MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022119	CT	3	6	503384	503389	0 %	50 %	0 %	50 %	532424352
10002	NC_022119	TCC	2	6	503409	503414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424352
10003	NC_022119	TTC	2	6	503467	503472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424352
10004	NC_022119	TAT	2	6	503483	503488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424352
10005	NC_022119	TCGT	2	8	503506	503513	0 %	50 %	25 %	25 %	532424352
10006	NC_022119	GA	3	6	503566	503571	50 %	0 %	50 %	0 %	532424352
10007	NC_022119	GCA	2	6	503577	503582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424352
10008	NC_022119	CTC	2	6	503605	503610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424352
10009	NC_022119	T	6	6	503623	503628	0 %	100 %	0 %	0 %	532424352
10010	NC_022119	CTT	3	9	503770	503778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424353
10011	NC_022119	TTC	2	6	503782	503787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424353
10012	NC_022119	AT	3	6	503802	503807	50 %	50 %	0 %	0 %	532424353
10013	NC_022119	ATT	2	6	503880	503885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424353
10014	NC_022119	TGT	2	6	503927	503932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424353
10015	NC_022119	GGA	2	6	503985	503990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424353
10016	NC_022119	TCTA	2	8	504037	504044	25 %	50 %	0 %	25 %	532424353
10017	NC_022119	AAG	2	6	504046	504051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424353
10018	NC_022119	TTC	2	6	504166	504171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424353
10019	NC_022119	TAT	2	6	504269	504274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424353
10020	NC_022119	TCT	2	6	504313	504318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424354
10021	NC_022119	T	7	7	504391	504397	0 %	100 %	0 %	0 %	532424354
10022	NC_022119	CAAA	2	8	504402	504409	75 %	0 %	0 %	25 %	532424354
10023	NC_022119	AAAG	2	8	504410	504417	75 %	0 %	25 %	0 %	532424354
10024	NC_022119	CTT	2	6	504418	504423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424354
10025	NC_022119	CTT	2	6	504433	504438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424354
10026	NC_022119	TTG	2	6	504452	504457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424354
10027	NC_022119	AGAAT	2	10	504595	504604	60 %	20 %	20 %	0 %	532424354
10028	NC_022119	TGT	2	6	504636	504641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424354
10029	NC_022119	A	6	6	504783	504788	100 %	0 %	0 %	0 %	532424354
10030	NC_022119	GAA	2	6	504879	504884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424354
10031	NC_022119	A	6	6	505008	505013	100 %	0 %	0 %	0 %	532424354
10032	NC_022119	TTG	2	6	505165	505170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424354
10033	NC_022119	GAAC	2	8	505212	505219	50 %	0 %	25 %	25 %	532424354
10034	NC_022119	GAA	2	6	505278	505283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424354
10035	NC_022119	CAG	2	6	505388	505393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424355
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10037	NC_022119	GAG	2	6	505505	505510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424355
10038	NC_022119	TC	3	6	505531	505536	0 %	50 %	0 %	50 %	532424355
10039	NC_022119	TTG	2	6	505538	505543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424355
10040	NC_022119	CAA	2	6	505559	505564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424355
10041	NC_022119	CAA	2	6	505592	505597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424355
10042	NC_022119	TGC	2	6	505666	505671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424355
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10044	NC_022119	TCT	2	6	505700	505705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424356
10045	NC_022119	AT	3	6	505790	505795	50 %	50 %	0 %	0 %	532424356
10046	NC_022119	ACG	2	6	505876	505881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424356
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10049	NC_022119	ATA	2	6	505940	505945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424356
10050	NC_022119	CTT	2	6	505980	505985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424356
10051	NC_022119	CCAG	2	8	506087	506094	25 %	0 %	25 %	50 %	532424356
10052	NC_022119	CGA	2	6	506166	506171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424356
10053	NC_022119	ACC	2	6	506248	506253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424356
10054	NC_022119	AAT	2	6	506404	506409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424356
10055	NC_022119	TAG	2	6	506430	506435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424356
10056	NC_022119	AG	4	8	506461	506468	50 %	0 %	50 %	0 %	532424356
10057	NC_022119	TC	3	6	506490	506495	0 %	50 %	0 %	50 %	532424356
10058	NC_022119	ATCA	2	8	506527	506534	50 %	25 %	0 %	25 %	532424356
10059	NC_022119	AC	3	6	506621	506626	50 %	0 %	0 %	50 %	532424356
10060	NC_022119	GCAT	2	8	506675	506682	25 %	25 %	25 %	25 %	532424356
10061	NC_022119	CTT	2	6	506743	506748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424356
10062	NC_022119	GGTC	2	8	506796	506803	0 %	25 %	50 %	25 %	532424356
10063	NC_022119	AGC	2	6	506821	506826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424356
10064	NC_022119	CTT	2	6	506859	506864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424356
10065	NC_022119	AAG	2	6	506938	506943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424356
10066	NC_022119	GATT	2	8	506988	506995	25 %	50 %	25 %	0 %	532424356
10067	NC_022119	TCT	3	9	507035	507043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424356
10068	NC_022119	TCA	2	6	507095	507100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424356
10069	NC_022119	TTC	2	6	507112	507117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424356
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10072	NC_022119	TC	3	6	507308	507313	0 %	50 %	0 %	50 %	532424356
10073	NC_022119	TTTA	2	8	507358	507365	25 %	75 %	0 %	0 %	532424356
10074	NC_022119	AAT	2	6	507526	507531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424356
10075	NC_022119	CCAG	2	8	507546	507553	25 %	0 %	25 %	50 %	532424356
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10078	NC_022119	TCCA	2	8	507605	507612	25 %	25 %	0 %	50 %	532424356
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10088	NC_022119	GTC	2	6	508271	508276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424357
10089	NC_022119	T	6	6	508379	508384	0 %	100 %	0 %	0 %	532424358
10090	NC_022119	GCA	2	6	508388	508393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424358
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10092	NC_022119	AGAC	2	8	508601	508608	50 %	0 %	25 %	25 %	532424358
10093	NC_022119	GAG	2	6	508620	508625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424358
10094	NC_022119	TTTC	2	8	508645	508652	0 %	75 %	0 %	25 %	532424358
10095	NC_022119	CTT	2	6	508672	508677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424358
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10099	NC_022119	TAT	2	6	509107	509112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424359
10100	NC_022119	T	6	6	509153	509158	0 %	100 %	0 %	0 %	532424359
10101	NC_022119	TCTT	2	8	509196	509203	0 %	75 %	0 %	25 %	532424359
10102	NC_022119	GAA	2	6	509224	509229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424359
10103	NC_022119	TCGC	2	8	509471	509478	0 %	25 %	25 %	50 %	532424360
10104	NC_022119	CAG	2	6	509522	509527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424360
10105	NC_022119	CGA	2	6	509536	509541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424360
10106	NC_022119	TC	3	6	509600	509605	0 %	50 %	0 %	50 %	532424360
10107	NC_022119	TC	4	8	509613	509620	0 %	50 %	0 %	50 %	532424360
10108	NC_022119	GTTC	2	8	509638	509645	0 %	50 %	25 %	25 %	532424360
10109	NC_022119	TCT	2	6	509684	509689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424360
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10113	NC_022119	CAA	2	6	509782	509787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424360
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10118	NC_022119	ATCT	2	8	509949	509956	25 %	50 %	0 %	25 %	532424360
10119	NC_022119	AGA	2	6	509961	509966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424360
10120	NC_022119	GCA	2	6	509968	509973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424360
10121	NC_022119	A	6	6	509973	509978	100 %	0 %	0 %	0 %	532424360
10122	NC_022119	GGA	2	6	510087	510092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424360
10123	NC_022119	TAT	2	6	510117	510122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424360
10124	NC_022119	GAA	2	6	510172	510177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424360
10125	NC_022119	TG	3	6	510212	510217	0 %	50 %	50 %	0 %	532424360
10126	NC_022119	AGA	2	6	510237	510242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424360
10127	NC_022119	AAG	2	6	510263	510268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424360
10128	NC_022119	CTG	2	6	510284	510289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424360
10129	NC_022119	ATT	2	6	510319	510324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424360
10130	NC_022119	TCC	2	6	510400	510405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424360
10131	NC_022119	AAT	2	6	510430	510435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424360
10132	NC_022119	CGT	2	6	510454	510459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424360
10133	NC_022119	A	6	6	510461	510466	100 %	0 %	0 %	0 %	532424360
10134	NC_022119	GTC	2	6	510479	510484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424360
10135	NC_022119	ATC	2	6	510532	510537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424360
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10137	NC_022119	GA	3	6	510647	510652	50 %	0 %	50 %	0 %	532424360
10138	NC_022119	GGA	2	6	510658	510663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424360
10139	NC_022119	GGTTGT	2	12	510711	510722	0 %	50 %	50 %	0 %	532424360
10140	NC_022119	ATG	2	6	510782	510787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424360
10141	NC_022119	GCA	2	6	510826	510831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424360
10142	NC_022119	TTG	2	6	510836	510841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424360
10143	NC_022119	CAA	2	6	510886	510891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424360
10144	NC_022119	AAG	2	6	510944	510949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424360
10145	NC_022119	CA	3	6	510999	511004	50 %	0 %	0 %	50 %	532424360
10146	NC_022119	AGA	2	6	511050	511055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424360
10147	NC_022119	GA	3	6	511206	511211	50 %	0 %	50 %	0 %	532424360
10148	NC_022119	A	7	7	511253	511259	100 %	0 %	0 %	0 %	532424360
10149	NC_022119	A	7	7	511291	511297	100 %	0 %	0 %	0 %	532424360
10150	NC_022119	CAAA	2	8	511298	511305	75 %	0 %	0 %	25 %	532424360
10151	NC_022119	GATC	2	8	511309	511316	25 %	25 %	25 %	25 %	532424360
10152	NC_022119	GAA	2	6	511342	511347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424360
10153	NC_022119	GAG	2	6	511418	511423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424360
10154	NC_022119	CCA	2	6	511531	511536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424361
10155	NC_022119	TCT	2	6	511544	511549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424361
10156	NC_022119	CTA	2	6	511561	511566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424361
10157	NC_022119	CCAT	2	8	511569	511576	25 %	25 %	0 %	50 %	532424361
10158	NC_022119	TCA	2	6	511590	511595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424361
10159	NC_022119	GTT	2	6	511613	511618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424361
10160	NC_022119	CAT	2	6	511627	511632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424361
10161	NC_022119	GAT	2	6	511634	511639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424361
10162	NC_022119	TCT	2	6	511641	511646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424361
10163	NC_022119	CTT	2	6	511661	511666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424361
10164	NC_022119	TC	3	6	511679	511684	0 %	50 %	0 %	50 %	532424361
10165	NC_022119	TAGA	2	8	511757	511764	50 %	25 %	25 %	0 %	532424361
10166	NC_022119	AGT	2	6	511821	511826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424361
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10170	NC_022119	TG	3	6	512159	512164	0 %	50 %	50 %	0 %	532424362
10171	NC_022119	GAA	2	6	512203	512208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424362
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10185	NC_022119	GTT	2	6	512866	512871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424362
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10193	NC_022119	CAG	2	6	513323	513328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424362
10194	NC_022119	ATAGG	2	10	513433	513442	40 %	20 %	40 %	0 %	532424362
10195	NC_022119	TG	3	6	513475	513480	0 %	50 %	50 %	0 %	532424362
10196	NC_022119	ATC	2	6	513495	513500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424362
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10198	NC_022119	T	6	6	513627	513632	0 %	100 %	0 %	0 %	532424362
10199	NC_022119	AGCTA	2	10	513669	513678	40 %	20 %	20 %	20 %	532424362
10200	NC_022119	AG	4	8	513690	513697	50 %	0 %	50 %	0 %	532424362
10201	NC_022119	TGA	2	6	513779	513784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424362
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10203	NC_022119	T	6	6	513819	513824	0 %	100 %	0 %	0 %	532424362
10204	NC_022119	ACC	2	6	514079	514084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424363
10205	NC_022119	TCTT	2	8	514092	514099	0 %	75 %	0 %	25 %	532424363
10206	NC_022119	ACA	2	6	514166	514171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424363
10207	NC_022119	ACT	2	6	514172	514177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424363
10208	NC_022119	ACA	2	6	514185	514190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424363
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10210	NC_022119	T	7	7	514216	514222	0 %	100 %	0 %	0 %	532424363
10211	NC_022119	CTG	2	6	514593	514598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424364
10212	NC_022119	CCT	2	6	514600	514605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424364
10213	NC_022119	TC	3	6	514698	514703	0 %	50 %	0 %	50 %	532424364
10214	NC_022119	CTT	2	6	514729	514734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424364
10215	NC_022119	CAC	2	6	514743	514748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424364
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10217	NC_022119	TGC	3	9	514841	514849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424365
10218	NC_022119	CTC	2	6	514863	514868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424365
10219	NC_022119	CTT	2	6	514996	515001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424365
10220	NC_022119	ATG	2	6	515002	515007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424365
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10222	NC_022119	CTT	2	6	515071	515076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424365
10223	NC_022119	ACA	2	6	515100	515105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424365
10224	NC_022119	CTC	2	6	515146	515151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424365
10225	NC_022119	AAG	2	6	515180	515185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424365
10226	NC_022119	GTA	2	6	515213	515218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424365
10227	NC_022119	AG	3	6	515232	515237	50 %	0 %	50 %	0 %	532424365
10228	NC_022119	GAA	2	6	515238	515243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424365
10229	NC_022119	CT	3	6	515297	515302	0 %	50 %	0 %	50 %	532424365
10230	NC_022119	CTT	2	6	515481	515486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424365
10231	NC_022119	T	6	6	515485	515490	0 %	100 %	0 %	0 %	532424365
10232	NC_022119	A	6	6	515511	515516	100 %	0 %	0 %	0 %	532424365
10233	NC_022119	TTCT	2	8	515528	515535	0 %	75 %	0 %	25 %	532424365
10234	NC_022119	AGA	2	6	515564	515569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424365
10235	NC_022119	CCCA	2	8	515598	515605	25 %	0 %	0 %	75 %	532424365
10236	NC_022119	AGA	2	6	515618	515623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424365
10237	NC_022119	ATC	2	6	515689	515694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424365
10238	NC_022119	ACGAC	2	10	515774	515783	40 %	0 %	20 %	40 %	532424365
10239	NC_022119	CTCTT	2	10	515857	515866	0 %	60 %	0 %	40 %	532424365
10240	NC_022119	TCC	2	6	515911	515916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424365
10241	NC_022119	GAG	2	6	515964	515969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424365
10242	NC_022119	T	6	6	516019	516024	0 %	100 %	0 %	0 %	532424365
10243	NC_022119	CTC	2	6	516066	516071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424365
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10484	NC_022119	ATGA	2	8	529772	529779	50 %	25 %	25 %	0 %	532424375
10485	NC_022119	GAT	2	6	529792	529797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424375
10486	NC_022119	AAAT	2	8	529841	529848	75 %	25 %	0 %	0 %	532424375
10487	NC_022119	AAC	2	6	529924	529929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424375
10488	NC_022119	CTGA	2	8	529933	529940	25 %	25 %	25 %	25 %	532424375
10489	NC_022119	GA	3	6	529939	529944	50 %	0 %	50 %	0 %	532424375
10490	NC_022119	GTT	2	6	529960	529965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424375
10491	NC_022119	TAA	2	6	529975	529980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424375
10492	NC_022119	AGA	2	6	530004	530009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424375
10493	NC_022119	CCT	2	6	530073	530078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424375
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10496	NC_022119	AGC	2	6	530177	530182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424375
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10500	NC_022119	AGC	2	6	530327	530332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424375

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