532424397
11053	NC_022119	AAT	2	6	556397	556402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424397
11054	NC_022119	CGAT	2	8	556410	556417	25 %	25 %	25 %	25 %	532424397
11055	NC_022119	AAAGA	2	10	556454	556463	80 %	0 %	20 %	0 %	532424397
11056	NC_022119	TGA	2	6	556502	556507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424397
11057	NC_022119	T	7	7	556509	556515	0 %	100 %	0 %	0 %	532424397
11058	NC_022119	CCTCT	2	10	556525	556534	0 %	40 %	0 %	60 %	532424397
11059	NC_022119	AGC	2	6	556535	556540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424397
11060	NC_022119	AGG	2	6	556595	556600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424397
11061	NC_022119	AG	3	6	556642	556647	50 %	0 %	50 %	0 %	532424397
11062	NC_022119	ATATAG	2	12	556665	556676	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532424397
11063	NC_022119	TCA	2	6	556740	556745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424397
11064	NC_022119	GAA	2	6	556803	556808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424397
11065	NC_022119	TCT	2	6	556857	556862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424397
11066	NC_022119	TCT	2	6	556870	556875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424397
11067	NC_022119	T	6	6	556955	556960	0 %	100 %	0 %	0 %	532424397
11068	NC_022119	AACG	2	8	557002	557009	50 %	0 %	25 %	25 %	532424397
11069	NC_022119	CCGAA	2	10	557033	557042	40 %	0 %	20 %	40 %	532424397
11070	NC_022119	CAT	2	6	557128	557133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424397
11071	NC_022119	AAG	2	6	557157	557162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424397
11072	NC_022119	AAAT	2	8	557232	557239	75 %	25 %	0 %	0 %	532424397
11073	NC_022119	CTC	2	6	557312	557317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424397
11074	NC_022119	CCTT	2	8	557457	557464	0 %	50 %	0 %	50 %	532424397
11075	NC_022119	AAC	2	6	557466	557471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424397
11076	NC_022119	ATA	2	6	557506	557511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424397
11077	NC_022119	T	7	7	557592	557598	0 %	100 %	0 %	0 %	532424397
11078	NC_022119	ACA	2	6	557701	557706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424397
11079	NC_022119	TATC	2	8	557743	557750	25 %	50 %	0 %	25 %	532424397
11080	NC_022119	AAT	2	6	558009	558014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424833
11081	NC_022119	CTT	2	6	558038	558043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424833
11082	NC_022119	AAC	2	6	558063	558068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424833
11083	NC_022119	AGA	2	6	558072	558077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424833
11084	NC_022119	CTT	2	6	558080	558085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424833
11085	NC_022119	TCT	2	6	558088	558093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424833
11086	NC_022119	TCA	2	6	558100	558105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424833
11087	NC_022119	CAG	2	6	558119	558124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424833
11088	NC_022119	GCA	2	6	558127	558132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424833
11089	NC_022119	T	6	6	558159	558164	0 %	100 %	0 %	0 %	532424833
11090	NC_022119	TG	3	6	558469	558474	0 %	50 %	50 %	0 %	532424398
11091	NC_022119	TAC	2	6	558546	558551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424398
11092	NC_022119	GAAA	2	8	558569	558576	75 %	0 %	25 %	0 %	532424398
11093	NC_022119	ATA	2	6	558623	558628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424398
11094	NC_022119	TG	3	6	558636	558641	0 %	50 %	50 %	0 %	532424398
11095	NC_022119	AGG	2	6	558648	558653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424398
11096	NC_022119	GAA	2	6	558685	558690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424398
11097	NC_022119	CT	3	6	558729	558734	0 %	50 %	0 %	50 %	532424398
11098	NC_022119	TGA	2	6	558751	558756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424398
11099	NC_022119	A	6	6	558784	558789	100 %	0 %	0 %	0 %	532424398
11100	NC_022119	GAA	2	6	558890	558895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424398
11101	NC_022119	TG	3	6	558907	558912	0 %	50 %	50 %	0 %	532424398
11102	NC_022119	AG	3	6	559006	559011	50 %	0 %	50 %	0 %	532424398
11103	NC_022119	TCT	2	6	559119	559124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424834
11104	NC_022119	ATA	2	6	559149	559154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424834
11105	NC_022119	TTC	2	6	559172	559177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424834
11106	NC_022119	CTG	2	6	559189	559194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424834
11107	NC_022119	GAG	2	6	559224	559229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424834
11108	NC_022119	CTG	2	6	559272	559277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424399
11109	NC_022119	AAG	2	6	559463	559468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424399
11110	NC_022119	GAG	2	6	559546	559551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424399
11111	NC_022119	AAT	2	6	559594	559599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424399
11112	NC_022119	CTC	2	6	559603	559608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424399
11113	NC_022119	ACC	2	6	559673	559678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424399
11114	NC_022119	GCATAG	2	12	559699	559710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532424399
11115	NC_022119	AGC	2	6	559742	559747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424399
11116	NC_022119	AAC	2	6	559811	559816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424399
11117	NC_022119	GAAA	2	8	559827	559834	75 %	0 %	25 %	0 %	532424399
11118	NC_022119	ACA	2	6	559845	559850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424399
11119	NC_022119	AAC	2	6	559862	559867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424399
11120	NC_022119	AAG	2	6	559873	559878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424399
11121	NC_022119	T	6	6	559884	559889	0 %	100 %	0 %	0 %	532424399
11122	NC_022119	ACC	2	6	560167	560172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424835
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11125	NC_022119	T	8	8	560246	560253	0 %	100 %	0 %	0 %	532424835
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11227	NC_022119	T	6	6	564874	564879	0 %	100 %	0 %	0 %	532424405
11228	NC_022119	CCCA	2	8	564888	564895	25 %	0 %	0 %	75 %	532424405
11229	NC_022119	CTTG	2	8	564981	564988	0 %	50 %	25 %	25 %	532424405
11230	NC_022119	GAT	2	6	565104	565109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424406
11231	NC_022119	AAC	2	6	565122	565127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424406
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11234	NC_022119	CAT	2	6	565287	565292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424406
11235	NC_022119	CA	3	6	565385	565390	50 %	0 %	0 %	50 %	532424406
11236	NC_022119	AAT	2	6	565419	565424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424406
11237	NC_022119	GAT	2	6	565436	565441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424406
11238	NC_022119	C	6	6	565461	565466	0 %	0 %	0 %	100 %	532424406
11239	NC_022119	TCA	2	6	565468	565473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424406
11240	NC_022119	TGT	2	6	565493	565498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424406
11241	NC_022119	TAA	2	6	565534	565539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424406
11242	NC_022119	CGT	2	6	565571	565576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424406
11243	NC_022119	ATC	2	6	565635	565640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424406
11244	NC_022119	TCT	2	6	565648	565653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424406
11245	NC_022119	T	6	6	565740	565745	0 %	100 %	0 %	0 %	532424406
11246	NC_022119	ATCA	2	8	565809	565816	50 %	25 %	0 %	25 %	532424406
11247	NC_022119	CTA	2	6	565922	565927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424406
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11254	NC_022119	CGTC	2	8	566370	566377	0 %	25 %	25 %	50 %	532424406
11255	NC_022119	CCA	2	6	566397	566402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424406
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11265	NC_022119	TCC	2	6	567164	567169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424408
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11304	NC_022119	GCT	3	9	569354	569362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424410
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11344	NC_022119	AACCC	2	10	571569	571578	40 %	0 %	0 %	60 %	532424411
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11346	NC_022119	TGAT	2	8	571646	571653	25 %	50 %	25 %	0 %	532424411
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11349	NC_022119	GCTT	2	8	571679	571686	0 %	50 %	25 %	25 %	532424411
11350	NC_022119	AATA	2	8	571690	571697	75 %	25 %	0 %	0 %	532424411
11351	NC_022119	AAC	2	6	571753	571758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424411
11352	NC_022119	GAA	2	6	571829	571834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424411
11353	NC_022119	CTT	2	6	571905	571910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424411
11354	NC_022119	ATA	2	6	571999	572004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424411
11355	NC_022119	TCC	2	6	572005	572010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424411
11356	NC_022119	TTC	2	6	572060	572065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424411
11357	NC_022119	AG	3	6	572071	572076	50 %	0 %	50 %	0 %	532424411
11358	NC_022119	CAC	2	6	572109	572114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424411
11359	NC_022119	ATA	2	6	572222	572227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424411
11360	NC_022119	ATCA	2	8	572239	572246	50 %	25 %	0 %	25 %	532424411
11361	NC_022119	AAT	2	6	572251	572256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424411
11362	NC_022119	AAC	2	6	572281	572286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424411
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