MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022119	TAA	2	6	530338	530343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424375
10502	NC_022119	TCGT	2	8	530344	530351	0 %	50 %	25 %	25 %	532424375
10503	NC_022119	AGGGT	2	10	530402	530411	20 %	20 %	60 %	0 %	532424375
10504	NC_022119	TG	3	6	530419	530424	0 %	50 %	50 %	0 %	532424375
10505	NC_022119	CAA	2	6	530428	530433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424375
10506	NC_022119	TCA	2	6	530463	530468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424375
10507	NC_022119	CTT	2	6	530492	530497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424375
10508	NC_022119	ACG	2	6	530579	530584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424375
10509	NC_022119	AAC	2	6	530586	530591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424375
10510	NC_022119	GGA	2	6	530637	530642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424375
10511	NC_022119	AGG	2	6	530800	530805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424375
10512	NC_022119	CAT	2	6	531157	531162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424830
10513	NC_022119	CTT	2	6	531202	531207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424830
10514	NC_022119	CTA	2	6	531214	531219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424830
10515	NC_022119	ACA	2	6	531252	531257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424830
10516	NC_022119	TCT	2	6	531273	531278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424830
10517	NC_022119	GA	3	6	531292	531297	50 %	0 %	50 %	0 %	532424830
10518	NC_022119	GTA	2	6	531300	531305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424830
10519	NC_022119	ACTGTA	2	12	531333	531344	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532424830
10520	NC_022119	CTT	2	6	531355	531360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424830
10521	NC_022119	CA	3	6	531362	531367	50 %	0 %	0 %	50 %	532424830
10522	NC_022119	AGCCAC	2	12	531368	531379	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532424830
10523	NC_022119	TCA	2	6	531459	531464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424830
10524	NC_022119	CAA	2	6	531521	531526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424830
10525	NC_022119	GTAG	2	8	531537	531544	25 %	25 %	50 %	0 %	532424830
10526	NC_022119	AAC	2	6	531546	531551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424830
10527	NC_022119	TGC	3	9	531578	531586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10528	NC_022119	ACT	2	6	531606	531611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424830
10529	NC_022119	TGG	2	6	531632	531637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424830
10530	NC_022119	GTG	3	9	531667	531675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424830
10531	NC_022119	AGC	4	12	531677	531688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10532	NC_022119	CTC	2	6	531707	531712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424830
10533	NC_022119	TGC	3	9	531731	531739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10534	NC_022119	ACT	2	6	531759	531764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424830
10535	NC_022119	TGG	2	6	531785	531790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424830
10536	NC_022119	GCA	5	15	531828	531842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10537	NC_022119	CTC	2	6	531860	531865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424830
10538	NC_022119	TGC	3	9	531884	531892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10539	NC_022119	ACT	2	6	531912	531917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424830
10540	NC_022119	TGG	2	6	531938	531943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424830
10541	NC_022119	GCA	5	15	531981	531995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10542	NC_022119	CTC	2	6	532013	532018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424830
10543	NC_022119	ACA	2	6	532023	532028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424830
10544	NC_022119	CTTC	2	8	532086	532093	0 %	50 %	0 %	50 %	532424830
10545	NC_022119	AGT	2	6	532203	532208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424830
10546	NC_022119	AGA	2	6	532277	532282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424830
10547	NC_022119	TG	3	6	532309	532314	0 %	50 %	50 %	0 %	532424830
10548	NC_022119	AAT	2	6	532434	532439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424830
10549	NC_022119	GGA	2	6	532539	532544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424830
10550	NC_022119	TAA	2	6	532568	532573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424830
10551	NC_022119	TAG	2	6	532601	532606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424830
10552	NC_022119	GCT	2	6	532659	532664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10553	NC_022119	ATC	2	6	532692	532697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424830
10554	NC_022119	AATGTC	2	12	532698	532709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532424830
10555	NC_022119	ACACC	2	10	532762	532771	40 %	0 %	0 %	60 %	532424830
10556	NC_022119	AAC	2	6	532772	532777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424830
10557	NC_022119	CAA	2	6	532829	532834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424830
10558	NC_022119	TGA	2	6	532841	532846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424830
10559	NC_022119	GACA	2	8	532856	532863	50 %	0 %	25 %	25 %	532424830
10560	NC_022119	TGG	2	6	532880	532885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424830
10561	NC_022119	AT	3	6	532897	532902	50 %	50 %	0 %	0 %	532424830
10562	NC_022119	GAT	2	6	532926	532931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424830
10563	NC_022119	CGT	2	6	533033	533038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10564	NC_022119	CAA	2	6	533182	533187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424830
10565	NC_022119	GCT	2	6	533193	533198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10566	NC_022119	GAT	2	6	533253	533258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424830
10567	NC_022119	GGA	2	6	533295	533300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424830
10568	NC_022119	TCTCC	2	10	533302	533311	0 %	40 %	0 %	60 %	532424830
10569	NC_022119	CGTA	2	8	533381	533388	25 %	25 %	25 %	25 %	532424830
10570	NC_022119	TGG	2	6	533420	533425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424830
10571	NC_022119	ACA	2	6	533487	533492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424830
10572	NC_022119	CTT	2	6	533536	533541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424830
10573	NC_022119	CAG	2	6	533551	533556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10574	NC_022119	ACT	2	6	533579	533584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424830
10575	NC_022119	CAC	2	6	533590	533595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424830
10576	NC_022119	ACA	2	6	533613	533618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424830
10577	NC_022119	ACC	2	6	533640	533645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424830
10578	NC_022119	TGA	2	6	533653	533658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424830
10579	NC_022119	GGA	2	6	533661	533666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424830
10580	NC_022119	ATA	2	6	533682	533687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424830
10581	NC_022119	TGG	2	6	533693	533698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424830
10582	NC_022119	GGA	2	6	533700	533705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424830
10583	NC_022119	GGA	3	9	533715	533723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424830
10584	NC_022119	GCT	2	6	533735	533740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10585	NC_022119	AGC	2	6	533951	533956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10586	NC_022119	ATC	2	6	534026	534031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424830
10587	NC_022119	GAC	2	6	534042	534047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10588	NC_022119	AGC	3	9	534080	534088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424830
10589	NC_022119	AAC	2	6	534092	534097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424830
10590	NC_022119	TGAT	2	8	534115	534122	25 %	50 %	25 %	0 %	532424830
10591	NC_022119	TCA	2	6	534271	534276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424376
10592	NC_022119	CT	3	6	534310	534315	0 %	50 %	0 %	50 %	532424376
10593	NC_022119	TAA	2	6	534339	534344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424376
10594	NC_022119	AAG	2	6	534388	534393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424376
10595	NC_022119	TTC	2	6	534396	534401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424376
10596	NC_022119	TCG	2	6	534403	534408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424376
10597	NC_022119	TCCTC	2	10	534418	534427	0 %	40 %	0 %	60 %	532424376
10598	NC_022119	CA	3	6	534480	534485	50 %	0 %	0 %	50 %	532424376
10599	NC_022119	TA	3	6	534509	534514	50 %	50 %	0 %	0 %	532424376
10600	NC_022119	CAA	2	6	534608	534613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424376
10601	NC_022119	CTC	2	6	534623	534628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424376
10602	NC_022119	TTC	2	6	534654	534659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424376
10603	NC_022119	TTC	2	6	534664	534669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424376
10604	NC_022119	AGA	2	6	534678	534683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424376
10605	NC_022119	CTTT	2	8	534686	534693	0 %	75 %	0 %	25 %	532424376
10606	NC_022119	C	6	6	534784	534789	0 %	0 %	0 %	100 %	532424376
10607	NC_022119	A	6	6	534827	534832	100 %	0 %	0 %	0 %	532424376
10608	NC_022119	CT	3	6	535095	535100	0 %	50 %	0 %	50 %	532424377
10609	NC_022119	TCT	2	6	535146	535151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424377
10610	NC_022119	CAAATC	2	12	535167	535178	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532424377
10611	NC_022119	AGA	2	6	535274	535279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424377
10612	NC_022119	TTG	2	6	535295	535300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424377
10613	NC_022119	ACA	2	6	535326	535331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424377
10614	NC_022119	ATG	2	6	535336	535341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424377
10615	NC_022119	CCG	2	6	535404	535409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424377
10616	NC_022119	ACT	2	6	535414	535419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424377
10617	NC_022119	GAA	2	6	535494	535499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424377
10618	NC_022119	TAA	2	6	535564	535569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424377
10619	NC_022119	CATC	2	8	535646	535653	25 %	25 %	0 %	50 %	532424378
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10987	NC_022119	CCG	2	6	553161	553166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424395
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10990	NC_022119	TAA	2	6	553193	553198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424395
10991	NC_022119	ATT	2	6	553274	553279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424395
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